BAHAN DAN METODE Ikan Uji

  Jurnal Riset Akuakult ur, 11 (4), 2016, 313-319

Tersedia online di: ht t p://ej ournal-balit bang.kkp.go.id/index.php/j ra

  

EVALUASI KERAGAM AN GENETIK IKAN KALUI ( )

Osphronemus goramy

  

DARI KABUPATEN LIM A PULUH KOTA, SUM ATERA BARAT BERDASARKAN

M ARKA RANDOM AM PLIFIED POLYM ORPHISM DNA (RAPD)

  • *)# **) **) ***)

  

Estu Nugroho , Azrita , Hafrizal Syandri , dan Refilza

*) **)

Pu sat Pene litian dan Pe ngem bangan Pe rikanan

Fakult as Perikanan , Un iversitas Bun g Hatta, Pad ang, Sum atera Barat

***)

Dinas Perikanan, Kabup aten Lima Puluh Kota, Sum atera Barat

  ABSTRAK

Ikan kalui merupakan nama lokal dari ikan gurami di Kabupaten Lima Puluh Kota, Sumatera Barat termasuk

jenis ikan ekonomis tinggi. Terdapat lima st rain ikan kalui yang tersebar di pembudidaya, yaitu Tambago,

Palapah, Krista, Jepun, dan Merah. Penelitian ini dilakukan untuk mengamati keragaman genetik st rain ikan

kalui atau gurami dengan menggunakan penanda RAPD. Sebanyak 50 sampel DNA ikan kalui diekstraksi

dari sirip dan diamplifikasi secara random dengan menggunakan empat primer terbaik dari 20 primer OPA

yaitu OPA-02, OPA-04, OPA-06, d an OPA-07. Hasil me nu njukkan bah wa p erbe daan yang n yata secara

genetik hanya terdapat antara st rain ikan kalui Merah dengan Tambago dan Krista. Variasi genetik tertinggi

diamati pada ikan kalui st rain Krista dengan nilai heterogenitas 0,1756 kemudian diikuti berturut-turut

oleh st rain Merah (0,1735), Palapah (0,1480), Jep un (0,0594), dan Tambago (0,0203). Jarak rata-rat a Nei

genetik adalah 0,407; dengan nilai terendah yang teramati antara st rain Tambago dan Palapah.

  KATA KUNCI: kalui; RAPD; keragaman genetik ABSTRACT: Evaluation of genetic divergence of kalui fish (

  Osphronemus goramy) strains from West Sumatra revealed by random amplified polymorphism DNA (RAPD) marker. By. Estu Nugroho, Azrita, Hafrizal Syandri, and Refilza

  

Kalui is a local name of giant gouramy fish in West Sumat era Province t hat cat egorized as an high economically fish.

Five st rains of Kalui are dist ribut ed t o farmers i.e. Tambago, Palapah, Krist a, Jepun, and M erah. This research was

conduct ed t o obser ve t he genet ic variat ion of Kalui st rains using RAPD marker. A t otal of 50 samples of whole DNA was

extracted from Kalui-giant gouramy finclip and randomly amplified using four of t he best 20 primers (OPA i.e. OPA-02,

OPA-04, OPA-06, and OPA-07). The result s showed t hat Significant genet ic differences were only obser ved bet ween

st rain M erah-Tambago and M erah-Krist a. The highest variabilit y was obser ved in Krist a wit h het erogeneit y value of

0.1735 followed by M erah (0.1735), Palapah (0.1480), Jepun (0.0594), and Tambago (0.0203). The average Nei

genet ic dist ance was 0.407, wit h t he lowest was obser ved bet ween Tambago and Palapah.

  KEYW ORDS: kalui; genetic variation; RAPD

PENDAHULUAN Kalimant an Selat an. Ikan ini dikenal dengan nama lokal

ikan kalui di daerah Sumat era Barat (Ano nim, 2002).

