Peran Polimorfisme Gen Reseptor Vitamin D Pada Kerentanan Terhadap Tuberkulosis Paru Suku Batak Di Medan

vii

PERAN POLIMORFISME GEN RESEPTOR VITAMIN D
PADA KERENTANAN TERHADAP TUBERKULOSIS PARU
SUKU BATAK DI MEDAN

Diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh Gelar Doktor
dalam Program Studi Doktor (S-3) Ilmu Kedokteran
pada Fakultas Kedokteran
Universitas Sumatera Utara
Untuk dipertahankan di Hadapan Sidang Ujian Terbuka
Program Studi Doktor (S-3) Ilmu Kedokteran
Universitas Sumatera Utara

Oleh
BINTANG YINKE MAGDALENA SINAGA
NIM 078102007

PROGRAM STUDI DOKTOR (S-3) ILMU KEDOKTERAN
FAKULTAS KEDOKTERAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA

MEDAN
2015

vii

viii

PROMOTOR
Prof. Dr. dr. Muhammad Amin, Sp.P(K)
Guru Besar Tetap Pulmonologi & Ilmu Kedokteran Respirasi
Fakultas Kedokteran
Universitas Airlangga
Surabaya

KO-PROMOTOR
dr. Yahwardiah Siregar, Ph.D
Staf Pengajar Tetap Biokimia
Fakultas Kedokteran
Universitas Sumatera Utara
Medan

KO-PROMOTOR
Prof. dr. Sori Muda Sarumpaet, MPH
Guru Besar Tetap Epidemiologi
Fakultas Kesehatan Masyarakat
Universitas Sumatera Utara
Medan

viii

ix

ix

x
Telah diuji pada Ujian Tertutup
Tanggal 10 Februari 2014

TIM PENGUJI DISERTASI

Ketua

:

Prof. Dr. dr. Muhammad Amin, Sp.P(K)

Anggota

:

dr. Yahwardiah Siregar, Ph.D
Prof. dr. Sori Muda Sarumpaet, MPH
Prof. dr. Tamsil Syafiuddin, Sp.P(K)
dr. Gino Tann, Ph.D, Sp.PK
Dr. Ir. Erna Mutiara, MKM
Dr. dr. Erlina Burhan, Msc, Sp.P(K)

x

xi

PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH
UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS

Sebagai sivitas akademik Universitas Sumatera Utara, saya yang bertanda
tangan dibawah ini :
Nama

: Bintang Yinke Magdalena Sinaga

NIM

: 078102007

Program Studi

: Ilmu Kedokteran

Jenis Karya

: Disertasi

Demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan
kepada Universitas Sumatera Utara Hak Bebas Royalti Non Eksklusif (Nonexclusive Royalty Free Right) atas disertasi saya yang berjudul :
PERAN POLIMORFISME GEN RESEPTOR VITAMIN D
PADA KERENTANAN TERHADAP TUBERKULOSIS PARU
SUKU BATAK DI MEDAN
Beserta perangkat yang ada (jika diperlukan), dengan Hak Bebas Royalti Non
eksklusif ini Universitas Sumatera Utara berhak menyimpan, mengalih
media/formatkan,

mengelola

dalam

bentuk

database,

merawat

dan

mempublikasikan disertasi saya tanpa meminta izin dari saya sebagai penulis
dan sebagai pemilik hak cipta.
Demikian pernyataan ini saya perbuat dengan sebenarnya.
Dibuat di Medan pada Maret 2015
Yang menyatakan,

(Bintang Yinke Magdalena Sinaga)

xi

xii

PERNYATAAN ORISINALITAS

Saya

yang

bertanda

tangan

dibawah

ini,

dengan

ini

menyatakan bahwa hasil penelitian ini adalah hasil karya
sendiri, dan semua sumber baik yang dikutip maupun dirujuk
telah saya nyatakan dengan benar.

