BEBERAPA ASPEK EKOLOGI JAMUR ENDOFIT PADA MENTIGI (Vaccinium varingiaefolium) DI KAWAH GUNUNG SINABUNG SUMATERA UTARA THESIS

   BEBERAPA ASPEK EKOLOGI JAMUR ENDOFIT PADA MENTIGI (Vaccinium varingiaefolium) DI KAWAH GUNUNG SINABUNG SUMATERA UTARA THESIS Oleh 107030008 RAHMAD LINGGA PASCA SARJANA BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2012 Universitas Sumatera Utara

  BEBERAPA ASPEK EKOLOGI JAMUR ENDOFIT PADA MENTIGI (Vaccinium varingiaefolium) DI KAWAH GUNUNG SINABUNG SUMATERA UTARA THESIS Oleh 107030008 RAHMAD LINGGA PASCA SARJANA BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN Universitas Sumatera Utara Beberapa Aspek Ekologi Jamur Endofit Pada Mentigi (Vaccinium varingiaefolium) Di Kawah Gunung Sinabung Sumatera Utara

  TESIS Diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Magister Sains dalam

  Program Studi Magister Ilmu Biologi pada Program Pascasarjana Fakultas MIPA Universitas Sumatera Utara

  Oleh RAHMAD LINGGA

  107030008/BIO

  PROGRAM PASCA SARJANA FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2013

  Universitas Sumatera Utara

  

PENGESAHAN TESIS

Judul Tesis : Beberapa Aspek Ekologi Jamur Endofit pada Mentigi Vaccinium varingiaefolium) di Kawah Gunung Sinabung Sumatera Utara Nama Mahasiswa : RAHMAD LINGGA Nomor Pokok : 107030008 Departemen : BIOLOGI Menyetujui Komisi Pembimbing (Prof. Dr. Syafruddin Ilyas, M. Biomed.) (Prof. Dr.Retno Widhiastuti, M.S.) Pembimbing I Pembimbing II Ketua Program Studi, Dekan, (Prof. Dr. Syafruddin Ilyas, M. Biomed.) (Dr. Sutarman, M.Sc.) Tanggal lulus: 12 Februari 2013 Universitas Sumatera Utara

PERNYATAAN ORISIONALITAS

  BEBERAPA ASPEK EKOLOGI JAMUR ENDOFIT PADA MENTIGI (Vaccinium

  

varingiaefolium) DI KAWAH GUNUNG SINABUNG SUMATERA UTARA

TESIS

  

Dengan ini saya nyatakan bahwa saya mengakui semua karya tesis ini adalah hasil karya

kerja saya sendiri kecuali kutipan dan ringkasan yang tiap satunya telah dijelaskan

sumbernya dengan benar Medan, Februari 2013

  RAHMAD LINGGA NIM. 107030008 Universitas Sumatera Utara

PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS

  

Sebagai sivitas akademika Universitas Sumatera Utara, saya yang bertanda tangan

dibawah ini: Nama : RAHMAD LINGGA NIM : 107030008 Program Studi : Biologi Jenis Karya Ilmiah : Tesis

  

Demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan kepada Universitas

Sumatera Utara Hak Bebas Royalti Non-Eksklusif (Non-Exclusive Royalty free Right) atas

Tesis saya yang berjudul:

  Beberapa Aspek Ekologi Jamur Endofit Pada Mentigi (Vaccinium

  

varingiaefolium) Di Kawah Gunung Sinabung Sumatera Utara

Beserta perangkat yang ada (jika diperlukan). Dengan Hak Bebas Royalty Non-Eksklusif ini,

Universitas Sumatera Utara berhak menyimpan, mengalih media, memformat, mengelolah

dalam bentuk data-base, merawat dan mempublikasikan Tesis saya tanpa meminta izin dari

saya selama tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis dan sebagai pemegang dan

atau sebagai pemilik hak cipta. Demikian pernyataan ini dibuat dengan sebenarnya.

  Medan, Februari 2013 RAHMAD LINGGA NIM. 107030008

  Universitas Sumatera Utara

   Telah diuji pada Tanggal : 7 Februari 2013 PANITIA PENGUJI TESIS Ketua : Prof. Dr. Dwi Suryanto. M.Sc Anggota : 1. Prof. Dr. Retno Widhiastuti, M.S

   2. Prof. DrErman Munir. M.Sc

   3. Dr. It Jamilah, M.Sc Universitas Sumatera Utara

KATA PENGANTAR

  

Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Allah SWT yang telah melimpahkan rahmat

dan hidayah-Nya. Shalawat dan salam kepada junjungan nabi besar Muhammad

Rasullulah SAW sehingga penulis dapat menyelesaikan Penelitian dengan judul

Identifikasi Parasit Dari Feses Orangutan Sumatera (Pongo abelii) Liar, Rehabilitasi, Dan

Reintroduksi Di Sumatera Utara. Penelitian ini diajukan dalam rangka memenuhi

Kurikulum Program Magister Biologi pada Sekolah Pascasarjana, Universitas Sumatera

Utara.