  Osphronemus goramy

  Ikan gurami ( ) merupakan salah

  st rain

  sat u je nis ko m o d it as ikan air t awar yan g b e rn ilai Be b e rap a ikan kalu i yan g ad a di d ae rah eko n o mis t inggi di In do nesia. Pen ye baran ikan ini Ka b u p a t e n Lim a Pu lu h Ko t a , Su m a t e r a Ba r a t , m e lip u t i d ae rah yang cu ku p luas yait u m ulai dari khususnya di Kecamat an Luak, Larek Sago Halaban, Su m at e ra Bara t , Ja m b i, Jawa Barat , Jawa Te n g ah , dan Suliki adalah Tambago , Palapah, Krist a, Jepun, dan Jo gjakart a, Jawa Timur, sert a Kalim ant an Barat dan Merah. Berdasarkan mo rfo lo gi dengan menggunakan

  t r uss

  t eknik -mo rfo m e t rik (Azrit a & Syan dri, 2 0 15 ) #

  st rain-st rain

  t elah mengelo mpo kkan t ersebut menjadi

  Ko re sp o nd e n si: Pusat Pe n e lit ian d an Pe n g em b an gan Pe r ikan an

  t iga kelo mpo k besar yait u kalui Merah, kalui Krist a,

  Ge d un g Balit b an g KP II, Jl. Pasir Pu t ih II, An co l Tim u r 1 44 3 0 , Jakar t a, In d o n e sia. Te l. + (0 2 1 ) 6 4 7 0 0 9 2 8

  d a n k a lu i Pa la p a h -Ta m b a g o -Je p u n . Pe r b e d a a n

   engr oho@ yahoo.com E-m ail: Co p yright @ 2016 , Jurn al Rise t Akuakult ur (JRA), p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534

  • m o rfo me t rik (Se t ijan ingsih

  Taq

  Analisis Dat a

  (UV), sert a dicet ak gambarnya dengan po laro id.

  illuminat or

  digunakan dalam amplifikasi adalah sat u siklus pre- denat urasi pada suhu 94°C selama dua menit. Sebanyak 35 siklus penggandaan yang t erdiri at as 94°C selama sat u menit , 36 C selama sat u menit dan 72°C selama 2,5 menit . Selanjut nya sat u siklus t erakhir pada suhu 72 °C se lam a 1 0 m en it . Hasil am plifikasi kem udian d ip is a h k a n s e c a r a e le k t r o fo r e s is d e n g a n menggunakan gel agaro se 2%-3% dalam bufer Tris-Bo - ric-EDTA (TBE) dan diamat i dengan

  volume keseluruhannya 25 µL. Siklus PCR yang

  DNA” (Pro mega) dengan t o t al

  primer dan “pure

  st rain

  reaksi yang terdiri atas: 10 µg DNA, 10 pmol setiap

  (PCR) d en gan ko m p o sisi

  Polymer ase Chain React ion

  Un t u k m e n d a p a t k an p r im e r yan g m e m p u n yai pro duk amplifikasi yang sesuai dengan DNA ikan kalui d ila k u k a n d e n g a n p e n ye le k s ia n p r im e r. Pengamplifikasian dilakukan menggunakan m et o de

  b e r isi DNA d a n diinkubasikan selama 24 jam pada suhu 37°C unt uk mendigest i RNA yang masih ada dalam larut an DNA (Lia, 2006).

  t ube

  DNA ikan diekst raksi dari po t o ngan sirip dengan me nggu nakan me t o de phenol-chlor ofor m (Nu gro h o , 1997) dan dimurnikan hasilnya dengan penambahan RNa s e d ila ku k a n k e d ala m

  Untuk mengevaluasi variasi DNA antar ras ikan kalui dilakukan dengan menggun akan analisis mo le kuler varians (AMOVA) dan Fst dalam pro gram TFPGA (Miller , 1 99 7 ). Keke rab at an an t ar

  d ian alisis d e ngan menggunakan Jarak Genet ik Nei (Nei, 1972).

  st rain adalah 10 eko r.

  st rain Tambago (0,0203).

  st rain

  ikan kalui di daerah Parung, Bo go r, Jawa Barat yait u

  st rain

  Nilai keragaman hasil penelit ian ini lebih rendah jika dibandingkan dengan beberapa

  st rain Tambago (Tabel 1).

  Persentase polimorfisme berkisar antara 9,67%-41,93%; dengan nilai t ert inggi pada st rain Krist a sedangkan t erendah pada

  Jepun (0,0 594); dan

  HASIL DAN BAHASAN

  st rain

  Krist a (0,1756); kemudian diikut i o leh st rain Merah (0,1735); st rain Palapah (0,1480);

  st rain

  ikan kalui asal Kabupat en Lima Puluh Kot a yang dit elit i mempunyai nilai het ero zigo sit as berkisar ant ara 0,0203 hingga 0,1756; dengan nilai t ert inggi t erdapat pada

  st rain

  Ke r a g a m a n g e n e t ik d it e n t u k a n o le h n ila i het ero zigo sit as dan persent ase po limo rfisme. Secara umum

  Da ri 2 0 p r im e r OPA yan g t e la h d ico b a, t id ak semuanya dapat menunjukkan hasil amplifikasi. Empat primer di an t aranya mempunyai pro duk amplifikasi yait u OPA-2, OPA-4, OPA-6, dan OPA-7. Hal ini sesuai dengan hasil penelit ian Lia (2006). Panjang pit a yang dihasilkan mempunyai ukuran mulai 300 bp hingga 2.000 bp. Salah sat u hasil amplifikasi dengan primer OPA-2 t erlihat pada Gambar 2.

