minor GB limpok GB limpok Kampar 1 limpok Kampar 2 limpok Kampar 3 schilbeides GB schilbeides Kampar 1 schilbeides Kampar 2 schilbeides Kampar 3 apogon Kampar 1 apogon Kampar 2 apogon Kampar 3 minor GB limpok GB limpok Kampar 1 limpok Kampar 2 lim
110
Lampiran 11 Lanjutan
Basa nukleotida ke 513 525 529 530 534 559 570 573 591 609 612 616 621 624 654 657
606618622623627652663666684702705709714717747750
K. minor GB K. limpok GB
K. limpok Kampar 1 K. limpok Kampar 2
K. limpok Kampar 3 K. schilbeides GB
K. schilbeides Kampar 1 K. schilbeides Kampar 2
K. schilbeides Kampar 3 K. apogon Kampar 1
K. apogon Kampar 2 K. apogon Kampar 3
K. bicirrhis GB K. cryptopterus GB
K. macrocephalus GB T C A C C T T C A A C G T A A G
A T
A C C T A C T
A C G C A A A A
T A C C T
G C
T A C
A C A
G A
A T
A C C T G
C T
A C A
C A G
A A
T A C C T
G C
T A C
A C A
G A
A C A C G A A C A A T G A
A A C A C
G C
T C
C T
C T
A G
A C
A T
. A C
G C
T C
C T
C T
A G
A C
A T
. A C
G C
T C
C T
C T
A G
A C
A T
. G
C A T
C T C C C A C G C A A A G
C A T
C T C C C A C G C A A A G
C A T
C T C C C A C G C A A A T C A C C T T C A A C G T A A G
T C A C C T T C A A C G C A A A C C A C C T A C C A C G C T A A
Basa nukleotida ke 675 687 702 720 727 741 753 771 786 792 813 816 819 846 849 924
7687807958138208348468648798859069099129399421017
K. minor GB K. limpok GB
K. limpok Kampar 1 K. limpok Kampar 2
K. limpok Kampar 3 K. schilbeides GB
K. schilbeides Kampar 1 K. schilbeides Kampar 2
K. schilbeides Kampar 3 K. apogon Kampar 1
K. apogon Kampar 2 K. apogon Kampar 3
K. bicirrhis GB K. cryptopterus GB
K. macrocephalus GB A C A A C C A A A C T T C C C A
C C A G
C C A A A C T C C A
T A
C C A G
C C A A C
C T C C A
T A
C C A G
C C A A C
C T C C A
T A
C C A G
C C A A C
C T C C A
T A
C C A A C A A A A C T C C C C A G
C T
A T
C C
T G
C C C C C C C
. G
C T
A T
C C
T G
C C C C C C C
. G
C T
A T
C C
T G
C C C C C C C
. A
T A A C
T A A A
T A
A A
T C G
A T
A A C T
A A A T
A A
A T
C G A
T A A C
T A A A
T A
A A
T C G
A C A A C C A A A C T T C C C A C A A A C C A A A C C C T C C G
A C C A C C A A A C T C C C C A
Keterangan: Angka dalam tanda kurung = urutan berdasarkan basa nukleotida gen sitokrom b utuh K. minor data GenBank GB; = nukleotida K. limpok GB tidak sama dengan K. limpok Kampar; = nukleotida K. schilbeides GB tidak sama dengan K. schilbeides Kampar
111
Lampiran 12 Situs basa nukleotida sebagai penanda genetik pada gen sitokrom b parsial 927 nt Ompok spp. dari Sungai Kampar Riau dengan pembanding data GenBank
Basa nukleotida ke 27 40 45 48 51 57 81 93 120 123 144 150 153 165 168
120133138141144150174186213216237243246258261
O. eugeneiatus Kampar 1 O. eugeneiatus Kampar 2