Penggunaan Software Kimia Dalam Penggamb (1)
Paraf Asisten
LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK
Judul
:Penggunaan Software Kimia Dalam Penggambaran Struktur
Molekul
TujuanPercobaan
:Mempelajari dan mengaplikasikan pengetahuan dan ketrampilan
menggambar struktur molekul senyawa kimia menggunakan software
ChemSketch.
Pendahuluan
Teknologi informasi (informasion technology) biasa disebut TI atau infotech.
Berbagai definsi seperti, menurut Haag dan Keen (1996) Tegnologi informasi adalah
seperangkat alat yang membantu anda bekerja dengan iformasi dan melakukan tugas-tugas
yang berhubungan dengan pemrosesan informasi. Menurut Martin (1999) Tegnologi
informasi tidak hanya terbatas pada tegnologi komputer (perangkat keras dan perangkat
lunak) yang digunakan utuk memproses dan menyimpan informasi, melainkan juga
mencangkup tegnologi komunikasi untuk mengirimkan informasi. Sedangkan menurut
Williams dan Sawyer (2003) Tegnologi informasi adalah tegnologi yang menggabungkan
komputasi (komputer) dengan jalur komunikasi berkecepatan tinggi yang membawa data,
suara, dan video (Kadir dan Triwahyuni,2003).
Definisi-definisi tersebut terlihat bahwa tegnologi informasi baik secara implisit
maupun eksplisit tidak sekedar berupa tegnologi komputer, tetapi juga mencakup tegnologi
komunikasi. Dengan kata lain, yang disebut tegnologi informasi adalah gabungan antara
tegnologi komputer dan telekomunikasi (Kadir dan Triwahyuni,2003).
Alam memiliki berbagai macam benda dan memiliki berbagai macam senyawa kimia.
. Senyawa kimia yang terdapat di alam ini mempunyai beragam bentuk yang sangat unik,
bahkan terkadang senyawa kimia mempunyai bentuk molekul yang cukup rumit untuk
digambarkan. Misalnya saja sukrosa. Senyawa karbohidrat yang terdapat dalam gula tebu ini
memiliki rumus molekul C12H22O6 ini memiliki struktur yang cukup rumit untuk digambar
secara manual (Anonim,2014).
Struktur molekul senyawa yang cukup kompleks seperti sukrosa ini mungkin dapat
dikerjakan secara manual dengan mudah. Menggambar molekul dengan cara manual
mungkin hasilnya tidak akan terlalu rapi, apa lagi tidak memiliki keterampilan menggambar
yang baik (Anonim,2014).
Karena itu, untuk mempermudah pembuatan gambar struktur molekul senyawasenyawa yang cukup rumit seperti ini, mungkin akan memerlukan perangkat lunak (software)
yang dapat membuat gambar struktur molekul yang diinginkan, dan dapat dikerjakan dengan
menggunakan bantuan computer/laptop (Anonim,2014).
Sekarang ini sudah banyak perangkat lunak untuk komputasi kimia yang diciptakan
untuk mempermudah menggambar molekul-molekul. Diantara banyak perangkat-perangkat
lunak tersebut, dalam praktikum kali ini akan dibahas tentang perangkat lunak yang dapat
digunakan untuk membuat struktur molekul yaitu Chemsketch (Anonim,2014).
Prinsip Kerja
Software Chemsktech digunakan untuk mempermudah pembuatan gambar struktur molekul
senyawa-senyawa yang cukup rumit sehingga akan memerlukan perangkat lunak (software)
yang dapat membuat gambar struktur molekul yang diinginkan, dan dapat dikerjakan dengan
menggunakan bantuan computer/laptop
Alat
Laptop / PC dan Aplikasi ACD ChemSketch
Hasil
Aplikasi Chemskech yang telah dilakukan dengan menggambar struktur molekul dengan
berbagai bentuk dan model sangat membantu memudahkan pembuatan sesuai yang
diinginkan. Aplikasi Chemsketch memiliki banyak pilihan sehingga kita tidak sulit untuk
mengoprasikannya.
Aplikasi Chemsketch ini juga memiliki fitur-fitur yang cukup lengkap seperti peralatan
laboratorium ( Lab Kit ) , senyawa alkaloids , senyawa aromatics , dll. Dari fitur-fitur tersebut
aplikasi chemsketch akan mempermudah menggambarkan struktur suatu senyawa.
a. StrukturMolekul
No
NamaSenyawa
1.
MinyakAtsiri
StrukturMolekul
OH
OH
HO
O
OH
O
2.
CH2
H3CO
Eugenol
HO
3.