  Am plifikasi DNA

  ik a n k a lu i ya n g digunakan adalah Tambago, Palapah, Krist a, Jepun, dan Me rah (Gambar 1 ). Jum lah sam pel yang digu nakan unt uk set iap

  Co p yright @ 2 016 , Jurnal Riset Akuaku ltu r (JRA), p -ISSN 1 907 -675 4, e-ISSN 250 2-65 34 Evaluasi keragaman genet ik ikan kalui (Osphronemus goramy) dari ..... (Estu Nugroho)

  ., 2 0 0 0 ; Ku sm in i

  Pe n ggu naan m arka DNA d alam an alisis variasi g e n e t ik d a n id e n t ifika si je n is

  ., 2 0 0 7), bio kim ia (So e wardi, 1 99 5 ) d an DNA (Nu gro h o et al ., 2 01 3 ; Nugro ho , 2013).

  et al

  t r uss

  ., 2 0 0 0 ),

  et al

  et al

  m e m p u n ya i kelebih an di ant aranya se nsit ivit as dan keakurat an yang lebih baik dibandingkan met o de iso zyme dalam membant u menget ahui po t ensi-po t ensi genet ik dan m e n g e valu a si

  ., 1995; Su se n o

  et al

  ikan kalu i d i In d o n e sia t e lah d ilaku kan , d i ant aranya analisis morfo met rik (So ewardi

  st r ain

  . (1993). Namun perbedaan mo rfo lo gi belum dapat dideteksi kaitannya secara genet ik dengan menggunakan met ode enzimatis (Nugro ho & Kusmini, 20 07). Se rangkaian kegiat an pen elit ian ide nt ifikasi

  et al

  m o rfo lo gi pada ikan kalu i st r ain yan g lain se p e rt i So ang, Bast ar, dan Blusafir juga t elah didapat kan o leh Nugro ho

  st r ain

  fit ness

  st r ai n

  et al

  Ikan uji yang digunakan dalam penelit ian ini adalah ikan kalui yang berasal dari Kabupaten Lima Puluh Kot a, Su m a t e r a Ba r a t . Ad a p u n

  BAHAN DAN M ETODE Ikan Uji

  ik an ka lu i Tambago , Palapah, Krist a, Jepun, dan Merah dengan menggunakan marka RAPD.

  st r ain

  Pe n e lit ia n in i b e r t u ju a n u n t u k m e n ge va lu a s i ke ra ga m a n se ca ra g e n e t is lim a

  ., 2009) dan ikan gurami Indo nesia (Nugro ho , 2013). Mar ka in i m e ru p akan m ark a d o m in a n d a n d a p at m e n ja r in g ju m la h lo k u s ya n g b a n ya k t a n p a m e m e r lu k a n in fo r m as i a w al s e k u e n s DNA ya n g dianalisis (Theo do rakis & Bickham, 2004).

  ., 2012), ikan mas India (Rahman

  in d ivid u jan g ka p e n d e k d an s in t a s a n s u a t u p o p u la s i u n t u k ja n g k a p a n ja n g (Fe r g u s o n et a l . , 1 9 9 5 ), ya n g m u n g k in d a p a t dimanfaatkan dalam pembuat an jenis

  et al

  ., 2015; Rashid

  et al

  DNA) t elah banyak dit erapkan pada kajian diversitas genetik pada ikan, ant ara lain ikan lele Afrika (Ikpeme

  Random Amplified Polymorphic

  unggul ikan gurami melalui pro gram pemuliaan yang t epat dalam t ahapan berikut nya. Dari sejumlah marka DNA yang digunakan, RAPD (

  st rain

  Bast ar (0,2360); Paris (0,2832); dan Bluesafir (0,3050) yang Co p yright @ 2016 , Jurn al Rise t Akuakult ur (JRA), p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 Jurnal Riset Akuakult ur, 11 (4), 2016, 313-319

  Ke terang an ( Not e ): M= marker 10 0 bp ladder

  Gambar 2. Fragmen hasil amplifikasi PCR-RAPD ikan kalui dengan menggunakan primer OPA-2

  Figure 2. Fragment pat t erns of PCR-RAPD product of kalui fish using primer OPA-2

  Jepun M Merah M Krista Tembago M Palapah Gambar 1.

