Deteksi Mycobacterium tuberculosis Dari Sputum Penderita Tuberkulosis Paru Secara Teknik Polymerse Reaction Dibandingkan Dengan Pemeriksaan Mikroskopik.

ABSTRAK
DETEKSI Mycohacterium
tuherculosis DARI SPUTUM PENDERIT A
TUBERKULOSIS
PARU SECARA TEKNIK Polymerse Chain Reaction
DIBANDINGKAN
DENGAN PEMERIKSAAN
MIKROSKOPIK

Lindawaty Witono, 2004. Pembimbing I : Diana K.J., dr. M.Kes
Pembimbing II : Sylvia Soeng, dr.
Di Indonesia, penyakit tuberkulosis pam telah menjadi penyebab utama
kematian setelah penyakit jantung. Oleh karena itu sangat penting mendiagnosis
dan mendeteksi penyakit tuberkulosis pam pada stadium awal. Deteksi M.
tuherculosis dapat dilakukan dengan pemeriksaan mikroskopik atau teknik PCR.
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk membandingkan sensitivitas antara
pemeriksaan dengan teknik PCR dan secara mikroskopik dalam mendeteksi M.
tuberculosis dari sputum penderita tuberkulosis pam.
Penelitian experimental Laboratory ini merupakan uji diagnostik yang
membandingkan sensitivitas deteksi M. tuberculosis antara teknik PCR dan
pemeriksaan BTA (Ziehl-Neelsen).

Hasil penelitian dengan pemeriksaan mikroskopik, 7 dari 10 sampel adalah
positif, sedangkan dengan teknik PCR 8 dari 10 sampel yang positif.
Uji statistik dengan menggunakan Fisher t'xact Test, didapatkan tidak ada
perbedaan yang bermakna antara pemeriksaan mikroskopik dan teknik PCR
lmtuk mendeteksi M. tuberculosis.
Diharapkan akan ada penelitian se1anjutnya dengan jumlah lebih besar.

IV

ABSTRACT
Mycobacterium Tuberculosis Detectionfrom PCR Technique Compare with
Microscopic Examination from The Sputum of Pulmonary Tuberculosis
Patient,,.
Lindawaty Witono, 2004. Tutor I : Diana K.J., dr. M.Kes
Tutor 1I : Sylvia Soeng, dr.
In Indonesia, pulmonal tuberculosis is one (~lthe major cause of mortality
after heart diseases. Thus, it is important to diagnose and detect pulmonal
tuberculosis in early stage. The detection ~f M. tuberculosis could be conducted
either by microscopic
examination

or PCR technique. The objective ~f this
research was to compare the sensitivity between PCR technique and microscopic
examination
in detection of M. tuberculosis from the !'putum (?f pulmonary
tuberculosis patients.
This research was conducted by Laboratory experimental for laboratory
diagnostic test with BTA analysis by PCR technique and microscopic examination
(2N).
The result ~f this research showed that 7 (?f 10 samples were positive using
microscopic
examination,
and 8 of 10 samples were positive using PCR
technique.
Statistic analysis by Fischer exact test, showed that there were no
sign(ficant differences between microscopic examination and PCR technique in
detection ~fM. tuberculosis.
I am lookingforward
to another research with a larger sample.

v


DAFTAR ISI

LEMBAR
SURAT

Halaman
... ii

PERSETUJUAN...

... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...

PERNYATAAN...

ABSTRAK...

... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...

... ...


... ... ...
... ... ... ... ... ... ... ...
'"
'"
... ... ...
... ... ...
'"
'"

ABSTRACT...

...
'"
'" ...

... ...
...

KATAPENGANTAR


'"

'"

iii

iv

v

... ... ... ...

vi
DAFT AR IS 1. .. .. . .. . .. . .. . . .. . .. .. . .. . .. . .. .. .. . .. . .. . . .. .. . . .. .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . . .. .. . viii

DAFT AR T ABEL...

...


'"

OAFTARGAMBAR
D AFTAR

LAMPlRA

... ... ... ... ...

'"

...

'"

...

'"

... ... ... ... ... ... ...


N. .. .. . .. . .. . .. . . .. .. . .. . .. . .. . .. . ...
'"

BABI

x

... ... ... ...

'"

xi

.. . .. . .. . . .. . .. .. . .. . .. . .. .. .xii

PENDAHULUAN
1.1. Latar Belakang. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 1
'" ... ... ... ... ... ... ... ...

1.2. Identifikasi
Masalah...
... ... ... ... ...
... ... 2
'"
1.3. Maksud dan Tujuan... ... ...
... ... ...
...
... ... ...
... ... ... .2
'"
1.4. Kegunaan Penelitian..
. . .. .. . . .. .. . .. . .. . '".. . .. . '". .. . .. .. . .. . '".. . .. . .. . . .. 2
1.4.1. Kegunaan Akademis...
...
2
... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
'"
1.4.2. Kegunaan Praktis
...2

I .5. Kerangka

Penelitian.

