BEBERAPA ASPEK EKOLOGI JAMUR ENDOFIT PADA MENTIGI (Vaccinium varingiaefolium) DI KAWAH GUNUNG SINABUNG SUMATERA UTARA THESIS
BEBERAPA ASPEK EKOLOGI JAMUR ENDOFIT PADA MENTIGI (Vaccinium varingiaefolium) DI KAWAH GUNUNG SINABUNG SUMATERA UTARA THESIS Oleh 107030008 RAHMAD LINGGA PASCA SARJANA BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2012 Universitas Sumatera Utara
BEBERAPA ASPEK EKOLOGI JAMUR ENDOFIT PADA MENTIGI (Vaccinium varingiaefolium) DI KAWAH GUNUNG SINABUNG SUMATERA UTARA THESIS Oleh 107030008 RAHMAD LINGGA PASCA SARJANA BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN Universitas Sumatera Utara Beberapa Aspek Ekologi Jamur Endofit Pada Mentigi (Vaccinium varingiaefolium) Di Kawah Gunung Sinabung Sumatera Utara
TESIS Diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Magister Sains dalam
Program Studi Magister Ilmu Biologi pada Program Pascasarjana Fakultas MIPA Universitas Sumatera Utara
Oleh RAHMAD LINGGA
107030008/BIO
PROGRAM PASCA SARJANA FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2013
Universitas Sumatera Utara
PENGESAHAN TESIS
Judul Tesis : Beberapa Aspek Ekologi Jamur Endofit pada Mentigi Vaccinium varingiaefolium) di Kawah Gunung Sinabung Sumatera Utara Nama Mahasiswa : RAHMAD LINGGA Nomor Pokok : 107030008 Departemen : BIOLOGI Menyetujui Komisi Pembimbing (Prof. Dr. Syafruddin Ilyas, M. Biomed.) (Prof. Dr.Retno Widhiastuti, M.S.) Pembimbing I Pembimbing II Ketua Program Studi, Dekan, (Prof. Dr. Syafruddin Ilyas, M. Biomed.) (Dr. Sutarman, M.Sc.) Tanggal lulus: 12 Februari 2013 Universitas Sumatera UtaraPERNYATAAN ORISIONALITAS
BEBERAPA ASPEK EKOLOGI JAMUR ENDOFIT PADA MENTIGI (Vaccinium
varingiaefolium) DI KAWAH GUNUNG SINABUNG SUMATERA UTARA
TESIS
Dengan ini saya nyatakan bahwa saya mengakui semua karya tesis ini adalah hasil karya
kerja saya sendiri kecuali kutipan dan ringkasan yang tiap satunya telah dijelaskan
sumbernya dengan benar Medan, Februari 2013RAHMAD LINGGA NIM. 107030008 Universitas Sumatera Utara
PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS
Sebagai sivitas akademika Universitas Sumatera Utara, saya yang bertanda tangan
dibawah ini: Nama : RAHMAD LINGGA NIM : 107030008 Program Studi : Biologi Jenis Karya Ilmiah : Tesis
Demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan kepada Universitas
Sumatera Utara Hak Bebas Royalti Non-Eksklusif (Non-Exclusive Royalty free Right) atas
Tesis saya yang berjudul:Beberapa Aspek Ekologi Jamur Endofit Pada Mentigi (Vaccinium
varingiaefolium) Di Kawah Gunung Sinabung Sumatera Utara
Beserta perangkat yang ada (jika diperlukan). Dengan Hak Bebas Royalty Non-Eksklusif ini,
Universitas Sumatera Utara berhak menyimpan, mengalih media, memformat, mengelolah
dalam bentuk data-base, merawat dan mempublikasikan Tesis saya tanpa meminta izin dari
saya selama tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis dan sebagai pemegang dan
atau sebagai pemilik hak cipta. Demikian pernyataan ini dibuat dengan sebenarnya.Medan, Februari 2013 RAHMAD LINGGA NIM. 107030008
Universitas Sumatera Utara
Telah diuji pada Tanggal : 7 Februari 2013 PANITIA PENGUJI TESIS Ketua : Prof. Dr. Dwi Suryanto. M.Sc Anggota : 1. Prof. Dr. Retno Widhiastuti, M.S
2. Prof. DrErman Munir. M.Sc
3. Dr. It Jamilah, M.Sc Universitas Sumatera Utara
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Allah SWT yang telah melimpahkan rahmat
dan hidayah-Nya. Shalawat dan salam kepada junjungan nabi besar MuhammadRasullulah SAW sehingga penulis dapat menyelesaikan Penelitian dengan judul
Identifikasi Parasit Dari Feses Orangutan Sumatera (Pongo abelii) Liar, Rehabilitasi, DanReintroduksi Di Sumatera Utara. Penelitian ini diajukan dalam rangka memenuhi
Kurikulum Program Magister Biologi pada Sekolah Pascasarjana, Universitas Sumatera
Utara.Untuk menyelesaikan penelitian ini banyak pihak yang telah membantu saya hingga penelitian ini dapat diselesaikan. Pada kesempatan ini saya mengucapkan terima
kasih kepada :
1. Bapak Prof. Dr. Syafruddin Ilyas, M. Biomed selaku ketua komisi pembimbing dan Ibu Prof. Dr.Retno Widhiastuti M.S selaku anggota komisi pembimbing yang telah memberikan saya kesempatan melakukan penelitian ini dan telah membimbing serta mengarahkan saya dari awal penelitian saya sampai saya dapat menyelesaikan penelitian ini.