  St rain

  ikan kalui di Sumat era Barat

  Figure 1. St rain of kalui fish at West Sumat ra

  Strain Tambago Strain Palapah Strain Merah

  Strain Krista Strain Jepun Co p yright @ 2 016 , Jurnal Riset Akuaku ltu r (JRA), p -ISSN 1 907 -675 4, e-ISSN 250 2-65 34 Evaluasi keragaman genet ik ikan kalui (Osphronemus goramy) dari ..... (Estu Nugroho)

  dipero leh Nugro ho (2013) dengan meto de yang sama, s e r t a h a s il d a r i Lia (2 0 0 6 ) ya n g m e n d a p a t k a n keragaman rat a-rat a ikan kalui st rain Bluesafir sebesar 0,31. Rendahnya variasi genet ik beberapa

  Merah be rbe da nyat a (P< 0,05) (Tabel 2). Hal ini menunjukkan bahwa kemungkinan keempat

  ini t idak dijumpai di luar Kabupat en Lima Pulu h Ko t a. Nam un d e mikian fen o me n a ini m asih memerlukan kajian lebih lanjut .

  st rain

  Merah merupakan ikan asli yang berasal dari Kabupat en Lima Puluh Ko t a karena jenis

  st rain

  t ersebut yait u Tambago , Palapah, Jepun, dan Krist a berasal dari nenek mo yang yang sama. Perbedaan yang ada secara feno t ipe yait u berupa warna diduga adalah pengaruh lingkungan. Sement ara ikan kalui

  st rain

  st rain

  st rain

  ikan kalui yang diuji (P> 0,05) pada st rain Tambago , Palapah, Jepun, dan Krist a, sed angkan u nt uk

  st rain

  ) m e n u n ju kk an b ah wa sebagian besar menunjukkan tidak terdapat perbedaan yang nyat a secara genet ik ant ara

  analysis molecular var i ance

  (

  ) (Arifin & Kurniasih, 2007). Se cara st at ist ik d e ngan m e n ggu n akan AMOVA

  Or eochr omis mossambicus

  Hasil p en ghit un gan jarak gen e t ik m e nu rut Ne i (1972), t ert era pada Tabel 3. Jarak genet ik rat a-rat a ant ara

  ikan kalui adalah sekit ar 0,407; dengan nilai t e re ndah t e rd apat an t ara

  et al

  st r a i n

  Str ain ) Param et er

  12 .90 3 5 .4 8 4 1 .9 3 9 .6 7 3 5 .4 8 Ikan kalui (

  0 .0 5 9 4 0 .1 7 35 0 .17 5 6 0 .0 2 0 3 0 .1 4 80 Persen tase po limo r fisme Percent age polymorphisme

  10 1 0 1 0 1 0 1 0 Heter o zig o sitas Heterozygosity

  Ju mlah samp el Number of sample

  Table 1. Genet ic variat ion of kalui fish ( Osphronemus goramy ) Jepun Merah Kri st a Tam bago Palapah

  Ta m b a g o Tabel 1. Variasi genet ik pada beberapa st rain ikan kalui ( Osphronemus goramy )

  Tam bago d an Palap ah me mpu nyai co rak yang serupa, dan yang membedakannya hanya d a r i w a r n a s is ik n ya . Ika n ka lu i

  st rain

  st rain

  Merah (Gambar 3). Berdasarkan hasil pengamatan di lapangan, ikan kalui

  st rain

  Krist a lebih dekat dengan

  Strain

  De n d ro gram yan g d ib e n t u k b e rd asarkan jarak ge net ik t erseb ut me nun jukkan bahwa st rain Jep un m em pu nyai jarak le bih de kat de n gan Palapah dan Tambago .

  Tamb ago dan Palapah. Nilai jarak genet ik pada ikan kalui ini relat if set ara dibandin gkan jarak genet ik ant ara ikan d ari po pulasi yang yang sama, sepert i pada ikan kancra (Nugro ho et al ., 2006).

