BAHAN DAN METODE Ikan Uji
Jurnal Riset Akuakult ur, 11 (4), 2016, 313-319
Tersedia online di: ht t p://ej ournal-balit bang.kkp.go.id/index.php/j ra
EVALUASI KERAGAM AN GENETIK IKAN KALUI ( )
Osphronemus goramy
DARI KABUPATEN LIM A PULUH KOTA, SUM ATERA BARAT BERDASARKAN
M ARKA RANDOM AM PLIFIED POLYM ORPHISM DNA (RAPD)
- *)# **) **) ***)
Estu Nugroho , Azrita , Hafrizal Syandri , dan Refilza
*) **)Pu sat Pene litian dan Pe ngem bangan Pe rikanan
Fakult as Perikanan , Un iversitas Bun g Hatta, Pad ang, Sum atera Barat
***)Dinas Perikanan, Kabup aten Lima Puluh Kota, Sum atera Barat
ABSTRAK
Ikan kalui merupakan nama lokal dari ikan gurami di Kabupaten Lima Puluh Kota, Sumatera Barat termasuk
jenis ikan ekonomis tinggi. Terdapat lima st rain ikan kalui yang tersebar di pembudidaya, yaitu Tambago,
Palapah, Krista, Jepun, dan Merah. Penelitian ini dilakukan untuk mengamati keragaman genetik st rain ikan
kalui atau gurami dengan menggunakan penanda RAPD. Sebanyak 50 sampel DNA ikan kalui diekstraksi
dari sirip dan diamplifikasi secara random dengan menggunakan empat primer terbaik dari 20 primer OPA
yaitu OPA-02, OPA-04, OPA-06, d an OPA-07. Hasil me nu njukkan bah wa p erbe daan yang n yata secara
genetik hanya terdapat antara st rain ikan kalui Merah dengan Tambago dan Krista. Variasi genetik tertinggi
diamati pada ikan kalui st rain Krista dengan nilai heterogenitas 0,1756 kemudian diikuti berturut-turut
oleh st rain Merah (0,1735), Palapah (0,1480), Jep un (0,0594), dan Tambago (0,0203). Jarak rata-rat a Nei
genetik adalah 0,407; dengan nilai terendah yang teramati antara st rain Tambago dan Palapah.KATA KUNCI: kalui; RAPD; keragaman genetik ABSTRACT: Evaluation of genetic divergence of kalui fish (
Osphronemus goramy) strains from West Sumatra revealed by random amplified polymorphism DNA (RAPD) marker. By. Estu Nugroho, Azrita, Hafrizal Syandri, and Refilza
Kalui is a local name of giant gouramy fish in West Sumat era Province t hat cat egorized as an high economically fish.
Five st rains of Kalui are dist ribut ed t o farmers i.e. Tambago, Palapah, Krist a, Jepun, and M erah. This research was
conduct ed t o obser ve t he genet ic variat ion of Kalui st rains using RAPD marker. A t otal of 50 samples of whole DNA was
extracted from Kalui-giant gouramy finclip and randomly amplified using four of t he best 20 primers (OPA i.e. OPA-02,
OPA-04, OPA-06, and OPA-07). The result s showed t hat Significant genet ic differences were only obser ved bet ween
st rain M erah-Tambago and M erah-Krist a. The highest variabilit y was obser ved in Krist a wit h het erogeneit y value of
0.1735 followed by M erah (0.1735), Palapah (0.1480), Jepun (0.0594), and Tambago (0.0203). The average Nei
genet ic dist ance was 0.407, wit h t he lowest was obser ved bet ween Tambago and Palapah.KEYW ORDS: kalui; genetic variation; RAPD
PENDAHULUAN Kalimant an Selat an. Ikan ini dikenal dengan nama lokal
ikan kalui di daerah Sumat era Barat (Ano nim, 2002).Osphronemus goramy
Ikan gurami ( ) merupakan salah
st rain
sat u je nis ko m o d it as ikan air t awar yan g b e rn ilai Be b e rap a ikan kalu i yan g ad a di d ae rah eko n o mis t inggi di In do nesia. Pen ye baran ikan ini Ka b u p a t e n Lim a Pu lu h Ko t a , Su m a t e r a Ba r a t , m e lip u t i d ae rah yang cu ku p luas yait u m ulai dari khususnya di Kecamat an Luak, Larek Sago Halaban, Su m at e ra Bara t , Ja m b i, Jawa Barat , Jawa Te n g ah , dan Suliki adalah Tambago , Palapah, Krist a, Jepun, dan Jo gjakart a, Jawa Timur, sert a Kalim ant an Barat dan Merah. Berdasarkan mo rfo lo gi dengan menggunakan
