Deteksi Gen Yirulen dan Plasmid pada vibrio parahaemotrylicas dan Escherichia coli O157 dari Beberapa Makanan Laut serta pengujian Resistensi Antibiotika.
DETEKSI GDN VIRIjLEN DAI{ PLASWltpAttA VAvio pueh@ntub1i6
DAN trr.ri.rid crl, Ol5? DAXI BEBERAPA MA(ANAN LAUT SERTA
PENGUJIAN IIISISTENSI
A]{IIBIOTIXA
RIA AIRIANTI
082r2r004
PROGRAM PASCASAR'A}IA
IJMVERSITAS ANDAI-AS
2010
I)cr.r.\icnd v'rul.o drb Pl'rnid $dz vlbtio panhacdoh fu.b drn
L\.h..i.hi', oti Ots- dtn n b.dp, lli,k trRo L,ur$tu r.dguji.tr
R6iste6i Anrihiotiki
(Di b.e,h
Ol€h: Ri,
birbi4anIlus.i^fri.bti
Muknb.dan Mr.tin.)
watuE oUi.L. ncrupxk bahcri trur yang
t:.
dapar nengakibarkan
ga*rcntedris pada
'nanusia
bebeEpa
shinnF
atibal konsumsi r.d/@d
y
C
terkontlmidasi oleh bahe.i r€ffbui. Ma0ifcshsi klinis yang uilma akibd infeksi
v.
loruh&norynls
disebabkan oleh U
Ket anytkan
adalah
eastftnre.iris, dimma gejala
Ftrha.nnuti.r
melipuri
k@
uha
pada diare yang
abdomen. nuat dan munrah.
stftii y lrdtohunatrnls klinis menghditkai
tukror
vidto uha
y^it! lturn,aiable dne.r Jtnat'in llDH) rld l.DH-Nld.d hznollin (fR|).
)3n3 pbdukrinla dikodckan oleh een
d,l
dan
?r. Oteh
discbur*bagai gen eenvinrlcn penriepadz6ak
,s./p,Uiz tu/i cnrcrohemoFaik
sebab ilu, een gen ini
ti t. p .hacnntyi.6
(EHFC) adalah slah san, bakr.i usus
parhogen
ylng dapar ncnysbrhkan henataqik ohxs tt/,.). he otni*
qdmm
(llUS).
t
.dli enrFhcnoBsik Ot57 den
,t
nic
ebabkan dirre b€nlanh.
Mengingat masih rtndrnnya rineka( sanibsi tingkungan di ncga.a berkembang,
I'enyakil diarc yang disebabkatr .tch hatreri
t
.,1r palolcn menjadi melah
penting ap.bila rerjadi *ab.h. Makanan yans terkonlamina5i bakeri
khususnya
alllic
SLT (sr,gd
rtu
E
.d1t
bcnycbrbkao diarc ]ane disctui pendaBhan, karena lokrin
/dt)
]ang dihajilkannlra yaitu.Sd/ llau
S/t
kcdurnJa skrligus. Tirik rsrl drri bakt..i ini adalah rumjnusir
dau bahk.n
$p.ni domb4
l/ib.io ptahzenottticu
ten6t*
baked hatofitik ts@ ncEatit yang
I*er? b€@siasi deGan oganisec taul epedi pttukron, zmptankion. ikan.
true laut at u hidup $€6 bebas datam an hur (Kaysncr. €? al, 2001j
lLader.
&ea
1999). tntcksi baked ini dlpar menyebabkan pcnyakii
Sasloenreftis
g.jala diaft, nual, munbn dab pusin8 akibrtkonsunsi maxand
hasil taur
Fe GrkonEminasi oleh batft lonebut (Nishibuchier al, lggJjJoscph er al,
rc). S.laii itujusa scrins dilDmurrn pad, an hur deah p€skir pelzi {Csci.