Medan,

Maret 2015

Materai

Nama : Bintang Yinke Magdalena Sinaga
NIM : 078102007

xii

vii
UCAPAN TERIMA KASIH
Dengan

penuh

kebahagiaan

dan

perasaan

lega

saya

mengucapkan puji dan syukur yang setinggi-tingginya kepada Tuhan
Yang Maha Kuasa atas berkat dan karunia yang telah diberikan sehingga
saya dapat menyelesaikan pendidikan S3 dan disertasi dengan judul
”Peran Polimorfisme Gen Reseptor Vitamin D Pada Kerentanan terhadap
Tuberkulosis Paru Suku Batak di Medan”. Penelitian dan penulisan
disertasi ini mendapat dukungan dan masukan dari berbagai pihak.
Dengan hati yang tulus perkenankan saya sampaikan rasa terima kasih
yang sedalam-dalamnya kepada yang terhormat:
Pejabat Rektor Universitas Sumatera Utara, Prof. Subhilhar, Ph.D,
yang berkenan memimpin sidang terbuka promosi doktor saya dan
mantan Rektor Universitas Sumatera Utara, Prof. Dr. dr. Syahril Pasaribu,
DTM&H, M.Sc(CTM), SpA(K) atas kesempatan dan fasilitas yang
diberikan kepada saya dalam pendidikan Program Studi Doktor (S3)
Ilmu Kedokteran di Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara.
Dekan Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara, Prof. dr.
Gontar A. Siregar, Sp.PD, KGEH, Pembantu Dekan I Prof. dr. Guslihan
Dasa Tjipta, Sp.A(K), Pembantu Dekan II dr. Zaimah Z. Tala, MS,

Sp.GK(K) dan Pembantu Dekan III dr. Muhammad Rusda, Sp.OG(K), atas
kesempatan, dukungan dan fasilitas dalam mengikuti pendidikan S-3.
Prof. dr. Chairuddin P. Lubis, DTM&H, Sp.A(K) sebagai mantan
Ketua Program Studi S-3 Ilmu Kedokteran yang telah mengizinkan dan
mendorong untuk meraih pendidikan yang lebih tinggi. Demikian juga
kepada Prof. Dr. dr. Delfitri Munir, Sp.THT-KL sebagai

Sekretaris

Program Studi S-3, Prof. dr. Harun Rasyid Lubis Sp.PD-KGH sebagai
mantan Ketua Program Studi S-3 dan Prof. drg. Ismet Daniel Nasution,
Ph.D, Sp.Pros(K) sebagai mantan Sekretaris Program Studi S-3 Ilmu
Kedokteran Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara yang secara
berkesinambungan memberikan dukungan, saran dan motivasi kepada
saya selama mengikuti proses pendidikan.

vii

viii
Prof. Dr. dr. Muhammad Amin, Sp.P(K), Guru Besar Tetap

Pulmonologi

&

Ilmu

Kedokteran

Respirasi,

Fakultas

Kedokteran

Universitas Airlangga sebagai Promotor, yang banyak memberikan
bimbingan dan arahan dalam menyelesaikan disertasi ini. Saya bangga
dapat dibimbing oleh beliau yang menjadi panutan sebagai pendidik yang
sejati dengan dedikasi tinggi, kearifan dan sikap selalu siap menolong.
Dr. Yahwardiah Siregar, Ph.D, Staf Pengajar Tetap Biokimia
Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara sebagai Ko-Promotor,
yang dengan penuh kesabaran membimbing saya dalam menyelesaikan
disertasi ini dan juga dalam aspek lainnya dalam kehidupan sehingga
menambah makna dalam keilmuan, bermasyarakat dan berkeluarga.
Prof. dr. Sori Muda Sarumpaet, MPH, Guru Besar Tetap
Epidemiologi Fakultas Kesehatan Masyarakat Universitas Sumatera
Utara, atas kesediaannya menjadi Ko-Promotor, yang dengan tulus dan
lapang hati membimbing, memotivasi, memberi masukan, pengarahan
dalam penulisan disertasi ini.
Prof. Dr. dr. E.J. Manuhutu, MS, Sp.P(K) (almarhum), yang pernah
memberikan bimbingan dan motivasi yang sangat berharga dalam
mengikuti pendidikan program Doktor.
Prof.

dr.

H.

Luhur

Soeroso,

Sp.P(K),

Ketua

Departemen

Pulmonologi dan Ilmu Kedokteran Respirasi Universitas Sumatera Utara.
Terima kasih dan penghormatan yang setingginya atas izin dan
kepercayaan yang diberikan kepada saya untuk mengikuti pendidikan
Program Doktor.
Penguji Disertasi Prof. dr. Tamsil Syafiuddin, Sp.P(K), dr. Gino Tann,
Ph.D, Sp.PK, Dr. Ir. Erna Mutiara, MKM dan Dr. dr. Erlina Burhan, Msc,
Sp.P(K) yang telah bersedia memberikan penilaian dan masukan untuk
kesempurnaan disertasi ini.
Para pemberi kuliah S-3 Prof. dr. Chairuddin P. Lubis, DTM&H,
Sp.A(K); Prof. dr. Harun Rasyid Lubis Sp.PD-KGH; Prof. dr. Iskandar
Zulkarnaen Lubis, Sp.A(K) (almarhum); Prof. Dr. dr. Rozaimah Zainviii