t r uss
t eknik -mo rfo m e t rik (Azrit a & Syan dri, 2 0 15 ) #
st rain-st rain
t elah mengelo mpo kkan t ersebut menjadi
Ko re sp o nd e n si: Pusat Pe n e lit ian d an Pe n g em b an gan Pe r ikan an
t iga kelo mpo k besar yait u kalui Merah, kalui Krist a,
Ge d un g Balit b an g KP II, Jl. Pasir Pu t ih II, An co l Tim u r 1 44 3 0 , Jakar t a, In d o n e sia. Te l. + (0 2 1 ) 6 4 7 0 0 9 2 8
d a n k a lu i Pa la p a h -Ta m b a g o -Je p u n . Pe r b e d a a n
engr oho@ yahoo.com E-m ail: Co p yright @ 2016 , Jurn al Rise t Akuakult ur (JRA), p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534
- m o rfo me t rik (Se t ijan ingsih
Taq
Analisis Dat a
(UV), sert a dicet ak gambarnya dengan po laro id.
illuminat or
digunakan dalam amplifikasi adalah sat u siklus pre- denat urasi pada suhu 94°C selama dua menit. Sebanyak 35 siklus penggandaan yang t erdiri at as 94°C selama sat u menit , 36 C selama sat u menit dan 72°C selama 2,5 menit . Selanjut nya sat u siklus t erakhir pada suhu 72 °C se lam a 1 0 m en it . Hasil am plifikasi kem udian d ip is a h k a n s e c a r a e le k t r o fo r e s is d e n g a n menggunakan gel agaro se 2%-3% dalam bufer Tris-Bo - ric-EDTA (TBE) dan diamat i dengan
volume keseluruhannya 25 µL. Siklus PCR yang
DNA” (Pro mega) dengan t o t al
primer dan “pure
st rain
reaksi yang terdiri atas: 10 µg DNA, 10 pmol setiap
(PCR) d en gan ko m p o sisi
Polymer ase Chain React ion
Un t u k m e n d a p a t k an p r im e r yan g m e m p u n yai pro duk amplifikasi yang sesuai dengan DNA ikan kalui d ila k u k a n d e n g a n p e n ye le k s ia n p r im e r. Pengamplifikasian dilakukan menggunakan m et o de
b e r isi DNA d a n diinkubasikan selama 24 jam pada suhu 37°C unt uk mendigest i RNA yang masih ada dalam larut an DNA (Lia, 2006).
t ube
DNA ikan diekst raksi dari po t o ngan sirip dengan me nggu nakan me t o de phenol-chlor ofor m (Nu gro h o , 1997) dan dimurnikan hasilnya dengan penambahan RNa s e d ila ku k a n k e d ala m
Untuk mengevaluasi variasi DNA antar ras ikan kalui dilakukan dengan menggun akan analisis mo le kuler varians (AMOVA) dan Fst dalam pro gram TFPGA (Miller , 1 99 7 ). Keke rab at an an t ar
d ian alisis d e ngan menggunakan Jarak Genet ik Nei (Nei, 1972).
st rain adalah 10 eko r.
st rain Tambago (0,0203).
st rain
ikan kalui di daerah Parung, Bo go r, Jawa Barat yait u
st rain
Nilai keragaman hasil penelit ian ini lebih rendah jika dibandingkan dengan beberapa
st rain Tambago (Tabel 1).
Persentase polimorfisme berkisar antara 9,67%-41,93%; dengan nilai t ert inggi pada st rain Krist a sedangkan t erendah pada
Jepun (0,0 594); dan
HASIL DAN BAHASAN
st rain
Krist a (0,1756); kemudian diikut i o leh st rain Merah (0,1735); st rain Palapah (0,1480);
st rain
ikan kalui asal Kabupat en Lima Puluh Kot a yang dit elit i mempunyai nilai het ero zigo sit as berkisar ant ara 0,0203 hingga 0,1756; dengan nilai t ert inggi t erdapat pada
st rain
Ke r a g a m a n g e n e t ik d it e n t u k a n o le h n ila i het ero zigo sit as dan persent ase po limo rfisme. Secara umum
Da ri 2 0 p r im e r OPA yan g t e la h d ico b a, t id ak semuanya dapat menunjukkan hasil amplifikasi. Empat primer di an t aranya mempunyai pro duk amplifikasi yait u OPA-2, OPA-4, OPA-6, dan OPA-7. Hal ini sesuai dengan hasil penelit ian Lia (2006). Panjang pit a yang dihasilkan mempunyai ukuran mulai 300 bp hingga 2.000 bp. Salah sat u hasil amplifikasi dengan primer OPA-2 t erlihat pada Gambar 2.
