Analisis Keragaman Genetik Beberapa Origin Tanaman Kelapa Sawit (Elaeisguineensis Jacq.) Menggunakan Primer Spesifik Ily-2 dan Primer SSR
ABSTRACT
SYLVIA BIANCA S SIHOMBING: Identification of genomic DNA
fragments of palm oil with PCR products using specific primer for oleic acid and
SSR (Simple Sequence Repeat) primer, supervised by LOLLIE AGUSTINA P.
PUTRI and LUTHFI AZIZ M SIREGAR. The aim of the research was to identify
genomic DNA fragments of palm oil with PCR products by using spesific primer
for oleic acid and SSR primer. This research was conducted in Plant Tissue
Culture Laboratory, Faculty of Agriculture, University of Sumatera Utara, from
Maret to July 2017. A total of 36 palm oil samples issued by were identified using
specific ILY -2 primer of molecular marker for acid oleic and SSR Primer.
The results showed band patterns a total of 3 amplicons For ILY-2
Primer,4 amplicons for FR3300 and 6 amplicons sor FR 1753. Polymorphism
percentage was indicated at 67% for ILY-2 Primer and 100% for Primer FR 3300
and FR 1753. There was differences in band patterns on samples derived from the
same individual but different sources of isolated plant tissues. In this research
DNA fragments was obtained ranged from ± 127 - 1324 bp. Dendogram analysis
spread 36 samples into three main groups and molecular diversity that can be
explained using ILY-2 primer and SSR Primer were 36,65 %.
Keywords: oil palm, oleic acid, polymerase chain reaction, spesific primer, simple
sequence repeat
i
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
SYLVIA BIANCA S SIHOMBING: Identifikasi Fragmen DNA Genomik
Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Hasil PCR (Polymerase Chain Reaction)
Menggunakan Primer Spesifik untuk Asam Oleat dan Primer SSR (Simple
Sequence Repeat), dibimbing oleh LOLLIE AGUSTINA P. PUTRI dan
LUTHFI AZIZ M SIREGAR. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi
fragmen DNA genomik kelapa sawit hasil PCR dengan menggunakan primer
spesifik untuk asam oleat dan primer SSR. Penelitian ini dilaksanakan di
Laboratorium Kultur Jaringan Tanaman, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera
Utara, dimulai dari bulan Maret hingga Juli 2017. Sebanyak 36 sampel dari
tanaman kelapa sawit yang digunakan diidentifikasi menggunakan marka
molekuler primer spesifik ILY-2 untuk Asam oleat.
Hasil penelitian menunjukkan pola pita sebanyak 3 amplikon untuk primer
ILY-2, 4 amplikon untuk FR 3300 dan 6 amplikon untuk primer FR 1753.
Persentase polimorfisme yang dihasilkan sebesar 67% untuk ILY-2 dan 100%
untuk primer FR 3300 dan Primer FR 1753. Terdapat perbedaan pola pita pada
sampel yang berasal dari individu yang sama tetapi berbeda sumber bagian
tanaman yang diisolasi. Pada penelitian ini diperoleh fragmen DNA dengan
ukuran berkisar ± 127 bp - 1324 bp. Analisis dendogram membagi 36 sampel
menjadi tiga kelompok utama dan keragaman molekuler yang dapat dijelaskan
dengan primer ILY-2 dan Primer SSR sebesar 36.65 %.
Kata kunci: asam oleat, kelapa sawit, polymerase chain reaction, primer spesifik,
simple sequence repeat
ii
Universitas Sumatera Utara
SYLVIA BIANCA S SIHOMBING: Identification of genomic DNA
fragments of palm oil with PCR products using specific primer for oleic acid and
SSR (Simple Sequence Repeat) primer, supervised by LOLLIE AGUSTINA P.
PUTRI and LUTHFI AZIZ M SIREGAR. The aim of the research was to identify
genomic DNA fragments of palm oil with PCR products by using spesific primer
for oleic acid and SSR primer. This research was conducted in Plant Tissue
Culture Laboratory, Faculty of Agriculture, University of Sumatera Utara, from
Maret to July 2017. A total of 36 palm oil samples issued by were identified using
specific ILY -2 primer of molecular marker for acid oleic and SSR Primer.
The results showed band patterns a total of 3 amplicons For ILY-2
Primer,4 amplicons for FR3300 and 6 amplicons sor FR 1753. Polymorphism
percentage was indicated at 67% for ILY-2 Primer and 100% for Primer FR 3300
and FR 1753. There was differences in band patterns on samples derived from the
same individual but different sources of isolated plant tissues. In this research
DNA fragments was obtained ranged from ± 127 - 1324 bp. Dendogram analysis
spread 36 samples into three main groups and molecular diversity that can be
explained using ILY-2 primer and SSR Primer were 36,65 %.
Keywords: oil palm, oleic acid, polymerase chain reaction, spesific primer, simple
sequence repeat
i
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
SYLVIA BIANCA S SIHOMBING: Identifikasi Fragmen DNA Genomik
Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Hasil PCR (Polymerase Chain Reaction)
Menggunakan Primer Spesifik untuk Asam Oleat dan Primer SSR (Simple
Sequence Repeat), dibimbing oleh LOLLIE AGUSTINA P. PUTRI dan
LUTHFI AZIZ M SIREGAR. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi
fragmen DNA genomik kelapa sawit hasil PCR dengan menggunakan primer
spesifik untuk asam oleat dan primer SSR. Penelitian ini dilaksanakan di
Laboratorium Kultur Jaringan Tanaman, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera
Utara, dimulai dari bulan Maret hingga Juli 2017. Sebanyak 36 sampel dari
tanaman kelapa sawit yang digunakan diidentifikasi menggunakan marka
molekuler primer spesifik ILY-2 untuk Asam oleat.
Hasil penelitian menunjukkan pola pita sebanyak 3 amplikon untuk primer
ILY-2, 4 amplikon untuk FR 3300 dan 6 amplikon untuk primer FR 1753.
Persentase polimorfisme yang dihasilkan sebesar 67% untuk ILY-2 dan 100%
untuk primer FR 3300 dan Primer FR 1753. Terdapat perbedaan pola pita pada
sampel yang berasal dari individu yang sama tetapi berbeda sumber bagian
tanaman yang diisolasi. Pada penelitian ini diperoleh fragmen DNA dengan
ukuran berkisar ± 127 bp - 1324 bp. Analisis dendogram membagi 36 sampel
menjadi tiga kelompok utama dan keragaman molekuler yang dapat dijelaskan
dengan primer ILY-2 dan Primer SSR sebesar 36.65 %.
Kata kunci: asam oleat, kelapa sawit, polymerase chain reaction, primer spesifik,
simple sequence repeat
ii
Universitas Sumatera Utara