ix
Hamid, MS, Sp.FK; Prof. Dr. drg. Nurmala Situmorang, M.Kes (almarhum);
Drs. Sutarman, MSc, Ph.D; Prof. Dr. dr. E.J. Manuhutu, MS, Sp.P(K)
(almarhum); dr. Yahwardiah Siregar, Ph.D dan Dr. drs. Ridwan Siregar, M.
Lib atas pengajaran dan bimbingan selama mengikuti pendidikan S-3.
Dr. Zainuddin Amir, Sp.P(K) dan kepala BP4 Medan dr. Adlan
Sitompul, Sp.P yang memberi izin pelaksanaan tempat penelitian, serta
Werdiasih Zahara, S.E. dan seluruh staf BP4 lainnya yang ikut membantu.
Dr. dr. Yusirwan, Sp.B, Sp.BA(K), MARS, Direktur Utama R.S. H.
Adam Malik Medan serta Dr. Zulfikar Lubis Sp.PK(K) dan dr. Nelly E.
Samosir Sp.PK. pada Departemen Patologi Klinik R.S. H. Adam Malik
Medan serta Ellys Simatupang yang membantu pelaksanaan penelitian.
Dr. Tetty Aman Nasution, M.Med. Sc, sebagai Mantan Kepala
Laboratorium Terpadu FK USU, Mardiah Nasution, S.T., Indra Wahyudi,
S.P. dan Eliwati Hasibuan, S.Si.MSi sebagai staf Laboratorium Terpadu
FK USU yang semuanya telah banyak membantu pelaksanaan penelitian.
Dr. Ir. Erna Mutiara, MKM, Dr. dr. Arlinda Sari Wahyuni, M.Kes, dr.
Putri Chairani Eyanoer, MS.Epid., Ph.D. dan Yahman, Amd.Kom, yang
telah membantu di bidang Metodologi Penelitian dan Statistik.
Dr. dr. Imam Budi Putra, MHA, Sp.KK, Dipa Hidayat, S.Kom,
Muhammad Faridho, S.Kom, Kiki Lestari, SE; di sekretariat Program Studi
Doktor dan para sejawat peserta program studi doktor atas bantuan
informasi ilmiah, dorongan moril dan kekompakan selama pendidikan.
Seluruh guru, para senior, teman sejawat, para medis, pegawai dan
para peserta program dokter spesialis di Departemen Pulmonologi dan
Ilmu Kedokteran Respirasi FK USU/RSUP Haji Adam Malik atas bantuan
dan dukungan kepada saya dalam menyelesaikan pendidikan S-3.
Seluruh peserta yang menjadi subjek penelitian, atas kesediaannya
menjadi peserta dalam penelitian ini.
Terima kasih dan doa yang setulusnya kepada papa saya
almarhum Prof. Dr. dr. H.S.R.Parlindungan Sinaga dan mama saya Solita
Lumongga Simanjuntak, orang tua yang sangat saya kagumi dan cintai,
yang telah membesarkan saya dengan penuh kasih, memberikan motivasi

ix

x
dan teladan yang baik dalam bekerja keras, mendalami pendidikan ilmu
pengetahuan dan mengutamakan kejujuran, hingga membentuk diri saya
sebagaimana jadinya hari ini. Juga kepada kedua mertua drg. P.
Simanjuntak dan drg. M. Naiborhu atas kasih sayang, perhatian serta
doanya yang tiada batasnya.
Suami yang tercinta Freddyben Simanjuntak, ST, MM, yang telah
mendampingi dengan penuh kesabaran dan kasih sayang, terimakasih
atas doa dan dukungannya dalam suka duka menjalani pendidikan S-3.
Demikian pula kepada keempat anak saya: William Joshua Toga Raja
Simanjuntak, Anastasia Grace Eurika Simanjuntak, Thomas Rafael
Simanjuntak dan Michael Christopher Simanjuntak yang merupakan
sumber kebahagiaan, keceriaan dan semangat bagi saya, yang begitu
sabar berdoa dan menanti saya menyelesaikan disertasi ini. Semoga
menjadi anak yang beriman dan membanggakan.
Saudara-saudaraku dr. Elisabeth Putri Sulung Hasudungan Sinaga,
Sp.OG. dan keluarga serta Juliana Pasu Christina Sinaga, S.H., M.Hum.
dan keluarga. Demikian juga kepada ipar saya, John Simanjuntak, S.T.
dan keluarga serta seluruh keluarga besar yang telah memberikan
dorongan, doa dan persaudaraan yang erat selama ini. Semoga
kerukunan keluarga dan rasa saling mengasihi dapat terus kita bina
hingga masa mendatang.
Semua pihak yang telah banyak membantu, baik langsung maupun
tidak langsung yang tidak dapat saya sebutkan satu persatu, hanya Tuhan
yang mampu memberikan balasan terbaik.
Semoga disertasi ini dapat memberi sumbangan yang berharga
bagi perkembangan dunia ilmu pengetahuan dan bermanfaat bagi orang
banyak. Semoga Tuhan senantiasa mencurahkan berkat dan kasihNya
kepada kita semua. Amin.
Medan,