  Untuk menyelesaikan penelitian ini banyak pihak yang telah membantu saya hingga penelitian ini dapat diselesaikan. Pada kesempatan ini saya mengucapkan terima

  kasih kepada :

  1. Bapak Prof. Dr. Syafruddin Ilyas, M. Biomed selaku ketua komisi pembimbing dan Ibu Prof. Dr.Retno Widhiastuti M.S selaku anggota komisi pembimbing yang telah memberikan saya kesempatan melakukan penelitian ini dan telah membimbing serta mengarahkan saya dari awal penelitian saya sampai saya dapat menyelesaikan penelitian ini.

  2. Bapak Dr. Salomo Hutahaean M.Si dan Bapak Dr. Miswar Budi Mulya M.Si selaku dosen dan penguji yang telah banyak memberikan masukan saran untuk penyelesaian tesis ini agar lebih baik, terima kasih buat dukungannya.

3. Kepada Beasiswa Unggulan DIKNAS, terimakasih atas beasiswa yang telah diberikan, sehingga penulis dapat melaksanakan perkuliahan dan penelitian ini dengan baik.

  

4. Kepala Laboratorium Sistematika Hewan Biologi FMIPA USU dan Laboratorium

Entomologi Depkes Sumatera Utara yang telah bersedia mengizinkan penulis melakukan penelitian di laboratorium tersebut.

  5. Bapak dan Ibu dosen penulis di Program Studi Biologi Magister SPs USU, terima kasih untuk ilmu yang sudah diberikan selama ini.

  6. Ibu Nurhasni Muluk selaku laboran Mikrobiologi, Ibu Roslina Ginting, Pak Herois dan Bang Erwin selaku staf pegawai Departemen Biologi FMIPA USU. Adik-adik dan rekan Biologi USU; B’ Mahya, B’ Gigi, kak mugi, B’ Riski, Misel, Ria, Umri, Marzuki, Margareth, Juju, Gilang, Ika, Riwil, Meika, Nia, Nila, Aini, teman-teman Bio ’05 dan adik- adik, Bio’06 Bio ’07, Bio ’08, Bio’09, terima kasih atas bantuannya dan doanya selama di penelitian ini.

  

7. Pengelola dan seluruh staff Taman Hewan Pematangsiantar, terimakasih atas ijin

penelitian dan pengambilan sampel feses orangutan yang telah diberikan.

  

8. Ayahanda H. Yazid Busatami Dalimunthe yang sudah memberikan banyak doa,

harapan & dorongan sehingga penulis bisa menyelesaikan perkuliahan ini, dan Ibunda Hj. Hamidah Sayuthi yang tiada pernah berhenti memberi penulis doa, semangat dan harapan dalam hidup ini.

  

9. Kakanda yang sangat penulis banggakan dan sayangi Zulfadli Dalimunthe dan Nurmayani, Jalilah Ilmiha Dalimunthe dan Dodie, Kamalia Fitri Dalimunthe, Nazir Kahfi Dalimunthe, Faisal Afif Dalimunthe, Rini ndut, kepada para keponakan yang paling ku sayangi (Fira dan Fadhil), penulis mengucapkan ribuan terima kasih atas segala cinta, kasih sayang, pengorbanan moril maupun materil, motivasi, kesabaran serta doa yang tak akan pernah bisa penulis balas sampai kapanpun

  

10. Temanku tersayang di S2 Biologi 2010, Pak Hamdani, Kak Lili, Bang Novri, Angel,

Arman, Ronald, Kak Sri, Kak Wirdah. Rekan-rekan di S2 Bio 2011; B’mahya, Zulfan, Ummi, Dwi, saputri, yanti, bu elvi, bu teti, mama fatma, bu ratna dan semuanya stambuk 2011 terima kasih atas dukungan dan semangatnya.

  

11. Adik kostku, Lisna, Imah, Ani, dan sepupuku Sri Hidayati, kalian saudaraku yang

selalu memberi banyak bantuan dan doa, terimakasih atas doanya.

  

12. Kepada Rahmad Lingga yang selalu memberi bantuan dan dukungan setiap saat,

terimakasih sebesar-besarnya untuk mu.

