II. TINJAUAN PUSTAKA
A. Mikroorganisme
Populasi mikroorganisme yang ada di alam sekitar kita ini sangatlah besar dan cukup kompleks. Beratus spesies mikroba menguasai setiap bagian tubuh kita.
Mereka terdapat dalam jumlah yang cukup besar. Sebagai contoh, sekali kita bersin dapat menebarkan beribu- ribu mikroorganisme. Satu gram tinja dapat
mengandung jutaan bakteri. Alam di sekitar kita, baik itu tanah, air, maupun udara juga dihuni oleh kumpulan mikroorganisme. Penelitian yang layak
mengenai mikroorganisme dalam berbagai habitat ini memerlukan teknik untuk memisahkan populasi campuran yang rumit ini, atau yang biasanya dikenal
dengan istilah biakan campuran, menjadi spesies yang berbeda- beda yang dikenal dengan istilah biakan murni. Biakan murni ini terdiri dari satu populasi
sel yang semuanya berasal dari satu sel induk Pelczar, 1986.
Mikroorganisme dapat ditumbuhkan dan dikembangkan pada suatu substrat yang disebut medium. Medium yang digunakan untuk menumbuhkan dan
mengembangbiakkan mikroorganisme tersebut harus sesuai susunannya dengan kebutuhan jenis-jenis mikroorganisme yang bersangkutan. Beberapa
mikroorganisme dapat hidup baik pada medium yang sangat sederhana yang hanya mengandung garam anorganik ditambah sumber karbon organik seperti
gula. Sedangkan mikroorganisme lainnya memerlukan suatu medium yang sangat kompleks yaitu berupa medium ditambahkan darah atau bahan-bahan
kompleks lainnya Volk dan Wheeler,1993.
Mikroorganisme adalah sumber yang potensial sebagai bahan baku untuk produksi enzim. Hal ini disebabkan karena beberapa faktor yaitu: ekonomis,
karena dapat dihasilkan dalam waktu yang cukup pendek dan media yang cukup murah, kondisi reaksi seperti pH dan temperatur mudah diatur, dan
peningkatan produksi enzimnya dapat dikondisikan dengan cara penambahan induser tertentu Wang, 1979.
B. Bakteri
Bakteri, berasal dari kata Latin bacterium, adalah kelompok raksasa dari organisme hidup. Ukuran bakteri sangatlah kecil mikroskopik dan
kebanyakan uniselular, dengan struktur sel yang relatif sederhana tanpa nucleus inti sel, cytoskeleton, dan organel lain seperti mitokondria dan kloroplas.
Bakteri digolongkan menjadi dua, yaitu bakteri yang menguntungkan dan bakteri yang merugikan. Bakteri tersebar di tanah, air, dan sebagai simbiosis
dari organisme lain. Bakteri rata-rata mengandung 40-70 protein, 13-34 asam nukleat, 10-30 lipid angka-angka ini menunjukkan persen berat
kering Suhartono, 1989. Ada tiga bentuk dasar bakteri, yaitu bentuk bulat atau kokus, bentuk batang
silindris, bentuk lengkung atau vibri. Bentuk bulat atau kokus dapat dibedakan dalam mikrokokus, diplokokus, streptokokus, tetrakokus, sarsina dan
stafilokokus. Bakteri berbentuk batang dapat dibedakan ke dalam bentuk batang panjang dan batang pendek dengan ujung datar atau lengkung. Bakteri
berbentuk lengkung dapat dibagi menjadi bentuk koma vibrio, jika lengkungnya kurang dari setengah lingkaran. Bentuk bakteri dipengaruhi oleh
umur dan syarat pertumbuhan tertentu Hidayat et al., 2006.
1. Nutrien untuk Pertumbuhan Bakteri
Bakteri memerlukan nutrien dengan komposisi tertentu untuk tumbuh dan membelah diri. Kebutuhan nutrien meliputi unsur makroesensial dan unsur
mikroesensial. Unsur makro digunakan oleh mikroba dalam metabolisme sel, sedangkan unsur mikro digunakan untuk mengaktifkan enzim
Suhartono, 1989.
Organisme hidup memerlukan nutrisi untuk pertumbuhannya. Substansi kimia organik dan inorganik diperoleh dari lingkungan dalam berbagai
macam bentuk. Nutrien diambil dari lingkungan kemudian ditransformasikan melalui membran plasma menuju sel. Di sel beberapa
nutrisi diolah menghasilkan energi yang digunakan dalam proses seluler Lim, 1998.
