Rumusan Masalah Pertanyaan Penelitian Tujuan Manfaat Penelitian Batasan Penelitian

Maesaroh, 2013 Analisis Filogenetika Isolat Bakteri Aeromonas Hydrophila Dari Ikan Sehat Menggunakan Gen 16s rRNA Universitas Pendidikan Indonesia | repository.upi.edu | perpustakaan.upi.edu menggambarkan karakteristik dari setiap isolat bakteri A. hydrophila yang terpilih dalam penelitian ini. Selain itu, dibutuhkan pula pendeteksian gen-gen virulen terhadap semua isolat A. hydrophila yang didapat untuk mengetahui keberadaan gen-gen virulen yang diharapkan dapat menggambarkan potensi patogen dari setiap bakteri.

B. Rumusan Masalah

Bagaimanakah hubungan filogenetika bakteri A. hydrophila dari isolat beberapa ikan sehat dengan gen penanda 16S rRNA?

C. Pertanyaan Penelitian

1. Bagaimanakah karakteristik A. hydrophila yang terdapat pada intestin ikan sehat secara biokimia dan morfologi? 2. Bagaimanakah hubungan kekerabatan A. hydrophila yang didapat dari beberapa ikan sehat berdasarkan sikuen gen 16S rRNA? 3. Bagaimanakah keberadaan gen-gen virulen pada setiap A. hydropila yang didapat dari ikan sehat?

D. Tujuan

1. Untuk mengetahui karakteristik A. hydrophila yang hidup di ikan sehat secara biokimia dan morfologi. 2. Untuk mengetahui hubungan kekerabatan A. hydrophila yang didapat dari beberapa ikan sehat berdasarkan sikuen gen 16S rRNA. 3. Untuk mengetahui keberadaan gen-gen virulen dari setiap isolat bakteri A. hydrophila yang didapat dari ikan sehat.

E. Manfaat Penelitian

1. Memberikan informasi mengenai karakteristik bakteri A. hydrophila dari ikan sehat. 2. Memberi gambaran mengenai hubungan kekerabatan bakteri A. hydrophila yang diisolasi dari beberapa ikan sehat. Maesaroh, 2013 Analisis Filogenetika Isolat Bakteri Aeromonas Hydrophila Dari Ikan Sehat Menggunakan Gen 16s rRNA Universitas Pendidikan Indonesia | repository.upi.edu | perpustakaan.upi.edu 3. Dapat menggambarkan potensi patogen dari setiap bakteri A. hydrophila dilihat dari kelimpahan gen-gen virulen yang dimilikinya. 4. Dapat dijadikan sebagai landasan awal dalam pengontrolan perkembangan jangkitan penyakit pada ikan yang disebabkan oleh bakter A. hydrophila. 5. Sebagai tambahan ilmu khususnya bidang mikrobiologi dan biologi molekuler.

F. Batasan Penelitian

1. Ikan sehat yang digunakan merupakan ikan air tawar yaitu ikan tawes, ikan mas, ikan lele, ikan gurame, dan ikan nila. 2. Organ yang digunakan dalam mengisolasi bakteri A. hydrophila yaitu intestin. 3. Primer yang digunakan untuk amplifikasi gen 16S rRNA adalah primer forward 27F dan primer reverse 1492R Lane, 1991; Hill et al., 2003. 4. Isolat bakteri A. hydrophila yang digunakan merupakan bakteri yang didapat dari beda jenis ikan atau ikan yang sejenis namun beda individu. Maesaroh, 2013 Analisis Filogenetika Isolat Bakteri Aeromonas Hydrophila Dari Ikan Sehat Menggunakan Gen 16s rRNA Universitas Pendidikan Indonesia | repository.upi.edu | perpustakaan.upi.edu

BAB III METODE PENELITIAN