CH3
O
Biji Pala
(Trimyristin)
O
O
O
O
CH3
O
CH3
4.
O
BuahLada
(Piperine)
O
N
O
5.
CH3
Kafein
N
N
N
H3C
6.
Bensaldehida
O
N
CH3
O
O
H
b. PeralatanLaboratorium
No
1.
NamaAlat
Destilasi
2.
LabuUkur
3.
Termometer
4.
Penangas Air
Gambar
4
5
6
7
4
3
8
3
2
9
2
1
11
5
6
7
8
9
1
10
5.
Beaker Glass
6.
Erlenmeyer
7.
Corong
8.
Labu alas bulat
9
Pastledan Mortar
10
Kondensorrefluks
11
Corong pisah
Referensi
Anonim. 2014. PerangkatLunak Software PemodelanMolekul : ACD/ChemSketch [serial
online]
http://nabiungkangkung.blogspot.com/2013/04/perangkat-lunak-pemodelan-
molekul.html [19Februari 2014].
Anonim. 2014 . CHEMsketch... [serial online] http:// CHEMsketch... _ Inside
Me...!.htm.com/2014/02/CHEMsketch.html [19Februari 2014].
Kadir dan Triwahyuni. 2003. Pengenalan Tegnologi Informasi. ANDI : Yogyakarta.
Tim Penyusun. 2014. PetunjukPraktikum Kimia Organik. Jember: UniversitasJember.
Lampiran
1. MenggambarStruktursederhana
H3C
CH3
3
CH3
a.
F
F
F
b.
F
H3C
menjadi
CH2
H3C
H2C
c.
CH3
N
N
N
CH3
N
(CH 2)3Ph
F
2. MenggambarStruktur yang LebihKompleks
HO
O
OH
HO
O
O
O
OH
OH
O
O
OH
3. MemberiMuatan
H3C
+
NH2
CH3
4. Stereodeiscriptor
Z
S
CH3
Cl
CH3
5. Membuatikatankoordinasi
O
O
Li
O
6. IkatandanMuatanterdelokalisasi
CH3
CH3
Br CH3
H3C
CH3
+
CH3
7. Markush Bond
CH3
Br
8. MenggambarPeptidaSiklik : Tyr-Ala-Trp
HO
O
NH
NH
O
H 3C
Nama Praktikan
Luki Aprilliya S. (121810301026)
N
H
O
N
H
LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK
Judul
:Penggunaan Software Kimia Dalam Penggambaran Struktur
Molekul
TujuanPercobaan
:Mempelajari dan mengaplikasikan pengetahuan dan ketrampilan
menggambar struktur molekul senyawa kimia menggunakan software
ChemSketch.
Pendahuluan
Teknologi informasi (informasion technology) biasa disebut TI atau infotech.
Berbagai definsi seperti, menurut Haag dan Keen (1996) Tegnologi informasi adalah
seperangkat alat yang membantu anda bekerja dengan iformasi dan melakukan tugas-tugas
yang berhubungan dengan pemrosesan informasi. Menurut Martin (1999) Tegnologi
informasi tidak hanya terbatas pada tegnologi komputer (perangkat keras dan perangkat
lunak) yang digunakan utuk memproses dan menyimpan informasi, melainkan juga
mencangkup tegnologi komunikasi untuk mengirimkan informasi. Sedangkan menurut
Williams dan Sawyer (2003) Tegnologi informasi adalah tegnologi yang menggabungkan
komputasi (komputer) dengan jalur komunikasi berkecepatan tinggi yang membawa data,
suara, dan video (Kadir dan Triwahyuni,2003).
Definisi-definisi tersebut terlihat bahwa tegnologi informasi baik secara implisit
maupun eksplisit tidak sekedar berupa tegnologi komputer, tetapi juga mencakup tegnologi
komunikasi. Dengan kata lain, yang disebut tegnologi informasi adalah gabungan antara
tegnologi komputer dan telekomunikasi (Kadir dan Triwahyuni,2003).
Alam memiliki berbagai macam benda dan memiliki berbagai macam senyawa kimia.
. Senyawa kimia yang terdapat di alam ini mempunyai beragam bentuk yang sangat unik,
bahkan terkadang senyawa kimia mempunyai bentuk molekul yang cukup rumit untuk
digambarkan. Misalnya saja sukrosa. Senyawa karbohidrat yang terdapat dalam gula tebu ini
memiliki rumus molekul C12H22O6 ini memiliki struktur yang cukup rumit untuk digambar
secara manual (Anonim,2014).
