IDENTIFIKASI KARAKTER AROMA PADA TANAMAN PADI GENERASI F2 HASIL PERSILANGAN CIHERANG x BASMATI MENGGUNAKAN PCR (Polymerase Chain Reaction).
ABSTRAK
Resti Yulia Maharani. 2013. Identifikasi Karakter Aroma Pada Tanaman Padi
Generasi F2 Hasil Persilangan Ciherang x Basmati Menggunakan PCR (Polymerase
Chain Reaction) . Dibimbing oleh Murdaningsih Haeruman Karmana dan Nono
Carsono.
Karakter aroma pada beras sangat penting untuk meningkatkan kualitas jenis beras. Marka
molekuler berdasarkan PCR sering digunakan karena merupakan teknik sederhana yang
digunakan untuk memperbanyak molekul DNA secara in vitro. Metode PCR berbasis marka
SSR mempunyai hubungan dengan gen aromatik. Marka SSR digunakan karena mudah, tidak
mahal, dan metode deteksi cepat. Percobaan ini bertujuan untuk mendapatkan tanaman padi
generasi F2 persilangan Ciherang x Basmati yang positif memiliki karakter aroma. Percobaan
ini dilaksanakan di Laboratorium Analisi dan Bioteknologi Tanaman Fakultas Pertanian
Universitas Padjadjaran, dari bulan Desember 2011 sampai dengan September 2012. DNA
genom dari dua ratus dua tanaman, diisolasi menggunakan metode CTAB dengan cara
memecah dinding sel dan mengeluarkan isi sel serta mengendapkan bagian DNAnya.
Amplifikasi DNA dilakukan dengan mesin PCR menggunakan primer yang spesifik terhadap
sekuen DNA padi aromatik dan hasil PCR di elektroforesis menggunakan gel agarose. Primer
yang digunakan adalah primer Bradbury dan primer RM223 untuk mendeteksi tanaman padi
yang positif memilki karakter aroma. Hasil percobaan menunjukkan dua puluh tanaman yang
teridentifikasi memilki karakter aroma. Pada primer Bradbury berjumlah empat belas
tanaman sedangkan pada primer RM223 berjumlah dua belas tanaman. Genotipe CHB 7,
CHB 37, CHB 49, CHB 66, CHB 70, CHB 85 merupakan genotipe yang teridentifikasi
karakter aroma dari kedua primer. Keenam genotipe terpilih direkomendasikan untuk
dilanjutkan ke generasi berikutnya guna perakitan padi aromatik.
Kata kunci : Karakter Aroma, Ciherang, Basmati, PCR
ii
Resti Yulia Maharani. 2013. Identifikasi Karakter Aroma Pada Tanaman Padi
Generasi F2 Hasil Persilangan Ciherang x Basmati Menggunakan PCR (Polymerase
Chain Reaction) . Dibimbing oleh Murdaningsih Haeruman Karmana dan Nono
Carsono.
Karakter aroma pada beras sangat penting untuk meningkatkan kualitas jenis beras. Marka
molekuler berdasarkan PCR sering digunakan karena merupakan teknik sederhana yang
digunakan untuk memperbanyak molekul DNA secara in vitro. Metode PCR berbasis marka
SSR mempunyai hubungan dengan gen aromatik. Marka SSR digunakan karena mudah, tidak
mahal, dan metode deteksi cepat. Percobaan ini bertujuan untuk mendapatkan tanaman padi
generasi F2 persilangan Ciherang x Basmati yang positif memiliki karakter aroma. Percobaan
ini dilaksanakan di Laboratorium Analisi dan Bioteknologi Tanaman Fakultas Pertanian
Universitas Padjadjaran, dari bulan Desember 2011 sampai dengan September 2012. DNA
genom dari dua ratus dua tanaman, diisolasi menggunakan metode CTAB dengan cara
memecah dinding sel dan mengeluarkan isi sel serta mengendapkan bagian DNAnya.
Amplifikasi DNA dilakukan dengan mesin PCR menggunakan primer yang spesifik terhadap
sekuen DNA padi aromatik dan hasil PCR di elektroforesis menggunakan gel agarose. Primer
yang digunakan adalah primer Bradbury dan primer RM223 untuk mendeteksi tanaman padi
yang positif memilki karakter aroma. Hasil percobaan menunjukkan dua puluh tanaman yang
teridentifikasi memilki karakter aroma. Pada primer Bradbury berjumlah empat belas
tanaman sedangkan pada primer RM223 berjumlah dua belas tanaman. Genotipe CHB 7,
CHB 37, CHB 49, CHB 66, CHB 70, CHB 85 merupakan genotipe yang teridentifikasi
karakter aroma dari kedua primer. Keenam genotipe terpilih direkomendasikan untuk
dilanjutkan ke generasi berikutnya guna perakitan padi aromatik.
Kata kunci : Karakter Aroma, Ciherang, Basmati, PCR
ii