  ., 2 0 0 7), d an ikan m u jair (

  ) (Mamangkey

  st rain

  st r ain

  ikan kalui lainnya di daerah Pa r u n g , Bo g o r s e b a g a i a k ib a t d a r i p r e fe r e n s i masyarakat yang lebih t inggi dalam penggunaan

  st rain

  Tambago . Sama halnya dengan r e n d a h n ya t in g k a t k e r a g a m a n st r a i n Ba s t a r dibandingkan dua

  st rain

  Jepun sangat ja r a n g s e k a li d ig u n a k a n o le h p e m b e n ih u n t u k p e m b e n ih an d e n g an a lasan p e r t u m b u h an san gat lam b at , u ku r an n ya ke cil d a n t id ak d im in a t i o le h ko n su me n . Be rd asarkan p en gamat an d i lapan gan , h a m p ir s e lu r u h k e g ia t a n b u d id a ya ik a n k a lu i menggunakan

  st rain

  Tam b a go se rin gkali d ig u n aka n o le h p e m b e n ih d a la m p r o s e s p e m ija h a n u n t u k mempro duksi benih. Menurut ket erangan beberapa o rang pembenih ikan di Nagari Mungo , bahwa st rain Tamb ago m eru pakan ind uk yang se rin g digun akan dalam mempro duksi anak ikan kalui karena diminat i oleh konsumen. Lain halnya dengan

  Tambago (0,0203). Hal ini akibat in d u k

  Keragaman genetik ikan kalui yang t ergolo ng cukup rendah ini merupakan gambaran umum variasi genetik yang dit emui pada jenis ikan air t awar sebagai akibat ket erbat asan migrasi secara alami, sepert i misalnya pada ikan garing (

  st rain

  Lebih lanjut dapat dikemukakan bahwa nilai variasi genet ik yang paling rendah di ant ara lima st rain ikan kalui adalah

  ikan kalui ya n g s u d a h b e r la n g s u n g cu k u p la m a d i t in gk a t pemb udidaya ikan dan be lum dilakukan pemuliaan induk.

  st rain-st rain

  ) pada

  inbreeding

  ikan kalui asal Kecamat an Luak Kabupat en Lima Puluh Ko t a disebabkan karena sudah t erjadi pro ses perkawinan silang dalam (

  st rain Bast ar sebagai ko mo dit as budidaya (Nugro ho , 2013).

  Tor sorro

  Glossobius mat anensis

  et al

  ., 2005), ikan but ini (

  et al

  ) (Nugro ho

  M yst us nemurus

  ) be rkisar ant ara 0 ,04 31 -0,15 12 (Syandri et al ., 2015). Hal serupa juga dit emukan pada ikan baung (

  Ost eochilus vit t at us

  ., 2 0 1 1 ), ik a n a s a n g (

  ) b e rkisar an t ara 0 ,2 1 8 6 -0 ,3 6 6 8 (Az r it a

  ) berkisar ant ara 0,0909- 0,1407 (Asih

  Channa lucius

  ., 2 0 1 1 ), ikan b u ju k (

  et al

  ) berkisar ant ara 0,0100-0,1651 (Kusmini

  Ost eochilus kelabau

  ., 2008), ikan kelabau (

  et al

  Parameters

  • ***** Kr ista

  • Tamb ago 0 .0 9 96
  • 0.6 21 4
    • Palap ah 0 .2 9 31
    • Tabel 3. Jarak genet ik ant ar st rain ikan kalui

  Merah

  n s

0 .2 2 8 3

ns

  0.8 67 4 n s

  1 .00 0 ns

  Table 3. Genet ic dist ance among kalui fish Str ain

  Jepun Merah Krist a Tam bago Palapah Jepu n ***** Mer ah

  0 .3 8 36 ***** Kr ista

0 .5 1 31 0 .47 0 3 *****

Tamb ago 0 .4 9 05 0 .47 7 7 0 .3 9 76 ***** Palap ah 0 .4 2 09 0 .41 1 2 0 .3 2 77 0 .18 4 1 *****

  st rain

  Gambar 3. Dendro gram jarak genet ik Nei (1972) ant ar

  ikan kalui

  Figure 3. Dendrogram based on Nei genet ic dist ance of kalui fish

  0.5000 0.4000 0.3000 0.2000

  0.1000 0.0000

  Tambago Palapah

  Jep un Krist a

  n s

  0 .00 2 7

  n s 0 .02 6 6

  ikan kalui yang dit emukan secara sist emat ika (kat ego ri pedigri) t idak merupakan spesies yang berbeda. Namun perbedaan hanya merupakan kategori

  Co p yright @ 2016 , Jurn al Rise t Akuakult ur (JRA), p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 Jurnal Riset Akuakult ur, 11 (4), 2016, 313-319

  mempunyai warna lebih gelap, sedangkan strain Palapah mempunyai warna lebih t e rang dengan warna sisik le bih ke ab u -ab uan . Hasil in i m en u n ju kkan b ah wa k e m u n g k in a n k a w in s ila n g a n t a r

  st r a i n

  ya n g mempunyai peluang t erbaik unt uk menghasilkan benih unggul unt uk kegiat an budidaya adalah ant ara st rain Palapah dengan Merah at au Merah dengan Krist a.