Am plifikasi DNA
ik a n k a lu i ya n g digunakan adalah Tambago, Palapah, Krist a, Jepun, dan Me rah (Gambar 1 ). Jum lah sam pel yang digu nakan unt uk set iap
Co p yright @ 2 016 , Jurnal Riset Akuaku ltu r (JRA), p -ISSN 1 907 -675 4, e-ISSN 250 2-65 34 Evaluasi keragaman genet ik ikan kalui (Osphronemus goramy) dari ..... (Estu Nugroho)
., 2 0 0 0 ; Ku sm in i
Pe n ggu naan m arka DNA d alam an alisis variasi g e n e t ik d a n id e n t ifika si je n is
., 2 0 0 7), bio kim ia (So e wardi, 1 99 5 ) d an DNA (Nu gro h o et al ., 2 01 3 ; Nugro ho , 2013).
et al
t r uss
., 2 0 0 0 ),
et al
et al
m e m p u n ya i kelebih an di ant aranya se nsit ivit as dan keakurat an yang lebih baik dibandingkan met o de iso zyme dalam membant u menget ahui po t ensi-po t ensi genet ik dan m e n g e valu a si
., 1995; Su se n o
et al
ikan kalu i d i In d o n e sia t e lah d ilaku kan , d i ant aranya analisis morfo met rik (So ewardi
st r ain
. (1993). Namun perbedaan mo rfo lo gi belum dapat dideteksi kaitannya secara genet ik dengan menggunakan met ode enzimatis (Nugro ho & Kusmini, 20 07). Se rangkaian kegiat an pen elit ian ide nt ifikasi
et al
m o rfo lo gi pada ikan kalu i st r ain yan g lain se p e rt i So ang, Bast ar, dan Blusafir juga t elah didapat kan o leh Nugro ho
st r ain
fit ness
st r ai n
et al
Ikan uji yang digunakan dalam penelit ian ini adalah ikan kalui yang berasal dari Kabupaten Lima Puluh Kot a, Su m a t e r a Ba r a t . Ad a p u n
BAHAN DAN M ETODE Ikan Uji
ik an ka lu i Tambago , Palapah, Krist a, Jepun, dan Merah dengan menggunakan marka RAPD.
st r ain
Pe n e lit ia n in i b e r t u ju a n u n t u k m e n ge va lu a s i ke ra ga m a n se ca ra g e n e t is lim a
., 2009) dan ikan gurami Indo nesia (Nugro ho , 2013). Mar ka in i m e ru p akan m ark a d o m in a n d a n d a p at m e n ja r in g ju m la h lo k u s ya n g b a n ya k t a n p a m e m e r lu k a n in fo r m as i a w al s e k u e n s DNA ya n g dianalisis (Theo do rakis & Bickham, 2004).
., 2012), ikan mas India (Rahman
in d ivid u jan g ka p e n d e k d an s in t a s a n s u a t u p o p u la s i u n t u k ja n g k a p a n ja n g (Fe r g u s o n et a l . , 1 9 9 5 ), ya n g m u n g k in d a p a t dimanfaatkan dalam pembuat an jenis
et al
., 2015; Rashid
et al
DNA) t elah banyak dit erapkan pada kajian diversitas genetik pada ikan, ant ara lain ikan lele Afrika (Ikpeme
Random Amplified Polymorphic
unggul ikan gurami melalui pro gram pemuliaan yang t epat dalam t ahapan berikut nya. Dari sejumlah marka DNA yang digunakan, RAPD (
st rain
Bast ar (0,2360); Paris (0,2832); dan Bluesafir (0,3050) yang Co p yright @ 2016 , Jurn al Rise t Akuakult ur (JRA), p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 Jurnal Riset Akuakult ur, 11 (4), 2016, 313-319
Ke terang an ( Not e ): M= marker 10 0 bp ladder
Gambar 2. Fragmen hasil amplifikasi PCR-RAPD ikan kalui dengan menggunakan primer OPA-2
Figure 2. Fragment pat t erns of PCR-RAPD product of kalui fish using primer OPA-2
Jepun M Merah M Krista Tembago M Palapah Gambar 1.