Maret 2015

Penulis,

Bintang Yinke Magdalena Sinaga

x

xi

DAFTAR RIWAYAT HIDUP

A. Identitas Pribadi
1. Nama

: dr. Bintang Yinke Magdalena Sinaga,
M.Ked(Paru), Sp.P(K).

2. Tempat/Tgl. Lahir

: Medan, 28 - 02 – 1972.

3. Agama

: Kristen Protestan.

4. NIP

: 197202281999032002.

5. Pangkat/Golongan : Lektor, III/c.
6. Jabatan Pekerjaan :
Departemen

: Pulmonologi dan Ilmu Kedokteran Respirasi
FK-USU / RSUP. H. Adam Malik Medan

Akademik

: Dosen tetap Departemen Pulmonologi
dan Ilmu Kedokteran Respirasi FK-USU.

7. Alamat Kantor

: SMF Paru / RSUP. H. Adam Malik Medan
Jl. Bunga Lau No. 17 Medan.

8. No. Telpon Kantor : 061- 8363796.
9. Alamat Rumah

: Komp. Bumi Seroja Permai
Jl. Pinus Blok E, No. 61 Medan Sunggal.

10. Telp. Rumah / HP

: 061-8461174 / 08126017996

11. E-mail

: bymsinaga@yahoo.co.id

12. Nama Bapak

: Prof.Dr.dr. H.S.R. Parlindungan Sinaga (Alm).

13. Nama Ibu

: Solita L. Simanjuntak.

14. Nama Bapak Mertua: drg. P. Simanjuntak.
15. Nama Ibu Mertua

: drg. M. Naiborhu.

16. Nama Suami

: Freddyben S.T.M.Simanjuntak, ST,MM.

17. Nama Anak

: 1. William Joshua Toga Raja Simanjuntak.
2. Anastasia Grace Eurika Simanjuntak.
3. Thomas Rafael Simanjuntak.
4. Michael Christopher Simanjuntak.

xi

xii
B. Pendidikan Formal
1. 1984

: SD Immanuel Medan.

2. 1987

: SMP Immanuel Medan.

3. 1990

: SMA Negeri I Medan.

4. 1996

: S1 Fakultas Kedokteran USU Medan.

5. 2005

: Spesialis Paru Fakultas Kedokteran USU Medan.

6. 2012

: S2 Magister Kedokteran Klinis USU Medan.

7. 2014

: Brevet Konsultan Infeksi Paru dari Kolegium
Perhimpunan Dokter Paru Indonesia

C. Pendidikan Tambahan
1.

Kursus imunologi dasar, 2004, Medan.

2.

Interpretasi foto toraks, 2007, Medan.

3.

Essentials of flexible broncoscopy workshop, 2nd Asia Pacific
Congress of Bronchology, 2007, Singapore.

4.

Interventional Pulmonology Workshop, 2007, Singapore.

5.

Evidence-based medicine workshop,2007, Medan.

6.

Evidence-based medicine workshop,2008, Medan.

7.

Workshop lung cancer management for pulmonologist, 2008,
Jakarta

8.

Workshop inflammation & sleep impairment in allergic Rhinitis,
2008, Jakarta.

9.

Workshop Pulmonary Intervention, 2008, Bandung.

