Dina Karina Islami, 2015 ANALISIS KEKERABATAN ANGGOTA FAMILIA SOLANACEAE
BERDASARKAN SIKUEN DNA DAERAH ITS Universitas Pendidikan Indonesia
| repository.upi.edu
| perpustakaan.upi.edu
26
BAB III METODE PENELITIAN
3.1 Jenis Penelitian
Penelitian ini merupakan jenis penelitian dasar dengan menggunakan metode deskriptif, yaitu untuk menganalisis hubungan kekerabatan antar
anggota familia Solanaceae dengan cara merekonstruksi pohon filogenetik berdasarkan siuken DNA daerah ITS.
3.2 Sampel Penelitian
Sampel pada penelitian ini adalah sebanyak dua puluh spesies tumbuhan dari sebelas genus anggota familia Solanaceae. Familia Convolvulaceae,
Apocynaceae, dan Plantaginaceae digunakan sebagai outgroup. Pemilihan familia Convolvulaceae sebagai outgroup didasarkan pada penelitian
Stefanovic et al., 2002, hlm. 1510 yang menyatakan bahwa Convolvulaceae merupakan sister group dari familia Solanaceae. Sedangkan Plantaginaceae,
dan Apocynaceae dipilih sebagai outgroup karena memiliki kekerabatan yang dekat dengan familia Solanaceae Melotto-Passarin et al., 2008, hlm. 91;
Haston et al., 2009, hlm. 161. Sikuen DNA daerah ITS untuk genus Capsicum dan Withania diperoleh dari genbank dengan alamat
http:www.ncbi.nlm.nih.gov . Daftar tumbuhan yang digunakan pada
penelitian ini tercantum dalam Tabel 3.1.
Tabel 3.1 Tumbuhan yang Digunakan dalam Penelitian
No 1
Spesies 2
Nama Daerah 3
Keterangan 4
Lokasi Sampling
5
1 Physalis angulata
Ciplukan Ingroup
Ujung Berung 2
Solanum nigrum Leunca
Ingroup UPI
3 Solanum wrightii
Karundung Ingroup
UPI dan Dago 4
Solanum lycopersicum Tomat
Ingroup UPI Ujung
Berung
Dina Karina Islami, 2015 ANALISIS KEKERABATAN ANGGOTA FAMILIA SOLANACEAE
BERDASARKAN SIKUEN DNA DAERAH ITS Universitas Pendidikan Indonesia
| repository.upi.edu
| perpustakaan.upi.edu
5 Solanum viarum
Terong hutan Ingroup
UPI
1 2
3 4
5
6 Solanum melongena
Terong ungu Ingroup
Ujung Berung 7
Nicotiana tabacum Tembakau
Ingroup Ujung Berung
8 Brugmansia suaveolens
Kecubung orange
Ingroup UPI
9 Brugmansia candida
Kecubung putih Ingroup
UPI 10
Brunfelsia uniflora Manacá
Ingroup UPI
11 Cestrum nocturnum
Kembang dayang
Ingroup UPI
12
Solanum pseudocapsicum
Leunca kuning Ingroup
UPI 13
Capsicum annum Cabai merah
Ingroup Genbank
14 Withania somnifera
Ashwagandha Ingroup
Genbank 15
Datura metel Kecubung ungu
Ingroup Cihideung
16 Petunia grandiflora
Petunia Ingroup
Cihideung 17
Nicandra physalodes Ciplukan keras
Ingroup UPI
18 Cestrum cultum
Kembang dayang
Ingroup Dago
19 Physalis peruviana
Ciplukan Ingroup
Dago 20
Solanum tuberosum Kentang
Ingroup Cimahi
21 Plantago major
Ki sendok Outgroup
UPI Dago 22
Allamanda cathartica Alamanda
Outgroup UPI
23 Ipomoea cairica
Bunga terompet Outgroup
UPI
3.3 Lokasi Penelitian