  

13. Melalui kesempatan ini, saya sampaikan semoga Allah SWT selalu memberikan

pahala, nikmat dan limpahan rahmat yang tiada taranya.

  Saya menyadari sepenuhnya bahwa penelitian ini masih banyak kekurangan, oleh karena itu kritik dan saran yang bersifat membangun dari semua pihak sangat diharapkan demi kesempurnaan penulisan Penelitian ini serta berharap penelitian ini dapat digunakan sebagai bahan referensi bagi penelitian berikutnya.

  Medan, Februari 2013

  Penulis DAFTAR ISI

  Halaman Abstrak i

  Abstract ii

  Daftar Isi iii Daftar Lampiran iv

  Daftar Gambar v

  Daftar Tabel Vi

  Bab 1 Pendahuluan

  1

  1.1 Latar belakang

  1

  1.2 Permasalahan

  3

  1.3 Tujuan Penelitian

  3

  1.4 Hipotesis

  3

  1.5 Manfaat Penelitian

  4 Bab 2 Tinjauan Pustaka

  5

  2.1 Biodiversitas Jamur Endofit

  5

  2.2 Jamur Asidofilik

  6

  2.3 Vaccinium varingeafolium

  7 Ekologi Jamur Endofit

  2.4

  8 Bab 3 Bahan dan Metoda

  10 Deskripsi Area

  3.1

  10

  3.2 Penentuan Area Sampling dan Pengambilan Sampel Pohon

  10 Pengambilan sampel dan pengukuran faktor fisik-kimia

  3.3

  11

  lingkungan Identifikasi Jamur Endofit

  3.4

  11 Pengaruh pH Terhadap Pertumbuhan

  3.5

  12 Analisis Data

  3.6

  12 Analisis Keanekaragaman Jamur Endofit

  3.6

  12

  3.7 Analisis Pengaruh pH dan konsentrasi H

  2 SO terhadap

  13

  pertumbuhan jamur endofit

  Bab 4 Hasil dan Pembahasan

  4.1 Karakteristik Jamur Endofit

  14

  4.2 Derajat Kolonisasi Jamur Endofit

  24

  4.3 Keanekaragaman Jamur Endofit

  26

  4.4 Jaccard Index

  28

  4.5 Faktor Fisik-kimia Lingkungan

  1 Isolasi Jamur Endofit

  4 Output analisis data dengan Program SPSS versi 19.00

  36

  varingiaefolium

  3 Karakteristik isolat jamur endofit Vaccinium

  16

  2 Lokasi Penelitian (Kawasan Hutan Gunung Sinabung Kabupaten Karo).

  15

  

Lampiran Judul Halaman

  29

  33 DAFTAR LAMPIRAN

  32 Daftar Pustaka

  5.2 Saran

  32

  5.1 Kesimpulan

  31 Bab 5

  4.6 Pertumbuhan In Vitro Jamur Endofit

  37

  

DAFTAR GAMBAR

Gambar Judul Halaman

  9 Foto jamur penampang koloni jamur taksa Yeast

  13 Pertumbuhan in vitro jamur endofit

  25

  varingiaefolium

  12 Derajat kolonisasi jamur endofit pada tanaman Vaccinium

  24

  11 Foto jamur taksa Sp1

  23

  10 Foto jamur taksa Verticiliastrum sp

  23

  22

  1 Foto jamur taksa Dematophora sp1.

  8 Foto hifa jamur taksa Penicillium sp2

  21

  7 Foto jamur taksa Penicillium sp1

  20

  19 6 Foto jamur taksa Aspergillus sp4.

  18 5 Foto jamur taksa Aspergillus sp3.

  17 4 Foto jamur taksa Aspergillus sp2.

  16 3 Foto jamur taksa Aspergiillus sp1.

  15 2 Foto jamur taksa Dematophora sp2.

  31

  

DAFTAR TABEL

Gambar Judul Halaman

  4.1 Keanekaragaman jamur endofit bagian akar Vaccinium

  26

  varingiaefolium

  4.2 Keanekaragaman jamur endofit bagian daun Vaccinium

  27 varingiaefolium .

  4.3 Perbandingan radius pada akar tanaman Vaccinium

  28

  varingiaefolium dengan Indeks Jaccard

  4.4

  29 Perbandingan radius pada daun tanaman Vaccinium

  varingiaefolium dengan Indeks Jaccard

  4.5 Faktor fisik-kimia lingkungan pada tanaman Vaccinium

  30

  varingiaefolium di kawah Gunung Sinabung