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . .3

1.6. Metodologi
1. 7. Lokasi

dan

3
Waktu

Penelitian...

... ... ...
'"

BAB II


TINJAUAN PUST AKA
2.1. Anatomi dan Fisiologi Pam-Pam...
tuberculosis...

2.2. KarakteristikM.

2.3. Penyakit Tuberkulosis Pam

... ... ...

'"

...

'"

...

...3


'"

.. .. .. . .. . .. . .. . . .. ... .. .. .. ...4

... ... ...
...
... '"

5

... ... ... ... ..

...6

2.3.1. Patogenesis Tuberkulosis Pam... ...
... ... ...
'"
2.3.2. Gejala Klinik
2.3.3. Diagnosis Penyakit Tuberkulosis Pam
2.4. OeteksiM. tuberculosis
2.4.1. Pemeriksaan

Mikroskopik.

...6
...7
...7
7

.. ... .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . ..

7

2.4.2. Pemeriksaan Konvensional (Kultur atau Biakan)
2.4.3. Deteksi dengan Teknik Polymerase Chain Reaction
2.4.3.1. Komponen Dasar Polymerase Chain Reaction
2.4.3.2. Tallapan Proses Polymerase Chain Reaction
2.5.

T es TuberkuIin.

2.6. Pemeriksaan

7
8
8
9

. . . . . . . . . . . . . . . . . ... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ... . . 11
Radiologik...

... ...

... ... ... ... ...

...

'"
'"
2.7. Pengobatan Penyakit TuberkuIosis Pam
2.7.1. Obat - Obatan Yang Digunakan Pada Pengobatan
Tuberkulosis

Pam.

... ... ...11

..11

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . .11

2.7.2. Pengobatan TuberkuIosis Menurut WHO
BAB HI

13

BAHAN DAN METODE PENELlTIAN
3.1.

Subjek

Penelitian

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ..

Vlll

17

lX

3.2. Metode Penelitian...
3.2.1. Desain

Penelitian...

.17
... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...17

3.2.2. Prosedurkerja
.17
3.2.2.1. Pemeriksaan BTA Metode Ziehl-Neelsen... ... ... 17
3.2.2.2. Teknik PCR
.18
3.2.2.2.1. Isolasi DNA... ... ... ... .,. ... ... ... ... ... ..18
3.2.2.2.2. PCR
..20
3.2.2.2.3. Elektroforesis
...21
3.2.3. Metode

BAB IV

. .. . . .. .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . . .. .. . . .. .. . .. . .. . 22

HASIL DAN PEMBAHASAN
4.1. Hasil Penelitian...
4.2. Pembahasan...

BAB V

Ana1isis..

... ...

24

... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...

KESIMPULAN DAN SARAN
5.1. Kesimpulan
5.2. Saran... ... ... ...

... ...

27

.28
... ... ...28

DAFTARPUSTAKA

29

LAMPIRAN...
...
RI WAY A T HID UP...

... ... ... ... ... ... ... ...
... ...
... ...
... ...30
... .. . .. . .. . .. . .. . . .. .. . . .. .. . . .. .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . 3 I

DAFTAR TABEL
Ha1aman
Tabe1 2.1. Tingkat Aktivitas Bakterisid Obat Anti-tuberku1osis
Tabe12.2. Pengobatan

in vitro... ... ... ...13

Tuberku10sis Pam... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..16

Tabe13.1. Protoko1 Waktu dan Suhu pada Teknik PCR

21

Tabe14.1. lum1ah Sampe1 Hasi1 Oeteksi M. tuberculosis antara
pemeriksaan BTA dengan PCR

x

26

DAFT AR GAMBAR

Halaman
Gambar 2.1. Sistem Pemapasan. Inset A, Asinus atau Unit Flmgsional
Paru-pam.

Gambar 2.2. Proses

-

Inset B, Membran

Mukosa

Bersilia.

Proses yang Terjadi Pada Teknik PCR

. . . . . . . . . . . ... . . . . . . ... . . .4
... ...

'"

... ...