4 2004) MaLmn yarg remduk datam karegori nakaren ldur remGuk
ia rtus dln crushce!, *p€ni diictaska pada Surcy cizi Nasional lahun
!F"tRlett.r"r, I999)nenunjukkanbahMkonn,msinakrnan trurs.hnd;
E dl'n rruha ikan (33./q), nolus 1%)_ dan crusia@ (6yo), mcnpakan
rhur menlah Fng secan atamilerkontaminrsi r
ra.dracn,/lri6 dan
t 'J.ifiat karena sif.r hatofitik ,anE ,lapar ne0ycbrbkan infeksi
d
(
1
F6)nlir !€nE disebabkan bakren r po.ahnhotltjcls carll di setrruh
adetu kejadian tertinggi pada qilayah dimana otung gefrar menakan
bm
frc.bi
alau ridak
mabg speni negan Jcplne, Tany
iea ftg@ b.rikli'n lrcpk diAsia
b.! nr rins€i aLu rcnJahnF
+Ai
pamerer
d KoM
tainny. (D.r,te. aid padhve, 1939)
rinSkar
konr
inasi ,/
/uturd.,orlr.6
kuatiras ekspor bahan nakanan laut
di
bsbeBoa
Fakor virulen yang ndentok&n pdt g.nibs U patuhunolytid, adetah
g.n p€ngkode prcduksi to*sin hcmolisin (Scn rd,
Fd.litian nengen.i
patemui
T.i@,
dd a,
atau k3dumF).
adanra scn virulen unnrk nengkonfimrAi adanya bakrei ,a
pzd^
nt\an
M€xico (tlah Knd..
laut iclah dilatakan dan dipubtihsi di tepane.
"r '1
2003 r Hcmandes. er
z/, 2003; Hay€ehi, sr ,1,
:mO. Di Indonesia epefri halnya yng relah dilakuhn i$lsi ,.
[email protected]\ d^t] dn bn o],h Mzdin\ (200a), Corbjruld noltkiae dan
&n
singkmk (Marlina, 3/
zl,
2007) yaig betnasiL diiFtasi adanla
ShiAbli*t torin pt drinz L:cheri.ri,
.,li
(S'l
,.
Fa) dikslahui pcn)cbab
F!*ir *rim pada n usia rlan kepriharinan kssehabr nayaEkar yes urama
lh. d Paron 1993a). Inleksi akibd STEC dapol mcnycbabk diae
tuanhoeic cohn
(Hc), tutennnrli. utzcdi. s)rntrone (t1rs)
Etheti.hia Mli Olszlti adalah bahei l)aroAcn yang pcdam! kati
-ldjfikai hhur 1932. ya4 dikcnaL t .oli [email protected] (€HEC) dan
-il,n den8an dua *abah ]ang rerkait dcngan konsumsi hmbueer y.ne
gdaiGi di Amerikr Scrikat (Riley cl d/ 931) *abah yang lerkait dene.n
I
STEC dido*unentasikai denern baik
di *ludh
dunia. lnleksi nEtrusja
r-fqt n dariabs:10 nesrndien:ni hetrla (Mcdd d.n Crimn t998) reruEna
lli dfl neniah alou kuBia maLng. makanan rerkontaminasi. Faktor virulensi
STaC ad.lah produksi eru aral lebih shsa
I-
r*. rdJ, (slx)
(.Jorhikunrar
Crifiihi2oo2a Nak.sonc, .i.,1. 2005)
H!6iEr Sl ljc a,lalah rumin..sia spenidonrba, ka,nbine. dan khusurnl
L-15
(Z$hck
cr
i,l
2000i Hrncdk ?,
zl
?001). Hcrv.n lain
sgcni babida
V. KESIMPI'LAN
Ori penelilis
L
udans pulih
DAN SARAN
yan8 tclah dilakultu dapat diambit kcsimputd ebzgd boikui :
(P"mex9rra"Bit,
llrliso vrts
j,
dn
kepirinE
udang lclone
(Pere6 i,/i.&jt, cumi{umi
6.!xo r?zar.) yDg dijml
di demr tcpi laul
panhi Padans rerkoDramirsi olch bakrcri t: ?d/a/4dcdryi.6 yrng hcAilai
patosen Gen
rrl
dih
genr,
dingkan
m€miliki
2.