St rain
ikan kalui di Sumat era Barat
Figure 1. St rain of kalui fish at West Sumat ra
Strain Tambago Strain Palapah Strain Merah
Strain Krista Strain Jepun Co p yright @ 2 016 , Jurnal Riset Akuaku ltu r (JRA), p -ISSN 1 907 -675 4, e-ISSN 250 2-65 34 Evaluasi keragaman genet ik ikan kalui (Osphronemus goramy) dari ..... (Estu Nugroho)
dipero leh Nugro ho (2013) dengan meto de yang sama, s e r t a h a s il d a r i Lia (2 0 0 6 ) ya n g m e n d a p a t k a n keragaman rat a-rat a ikan kalui st rain Bluesafir sebesar 0,31. Rendahnya variasi genet ik beberapa
Merah be rbe da nyat a (P< 0,05) (Tabel 2). Hal ini menunjukkan bahwa kemungkinan keempat
ini t idak dijumpai di luar Kabupat en Lima Pulu h Ko t a. Nam un d e mikian fen o me n a ini m asih memerlukan kajian lebih lanjut .
st rain
Merah merupakan ikan asli yang berasal dari Kabupat en Lima Puluh Ko t a karena jenis
st rain
t ersebut yait u Tambago , Palapah, Jepun, dan Krist a berasal dari nenek mo yang yang sama. Perbedaan yang ada secara feno t ipe yait u berupa warna diduga adalah pengaruh lingkungan. Sement ara ikan kalui
st rain
st rain
st rain
ikan kalui yang diuji (P> 0,05) pada st rain Tambago , Palapah, Jepun, dan Krist a, sed angkan u nt uk
st rain
) m e n u n ju kk an b ah wa sebagian besar menunjukkan tidak terdapat perbedaan yang nyat a secara genet ik ant ara
analysis molecular var i ance
(
) (Arifin & Kurniasih, 2007). Se cara st at ist ik d e ngan m e n ggu n akan AMOVA
Or eochr omis mossambicus
Hasil p en ghit un gan jarak gen e t ik m e nu rut Ne i (1972), t ert era pada Tabel 3. Jarak genet ik rat a-rat a ant ara
ikan kalui adalah sekit ar 0,407; dengan nilai t e re ndah t e rd apat an t ara
et al
st r a i n
Str ain ) Param et er
12 .90 3 5 .4 8 4 1 .9 3 9 .6 7 3 5 .4 8 Ikan kalui (
0 .0 5 9 4 0 .1 7 35 0 .17 5 6 0 .0 2 0 3 0 .1 4 80 Persen tase po limo r fisme Percent age polymorphisme
10 1 0 1 0 1 0 1 0 Heter o zig o sitas Heterozygosity
Ju mlah samp el Number of sample
Table 1. Genet ic variat ion of kalui fish ( Osphronemus goramy ) Jepun Merah Kri st a Tam bago Palapah
Ta m b a g o Tabel 1. Variasi genet ik pada beberapa st rain ikan kalui ( Osphronemus goramy )
Tam bago d an Palap ah me mpu nyai co rak yang serupa, dan yang membedakannya hanya d a r i w a r n a s is ik n ya . Ika n ka lu i
st rain
st rain
Merah (Gambar 3). Berdasarkan hasil pengamatan di lapangan, ikan kalui
st rain
Krist a lebih dekat dengan
Strain
De n d ro gram yan g d ib e n t u k b e rd asarkan jarak ge net ik t erseb ut me nun jukkan bahwa st rain Jep un m em pu nyai jarak le bih de kat de n gan Palapah dan Tambago .
Tamb ago dan Palapah. Nilai jarak genet ik pada ikan kalui ini relat if set ara dibandin gkan jarak genet ik ant ara ikan d ari po pulasi yang yang sama, sepert i pada ikan kancra (Nugro ho et al ., 2006).