...10

Gambar 4.1. Foto Hasil BTA Positifpada Sputum

24

Gambar 4.2. Foto Hasil BT A Negatif

24

Gambar 4.3. Hasil Elektroforesis Sampel no. 1- 5

...25

Gambar 4.4. Hasil Elektroforesis Sampe1 no. 6 - 10... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .26

Xl

DAFT AR LAMPlRAN

Halaman
LAMPlRAN

]. Hasi1 Uji Statistik dengan Fisher f-xact Test

XlI

30

BABI
PENDAHULUAN
1.1. Latar Belakang

Tuberkulosis paru merupakan penyakit infeksi yang disebabkan oleh bakteri
Mycobacterium

tuberculosis. Tuberkulosis paru menyebar me1a1ui udara, batuk,

atau bersin penderita, yang dapat menyebabkan infeksi pada orang di sekitamya
yang

menghirup udara tersebut. Penyakit ini menjadi masalah kesehatan yang

serius di negara berkembang, sehingga WHO menyatakan penyakit tuberkulosis
menjadi Global Emergency pada tahun 1993 (WHO, 2001).

Di seluruh dunia, tuberkulosis menyebabkan kematian 8000 orang setiap
harinya, berarti 2 - 3 mi1yar orang meninggal setiap tahun dan lebih dari 100.000
anak keeil meninggal karena penyakit tuberkulosis. Tiap tahun hampir 1 milyar
kematian terjadi di Asia Tenggara (40 %). Seorang penderita tuberkulosis akan
menulari 10 sampai 15 orang setiap tahun (WHO, 2001).
Di Indonesia penyakit tuberku10sis menempati urutan keA untuk morbiditas
dan urutan ke-3 tmtuk mortalitas. Insiden penyakit tuberkulosis terjadi 80 % pada
usia produktif. Masih banyak kendala yang dihadapi dalam menangani masa1ah
tuberkulosis, karena itu penyakit ini pertu mendapat perhatian (Thabrani Z, dkk,
2001).
Orang yang terinfeksi oleh tuberkulosis, tidak selalu menunjukkan
penyakit,

menyebarkan

penyakitnya.

Suatu

saat,

mungkin

keadaan

gejala
ini

berkembang menjadi penyakit tuberkulosis. Karena itu, orang yang terinfeksi
tuberku10sis sebaiknya mendapat pengobatan supaya tidak berkembang menjadi
penyakit tuberkulosis (WHO, 2003).
Agar pengobatan

yang

diberikan

tepat,

diperlukan

diagnosis

penyakit

tuberkulosis secara tepat pula. Diagnosis penyakit tuberku10sis antara lain dapat
di1akukan me1alui pemeriksaan Bakteri Tahan Asam (BT A) seeara mikroskopik
dengan pemeriksaan teknik Polymerase Chain Reaction (PCR).

2

Pemerjksaan BT A sangat bergantung pada jumlah kuman yang terdapat pada
bahan pemeriksaan.

Hal jni menyebabkan

sering didapatkan

hasil negatif

walaupun orangnya terinfeksj. Teknjk PCR mendjagnosjs penyakjt tuberkulosjs
secara

molekuler.

mengamphfikasj

PCR

mempakan

proses

sintesjs

enzjmatik

lmtuk

lmltan nukleohda secara invitro (Hanjfa U, Soemohardjo S,

Achmad H, Widodo MA, 2001). Dibandingkan dengan pemeriksaan BTA, teknik
PCR djharapkan bjsa lebih djpercaya lilltuk mendjagnosjs penyakjt tuberkulosjs.

1.2. Identifikasi

Masalah

Apakall pemeriksaan

dengan

teknik

PCR lebih

sensitif

dibandingkan

pemeriksaan secara mjkroskopjk lmtuk mendeteksj M. tuberculosis?

1.3. Maksud dan Tujuan

Maksud dari penelihan ini adalal1 lilltuk membandjngkan sensitivjtas deteksj
M. tuherculosis antara teknik PCR dengan pemeriksaan mjkroskopjk.
Tujuan penelitian ini adalal1 agar dapat menentukan jenjs pemeriksaan yang
lebjh bajk sehjngga pengobatarmya dapat djlakukan dengan tepat.

1.4. Manfaat Karya Tulis IImiah
1.4.1. Kegunaan Akademik

Kegunaan akademik dari karya tulis ilmiall ini untuk memperluas pengetal1uan
mengenaj djagnosjs penyakjt tuberkulosjs paru, khususnya dengan teknik PCR.

1.4.2. Kegunaan

Praktis

Kegtmaan praktis karya tubs ilmjall ini untuk membantu diagnosis dini
penyakjt tuberkulosjs pam, sehjngga pengobatannya
optimal.

dapat dj}akukan dengan

3

1.5. Kerangka

Pemikiran

dan Hipotesis

Dilakukan laboratory experimental antara pemeriksaan mikroskopik BT A dan
teknik PCR.
PCR merupakan proses sintesis enzimatik untuk mengamplifikasi
nukleotida secara invitro. Dengan teknik PCR, jumlah kuman tuberkulosis 1

urutan
~

10 /

ml sudah dapat mendeteksi penyakit tuberkulosis, sedangkan dengan pemeriksaan
mikroskopik BTA memerlukan minimal 5.000 kuman tuberkulosis / ml untuk
memberikan hasil positif (Thabrani Z, dkk, 200 I) sehingga teknik PCR lebih
sensitif daripada pemeriksaan BTA secara mikroskopik.
Berdasarkan kerangka pemikiran tersebut dapat disusun hipotesis penelitian
sebagai berikut : Deteksi mycobacterium tuberculosis dengan teknik PCR lebih
sensitif dibandingkan pemeriksaan BTA secara mikroskopik.