yang terdap€t pada
gensrrt,d
Sedatrgk d
26
spd
36 isolor
19
let'ih beer
ietarposiria
isolatpositilldsmengadunB gcnsd,
menunjuklan !i48inra tingkdt r€sisrensi
diuji l)ari
p.errde
bakrcrirl.o/iOl57 lcrdap.l
Pola rcsisrensi atrlibiorik pada bakcti It
yang
memiliki
prdhtututyti.tc
lsn.d.p
tl p/r,rd.,rolrri.6
d^n
b.berapa
E.oti Ot57
jenk anribiolik
didapdLkM :12 potr rcsisreisi
anribiotika dan did€reki kebcddan ptdmid pada 19 isotar yang mc,niliki
uku.an
psmid
yatrg ticsar dxd 10000 bp d.n,10
didapalkan 24 pola r.skrcnsi rnribiorika d.n didercksi
pada
i$ta(
/:t.r/r
kebcEle
Ot5?
plasmid
l2isolarfrcmiLikiukranpla$nidlnngbeerdrri 10.000bp
Disraikan kopida prnc ni untuk mengkamkr.rhasi d.ngln beG.apa teknik
nolekrl tetiaaat y ltohotnblltr.z! drn r .rli o I 57 padd h.berrpa nrakanan
laur baik ]anE mcnrah aau yang relah diolah.
Anonim,2009, Keajaiban Pada Cumi cumidan gunra dirkses lada r!.ggat2 Juni
:000. \r p: inliLnJLrboe oo',on l00a 0) tui"ib3'.o.d.
dd-turi6.hhl.
M
-um'{.
'
ris, S.. Mack. P., Cal,lwell.
M.,Rm!T a.d Birkhcad. c.199?.
Swi'nnin8 asociared haemoftaeic colirisdle b B?rrri.rid.dlr O 157;I 17
infection: lividene ol prclongen onbmination of a fresb Mrer lake.
Ackm
. D.,
Epidenrlol
lnl{l.
ll9:1.3.
Sieiftrk. H. Zinnne nann. S. dnd Schelr. t,. 1993.
Prevaleme and sonE ptupcnies ol verolox (Shiga-like toxin)produci[B
in even dilleFnl spccics ol h.alrhy
animals. J
'lomc$ic
Clin Mlcobioi. :l I i243:l 2433.
Aeulio. L.. Ceier, D.,
Arr.rtrtl.,1i
Bouver.1., Bavai, C., Roscl, R., L€ Roux, A., Modlcr, M. p. Ray Cueniot. S.,
Mzu!. C.. A.quillicru. C. and ve.iozy Roand. C. 2001. Prcvatcicc ot
veroroxin-producinsE!.rer,.ridcoltand E cdli()157: H7 in pt8qrcasss
I'om rhrLr Fr.nch lauehre.hou*s. rilJ Fo.dMic.obiot 7l:2!9-25:
Aimboim. ll.C. and Dol!. I 1979. A mpid allaline exhcliotr pro..dur. tu.
screeninqrecomhina! DNA. Nuclcic,\cid Research. 7:1511-t52:1.
Coync, Vemon E., M.D. Jancs. S.
J Reid.200l,PCRP ms desig
and re.ction
Chriiinc M. Tho.Jr. 200 3. l,h 3macoloey for rhe Healrh CaE Prolc$ions. A
Wil.:y & Son\. Lrd., Puhlicarion. UnivcsiryolSrllod.
Chal,
L C.
|aiimah. A. 8.. Gh.zaLi, F. M.,l€e. HY.. Tununs. R. ShaNiior.
R. A. S..lhahnahtul, A.2., Malakar. P. M.. Nrl€auchi.Y..
A.T.ljllA
\'DL.hi.
^i
Ew
John
V d,,l.oi.P .003 BiodFr)o
vegehbLes cotrsuhedns Ulzz rvilh EleEncc ro lhcn Btsrme to
lnribiotl.s.lficdation! roon Re*rrch loun,ol l5r 125 ll1.
Desmarchclier I'M.
200i Prrho3cfic vibrioj ln: t,oldbonre ni.n)',aankms ot
tublic h{lrh slgfilcance Sixth Ediri.n. Aunmlian lNtirurc dt Foul Science
and Tcchiology (NSW Bmnch) Food Micmbiolog crcup: Ncq South
Doylc, M P- ard vV. Padhlc
\,ris.onsii Madison, Nes ]ork.