10. Workshop implementasi sistem manajemen mutu USU untuk GJM
& GKM, 2008, Medan.
11. Workshop food allergy, 2008, Jakarta.
12. Workshop pulmonary intervention,2008, Bandung.
13. Nutritional short course,2009, Medan.
14. Workshop COPD, 2009, Jakarta.
15. Workshop fine needle aspiration biopsy (FNAB) transtorakal tumor
paru, 2009, Jokjakarta.

xii

xiii
16. Workshop biomolekuler “ pemeriksaan biomolekuler dengan teknik
lightcycler realtime PCR,2010, Medan.
17. Workshop basic of interventional bronchoscopy, 2010, Medan.
18. Workshop infection-immunology, 2010, Medan.
19. Workshop: thoracosentesis with ultrasound guindance, 2011,
Medan.
20. Kursus immunologi dasar, 2011, Jokjakarta.
21. Comprehensive management of MDR-TB side effect treatment,
2012, Surabaya.
22. Workshop Management in Multi Drug Resistant, Extreme Drug
Resistant, and Total Drug Resistant of Pulmonary Tuberculosis in
daily practice, 2013, Medan.
23. Workshop Pengenalan dan Pemanfaatan alat PCR dalam dunia
kedokteran, 2013, Medan.
24. Comprehensive Course on Clinical Management of Drug Resistant
Tuberculosis. Jakarta 1-5 september 2014.

D. Riwayat Pekerjaan
1. 1997 – 1999

: Dokter PTT di RSU Djoelham Binjai

2. 1999 s/d sekarang : Staf Bagian Paru FK-USU

E. Riwayat Organisasi
1. Anggota Ikatan Dokter Indonesia (IDI) Cabang Medan.
2. Anggota Perhimpunan Dokter Paru Indonesia (PDPI) Cabang
Sumatera

Utara.

3. Anggota Perkumpulan Pemberantasan Tuberkulosis Indonesia
(PPTI) Cabang Sumatera Utara.

xiii

xiv
F. Pembicara / Presentasi Oral Pada Forum Lokal / Regional /
Nasional
1. Presentasi Oral pada Kongres Nasional Perhimpunan Dokter Paru
Indonesia IX, 2002, Medan. Judul: Penerapan sistem DOTS dalam
program pemberantasan tuberkulosis paru di PPTI wilayah Sumut.
2. Presentasi Oral pada Pertemuan Ilmiah Tahunan IX Perhimpunan
Dokter Paru Indonesia, 2003, Makasar. Judul: Tuberkulosis paru
disertai tuberkulosis peritonium yang disangkakan kanker ovarium.
3. Pembicara pada Workshop 1st Medan Respiratory Care Meeting
Annually (MERCY) 2010, Medan.Judul: Inhalation therapy in daily
practice.
4. Pembicara pada simposium the 1st Medan Respiratory Care
Meeting Annually (MERCY) 2010. Judul: Tuberkulosis dan
kehamilan.
5. Pembicara pada Workshop 2nd Medan Respiratory Care Meeting
Annually (MERCY) 2011, Medan. Judul: therapy on asthma attack
and acute exacerbation of COPD
6. Pembicara pada simposium the 2nd Medan Respiratory Care
Meeting Annually (MERCY) 2011, Medan. Judul: Immune response
and human genetic aspect in tuberculosis infection
7. Pembicara pada simposium the 3rd Medan Respiratory Care
Meeting Annually (MERCY), 2013, Medan. Judul: Broncodilators
are central to symptom management in COPD.
8. Pembicara pada BPLS (Basic Pulmonary Life Support), Medan,
2014. Judul: Massive Haemoptysis
9. Pembicara pada International Standards for Tuberculosis Care,
2014, Medan.
10. Pembicara pada BPLS (Basic Pulmonary Life Support), Medan,
2015. Judul: Management of Acute Asthma and Life Threatening
Asthma.

xiv

xv
G. Pembicara / Presentasi Oral Forum Internasional
1. Presentasi Oral pada the 2nd Asean Conference on Medical
Science (ACMS), 2002, Medan. Judul: DOTS implementation for
TB control program at PPTI of North Sumatera
2. Presentasi poster pada the 17th Congress of the Asian Pasific
Society of Respirology (APSR), 2012, Hongkong. Judul: Pattern of
Primary Resistance in Patients with Pulmonary TB Categories I in
Adam Malik Hospital-Medan, Indonesia.
3. Presentasi Oral pada the 18th Congress of the Asian Pasific
Society of Respirology (APSR), 2013, Jepang. Judul: Vitamin D
Receptor gene FokI and BsmI polymorphisms in susceptibility to
pulmonary

tuberculosis

among

Indonesian

Batak-ethnic

population.
4. Presentasi Oral pada the 19th Congress of the Asian Pasific
Society of Respirology (APSR), 2013, Bali. Judul: Smoking and
alcohol consumption as risk faktor of pulmonary tuberculosis
development in Medan, Indonesia.