2. Bapak Dr. Salomo Hutahaean M.Si dan Bapak Dr. Miswar Budi Mulya M.Si selaku dosen dan penguji yang telah banyak memberikan masukan saran untuk penyelesaian tesis ini agar lebih baik, terima kasih buat dukungannya.
3. Kepada Beasiswa Unggulan DIKNAS, terimakasih atas beasiswa yang telah diberikan, sehingga penulis dapat melaksanakan perkuliahan dan penelitian ini dengan baik.
4. Kepala Laboratorium Sistematika Hewan Biologi FMIPA USU dan Laboratorium
Entomologi Depkes Sumatera Utara yang telah bersedia mengizinkan penulis melakukan penelitian di laboratorium tersebut.5. Bapak dan Ibu dosen penulis di Program Studi Biologi Magister SPs USU, terima kasih untuk ilmu yang sudah diberikan selama ini.
6. Ibu Nurhasni Muluk selaku laboran Mikrobiologi, Ibu Roslina Ginting, Pak Herois dan Bang Erwin selaku staf pegawai Departemen Biologi FMIPA USU. Adik-adik dan rekan Biologi USU; B’ Mahya, B’ Gigi, kak mugi, B’ Riski, Misel, Ria, Umri, Marzuki, Margareth, Juju, Gilang, Ika, Riwil, Meika, Nia, Nila, Aini, teman-teman Bio ’05 dan adik- adik, Bio’06 Bio ’07, Bio ’08, Bio’09, terima kasih atas bantuannya dan doanya selama di penelitian ini.
7. Pengelola dan seluruh staff Taman Hewan Pematangsiantar, terimakasih atas ijin
penelitian dan pengambilan sampel feses orangutan yang telah diberikan.
8. Ayahanda H. Yazid Busatami Dalimunthe yang sudah memberikan banyak doa,
harapan & dorongan sehingga penulis bisa menyelesaikan perkuliahan ini, dan Ibunda Hj. Hamidah Sayuthi yang tiada pernah berhenti memberi penulis doa, semangat dan harapan dalam hidup ini.
9. Kakanda yang sangat penulis banggakan dan sayangi Zulfadli Dalimunthe dan Nurmayani, Jalilah Ilmiha Dalimunthe dan Dodie, Kamalia Fitri Dalimunthe, Nazir Kahfi Dalimunthe, Faisal Afif Dalimunthe, Rini ndut, kepada para keponakan yang paling ku sayangi (Fira dan Fadhil), penulis mengucapkan ribuan terima kasih atas segala cinta, kasih sayang, pengorbanan moril maupun materil, motivasi, kesabaran serta doa yang tak akan pernah bisa penulis balas sampai kapanpun
10. Temanku tersayang di S2 Biologi 2010, Pak Hamdani, Kak Lili, Bang Novri, Angel,
Arman, Ronald, Kak Sri, Kak Wirdah. Rekan-rekan di S2 Bio 2011; B’mahya, Zulfan, Ummi, Dwi, saputri, yanti, bu elvi, bu teti, mama fatma, bu ratna dan semuanya stambuk 2011 terima kasih atas dukungan dan semangatnya.
11. Adik kostku, Lisna, Imah, Ani, dan sepupuku Sri Hidayati, kalian saudaraku yang
selalu memberi banyak bantuan dan doa, terimakasih atas doanya.