1939
Fmdbome
B3dc,i:
Paihoqcdi
DAN trr.ri.rid crl, Ol5? DAXI BEBERAPA MA(ANAN LAUT SERTA
PENGUJIAN IIISISTENSI
A]{IIBIOTIXA
RIA AIRIANTI
082r2r004
PROGRAM PASCASAR'A}IA
IJMVERSITAS ANDAI-AS
2010
I)cr.r.\icnd v'rul.o drb Pl'rnid $dz vlbtio panhacdoh fu.b drn
L\.h..i.hi', oti Ots- dtn n b.dp, lli,k trRo L,ur$tu r.dguji.tr
R6iste6i Anrihiotiki
(Di b.e,h
Ol€h: Ri,
birbi4anIlus.i^fri.bti
Muknb.dan Mr.tin.)
watuE oUi.L. ncrupxk bahcri trur yang
t:.
dapar nengakibarkan
ga*rcntedris pada
'nanusia
bebeEpa
shinnF
atibal konsumsi r.d/@d
y
C
terkontlmidasi oleh bahe.i r€ffbui. Ma0ifcshsi klinis yang uilma akibd infeksi
v.
loruh&norynls
disebabkan oleh U
Ket anytkan
adalah
eastftnre.iris, dimma gejala
Ftrha.nnuti.r
melipuri
k@
uha
pada diare yang
abdomen. nuat dan munrah.
stftii y lrdtohunatrnls klinis menghditkai
tukror
vidto uha
y^it! lturn,aiable dne.r Jtnat'in llDH) rld l.DH-Nld.d hznollin (fR|).
)3n3 pbdukrinla dikodckan oleh een
d,l
dan
?r. Oteh
discbur*bagai gen eenvinrlcn penriepadz6ak
,s./p,Uiz tu/i cnrcrohemoFaik
sebab ilu, een gen ini
ti t. p .hacnntyi.6
(EHFC) adalah slah san, bakr.i usus
parhogen
ylng dapar ncnysbrhkan henataqik ohxs tt/,.). he otni*
qdmm
(llUS).
t
.dli enrFhcnoBsik Ot57 den
,t
nic
ebabkan dirre b€nlanh.
Mengingat masih rtndrnnya rineka( sanibsi tingkungan di ncga.a berkembang,
I'enyakil diarc yang disebabkatr .tch hatreri
t
.,1r palolcn menjadi melah
penting ap.bila rerjadi *ab.h. Makanan yans terkonlamina5i bakeri
khususnya
alllic
SLT (sr,gd
rtu
E
.d1t
bcnycbrbkao diarc ]ane disctui pendaBhan, karena lokrin
/dt)
]ang dihajilkannlra yaitu.Sd/ llau
S/t
kcdurnJa skrligus. Tirik rsrl drri bakt..i ini adalah rumjnusir
dau bahk.n
$p.ni domb4
l/ib.io ptahzenottticu
ten6t*
baked hatofitik ts@ ncEatit yang
I*er? b€@siasi deGan oganisec taul epedi pttukron, zmptankion. ikan.
true laut at u hidup $€6 bebas datam an hur (Kaysncr. €? al, 2001j
lLader.
&ea
1999). tntcksi baked ini dlpar menyebabkan pcnyakii
Sasloenreftis
g.jala diaft, nual, munbn dab pusin8 akibrtkonsunsi maxand
hasil taur
Fe GrkonEminasi oleh batft lonebut (Nishibuchier al, lggJjJoscph er al,
rc). S.laii itujusa scrins dilDmurrn pad, an hur deah p€skir pelzi {Csci.