H. Simposium, Seminar, Lokakarya Nasional
1.

Kongres Nasional (KONAS) IX Perhimpunan Dokter Paru
Indonesia (PDPI), 2002, Medan

2.

Simposium dan Workshop Inflammation & Sleep Impairment in
Allergic Rhinitis, 2008, Jakarta.

3.

Pertemuan Ilmiah Pulmonologi dan Ilmu Kedokteran Respirasi
(PIPKRA), 2008, Jakarta.

4. Jakarta Allergy and Clinical Immunology (Network (JACIN), 2008,
Jakarta
5. Simposium Perhimpunan Alergi Imunologi (PERALMUNI), 2008,
Surakarta.
6. Kongres Nasional (KONAS) XI PDPI, 2008, Bandung.

xv

xvi
7. Pertemuan Ilmiah Pulmonologi & Ilmu Kedokteran Respirasi
(PIPKRA), 2009, Jakarta.
8. Pertemuan Ilmiah Khusus (PIK) PDPI, 2009, Jokjakarta.
9. Symposium: the 1st Medan Respiratory Care Meeting Annually
(MERCY), 2010, Medan.
10. Symposium the tuberculosis scientific of PDPI, 2010, Medan.
11. Pertemuan Ilmiah Pulmonologi & Ilmu Kedokteran Respirasi
(PIPKRA), 2011, Jakarta.
12. Simposium the 2nd Medan respiratory care meeting annually
(MERCY), 2011, Medan.
13. Kongres Nasional (KONAS) XIII PDPI, 2012, Surabaya.
14. Symposium the 3rd Medan respiratory care meeting annually
(MERCY), 2013, Medan.
15. Kongres Kerja Nasional (Konkernas) PDPI XIV, 2013, Lampung.

I. Simposium, Seminar, Lokakarya Internasional
1. The 2nd Asean Conference on Medical Science (ACMS), 2002,
Medan.
2. International Meeting on Respiratory Care Indonesia (RESPINA),
2004, Jakarta.
3. The 2nd Asia Pacific Congress of Bronchology, 2007, Singapore.
4. The 17th Congress of the Asian Pasific Society of Respirology
(APSR), 2012, Hongkong
5. The 18th Congress of the Asian Pasific Society of Respirology
(APSR), 2013, Jepang.
6. The 19th Congress of the Asian Pasific Society of Respirology
(APSR), 2014, Bali.
7. Two day International symposium Genomic and Beyond, Medan,
2015.

xvi

xvii
J. Penelitian
1.

Penerapan

sistem

DOTS

dalam

program

pemberantasan

Tuberkulosis paru di PTTI wilayah Sumatera Utara, 2002.
2.

Permasalahan

penerapan

sistem

DOTS

dalam

program

pemberantasan TB di kota Medan dan Kab. TOBASA, 2003.
3.

Penatalaksanaan Tuberkulosis paru oleh dokter umum yang
berpraktek swasta di Medan, 2005.

4.

Karakteristik penderita TB-MDR yang mengikuti Programmatic
Management of Drug-resistant TB di RSUP. H. Adam Malik
Medan, 2012.

5.

Peran polimorfisme gen Reseptor Vitamin D pada kerentanan
terhadap tuberkulosis paru suku Batak di Medan, 2014.

6.

Peran polimorfisme FokI gen Reseptor Vitamin D terhadap
terjadinya tuberkulosis paru suku Batak di Medan (dibandingkan
dengan peran polimorfisme TaqI dan ApaI gen reseptor vitamin D
serta pengaruh faktor risiko merokok dan konsumsi alkohol
terhadap terjadinya TB paru).

K. Buku/ Proceeding/ Majalah dll (Publikasi)
1. Proceeding book Kongres Nasional (KONAS) Perhimpunan Dokter
Paru Indonesia (PDPI), 2002, Medan. Sebagai Author. Judul:
Penerapan

sistem

DOTS

dalam

program

pemberantasan

Tuberkulosis paru di PTTI wilayah Sumatera Utara.
2. Proceeding book Pertemuan Ilmiah Tahunan IX Perhimpunan
Dokter Paru Indonesia, 2003, Makasar. Sebagai Author. Judul:
Tuberkulosis

paru

disertai

tuberkulosis

peritonium

yang

disangkakan kanker ovarium.
3. Majalah Kedokteran Nusantara 2002 volume 36 supplement 2002,
ISSN: 0216-325X. Sebagai author. Judul: DOTS implementation for
TB control program at PPTI of North Sumatera.