Jasad renik heterotrof membutuhkan nutrien untuk kehidupan dan pertumbuhannya, yakni sebagai: 1 sumber karbon, 2 sumber nitrogen,
3 sumber energi, 4 dan faktor pertumbuhan, yakni mineral dan vitamin. Nutrien tersebut dibutuhkan untuk membentuk energi dan menyusun
komponen-komponen sel. Setiap jasad renik bervariasi dalam kebutuhannya akan zat-zat nutrisi tersebut.
Ada tujuh komponen utama yang dibutuhkan semua makhluk hidup, yaitu karbon, oksigen, nitrogen, hidrogen, fosfor, sulfur dan kalium. Untuk
kebutuhan akan sumber karbon dipenuhi oleh adanya gula, pati, serta karbohidrat lainnya. Ada dua macam mikronutrien yakni mikronutrien
organik dan mikronutrien anorganik. Zat-zat yang bertindak sebagai mikronutrien organik pada beberapa asam amino triptofan dan pada
beberapa komponen-komponen DNA dan RNA purin dan pirimidin. Beberapa unsur logam yang termasuk dalam mikronutrien anorganik adalah
Co, Mo, Cu, Zn. Unsur logam ini sangat diperlukan untuk kehidupan sel meskipun jumlahnya sangat sedikit Irianto, 2006.
Menurut Waluyo 2005, peran utama nutrien adalah sebagai sumber energi, bahan pembangun sel, dan sebagai akseptor elektron dalam reaksi
bioenergetik reaksi yang menghasilkan energi. Oleh karenanya bahan makanan yang diperlukan terdiri dari air, sumber energi, sumber karbon,
sumber akseptor elektron, sumber mineral, faktor pertumbuhan, dan nitrogen. “Selain itu, secara umum nutrien dalam media pembenihan harus
mengandung seluruh elemen yang penting untuk sintesis biologik organisme baru Jawetz, 2001.”
a. Air
Air merupakan komponen utama sel mikroba dan medium. Fungsi air adalah sebagai sumber oksigen untuk bahan organik sel pada respirasi.
Selain itu air berfungsi sebagai pelarut dan alat pengangkut dalam metabolisme.
b. Sumber Energi
Ada beberapa sumber energi untuk mikroba yaitu senyawa organik atau anorganik yang dapat dioksidasi dan cahaya terutama cahaya matahari.
c. Sumber Karbon
Sumber karbon untuk mikroba dapat berbentuk senyawa organik maupun anorganik. Senyawa organik meliputi karbohidrat, lemak, protein, asam
amino, asam organik, garam asam organik, polialkohol, dan sebagainya. Senyawa anorganik misalnya karbonat dan gas CO
2
yang merupakan sumber karbon utama terutama untuk tumbuhan tingkat tinggi.
d. Sumber Akseptor Elektron
Proses oksidasi biologi merupakan proses pengambilan dan pemindahan elektron dari substrat. Karena elektron dalam sel tidak berada dalam
bentuk bebas, maka harus ada suatu zat yang dapat menangkap elektron tersebut. Penangkap elektron ini disebut akseptor elektron. Akseptor
elektron ialah agensia pengoksidasi. Pada mikrobia yang dapat berfungsi sebagai akseptor elektron ialah O
2
, senyawa organik, NO
3 -
, NO
2 -
, N
2
O, SO
4 2-
, CO
2
, dan Fe
3+
.
e. Sumber Mineral
Mineral merupakan bagian dari sel. Unsur penyusun utama sel ialah C, O, N, H, dan P. Unsur mineral lainnya yang diperlukan sel ialah K, Ca,
Mg, Na, S, Cl. Unsur mineral yang digunakan dalam jumlah sangat sedikit ialah Fe, Mn, Co, Cu, Bo, Zn, Mo, Al, Ni, Va, Sc, Si, Tu, dan
sebagainya yang tidak diperlukan jasad. Unsur yang digunakan dalam
jumlah besar disebut unsur makro, dalam jumlah sedang unsur oligo, dan dalam jumlah sangat sedikit unsur mikro. Unsur mikro sering terdapat
sebagai ikutan impurities pada garam unsur makro, dan dapat masuk ke dalam medium lewat kontaminasi gelas tempatnya atau lewat partikel
debu. Selain berfungsi sebagai penyusun sel, unsur mineral juga berfungsi untuk mengatur tekanan osmosis, kadar ion H
+
kemasaman, pH, dan potensial oksidasi reduksi redox potential medium.