., 2 0 0 7), d an ikan m u jair (
) (Mamangkey
st rain
st r ain
ikan kalui lainnya di daerah Pa r u n g , Bo g o r s e b a g a i a k ib a t d a r i p r e fe r e n s i masyarakat yang lebih t inggi dalam penggunaan
st rain
Tambago . Sama halnya dengan r e n d a h n ya t in g k a t k e r a g a m a n st r a i n Ba s t a r dibandingkan dua
st rain
Jepun sangat ja r a n g s e k a li d ig u n a k a n o le h p e m b e n ih u n t u k p e m b e n ih an d e n g an a lasan p e r t u m b u h an san gat lam b at , u ku r an n ya ke cil d a n t id ak d im in a t i o le h ko n su me n . Be rd asarkan p en gamat an d i lapan gan , h a m p ir s e lu r u h k e g ia t a n b u d id a ya ik a n k a lu i menggunakan
st rain
Tam b a go se rin gkali d ig u n aka n o le h p e m b e n ih d a la m p r o s e s p e m ija h a n u n t u k mempro duksi benih. Menurut ket erangan beberapa o rang pembenih ikan di Nagari Mungo , bahwa st rain Tamb ago m eru pakan ind uk yang se rin g digun akan dalam mempro duksi anak ikan kalui karena diminat i oleh konsumen. Lain halnya dengan
Tambago (0,0203). Hal ini akibat in d u k
Keragaman genetik ikan kalui yang t ergolo ng cukup rendah ini merupakan gambaran umum variasi genetik yang dit emui pada jenis ikan air t awar sebagai akibat ket erbat asan migrasi secara alami, sepert i misalnya pada ikan garing (
st rain
Lebih lanjut dapat dikemukakan bahwa nilai variasi genet ik yang paling rendah di ant ara lima st rain ikan kalui adalah
ikan kalui ya n g s u d a h b e r la n g s u n g cu k u p la m a d i t in gk a t pemb udidaya ikan dan be lum dilakukan pemuliaan induk.
st rain-st rain
) pada
inbreeding
ikan kalui asal Kecamat an Luak Kabupat en Lima Puluh Ko t a disebabkan karena sudah t erjadi pro ses perkawinan silang dalam (
st rain Bast ar sebagai ko mo dit as budidaya (Nugro ho , 2013).
Tor sorro
Glossobius mat anensis
et al
., 2005), ikan but ini (
et al
) (Nugro ho
M yst us nemurus
) be rkisar ant ara 0 ,04 31 -0,15 12 (Syandri et al ., 2015). Hal serupa juga dit emukan pada ikan baung (
Ost eochilus vit t at us
., 2 0 1 1 ), ik a n a s a n g (
) b e rkisar an t ara 0 ,2 1 8 6 -0 ,3 6 6 8 (Az r it a
) berkisar ant ara 0,0909- 0,1407 (Asih
Channa lucius
., 2 0 1 1 ), ikan b u ju k (
et al
) berkisar ant ara 0,0100-0,1651 (Kusmini
Ost eochilus kelabau
., 2008), ikan kelabau (
et al
Parameters
- ***** Kr ista
- Tamb ago 0 .0 9 96
- 0.6 21 4
- Palap ah 0 .2 9 31
- Tabel 3. Jarak genet ik ant ar st rain ikan kalui
Merah
n s
0 .2 2 8 3
ns0.8 67 4 n s
1 .00 0 ns
Table 3. Genet ic dist ance among kalui fish Str ain
Jepun Merah Krist a Tam bago Palapah Jepu n ***** Mer ah
0 .3 8 36 ***** Kr ista
0 .5 1 31 0 .47 0 3 *****
Tamb ago 0 .4 9 05 0 .47 7 7 0 .3 9 76 ***** Palap ah 0 .4 2 09 0 .41 1 2 0 .3 2 77 0 .18 4 1 *****st rain
Gambar 3. Dendro gram jarak genet ik Nei (1972) ant ar
ikan kalui
Figure 3. Dendrogram based on Nei genet ic dist ance of kalui fish
0.5000 0.4000 0.3000 0.2000
0.1000 0.0000
Tambago Palapah
Jep un Krist a
n s
0 .00 2 7
n s 0 .02 6 6
ikan kalui yang dit emukan secara sist emat ika (kat ego ri pedigri) t idak merupakan spesies yang berbeda. Namun perbedaan hanya merupakan kategori
Co p yright @ 2016 , Jurn al Rise t Akuakult ur (JRA), p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 Jurnal Riset Akuakult ur, 11 (4), 2016, 313-319
mempunyai warna lebih gelap, sedangkan strain Palapah mempunyai warna lebih t e rang dengan warna sisik le bih ke ab u -ab uan . Hasil in i m en u n ju kkan b ah wa k e m u n g k in a n k a w in s ila n g a n t a r
st r a i n
ya n g mempunyai peluang t erbaik unt uk menghasilkan benih unggul unt uk kegiat an budidaya adalah ant ara st rain Palapah dengan Merah at au Merah dengan Krist a.
