Bahan yang digunakan dalam ekstraksi DNA adalah sampel sirip ekor benih ikan lele dumbo transgenik F3, larutan fiksasi etanol 70, akuades, kit ekstraksi
DNA GeneJet Genomic DNA Purification kit, Thermo Scientific, sodium hipochlorit
1, tissue.
b. Amplifikasi PCR
Alat yang digunakan dalam amplifikasi PCR adalah mesin Thermal Cycler BIO-RAD, Esco, micropipette Thermo Scientific, chiller on ice IsoFreeze,
Chiller templa te IsoFreeze, microtube, tubes rack eppendorf, pinset, spidol,
gloves , masker.
Bahan yang digunakan dalam amplifikasi PCR adalah DNA template, nuclea se free wa ter, Fa stSta rt PCR Ma ster Mix
Roche ,
primer forwa rd yaitu ACT 107-
F 5’-GTG TGT GAC GCT GGA CCA ACT– 3’, primer reverse yaitu PhGH2-
R 5’-CGA TAA GCA CGC CGA TGC CCA TTT-3’ Marnis dkk., 2014.
c. Elektroforesis
Alat yang digunakan dalam elektroforesis adalah mini horizontal elektroforesis
Cleaver scientific Ltd, BIO-RAD, gel doc UVP, timbangan digital AND, beaker glass Pyrex, gelas ukur Pyrex, hot plate WiseStir, stirrer,
micropipette Thermo Scientific, cetakan agar 30 mL dan 60 mL , tubes rack
eppendorf, aluminium foil, chiller on ice IsoFreeze, chiller template IsoFreeze, gloves
, gunting, masker, komputer, kamera digital dan alat tulis.
Universitas Sumatera Utara
Bahan yang digunakan dalam elektroforesis adalah 10X Tr is-Acetate-EDTA TAE Buffer Vivantis, amplikon, marker 100-3000 bp Vivantis, loading dye,
akuades, agarose Vivantis, laboratory film Parafilm dan tissue.
Rancangan Percobaan
Rancangan percobaan yang digunakan dalam penelitian ini adalah Rancangan Acak Lengkap RAL dengan
enam perlakuan dan dua kali ulangan.
Perlakuan terdiri dari: P1
: Pemeliharaan benih ikan transgenik dan predator non-transgenik. P2
: Pemeliharaan benih ikan transgenik tanpa predator. P3
: Pemeliharaan benih ikan transgenik dan predator transgenik. P4
: Pemeliharaan benih ikan non-transgenik dan predator non-transgenik P5
: Pemeliharaan benih ikan non-transgenik tanpa predator. P6
: Pemeliharaan benih ikan non-transgenik dan predator transgenik.
Prosedur Penelitian Pemeliharaan Ikan
a. Hewan Uji
Hewan uji yang digunakan pada penelitian ini adalah benih ikan lele dumbo transgenik F3 berumur tiga minggu sebanyak 210 ekor dengan panjang rata-rata
2,15 cm ± 0,31 dan bobot rata-rata 0,10 ± 0,04 g, sedangkan benih ikan lele dumbo non-transgenik sebanyak 210 dengan panjang rata-rata 1,82 cm ± 0,23 dan bobot
rata-rata 0,05 ± 0,02 g.
Universitas Sumatera Utara
b. Pengujian Perilaku Predator dan Anti-Predator pada Ikan Lele Dumbo Transgenik F3