  Dari h asil analisis m o lekule r DNA d an karakt er mo rfo met rik (Azrit a & Syandri, 2015) ikan kalui yang terdapat di pembudidaya di Kabupaten Lima Puluh Ko ta dapat dinyat akan bahwa lima Co p yright @ 2 016 , Jurnal Riset Akuaku ltu r (JRA), p -ISSN 1 907 -675 4, e-ISSN 250 2-65 34 Evaluasi keragaman genet ik ikan kalui (Osphronemus goramy) dari ..... (Estu Nugroho)

  st rain

  strain

  0 .0 0 51 n s

  sebagai berikut yait u st rain Tambago, Palapah, Merah, Jepun, dan Krist a yang merupakan hasil silang perkawinan ant ar

  st rain

  yang dilakukan o leh pembenih ikan. Hal yang sama ju ga t erdapat di wilayah pem benihan ikan kalui di Tabel 2. Hasil uji Fst berpasangan ant ar st rain ikan kalui

  Table 2. Fst pairwise t est of kalui fish Str ain

  Jepun Merah Krist a Tam bago Pal apah Jepu n ***** Mer ah

  0 .1 0 58 n s

  • strain

  Pro vin si Jawa Barat yang t erdiri at as st rain So an g, Jepang, Paris, Bast ar, dan Po rselen (Suseno

  Skrip si. Un iversit as Pen did ikan Indo n esia (UPI). Bandung. Maman gkey J.J., Sulist io no , Sjafei, D.S., So ed arm a,

  (Burchell, 1822) using random amplified po lym o rph ism DNA (RAPD) finge rprint ing t ech- nique.

  Asian Journal of Animal Science

  , 9(5), 187- 197. Ku s m in i, I.I,, Gu st ia n o , R., & Mu lyas a ri. (2 0 1 1 ).

  Karakt e risasi ge n et ik ikan ke lab au (

  Ost eochilus kelabau

  ) dari berbagai lo kasi di Kalimant an Barat mengunakan met o de RAPD. (Rando m Am plified Polymorphism DNA).

  Berita Biologi , 10(4), 449-454.

  Kusmini, I.I., Hadie, L.E., Hadie, W., & Krist ant o , A.H.

  (2 0 0 0 ). Karakt e risasi d alam karakt e r fe n o t ip e beberapa ras ikan gurame (

  Osphoronemus gouramy

  ) yang berpo t ensi dalam budidaya dengan analisis t russ mo rfo met rik.

  Simposium Nasional Pengelolaan Plasma Nut fah

  . Ko m isi Nasio nal Plasma Nu t fah. Bo go r, hlm. 614-620. Lia, E. (2 0 06 ).

  Analisa keanekar agman genet ik ikan g ur am e (Osphronem us goura m y Lac.) var i et as Bl uesaf i r d eng an m eng g unakan m et ode RAPD .

  D., Sukimin, S., & Nugro ho , E. (2007). Keragaman g e n e t ik ik a n e n d e m ik Bu t in i (

  (2015). Unveiling t he genet ic diversit y in

  Gl ossog obi u s mat anensis ) berdasarkan penanda Rando m Ampli-

  fied Po lymo rphism DNA(RAPD) di Danau To wut i, Sulawesi Selat an.

  J. Ris. Akuakult ur , 2(3), 389-397.

  Miller, M.P. (1997). To o ls fo r po pulat io n genet ic analy- sis (TFPGA) (ve rsio n 1 .3 ). A Wind o ws Pro gram fo r t he Analysis o f Allo zyme and Mo lecular Po pu- lat io n Genet ic Dat a. Depart ment o f Bio lo gical Sci- ences, No rt hern Arizo na Universit y, Flagst aff, AZ. Nei, M. (19 72 ). Gen et ic d ist ance be t wee n po pu la- t io ns.

  American Nat ure , 106, 283-292.