12. Kepada Rahmad Lingga yang selalu memberi bantuan dan dukungan setiap saat,
terimakasih sebesar-besarnya untuk mu.
13. Melalui kesempatan ini, saya sampaikan semoga Allah SWT selalu memberikan
pahala, nikmat dan limpahan rahmat yang tiada taranya.Saya menyadari sepenuhnya bahwa penelitian ini masih banyak kekurangan, oleh karena itu kritik dan saran yang bersifat membangun dari semua pihak sangat diharapkan demi kesempurnaan penulisan Penelitian ini serta berharap penelitian ini dapat digunakan sebagai bahan referensi bagi penelitian berikutnya.
Medan, Februari 2013
Penulis DAFTAR ISI
Halaman Abstrak i
Abstract ii
Daftar Isi iii Daftar Lampiran iv
Daftar Gambar v
Daftar Tabel Vi
Bab 1 Pendahuluan
1
1.1 Latar belakang
1
1.2 Permasalahan
3
1.3 Tujuan Penelitian
3
1.4 Hipotesis
3
1.5 Manfaat Penelitian
4 Bab 2 Tinjauan Pustaka
5
2.1 Biodiversitas Jamur Endofit
5
2.2 Jamur Asidofilik
6
2.3 Vaccinium varingeafolium
7 Ekologi Jamur Endofit
2.4
8 Bab 3 Bahan dan Metoda
10 Deskripsi Area
3.1
10
3.2 Penentuan Area Sampling dan Pengambilan Sampel Pohon
10 Pengambilan sampel dan pengukuran faktor fisik-kimia
3.3
11
lingkungan Identifikasi Jamur Endofit
3.4
11 Pengaruh pH Terhadap Pertumbuhan
3.5
12 Analisis Data
3.6
12 Analisis Keanekaragaman Jamur Endofit
3.6
12
3.7 Analisis Pengaruh pH dan konsentrasi H
2 SO terhadap
13
pertumbuhan jamur endofit
Bab 4 Hasil dan Pembahasan
4.1 Karakteristik Jamur Endofit
14
4.2 Derajat Kolonisasi Jamur Endofit
24
4.3 Keanekaragaman Jamur Endofit
26
4.4 Jaccard Index
28
4.5 Faktor Fisik-kimia Lingkungan
1 Isolasi Jamur Endofit
4 Output analisis data dengan Program SPSS versi 19.00
36
varingiaefolium
3 Karakteristik isolat jamur endofit Vaccinium
16
2 Lokasi Penelitian (Kawasan Hutan Gunung Sinabung Kabupaten Karo).
15
Lampiran Judul Halaman
29
33 DAFTAR LAMPIRAN
32 Daftar Pustaka
5.2 Saran
32
5.1 Kesimpulan
31 Bab 5
4.6 Pertumbuhan In Vitro Jamur Endofit
37
DAFTAR GAMBAR
Gambar Judul Halaman
9 Foto jamur penampang koloni jamur taksa Yeast
13 Pertumbuhan in vitro jamur endofit
25
varingiaefolium
12 Derajat kolonisasi jamur endofit pada tanaman Vaccinium
24
11 Foto jamur taksa Sp1
23
10 Foto jamur taksa Verticiliastrum sp
23
22
1 Foto jamur taksa Dematophora sp1.
8 Foto hifa jamur taksa Penicillium sp2
21
7 Foto jamur taksa Penicillium sp1
20
19 6 Foto jamur taksa Aspergillus sp4.
18 5 Foto jamur taksa Aspergillus sp3.
17 4 Foto jamur taksa Aspergillus sp2.
16 3 Foto jamur taksa Aspergiillus sp1.
15 2 Foto jamur taksa Dematophora sp2.
31
DAFTAR TABEL
Gambar Judul Halaman
4.1 Keanekaragaman jamur endofit bagian akar Vaccinium
26
varingiaefolium
4.2 Keanekaragaman jamur endofit bagian daun Vaccinium
27 varingiaefolium .
4.3 Perbandingan radius pada akar tanaman Vaccinium
28
varingiaefolium dengan Indeks Jaccard
4.4
29 Perbandingan radius pada daun tanaman Vaccinium
varingiaefolium dengan Indeks Jaccard
4.5 Faktor fisik-kimia lingkungan pada tanaman Vaccinium
30
varingiaefolium di kawah Gunung Sinabung