f. Faktor Tumbuh
Faktor tumbuh ialah senyawa organik yang sangat diperlukan untuk pertumbuhan sebagai prekursor, atau penyusun bahan sel dan senyawa
ini tidak dapat disintesis dari sumber karbon yang sederhana. Faktor tumbuh sering juga disebut zat tumbuh dan hanya diperlukan dalam
jumlah sangat sedikit. Berdasarkan struktur dan fungsinya dalam metabolisme, faktor tumbuh digolongkan menjadi asam amino, sebagai
penyusun protein; basa purin dan pirimidin, sebagai penyusun asam nukleat; dan vitamin sebagai gugus prostetis atau bagian aktif dari enzim.
g. Sumber Nitrogen
Mikroba dapat menggunakan nitrogen dalam bentuk amonium, nitrat, asam amino, protein, dan sebagainya. Jenis senyawa nitrogen yang
digunakan tergantung pada jenis jasadnya. Beberapa mikroba dapat menggunakan nitrogen dalam bentuk gas N
2
zat lemas udara. Mikroba ini disebut mikrobia penambat nitrogen.
Untuk mendapatkan bakteri yang potensial dilakukan dengan penapisan mikroorganisme dari lingkungan. Umumnya isolat bakteri yang diperoleh
sesuai dengan lingkungan tempat hidupnya. Hal ini dikarenakan kondisi lingkungan tersebut biasanya digunakan bakteri sebagai substrat utamanya.
Misalnya, bakteri amilolitik dapat diisolasi dari sampel yang berasal dari limbah pengolahan singkong, limbah sayur Chakrabarty and Sen, 1984,
rumen Freer, 1993, serta hasil fermentasi ikan dan bahan makanan dari beras Olympia et al., 1995.
2. Fase Pertumbuhan Bakteri
Suatu mikroorganisme mempunyai siklus pertumbuhan tertentu tergantung produk yang akan dihasilkan. Fase pertumbuhan bakteri dapat dibagi
menjadi 4 fase, yaitu fase lag, fase logaritma eksponensial, fase stasioner dan fase kematian. Fase lag merupakan fase penyesuaian bakteri dengan
lingkungan yang baru. Lama fase lag pada bakteri sangat bervariasi, tergantung pada komposisi media, pH, suhu, aerasi, jumlah sel pada
inokulum awal dan sifat fisiologis mikroorganisme pada media sebelumnya. Ketika sel telah menyesuaikan diri dengan lingkungan yang baru maka sel
mulai membelah hingga mencapai populasi yang maksimum. Fase ini disebut fase logaritma atau fase eksponensial.
Fase eksponensial ditandai dengan terjadinya periode pertumbuhan yang cepat. Variasi derajat pertumbuhan bakteri pada fase eksponensial ini
sangat dipengaruhi oleh sifat genetik yang diturunkannya. Selain itu, derajat pertumbuhan juga dipengaruhi oleh kadar nutrien dalam media, suhu
inkubasi, kondisi pH dan aerasi. Ketika derajat pertumbuhan bakteri telah menghasilkan populasi yang maksimum, maka akan terjadi keseimbangan
antara jumlah sel yang mati dan jumlah sel yang hidup. Fase stasioner terjadi pada saat laju pertumbuhan bakteri sama dengan laju
kematiannya, sehingga jumlah bakteri keseluruhan akan tetap. Keseimbangan jumlah keseluruhan bakteri ini terjadi karena adanya
pengurangan derajat pembelahan sel. Hal ini disebabkan oleh kadar nutrisi yang berkurang dan terjadi akumulasi produk toksik sehingga mengganggu
pembelahan sel. Fase stasioner ini dilanjutkan dengan fase kematian yang ditandai dengan peningkatan laju kematian yang melampaui laju
pertumbuhan, sehingga secara keseluruhan terjadi penurunan populasi bakteri Volk dan Wheeler, 1993.