  Nugro ho , E., Sat yani, D., & Rusmaedi. (1993). Evaluasi po t ensi genet ik dari beberapa ras gurame. Bulle-

  t in Penelit ian Perikanan Darat , 12(1), 30-36.

  Nugro ho , E. (1997). Pract ical manual o n det ect io n o f DNA Po lymo rphism in fish po pulat io n st udy.

  Bul- let in of M arine Science and Fisheries

  , 17, 109-129. Nugro ho , E., Hadie, W., Su bagja, J., & Kurniasih, T.

  (2005). Variasi genet ik dan mo rfo met rik pada ikan baung (

  M yst us nemurus

  ) dari Jambi, Wo no giri dan Jat iluhur. J. Pen. Perik. Indonesia , 11(7), 1-6. Nu gro h o , E., Su b agja, J., Asih , S., & Ku rn iasih , T.

  (2006). Evaluasi keragaman genet ik ikan kancra dengan menggunakan marker mt DNA D-lo o p dan Rando m Amplified Po lymo rphism DNA (RAPD).

  Clarias gariepinus

  Ikp em e, E.V., Ud en si, O.U., Ekalu o , U.B., Ko o ffreh , M.E., Oko lo , C.M., Ekpo , P.B., & Ogb o nna, N.C.

  et al

  DAFTAR ACUAN

  ., 2000; Sudart o , 1989). Menurut Nugroho (2013), bahwa pada p e n gu jian variasi ge n e t ik st r ain Bast ar, Bu le , d an Bluesafir yang diko leksi dari daerah Parung, Jawa Barat menunjukkan bahwa t idak t erdapat perbedaan yang nyat a di ant ara ket iga

  st rain t ersebut .

  Pe r b e d a a n ya n g n ya t a s e ca r a g e n e t ik h a n ya t e r d ap a t a n t a r a

  st r ain

  ik a n k a lu i Me ra h d e n ga n Tambago dan Krist a. Terdapat variasi genet ik dari lima

  st rain

  ikan kalui. Variasi genet ik t ertinggi diamat i pada ikan kalui

  st r ain

  Krist a d en gan n ilai h e t e ro ge nit as 0,1756 kemudian diikut i o leh

  st rain

  Merah (0,1735); Pala p a h (0 ,1 4 8 0 ); Je p u n (0 ,0 5 9 4 ); d a n Tam b ag o (0 ,02 03 ). Jarak rat a-rat a Nei ge net ik adalah 0 ,40 7; d en gan nilai t e ren d ah yan g t e ram at i an t ara

  st rain Tambago dan Palapah.

  UCAPAN TERIM A KASIH

  Penulis mengucapkan t erima kasih kepada Dinas Perikanan Kabupat en Lima Puluh Ko t a, Sumatera Barat dan Balai Penelit ian dan Pengembangan Budidaya Air Tawar, Bo go r at as t erlaksananya kegiat an ini. Terima kasih juga disampaikan kepada Sri Sundari (BPPBAT) at as bant uan dalam pelaksanaan analisis.

  Ano nim. (2002). Budidaya ikan gurami (

  nal of Fish Biology , 47, 103-126.

  Osphronemus g our am y

  ). Wa n r it e k . Te k n o lo g i Te p a t Gu n a . Ment eri Negara Riset dan Tekno lo gi. Arifin , O.Z., & Kurn iasih, T. (20 07). Variasi gen et ik t iga p o p u las i ika n n ila ( Or eochr omi s ni lot i cus ) b e r d a s a r k a n p o lim o r fis m e m t -DNA.

  J. Ri s. Akuakult ur , 2(1), 67-75.

  Asih, S., Nu gro ho , E., Krist ant o , A.H., & Mulyasari.

  (2008). Penent uan variasi genet ik ikan bat ak (

  Tor sorro

  ) dari Sumat era Ut ara dan Jawa Barat dengan met o de RAPD. J. Ris. Akuakult ur , 3(1), 91-97. Azrit a, Syandri, H., Nugro ho, E., Dahelmi, & Syaifullah.

  (2011). Variasi genet ik ikan bujuk ( Channa lucius ) berdasarkan RAPD dari Sumat era Barat , Jambi dan Riau.

  Berit a Biologi , 10(5), 675-680.

  Azrit a, & Syandri, H. (2015). Mo rpho lo gical charact er a m o n g five s t r a in s o f g ia n t g o u r a m i,

  Osphronemuous gorami

  Lac 1801. Using a t russ mor- pho met ric syst em. Int ernat ional Journal of Fisher-

  ies and Aquat ic St udies , 6(2), 344-350.