xvii

xviii
4. Proceeding book Hari TB Sedunia, 2003, Medan. Sebagai Author.
Judul: Permasalahan penerapan sistem DOTS dalam program
pemberantasan TB di kota Medan dan Kab. TOBASA.
5. Jurnal Kedokteran Medicinal 2003 Vol. 4 No. 3. Sebagai Author.
Judul: Asma dan kehamilan.
6. Warta IDI, 2004, Medan. Sistem DOTS dalam penanggulangan TB.
7. Majalah Kedokteran Nusantara 2008, Vol. 41 No. 1. ISSN 0216-325
X. Sebagai Author. Judul: Kemoradioterapi pada penderita sindrom
vena kava superior akibat kanker paru bukan sel kecil
8. Majalah Kedokteran Nusantara, 2009, Vol. 42 No. 1. ISSN 0216325 X.

Sebagai

Author.

Judul:

Tuberkulosis

paru disertai

tuberkulosis peritoneum dan tuba falopi yang disangkakan
karsinoma ovarium.
9. Proceeding book Workshop the 1st Medan respiratory care meeting
annually (MERCY), 2010, Medan. Judul: Inhalation therapy in daily
practice.
10. Proceeding book Symposia the 1st Medan Respiratory Care
Meeting Annually (MERCY), 2010, Medan. Judul: Tuberkulosis dan
Kehamilan.
11. Proceeding book Workshop the 2nd Medan respiratory care meeting
annually (MERCY), 2011, Medan. Judul:

Inhalation therapy in

asthma attack and to reach asthma control.
12. Proceeding book Symposia the 2nd Medan Respiratory Care
Meeting

Annually

(MERCY),

2011,

Medan.

Judul:

Immune

response and human genetic aspect in tuberculosis Infection.
13. Proceeding Book the 17th Congress of Asian Pasific Society
Respirology, 2012, Hongkong. Sebagai Co-author. Judul: Pattern of
Primary Resistance in Patients with Pulmonary TB Categories I in
Adam Malik Hospital-Medan, Indonesia.
14. Jurnal Respirology

volume 17, supplement 2, Desember 2012.

ISSN 1323-7799. Sebagai co-author. Judul: Pattern of Primary

xviii

xix
Resistance in Patients with Pulmonary TB Categories I in Adam
Malik Hospital-Medan, Indonesia.
15. Jurnal Respirology Indonesia 2012 vol 32, no 3, 2012. ISSN 08537704. Sebagai co-author. Judul: Pola resistensi primer pada
penderita TB paru kategori I di RSUP H Adam Malik Medan..
16. Proceeding book Symposia the 3rd Medan Respiratory Care
Meeting Annually (MERCY), 2013, Medan. Judul: bronchodilators
are central to symptom management in COPD.
17. Proceding book the 18th Congress of the Asian Pasific Society of
Respirology, 2013, Jepang. Sebagai Author. Judul: Vitamin D
Receptor gene FokI and BsmI polymorphisms in susceptibility to
pulmonary tuberculosis among Indonesian Batak-ethnic population.
18. Jurnal Respirology volume 18, supplement 4, November 2013.
ISSN 1323-7799. Sebagai Author. Judul: Vitamin D Receptor gene
FokI and BsmI polymorphisms in susceptibility to pulmonary
tuberculosis among Indonesian Batak-ethnic population.
19. Jurnal Respirology Indonesia 2013 vol 33, no.4. ISSN 0853-7704.
Sebagai Author. Judul: Karakteristik penderita Multidrug Resistant
Tuberculosis yang Mengikuti Progrmmatic Management of DrugResistant Tuberculosis di Rumah Sakit Umum H. Adam Malik
Medan.
20. Jurnal Respirology volume 19, supplement 3, November 2014.
ISSN 1323-7799. Sebagai Author. Judul: Smoking and alcohol
consumption as risk faktor of pulmonary tuberculosis development
in Medan, Indonesia.
21. Acta Medica Indonesiana - The Indonesian Journal of Internal
Medicine Vol 46 no 4, 2014. ISSN 0125-9326. Sebagai Author.
Judul: Correlation between vitamin D receptor gene FokI and BsmI
polymorphisms and the susceptibility to pulmonary TB among
Indonesian Batak-ethnic population

xix

xx
L. Dana Penelitian
1. 2002 : Dana Lembaga Penelitian USU. Penerapan sistem DOTS
dalam program pemberantasan Tuberkulosis paru di PTTI wilayah
Sumatera Utara.
2. 2005 :

Dana

Lembaga

Penelitian

USU.