4 2004) MaLmn yarg remduk datam karegori nakaren ldur remGuk
ia rtus dln crushce!, *p€ni diictaska pada Surcy cizi Nasional lahun
!F"tRlett.r"r, I999)nenunjukkanbahMkonn,msinakrnan trurs.hnd;
E dl'n rruha ikan (33./q), nolus 1%)_ dan crusia@ (6yo), mcnpakan
rhur menlah Fng secan atamilerkontaminrsi r
ra.dracn,/lri6 dan
t 'J.ifiat karena sif.r hatofitik ,anE ,lapar ne0ycbrbkan infeksi
d
(
1
F6)nlir !€nE disebabkan bakren r po.ahnhotltjcls carll di setrruh
adetu kejadian tertinggi pada qilayah dimana otung gefrar menakan
bm
frc.bi
alau ridak
mabg speni negan Jcplne, Tany
iea ftg@ b.rikli'n lrcpk diAsia
b.! nr rins€i aLu rcnJahnF
+Ai
pamerer
d KoM
tainny. (D.r,te. aid padhve, 1939)
rinSkar
konr
inasi ,/
/uturd.,orlr.6
kuatiras ekspor bahan nakanan laut
di
bsbeBoa
Fakor virulen yang ndentok&n pdt g.nibs U patuhunolytid, adetah
g.n p€ngkode prcduksi to*sin hcmolisin (Scn rd,
Fd.litian nengen.i
patemui
T.i@,
dd a,
atau k3dumF).
adanra scn virulen unnrk nengkonfimrAi adanya bakrei ,a
pzd^
nt\an
M€xico (tlah Knd..
laut iclah dilatakan dan dipubtihsi di tepane.
"r '1
2003 r Hcmandes. er
z/, 2003; Hay€ehi, sr ,1,
:mO. Di Indonesia epefri halnya yng relah dilakuhn i$lsi ,.
[email protected]\ d^t] dn bn o],h Mzdin\ (200a), Corbjruld noltkiae dan
&n
singkmk (Marlina, 3/
zl,
2007) yaig betnasiL diiFtasi adanla
ShiAbli*t torin pt drinz L:cheri.ri,
.,li
(S'l
,.
Fa) dikslahui pcn)cbab
F!*ir *rim pada n usia rlan kepriharinan kssehabr nayaEkar yes urama
lh. d Paron 1993a). Inleksi akibd STEC dapol mcnycbabk diae
tuanhoeic cohn
(Hc), tutennnrli. utzcdi. s)rntrone (t1rs)
Etheti.hia Mli Olszlti adalah bahei l)aroAcn yang pcdam! kati
-ldjfikai hhur 1932. ya4 dikcnaL t .oli [email protected] (€HEC) dan
-il,n den8an dua *abah ]ang rerkait dcngan konsumsi hmbueer y.ne
gdaiGi di Amerikr Scrikat (Riley cl d/ 931) *abah yang lerkait dene.n
I
STEC dido*unentasikai denern baik
di *ludh
dunia. lnleksi nEtrusja
r-fqt n dariabs:10 nesrndien:ni hetrla (Mcdd d.n Crimn t998) reruEna
lli dfl neniah alou kuBia maLng. makanan rerkontaminasi. Faktor virulensi
STaC ad.lah produksi eru aral lebih shsa
I-
r*. rdJ, (slx)
(.Jorhikunrar
Crifiihi2oo2a Nak.sonc, .i.,1. 2005)
H!6iEr Sl ljc a,lalah rumin..sia spenidonrba, ka,nbine. dan khusurnl
L-15
(Z$hck
cr
i,l
2000i Hrncdk ?,
zl
?001). Hcrv.n lain
sgcni babida
V. KESIMPI'LAN
Ori penelilis
L
udans pulih
DAN SARAN
yan8 tclah dilakultu dapat diambit kcsimputd ebzgd boikui :
(P"mex9rra"Bit,
llrliso vrts
j,
dn
kepirinE
udang lclone
(Pere6 i,/i.&jt, cumi{umi
6.!xo r?zar.) yDg dijml
di demr tcpi laul
panhi Padans rerkoDramirsi olch bakrcri t: ?d/a/4dcdryi.6 yrng hcAilai
patosen Gen
rrl
dih
genr,
dingkan
m€miliki
2.