Dari h asil analisis m o lekule r DNA d an karakt er mo rfo met rik (Azrit a & Syandri, 2015) ikan kalui yang terdapat di pembudidaya di Kabupaten Lima Puluh Ko ta dapat dinyat akan bahwa lima Co p yright @ 2 016 , Jurnal Riset Akuaku ltu r (JRA), p -ISSN 1 907 -675 4, e-ISSN 250 2-65 34 Evaluasi keragaman genet ik ikan kalui (Osphronemus goramy) dari ..... (Estu Nugroho)
st rain
strain
0 .0 0 51 n s
sebagai berikut yait u st rain Tambago, Palapah, Merah, Jepun, dan Krist a yang merupakan hasil silang perkawinan ant ar
st rain
yang dilakukan o leh pembenih ikan. Hal yang sama ju ga t erdapat di wilayah pem benihan ikan kalui di Tabel 2. Hasil uji Fst berpasangan ant ar st rain ikan kalui
Table 2. Fst pairwise t est of kalui fish Str ain
Jepun Merah Krist a Tam bago Pal apah Jepu n ***** Mer ah
0 .1 0 58 n s
- strain
Pro vin si Jawa Barat yang t erdiri at as st rain So an g, Jepang, Paris, Bast ar, dan Po rselen (Suseno
Skrip si. Un iversit as Pen did ikan Indo n esia (UPI). Bandung. Maman gkey J.J., Sulist io no , Sjafei, D.S., So ed arm a,
(Burchell, 1822) using random amplified po lym o rph ism DNA (RAPD) finge rprint ing t ech- nique.
Asian Journal of Animal Science
, 9(5), 187- 197. Ku s m in i, I.I,, Gu st ia n o , R., & Mu lyas a ri. (2 0 1 1 ).
Karakt e risasi ge n et ik ikan ke lab au (
Ost eochilus kelabau
) dari berbagai lo kasi di Kalimant an Barat mengunakan met o de RAPD. (Rando m Am plified Polymorphism DNA).
Berita Biologi , 10(4), 449-454.
Kusmini, I.I., Hadie, L.E., Hadie, W., & Krist ant o , A.H.
(2 0 0 0 ). Karakt e risasi d alam karakt e r fe n o t ip e beberapa ras ikan gurame (
Osphoronemus gouramy
) yang berpo t ensi dalam budidaya dengan analisis t russ mo rfo met rik.
Simposium Nasional Pengelolaan Plasma Nut fah
. Ko m isi Nasio nal Plasma Nu t fah. Bo go r, hlm. 614-620. Lia, E. (2 0 06 ).
Analisa keanekar agman genet ik ikan g ur am e (Osphronem us goura m y Lac.) var i et as Bl uesaf i r d eng an m eng g unakan m et ode RAPD .
D., Sukimin, S., & Nugro ho , E. (2007). Keragaman g e n e t ik ik a n e n d e m ik Bu t in i (
(2015). Unveiling t he genet ic diversit y in
Gl ossog obi u s mat anensis ) berdasarkan penanda Rando m Ampli-
fied Po lymo rphism DNA(RAPD) di Danau To wut i, Sulawesi Selat an.
J. Ris. Akuakult ur , 2(3), 389-397.
Miller, M.P. (1997). To o ls fo r po pulat io n genet ic analy- sis (TFPGA) (ve rsio n 1 .3 ). A Wind o ws Pro gram fo r t he Analysis o f Allo zyme and Mo lecular Po pu- lat io n Genet ic Dat a. Depart ment o f Bio lo gical Sci- ences, No rt hern Arizo na Universit y, Flagst aff, AZ. Nei, M. (19 72 ). Gen et ic d ist ance be t wee n po pu la- t io ns.
American Nat ure , 106, 283-292.