1.6. Metodologi

Penelitian ini merupakan uji Laboratorium dengan menggunakan bahan uji
berupa sputum penderita tuberkulosis paru yang telah terdiagnosis secara klinis
dan radiologis.

Selanjutnya

dilakukan

uji diagnostik

guna mendeteksi M.

tuberculosis secara komparatif antara pemeriksaan mikroskopik BTA dan teknik
PCR.
Kemudian dianalisis statistik data dengan Fisher Exact Test, diharapkan ada
perbedaan yang bermakna.

1.7. Lokasi dan Waktu Penelitian

Penelitian ini dilaksanakan di Balai Pengobatan Penyakit Paru

- Paru

Bandung

dan Laboratorium Biotek RS Rajawali Bandung selama 6 bulan, dari bulan April
sampai dengan September 2004.

BABV
KESIMPULAN DAN SARAN
5.1. Kesimpulan

Penelitian ini menunjukkan bahwa deteksi M tuberculosis dengan teknik PCR
dan pemeriksaan BT A secara mikroskopik (metode Ziehl-Neelsen) pada sputum
penderita tuberkulosis pam tidak menunjukkan perbedaan yang bermakna.

5.2. Saran

Karni menyarankan agar dapat dilakukan penelitian lebih lanjut dengan jumlah
sampel yang lebih banyak.

28

DAFT AR PUST AKA

Aditama

TY. 2002. Tuberkulosis

Jakarta. Hal : 25

-

Diagnosis,

terapi & Masalahnya.

Edisi IV. ID1.

58.

Handayani S. 2002. Respon lmtmitas Seluler pada Infeksi Tuberkulosis Pam.
Cermin Dunia Kedokteran. No. 137. Hal: 33 - 36.
Hanifa U, Soemohardjo S, Achmad H, Widodo MA. 2001. Perbandingan
Pemeriksaan PCR, Kultur M. tuberculosis dan BTA Cairan Pleura Serta
Pemeriksaan Radiologi Paru untuk Menegakkan Diagnose £filSi Pleura
Tuberkulosis di Rumah Saki! Umum Mataram. http://digilib.brawiiaya.ac.id.
26 Februari 2004.
Price SA, Wilson LM. 1992. Patofisiologi Pemapasan. Patofisiologi Konsep
Klinis Proses-Proses Penyakit. Edisi 4. Buku 2. Jakarta. EGC. Hal : 645 658.
Soedarto. 1996. Tuberkulosis. Penyaki!-Penyaki!
Widya Medika. Hal: 170 -194.

Infeksi di Indonesia. Jakarta.

Thabrani
Z, dkk. 2001. Pemeriksaan Reaksi Rantai Pohmerasi dan
Hublmgannya dengan Mikroskopik BTA & Biakan Konvensiona1 pada
Penderita Tuberkulosis Pam di RSVP Persahabatan. Jurnal Re:-.pirologi
Indonesia Vol. 21, No.2, April. Hal: 56 -65.
Wargasetia TL. 1999. Polymerase Chain Reaction (PCR) dan Aplikasinya.
Majalah Ilmiah Maranatha. Vol XVII / Th. Ke VI/ Desember. Hal: 45 - 52.
Wargasetia

TL.

2002.

Diagnosis

Penyakit

Infeksi

dengan

Teknik

"POL YMERASE CHAIN REACTION ". Majalah l/miah Maranatha.

Vol

XXI/ Th. IX/April. Hal : 36 - 42.
Zubaidi Y. 1995. Farmakologi dan Terapi. Tuberkulostatik dan Leprostatik.
Edisi 4. Bagian Farmakologi Faku1tas Kedokteran - Universitas Indonesia.

Jakarta. Hal: 597 - 606.

www.infeksi.comlpenyakit/penyakit

tuberkulosis.html.

http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs104/en/.
http://medic.med.

2003. 8 April 2004.
2001. 27 Desember 2004.

uth. tmcedu/path/ scan 16. gif. 27 Oesember 2004.

http://www-medlib.med. utah. edu/webPath/1NFEHTML/INFEC03
Desember 2004.

29

3 .html.

27