Penatalaksanaan

Tuberkulosis paru oleh dokter umum yang berpraktek swasta di
Medan.
3. 2013 : Dana Hibah Bersaing. Peran polimorfisme FokI gen
Reseptor Vitamin D terhadap terjadinya tuberkulosis paru suku
Batak di Medan.
4. 2014 : Dana Hibah Bersaing. Peran polimorfisme FokI gen
Reseptor Vitamin D terhadap terjadinya tuberkulosis paru suku
Batak di Medan (dibandingkan dengan peran polimorfisme TaqI
dan ApaI gen reseptor vitamin D serta pengaruh faktor risiko
merokok dan konsumsi alkohol terhadap terjadinya TB paru).

M. Penghargaan
1. Traveling Award atas poster yang dibawakan pada The 17th
Congress of the Asian Pasific Society of Respirology (APSR), 2012,
Hongkong
2. APSR Award atas oral presentation yang dibawakan pada The
18th Congress of the Asian Pasific Society of Respirology (APSR),
2013 Jepang.
3. Pemenang ketiga TB Award atas penelitian yang dibawakan secara
oral presentation di Bali, 2014.

xx

xxi
SUMMARY
Susceptibility to disease after mycobacteria infection is influenced
by agent, environmental and host factors. One of the host factor is host
genetic. Many studies have strongly indicated that genetic factor play an
important role in the disease development or susceptibility to tuberculosis.
Vitamin D Receptor (VDR) gene is one of the recently interested candidate
gene. The potential roles of VDR FokI and BsmI polymorphisms in the
development of pulmonary TB (PTB) have been investigated in many
ethnic group. The different results may be due to diverse ethnic
background.
The active metabolite of vitamin D leads to activation of
macrophage and restricts the growth of M. tuberculosis. The effect of
vitamin D is achieved by binding to Vitamin D Receptor and may be
influenced by polymorphisms in VDR gene. The aim of this study was to
explore the role of FokI and BsmI polymorphisms VDR gene in
susceptibility to PTB in Indonesian Batak ethnic population.
This is a matched case control study with FokI and BsmI
polymorphisms VDR gene as an independent variables and PTB as a
dependent variable
Cases were PTB patients which were recruited from several TB
services in Medan city, Indonesia. The inclusion criteria in case group
were newly diagnosed PTB patients, age 16-55 years old, Batak ethnic,
have symptoms of PTB, positive sputum smear and chest radiography
consistent with active disease. The exclusion criteria in case group were
HIV positive, known to present diabetes mellitus and other severe disease,
consuming imunnosupressive drug.
A control group composed of sex, age and ethnically matched were
healthy subjects with normal chest X ray and no history of previous
tuberculosis. A control group were health workers like doctors, nurses and
medical students. Tuberculin test was done in control group. All subjects
were interviewed and informed consent were obtained.

xxi

xxii
. Sample size was determined by using a matched case and control
formula. Minimal sample size was 68 subjects for case group and 68
subjects for control group. Sample size in this study was 76 subjects for
case group and 76 subjects for control group.
An anticoagulated peripheral blood specimen was collected and DNA
was extracted and stored at minus 200C. Polymerase Chain Reaction
(PCR) and Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) was used
to identify FokI and BsmI polymorphism of VDR gene. Following PCR, the
amplified PCR products was digested with FokI restriction enzyme and
BsmI restriction enzyme. Digested products were analyzed using
electrophoresis in 2% agarose gel and ethidium bromide stained. The
bands were visualyzed by Gel Documentation System.
Depend on the digestion pattern of FokI polymorphism, individuals
were scored as ff when homozygous for the presence of the FokI site (169
bp and 96 bp), FF when homozygous for the absence of the FokI site (265
bp), or Ff in case of heterozygosity (265 bp, 169 bp and 96 bp). The
digestion pattern of BsmI polymorphism were bb for the presence of BsmI
site (175 and 650 bp), BB when homozygous for the absence of the BsmI
site (825 bp), and Bb in case of heterozygote (825, 175 and 650 bp).
Data were managed and analysed using the Epi Info because case
and control were matched according to age, sex and ethnic. Conditional
logistic regression was performed to calculate the odds ratio. The
genotype frequencies of each SNPs compared by the Mc Nemar Chisquare test. The strength of the association between VDR FokI, BsmI
polymorphisms and TB risk was evaluated by calculating odds ratio (OR)
with 95% confidence interval (95% CI). The 2-sided exact p value