C. Amilum
Amilum atau dalam bahasa sehari-hari disebut pati terdapat pada umbi, daun, batang dan biji-bijian Poedjiadi, 1994. Pati C
6
H
10
O
5 n
adalah homopolimer glukosa dengan ikatan α-glikosidik yang merupakan rantai gula yang panjang.
Sifat berbagai macam pati tidak sama, tergantung dari panjang rantai C dan cabang rantai molekul. Pati terdiri dari dua fraksi yang dapat dipisahkan
dengan air panas. Fraksi terlarut disebut amilosa dan fraksi tidak larut disebut amilopektin Winarno, 1986. Berbagai macam pati ditemukan di alam karena
dapat disintesis oleh berbagai macam tumbuhan. Setiap macam pati memiliki bentuk partikel atau granula yang berbeda, dan secara mikroskopis dipakai
untuk membedakan berbagai pati alamiah. Pati terbagi menjadi dua golongan yaitu pertama adalah amilosa 15-20 yang merupakan rantai panjang tidak
bercabang yang terdiri dari molekul-molekul α-D-glukopiranosa yang bersambungan dengan ikatan α-1,4. Amilosa terdiri atas 250-300 unit
D-glukosa yang terikat dengan ikatan α-1,4-glikosidik, jadi molekulnya merupakan rantai terbuka. Kedua adalah amilopektin 80-85 yang
merupakan rantai bercabang sebanyak 20-30 molekul α-D-glukopiranosa yang bersambungan dengan ikatan α-1,4 dan α-1,6. Adanya ikatan α-1,6-glikosidik
ini menyebabkan terjadinya cabang, sehingga molekul amilopektin berbentuk rantai terbuka dan bercabang Poedjiadi, 1994. Struktur amilosa dan
amilopektin dapat dilihat pada Gambar 1.
B Amilopektin
Gambar 1.
Struktur kimia dari A Amilosa dan B Amilopektin
A Amilosa
Amilum dapat dihidrolisis sempurna dengan menggunakan asam sehingga menghasilkan glukosa. Hidrolisis juga dapat dilakukan dengan bantuan enzim
amilase. Pada reaksi hidrolisis parsial, amilum terpecah menjadi molekul- molekul yang lebih kecil yang dikenal dengan nama dekstrin. Jadi dekstrin
adalah hasil antara pada proses hidrolisis amilum sebelum terbentuk maltosa Poedjiadi, 1994. Untuk mengetahui adanya pati maka dilakukan pengujian
dengan menggunakan larutan iodium I
2
dalam KI. Bila terdapat amilosa, polimer-polimer glukosa yang lebih besar dari 20 maka akan menghasilkan
warna biru. Bila polimer-polimer glukosa kurang dari 20 maka akan menghasilkan warna merah. Dekstrin dengan polimer enam, tujuh, dan
delapan akan memberikan warna coklat. Polimer yang lebih kecil dari lima tidak memberikan warna dengan iodium Winarno, 1986.
Dalam kehidupan manusia amilum berperan sebagai sumber makanan penghasil energi utama dari golongan karbohidrat, di samping itu amilum juga
dapat berperan sebagai bahan aditif pada proses pengolahan makanan, misalnya sebagai penstabil dalam proses pembuatan puding. Amilum juga
berperan dalam pembuatan sirup dan pemanis buatan seperti sakarin. Dalam bidang non makanan, amilum digunakan untuk bahan baku dalam proses
pembuatan kertas, pakaian dari katun, industri cat, maupun untuk produksi hidrogen. Tabel 1. di bawah ini menunjukkan peran amilum di berbagai bidang
industri.
Tabel 1.
Penggunaan amilum di bidang industri Liu, 2005
Jenis Industri Penggunaan AmilumAmilum
Termodifikasi
Makanan
Bahan Perekat Kertas dan Papan
Tekstil
Farmasi Pengeboran Minyak
Detergen
Kimia Pertanian
Plastik Kosmetik
Purifikasi Bidang Medis
Pengental, pelapis makanan, film makanan
Pembuat lem Kertas penjilid, pembungkus, pengepak
Dalam proses sizing, finishing dan printing
Kapsul obat, bahan pelarut obat Modifikasi pengental
Surfaktan, bahan pensuspensi, bahan pemutih, aktivator pemutih
Pembungkus biji, pembungkus pestisida benang pintal
Pembungkus makanan filler Bedak dan talk
Flokulan Scaffold
, plasma eksterder, produk absorben untuk sanitasi
D. Enzim