12 berakar, semuanya terdiri dari thallus batang saja. Sampai kini
Thallophyta memiliki 7 filum yaitu Euglenophyta, Chlorophyta, Chrysophyta, Pyrrophyta, Phaeophyta, Rhodophyta, dan Cryptophyta. Untuk menentukan
divisi dan mencirikan kemungkinan hubungan filogenetik di antara kelas secara khas dipakai komposisi plastida pigmen, persediaan karbohidrat, dan
komposisi dinding sel Aslan, 1991.
2.4.2 Phaeophyceae Alga Coklat
Phaeophyceae adalah ganggang yang berwarna coklatpirang. Dalam kromatoforanya terkandung klorofil a, karotin dan xanthofil tetapi yang terutama
adalah fikosantin yang menutupi warna lainnya dan menyebabkan ganggang itu kelihatan berwarna pirang. Sebagai hasil asimilasi dan sebagai zat
makanan cadangan tidak pernah ditemukan zat tepung, tetapi sampai 50 dari berat keringnya terdiri atas laminarin, sejenis karbohidrat yang menyerupai
dekstrin dan lebih dekat dengan selulosa daripada zat tepung. Selain laminarin, juga ditemukan manit, minyak dan zat-zat lainnya. Dinding
selnya sebelah dalam terdiri atas selulosa, yang sebelah luar dari pektin dan di bawah pektin terdapat algin. Sel-selnya hanya mempunyai satu inti Estiati ,1995
Perkembangbiakannya dapat berupa zoospora dan gamet. Kebanyakan phaeophyceae hidup dalam air laut dan hanya beberapa jenis saja yang dapat
hidup di air tawar. Di laut dan samudera di daerah iklim sedang dan dingin, thallusnya dapat mencapai ukuran yang amat besar dan sangat berbeda-beda
bentuknya Tjitrosoepomo, 1994. Menurut Romimohtarto dan Juwana 2009, alga coklat berukuran besar, alga ini sangat berkembang di perairan yang sangat
dingin karena alga ini adalah khas tumbuh-tumbuhan pantai berbatu. Terdapat
13 beberapa kelompok alga coklat ini yang hidupnya bersifat epifit yakni
menempel pada makroalga lainnya. Terdapat delapan marga alga coklat yang sering ditemukan di Indonesia. Berikut ini adalah marga-marga alga coklat adalah:
a. Cystoseira sp. hidup menempel pada batu di daerah rataan terumbu dengan alat pelekatnya yang berbentuk cakram kecil. Alga ini mengelompok
bersama dengan komunitas Sargassum dan Turbinaria. Alga ini mempunyai dua atau tiga sayap longitudinal dengan pinggiran bergerigi.
Sayap ini mencapai lebih dari 0,5 cm lebarnya. Kantung udaranya terdapat di sepanjang thallus.
b. Dictyopteris sp. hidup melekat pada batu di pinggiran luar rataan terumbu jarang dijumpai. Jenis alga ini banyak ditemukan di Selatan Jawa,
Selat Sunda dan Bali. c. Dictyota D. bartayresiana, tumbuh menempel pada batu dan karang mati
di daerah rataan terumbu. Warnanya coklat tua dan mempunyai thallus bercabang yang terbagi dua. Thallus yang pipih, lebarnya 2 mm.
d. Hormophysa H. triquesa, hidup menempel pada batu dengan alat pelekatnya berbentuk cakram kecil. Alga ini hidup bercampur dengan
Sargassum dan Turbinaria dan hidup di rataan terumbu. e. Hydroclathrus H. clatratus, tumbuh melekat pada batu atau pasir di daerah
rataan terumbu dan tersebar agak luas di perairan Indonesia. f. Padina P. australis, tumbuh menempel pada batu di daerah rataan terumbu,
baik di tempat terbuka, di laut maupun di tempat terlindung. Alat pelekatnya yang melekat pada batu atau pada pasir, terdiri dari cakram pipih,
biasanya terbagi menjadi cuping-cuping pipih 5 – 8 cm lebarnya. Tangkai
14 yang pipih dan pendek menghubungkan alat pelekat ini dengan ujung
meruncing dari selusin daun berbentuk kipas. Setiap daun mempunyai jari- jari 5 cm atau lebih.
g. Sargassum terdapat teramat melimpah mulai dari air surut pada pasang-surut bulan setengah ke bawah. Alga ini hidup melekat pada batu atau
bongkahan karang dan dapat terlepas dari substratnya selama ombak besar dan menghanyut ke permukaan laut atau terdampar di bagian atas
pantai. Warnanya bermacam-macam dari coklat muda sampai coklat tua. Alat pelekatnnya terdiri dari cakram pipih. Di perairan Indonesia tercatat tujuh
jenis, yakni: S. polycystum, S. plagiophyllum, S. duplicatum, S. crassifolium, S. binderi, S. echinocarpum, dan S. cinereum.
h. Turbinaria terdiri dari tiga jenis yang tercatat, yakni T. conoides, T. decurrens, dan T. ornate. Alga ini mempunyai cabang-cabang silindris
dengan diameter 2-3 mm dan mempunyai cabang lateral pendek dari 1-1,5 cm panjangnya. Alga ini terdapat di pantai berbatu dan paparan terumbu.
2.4.3 Rhodophyceae Alga Merah