Nugro ho , E., Sat yani, D., & Rusmaedi. (1993). Evaluasi po t ensi genet ik dari beberapa ras gurame. Bulle-
t in Penelit ian Perikanan Darat , 12(1), 30-36.
Nugro ho , E. (1997). Pract ical manual o n det ect io n o f DNA Po lymo rphism in fish po pulat io n st udy.
Bul- let in of M arine Science and Fisheries
, 17, 109-129. Nugro ho , E., Hadie, W., Su bagja, J., & Kurniasih, T.
(2005). Variasi genet ik dan mo rfo met rik pada ikan baung (
M yst us nemurus
) dari Jambi, Wo no giri dan Jat iluhur. J. Pen. Perik. Indonesia , 11(7), 1-6. Nu gro h o , E., Su b agja, J., Asih , S., & Ku rn iasih , T.
(2006). Evaluasi keragaman genet ik ikan kancra dengan menggunakan marker mt DNA D-lo o p dan Rando m Amplified Po lymo rphism DNA (RAPD).
Clarias gariepinus
Ikp em e, E.V., Ud en si, O.U., Ekalu o , U.B., Ko o ffreh , M.E., Oko lo , C.M., Ekpo , P.B., & Ogb o nna, N.C.
et al
DAFTAR ACUAN
., 2000; Sudart o , 1989). Menurut Nugroho (2013), bahwa pada p e n gu jian variasi ge n e t ik st r ain Bast ar, Bu le , d an Bluesafir yang diko leksi dari daerah Parung, Jawa Barat menunjukkan bahwa t idak t erdapat perbedaan yang nyat a di ant ara ket iga
st rain t ersebut .
Pe r b e d a a n ya n g n ya t a s e ca r a g e n e t ik h a n ya t e r d ap a t a n t a r a
st r ain
ik a n k a lu i Me ra h d e n ga n Tambago dan Krist a. Terdapat variasi genet ik dari lima
st rain
ikan kalui. Variasi genet ik t ertinggi diamat i pada ikan kalui
st r ain
Krist a d en gan n ilai h e t e ro ge nit as 0,1756 kemudian diikut i o leh
st rain
Merah (0,1735); Pala p a h (0 ,1 4 8 0 ); Je p u n (0 ,0 5 9 4 ); d a n Tam b ag o (0 ,02 03 ). Jarak rat a-rat a Nei ge net ik adalah 0 ,40 7; d en gan nilai t e ren d ah yan g t e ram at i an t ara
st rain Tambago dan Palapah.
UCAPAN TERIM A KASIH
Penulis mengucapkan t erima kasih kepada Dinas Perikanan Kabupat en Lima Puluh Ko t a, Sumatera Barat dan Balai Penelit ian dan Pengembangan Budidaya Air Tawar, Bo go r at as t erlaksananya kegiat an ini. Terima kasih juga disampaikan kepada Sri Sundari (BPPBAT) at as bant uan dalam pelaksanaan analisis.
Ano nim. (2002). Budidaya ikan gurami (
nal of Fish Biology , 47, 103-126.
Osphronemus g our am y
). Wa n r it e k . Te k n o lo g i Te p a t Gu n a . Ment eri Negara Riset dan Tekno lo gi. Arifin , O.Z., & Kurn iasih, T. (20 07). Variasi gen et ik t iga p o p u las i ika n n ila ( Or eochr omi s ni lot i cus ) b e r d a s a r k a n p o lim o r fis m e m t -DNA.
J. Ri s. Akuakult ur , 2(1), 67-75.
Asih, S., Nu gro ho , E., Krist ant o , A.H., & Mulyasari.
(2008). Penent uan variasi genet ik ikan bat ak (
Tor sorro
) dari Sumat era Ut ara dan Jawa Barat dengan met o de RAPD. J. Ris. Akuakult ur , 3(1), 91-97. Azrit a, Syandri, H., Nugro ho, E., Dahelmi, & Syaifullah.
(2011). Variasi genet ik ikan bujuk ( Channa lucius ) berdasarkan RAPD dari Sumat era Barat , Jambi dan Riau.
Berit a Biologi , 10(5), 675-680.
Azrit a, & Syandri, H. (2015). Mo rpho lo gical charact er a m o n g five s t r a in s o f g ia n t g o u r a m i,
Osphronemuous gorami
Lac 1801. Using a t russ mor- pho met ric syst em. Int ernat ional Journal of Fisher-
ies and Aquat ic St udies , 6(2), 344-350.