Struktur molekul senyawa yang cukup kompleks seperti sukrosa ini mungkin dapat
dikerjakan secara manual dengan mudah. Menggambar molekul dengan cara manual
mungkin hasilnya tidak akan terlalu rapi, apa lagi tidak memiliki keterampilan menggambar
yang baik (Anonim,2014).
Karena itu, untuk mempermudah pembuatan gambar struktur molekul senyawasenyawa yang cukup rumit seperti ini, mungkin akan memerlukan perangkat lunak (software)
yang dapat membuat gambar struktur molekul yang diinginkan, dan dapat dikerjakan dengan
menggunakan bantuan computer/laptop (Anonim,2014).
Sekarang ini sudah banyak perangkat lunak untuk komputasi kimia yang diciptakan
untuk mempermudah menggambar molekul-molekul. Diantara banyak perangkat-perangkat
lunak tersebut, dalam praktikum kali ini akan dibahas tentang perangkat lunak yang dapat
digunakan untuk membuat struktur molekul yaitu Chemsketch (Anonim,2014).
Prinsip Kerja
Software Chemsktech digunakan untuk mempermudah pembuatan gambar struktur molekul
senyawa-senyawa yang cukup rumit sehingga akan memerlukan perangkat lunak (software)
yang dapat membuat gambar struktur molekul yang diinginkan, dan dapat dikerjakan dengan
menggunakan bantuan computer/laptop
Alat
Laptop / PC dan Aplikasi ACD ChemSketch
Hasil
Aplikasi Chemskech yang telah dilakukan dengan menggambar struktur molekul dengan
berbagai bentuk dan model sangat membantu memudahkan pembuatan sesuai yang
diinginkan. Aplikasi Chemsketch memiliki banyak pilihan sehingga kita tidak sulit untuk
mengoprasikannya.
Aplikasi Chemsketch ini juga memiliki fitur-fitur yang cukup lengkap seperti peralatan
laboratorium ( Lab Kit ) , senyawa alkaloids , senyawa aromatics , dll. Dari fitur-fitur tersebut
aplikasi chemsketch akan mempermudah menggambarkan struktur suatu senyawa.
a. StrukturMolekul
No
NamaSenyawa
1.
MinyakAtsiri
StrukturMolekul
OH
OH
HO
O
OH
O
2.
CH2
H3CO
Eugenol
HO
3.
CH3
O
Biji Pala
(Trimyristin)
O
O
O
O
CH3
O
CH3
4.
O
BuahLada
(Piperine)
O
N
O
5.
CH3
Kafein
N
N
N
H3C
6.
Bensaldehida
O
N
CH3
O
O
H
b. PeralatanLaboratorium
No
1.
NamaAlat
Destilasi
2.
LabuUkur
3.
Termometer
4.
Penangas Air
Gambar
4
5
6
7
4
3
8
3
2
9
2
1
11
5
6
7
8
9
1
10
5.
Beaker Glass
6.
Erlenmeyer
7.
Corong
8.
Labu alas bulat
9
Pastledan Mortar
10
Kondensorrefluks
11
Corong pisah
Referensi
Anonim. 2014. PerangkatLunak Software PemodelanMolekul : ACD/ChemSketch [serial
online]
http://nabiungkangkung.blogspot.com/2013/04/perangkat-lunak-pemodelan-
molekul.html [19Februari 2014].
Anonim. 2014 . CHEMsketch... [serial online] http:// CHEMsketch... _ Inside
Me...!.htm.com/2014/02/CHEMsketch.html [19Februari 2014].
Kadir dan Triwahyuni. 2003. Pengenalan Tegnologi Informasi. ANDI : Yogyakarta.
Tim Penyusun. 2014. PetunjukPraktikum Kimia Organik. Jember: UniversitasJember.
Lampiran
1. MenggambarStruktursederhana
H3C
CH3
3
CH3
a.
F
F
F
b.
F
H3C
menjadi
CH2
H3C
H2C
c.
CH3
N
N
N
CH3
N
(CH 2)3Ph
F
2. MenggambarStruktur yang LebihKompleks
HO
O
OH
HO
O
O
O
OH
OH
O
O
OH
3. MemberiMuatan
H3C
+
NH2
CH3
4. Stereodeiscriptor
Z
S
CH3
Cl
CH3
5. Membuatikatankoordinasi
O
O
Li
O
6. IkatandanMuatanterdelokalisasi
CH3
CH3
Br CH3
H3C
CH3
+
CH3
7. Markush Bond
CH3
Br
8. MenggambarPeptidaSiklik : Tyr-Ala-Trp
HO
O
NH
NH
O
H 3C
Nama Praktikan
Luki Aprilliya S. (121810301026)
N
H
O
N
H