yang terdap€t pada
gensrrt,d
Sedatrgk d
26
spd
36 isolor
19
let'ih beer
ietarposiria
isolatpositilldsmengadunB gcnsd,
menunjuklan !i48inra tingkdt r€sisrensi
diuji l)ari
p.errde
bakrcrirl.o/iOl57 lcrdap.l
Pola rcsisrensi atrlibiorik pada bakcti It
yang
memiliki
prdhtututyti.tc
lsn.d.p
tl p/r,rd.,rolrri.6
d^n
b.berapa
E.oti Ot57
jenk anribiolik
didapdLkM :12 potr rcsisreisi
anribiotika dan did€reki kebcddan ptdmid pada 19 isotar yang mc,niliki
uku.an
psmid
yatrg ticsar dxd 10000 bp d.n,10
didapalkan 24 pola r.skrcnsi rnribiorika d.n didercksi
pada
i$ta(
/:t.r/r
kebcEle
Ot5?
plasmid
l2isolarfrcmiLikiukranpla$nidlnngbeerdrri 10.000bp
Disraikan kopida prnc ni untuk mengkamkr.rhasi d.ngln beG.apa teknik
nolekrl tetiaaat y ltohotnblltr.z! drn r .rli o I 57 padd h.berrpa nrakanan
laur baik ]anE mcnrah aau yang relah diolah.
Anonim,2009, Keajaiban Pada Cumi cumidan gunra dirkses lada r!.ggat2 Juni
:000. \r p: inliLnJLrboe oo',on l00a 0) tui"ib3'.o.d.
dd-turi6.hhl.
M
-um'{.
'
ris, S.. Mack. P., Cal,lwell.
M.,Rm!T a.d Birkhcad. c.199?.
Swi'nnin8 asociared haemoftaeic colirisdle b B?rrri.rid.dlr O 157;I 17
infection: lividene ol prclongen onbmination of a fresb Mrer lake.
Ackm
. D.,
Epidenrlol
lnl{l.
ll9:1.3.
Sieiftrk. H. Zinnne nann. S. dnd Schelr. t,. 1993.
Prevaleme and sonE ptupcnies ol verolox (Shiga-like toxin)produci[B
in even dilleFnl spccics ol h.alrhy
animals. J
'lomc$ic
Clin Mlcobioi. :l I i243:l 2433.
Aeulio. L.. Ceier, D.,
Arr.rtrtl.,1i
Bouver.1., Bavai, C., Roscl, R., L€ Roux, A., Modlcr, M. p. Ray Cueniot. S.,
Mzu!. C.. A.quillicru. C. and ve.iozy Roand. C. 2001. Prcvatcicc ot
veroroxin-producinsE!.rer,.ridcoltand E cdli()157: H7 in pt8qrcasss
I'om rhrLr Fr.nch lauehre.hou*s. rilJ Fo.dMic.obiot 7l:2!9-25:
Aimboim. ll.C. and Dol!. I 1979. A mpid allaline exhcliotr pro..dur. tu.
screeninqrecomhina! DNA. Nuclcic,\cid Research. 7:1511-t52:1.
Coync, Vemon E., M.D. Jancs. S.
J Reid.200l,PCRP ms desig
and re.ction
Chriiinc M. Tho.Jr. 200 3. l,h 3macoloey for rhe Healrh CaE Prolc$ions. A
Wil.:y & Son\. Lrd., Puhlicarion. UnivcsiryolSrllod.
Chal,
L C.
|aiimah. A. 8.. Gh.zaLi, F. M.,l€e. HY.. Tununs. R. ShaNiior.
R. A. S..lhahnahtul, A.2., Malakar. P. M.. Nrl€auchi.Y..
A.T.ljllA
\'DL.hi.
^i
Ew
John
V d,,l.oi.P .003 BiodFr)o
vegehbLes cotrsuhedns Ulzz rvilh EleEncc ro lhcn Btsrme to
lnribiotl.s.lficdation! roon Re*rrch loun,ol l5r 125 ll1.
Desmarchclier I'M.
200i Prrho3cfic vibrioj ln: t,oldbonre ni.n)',aankms ot
tublic h{lrh slgfilcance Sixth Ediri.n. Aunmlian lNtirurc dt Foul Science
and Tcchiology (NSW Bmnch) Food Micmbiolog crcup: Ncq South
Doylc, M P- ard vV. Padhlc
\,ris.onsii Madison, Nes ]ork.
1939
Fmdbome
B3dc,i:
Paihoqcdi