  Fe rguso n , A.J., Taggart , B., Pro d o h l, P.A., Mc.Mee l, O., Th o m p so n , C., St o n e , C., McGin n it y, P., & Hynes, R.A. (1995). The applicat io n o f mo lecular markers t o t he st u dy an d co nser vat io n o f fish po pulat io n, wit h special reference t o Salmo . Jour-

  J. Ris. Akuakult ur , 1(2), 211-217. Co p yright @ 2016 , Jurn al Rise t Akuakult ur (JRA), p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 Jurnal Riset Akuakult ur, 11 (4), 2016, 313-319

  Nugro ho , E., & Kusmini, I.I. (2007). Evaluasi variasi g e n e t ik t ig a r as ik a n g u r a m e (

  War t a Penel i t i an dan Peng em bang an Pert anian

   Jurnal Ilmu-Ilmu Perairan dan Perikanan Indonesia

  , 3(2), 23-31. So ewardi, K, Rachmawat i, R., Affandi, R., & Bengen,

  D.G. (1 99 5). Pe ne lu su ran varie t as ikan guram e

  Osp h or on em u s g ou r a m y La c b e r d a s a r k a n penampilan karakt er luar.

  Jurnal Ilmu Ilmu Perairan dan Perikanan Indonesia

  , 3(2), 31-35. Su dart o . (1 98 9). Po rse lin, Blue safir d an Paris yang b e rt e lu r.

  , 11(2), 1-2. Su se no , D., Ru sm aed i, Ku sm ini, I.I., Dharma, L., &

  Osphorenemus gouramy

  Arifin, O.Z. (2000). Karakt erisasi mo rfo lo gi ikan gurame st rain Soang dan Paris.

  Simposium Nasional Pengelolaan Pemuliaan dan Plasma Nut fah

  . Bo go r , hlm. 589-595. Syandri, H., Elfiandri, Azrit a, & Junaidi. (2015). So cial

  St at us o f t he Fish-farmers o f Flo at ing-net -cages in Lake Maninjau, Indo nesia.

  Journal Aquacult ure Research Development

  , 7, 1-6. Theo do rakis, C.W., & Bickham, J.W. (2004). Mo lecu- lar ch aract erizat io n o f co n t am in ant -in d icat ive

  Lac dengan met ode bio kimia.

  23-30. So e w ar d i, K. (1 9 9 5 ). Kar a kt e ris as i p o p u as i ika n gurame

  Osphor enem us g ou r a m y

  (2 00 9). Ge ne t ic variat io n o f wild an d hat che r y po pulat io ns o f t he cat la Indian majo r carp ( Cat la

  ) d e n g a n m e t o d e is o z ym e .

  J. Ri s. Akuakult ur , 2(2), 51-57.

  Nu g ro h o , E. (2 0 1 3 ). Ge n e t ic va riab ilit y o f gian t gouramy strain revealed by rando m amplified po ly- m o rp hism DNA. Indonesian Aquacult ur e Jour nal , 8(1), 107-111. Nugro ho , E., Rahayun i, E., & Hamid , M.A. (2 0 1 3).

  Gurame Bat an g Hari, benarkah st rain berbeda?: suat u kajian genet ik dengan menggunakan marker DNA.

  M edia Akuakult ur , 8(1), 9-12.

  Rahman, S.M.Z., Khan, M.R., Islam, S., & Alam, M.S.

  cat la

  Ka r a k t e r is a s i t ig a s t r a in ik a n g u r a m e ( Osphoronemus gouramy ) berdasarkan meto de truss m o r fo m e t r ik . Jur nal I kt i ol og i I ndonesi a , 7 (1 ),

  Hamilt o n 1822: Cyprinifo rmes, Cyprinidae) revealed by RAPD markers.

  Genet ic and M olecular Biology

  , 32, 197-201. Rashid , J., Tamanna, F.M., Ho ssain, M.A.R., & Alam,

  Md.S. (2012). Genet ic variat io n in endagered but - t er cat fish, ( Ompok bimaculat us Blo ch) po pulat io n revealed by rando m amplified po lymo rphism DNA (RAPD) fingerprint ing.

  Int ernat ional Journal of Bio- sciences , 2(9), 85-93.

  Set ijaningsih, L., Arifin, O.Z., & Gust iano , R. (2007).

  RAPD markers. Ecot oxicology , 13, 303-309.

Dokumen yang terkait

Dokumen baru