Adapun pembagian tugas dan wewenang masing-masing seksi dalam struktur organisasi Kantor Pelayanan Pajak Pratama Medan Timur adalah :
1. Sub Bagian Tata Usaha Umum, mempunyai tugas :
1.1. Penatausahaan surat masuk dan surat keluar.
1.2. Menyusun tanggapantindak lanjut terhadap Surat Hasil Pemeriksaan
Laporan Hasil Pemeriksaan dari Ditjen KemenkeuBPKBPKPUnit Fungsional Pemeriksaan lainnya.
1.3. Menyusun tanggapan terhadap surat pengaduan anggota masyarakat melalui
pos maupun secara langsung. 1.4.
Menyusun laporan berkala KPP, meliputi Laporan Ketertiban Pegawai, Laporan Penggunaan Anggaran, Laporan Pemakaian Barang-Barang Milik
Negara dan lain sebagainya. 1.5.
Meneliti pelanggaran disiplin pegawai yang terjadi sesuai dengan peraturan Pemerintah Nomor 53 Tahun 2010.
1.6. Pengadministrasian hak-hak pegawai antara lain hak cuti, asuransi
kesehatan, pengangkatan pegawai, pengajuan pensiun dan sebagainya. 1.7.
Pengadministrasian gaji pegawai. Pemeliharaan aset-aset negara serta pengadaan barang-barang kebutuhan kantor.
1.8. Pengelolaan dan penggunaan anggaran, serta mengelola Sistem Akuntansi
Instansi.
2. Seksi Pengolahan Data dan Informasi, mempunyai tugas :
2.1. Menyusun rencana penerimaan pajak berdasarkan ekonomi dan keuangan.
2.2. Menatausahaan penerimaan pajak.
2.3. Membuat Laporan monotoring Penerimaan Pajak dan Extra Effort.
2.4. Perbaikan komputer dan aplikasi komputer.
2.5. Penatausahaan Alat Keterangan.
2.6. Penatausahaan surat-surat masuk pada Seksi pengolahan Data dan Informasi.
2.7. Pengaturan jaringan komputer ke seluruh pegawai serta pengawasan
terhadap penggunaan jaringan komputer.
3. Seksi Pelayanan, mempunyai tugas :
3.1. Menatausahakan surat-surat permohonan dari wajib pajak dan surat-surat
lainnya pada Tempat Pelayanan Terpadu TPT. 3.2.
Menatausahakan surat-surat masuk untuk seksi pelayanan. 3.3.
Penatausahaan arsipberkas perpajakan. 3.4.
Menyelesaikan registrasiwajib pajak dan pengukuhan Pengusaha Kena Pajak PKP serta permohonan NPWP.
3.5. Menyelesaikanpermohonan penghapusan NPWP dan pengukuhan PKP.
3.6. Menerbitkan surat keputusan pembetulan produk hukum.
3.7. Pemberitahuan wajib pajak keluarpindah masuk.
3.8. Menatausahakan SPT Tahunan PPh atau SPT Masa PN atau SPT Masa PPh
pemotong dan pemungut yang telah diterima kembali dalam rangka pengawasan kepatuhan wajib pajak.
3.9. Menyelesaikan permohonan perpanjangan jangka waktu penyampaian SPT
Tahunan PPh. 3.10.
Melayani peminjamanpengiriman berkas darike KPP lain. 3.11.
Melaksanakan pemenuhan permintaan konfirmasi dan klarifikasi.
3.12. Mencetak surat teguran sehubungan dengan SPT Tahunan PPh, SPT Masa
PPh, SPT Masa PPN, yang tidak disampaikan atau disampaikantidak sesuai dengan batas waktu yang telah ditentukan.
3.13. Menerbitkan Surat Ketetapan Pajak SKP dan Surat Tagihan Pajak SPT.
3.14. Melaksanakan penyuluhan perpajakan.
3.15. Melaksanakan pelayanan kebutuhan informasi perpajakan yang dibutuhkan
oleh wajib pajak.
4. Seksi Penagihan, mempunyai tugas :