Fe rguso n , A.J., Taggart , B., Pro d o h l, P.A., Mc.Mee l, O., Th o m p so n , C., St o n e , C., McGin n it y, P., & Hynes, R.A. (1995). The applicat io n o f mo lecular markers t o t he st u dy an d co nser vat io n o f fish po pulat io n, wit h special reference t o Salmo . Jour-
J. Ris. Akuakult ur , 1(2), 211-217. Co p yright @ 2016 , Jurn al Rise t Akuakult ur (JRA), p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 Jurnal Riset Akuakult ur, 11 (4), 2016, 313-319
Nugro ho , E., & Kusmini, I.I. (2007). Evaluasi variasi g e n e t ik t ig a r as ik a n g u r a m e (
War t a Penel i t i an dan Peng em bang an Pert anian
Jurnal Ilmu-Ilmu Perairan dan Perikanan Indonesia
, 3(2), 23-31. So ewardi, K, Rachmawat i, R., Affandi, R., & Bengen,
D.G. (1 99 5). Pe ne lu su ran varie t as ikan guram e
Osp h or on em u s g ou r a m y La c b e r d a s a r k a n penampilan karakt er luar.
Jurnal Ilmu Ilmu Perairan dan Perikanan Indonesia
, 3(2), 31-35. Su dart o . (1 98 9). Po rse lin, Blue safir d an Paris yang b e rt e lu r.
, 11(2), 1-2. Su se no , D., Ru sm aed i, Ku sm ini, I.I., Dharma, L., &
Osphorenemus gouramy
Arifin, O.Z. (2000). Karakt erisasi mo rfo lo gi ikan gurame st rain Soang dan Paris.
Simposium Nasional Pengelolaan Pemuliaan dan Plasma Nut fah
. Bo go r , hlm. 589-595. Syandri, H., Elfiandri, Azrit a, & Junaidi. (2015). So cial
St at us o f t he Fish-farmers o f Flo at ing-net -cages in Lake Maninjau, Indo nesia.
Journal Aquacult ure Research Development
, 7, 1-6. Theo do rakis, C.W., & Bickham, J.W. (2004). Mo lecu- lar ch aract erizat io n o f co n t am in ant -in d icat ive
Lac dengan met ode bio kimia.
23-30. So e w ar d i, K. (1 9 9 5 ). Kar a kt e ris as i p o p u as i ika n gurame
Osphor enem us g ou r a m y
(2 00 9). Ge ne t ic variat io n o f wild an d hat che r y po pulat io ns o f t he cat la Indian majo r carp ( Cat la
) d e n g a n m e t o d e is o z ym e .
J. Ri s. Akuakult ur , 2(2), 51-57.
Nu g ro h o , E. (2 0 1 3 ). Ge n e t ic va riab ilit y o f gian t gouramy strain revealed by rando m amplified po ly- m o rp hism DNA. Indonesian Aquacult ur e Jour nal , 8(1), 107-111. Nugro ho , E., Rahayun i, E., & Hamid , M.A. (2 0 1 3).
Gurame Bat an g Hari, benarkah st rain berbeda?: suat u kajian genet ik dengan menggunakan marker DNA.
M edia Akuakult ur , 8(1), 9-12.
Rahman, S.M.Z., Khan, M.R., Islam, S., & Alam, M.S.
cat la
Ka r a k t e r is a s i t ig a s t r a in ik a n g u r a m e ( Osphoronemus gouramy ) berdasarkan meto de truss m o r fo m e t r ik . Jur nal I kt i ol og i I ndonesi a , 7 (1 ),
Hamilt o n 1822: Cyprinifo rmes, Cyprinidae) revealed by RAPD markers.
Genet ic and M olecular Biology
, 32, 197-201. Rashid , J., Tamanna, F.M., Ho ssain, M.A.R., & Alam,
Md.S. (2012). Genet ic variat io n in endagered but - t er cat fish, ( Ompok bimaculat us Blo ch) po pulat io n revealed by rando m amplified po lymo rphism DNA (RAPD) fingerprint ing.
Int ernat ional Journal of Bio- sciences , 2(9), 85-93.
Set ijaningsih, L., Arifin, O.Z., & Gust iano , R. (2007).
RAPD markers. Ecot oxicology , 13, 303-309.