Analisis Keragaman Genetik Klon Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Plasma Nutfah PT. Socfindo Menggunakan Marka RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)
ANALISIS KERAGAMAN GENETIK KLON KELAPA SAWIT (Elaeis guineensis Jacq.)
PLASMA NUTFAH PT. SOCFINDO MENGGUNAKAN MARKA RAPD
(Random Amplified Polymorphic DNA)
SKRIPSI
OLEH :
HERMANYANTO LAIA / 130301234
PEMULIAAN TANAMAN
PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2017
Universitas Sumatera Utara
ANALISIS KERAGAMAN GENETIK KLON KELAPA SAWIT (Elaeis guineensis Jacq.)
PLASMA NUTFAH PT. SOCFINDO MENGGUNAKAN MARKA RAPD
(Random Amplified Polymorphic DNA)
SKRIPSI
OLEH :
HERMANYANTO LAIA / 130301234
PEMULIAAN TANAMAN
Skripsi sebagai salah satu syarat untuk dapat memperoleh gelar sarjana di
Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara Medan
PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2017
Universitas Sumatera Utara
: Analisis Keragaman Genetik Klon Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.)
Plasma Nutfah PT. Socfindo Menggunakan Marka RAPD (Random Amplified
Polymorphic DNA)
Nama
: Hermanyanto Laia
NIM
: 130301234
Program Studi : Agroteknologi
Judul Skripsi
Disetujui Oleh :
Komisi Pembimbing
Dr. Ir. Lollie Agustina P. Putri, M.Si
Ketua Komisi Pembimbing
Dr. Khairunnisa Lubis, S.P., M.P.
Anggota Komisi Pembimbing
Diketahui Oleh :
Dr. Ir. Sarifuddin, M.P.
Ketua Program Studi Agroteknologi
Universitas Sumatera Utara
ABSTRACT
HERMANYANTO LAIA, 2017 : Genetic Diversity of Oil Palm
(Elaeis guinnensis Jacq.) Clones Germaplasm of PT. Socfindo Based on RAPD
(Random Amplified Polymorphic DNA). Supervised by LOLLIE AGUSTINA P.
PUTRI andKHAIRUNISA LUBIS.
The objective of this research was to analyze genetic diversity of Oil Palm Clones
based on RAPD used marker OPD-13, OPD-20 and OPM-01. This research was
conduted at Plant Tissue Culture Laboratory, Faculty of Agriculture, University
of Sumatera Utara, Medan, from March 2017 until June 2017. Genetic materials
were 30 DNA stock of oil palm BTC-60 clone from PT. Socfindo. A total 13 bands
were scored, with the range of band size was 405 bp – 2268 bp and average of
polymorphism was 39,29%. Genetic distance measurement and dendrogram
formation were analyzed using DARwin 6.0 software. Based on the analysis, 30
clones of oil palm grouped into 3 clusters with a total of molecular diversity was
65,89%. The range of dissimilarity coefficient was 0-0,24.
Keywords
: clone, genetic diversity, oil palm, RAPD
i
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
HERMANYANTO LAIA, 2017 : Analisis Keragaman Genetik Klon Kelapa
Sawit (Elaeis guinnensis Jacq.) Plasma Nutfah PT. Socfindo Menggunakan Marka
RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Dibimbing oleh LOLLIE
AGUSTINA P. PUTRI dan KHAIRUNISA LUBIS.
Penelitian ini bertujuan mengetahui keragaman genetik klon kelapa sawit
plasma nutfah PT. Socfindo berdasarkan marka Random Amplified Polymorphic
DNA (RAPD) menggunakan primer OPD-13, OPD-20 dan OPM-01. Penelitian ini
dilaksanakan di Laboratorium Kultur Jaringan Tanaman, Fakultas Pertanian
Universitas Sumatera Utara, Medan, dimulai dari bulan Maret 2017 hingga Juni
2017. Materi genetik yang dianalisis merupakan 30 stok DNA kelapa sawit klon
BTC-60 dari PT. Socfindo. Didapatkan 13 pita dengan ukuran berkisar antara
369 bp – 2586 bp dan rataan persentase polimorfisme 39,29%. Perhitungan jarak
dan pembentukan dendrogram dilakukan menggunakan software DARwin 6.0.
Hasil analisis tersebut menunjukan bahwa 30 klon tersebut terbagi atas 3
kelompok utama dengan total keragaman molekuler 65,89%. Koefisien jarak
genetik berkisar antara 0-0,24.
Kata Kunci
: kelapa sawit, keragaman genetik, klon, RAPD
ii
Universitas Sumatera Utara
RIWAYAT HIDUP
Hermanyanto Laia lahir pada tanggal 22 Februari 1995 di Lawa-Lawa
Luo, putra dari bapak Fatizanolo Laia dan ibu Nasiba Laia.
Pernah mengikuti pendidikan di SD Negeri 071190 Hililaza lulus pada
tahun 2007, SMP Swasta Bintang Laut Teluk Dalam lulus tahun 2010 dan pada
tahun 2013 menyelesaikan pendidikan dari SMA Swasta Pembda 1 Gunungsitoli.
Pada tahun 2013 diterima sebagai mahasiwa di program studi Agroteknologi
Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara melalui jalur tertulis Seleksi
Bersama Masuk Perguruan Tinggi Negeri (SBMPTN), dengan konsentrasi
peminatan Pemuliaan Tanaman.
Selama mengikuti perkuliahan, penulis berkesempatan untuk menjadi
asisten praktikum di Laboratorium Teknologi Benih pada tahun 2015,
Laboratorium Produksi Benih pada tahun 2017 dan Genetika Molekuler pada
tahun 2017.
Pada tahun 2016 tepatnya pada bulan Juli hingga bulan Agustus, penulis
mengikuti Praktek Kerja Lapangan (PKL) di PT. Perkebunan Nusantara III,
Kebun Sisumut, Kabupaten Labuhan Batu Selatan.
iii
Universitas Sumatera Utara
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis ucapkan kepada Tuhan Yang Maha Esa karena
atas berkat dan rahmat-Nya penulis dapat menyelesaikan skripsi berjudul
“Analisis Keragaman Genetik Klon Kelapa Sawit (Elaeis guinnensis Jacq.)
Plasma Nutfah PT. Socfindo Menggunakan Marka RAPD (Random Amplified
Polymorphic DNA)” yang merupakan salah satu syarat untuk mendapatkan gelar
sarjana di Program Studi Agroteknologi Fakultas Pertanian Universitas Sumatera
Utara, Medan.
Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terima kasih kepada kedua
orang tua penulis yang telah berjuang membesarkan, membimbing dan menjadi
panutan bagi penulis. Kepada Ibu Dr. Ir. Lollie Agustina P. Putri, M.Si selaku
ketua komisi pembimbing yang telah mendukung penuh penyusunan skripsi ini
mulai dari awal hingga akhir, mulai dari materi serta bahan penelitian hingga
waktu, ilmu, dan bimbingannya penulis mengucapkan terima kasih. Penulis juga
mengucapkan terima kasih kepada Ibu Dr. Khairunisa Lubis, S.P.,M.P. selaku
anggota komisi pembimbing yang selalu meluangkan waktu untuk konsultasi,
telah memberi saran, bimbingan, dan kepercayaan dalam menyelesaikan skripsi
ini.
Selain itu penulis juga mengucapkan terimakasih kepada kakak, abang dan
adik penulis atas dukungannya, terutama kak Feb. Serta kepada kak Ana, kak
Dian, kak Rika, bang Alex, Kak Asni laboran kultur jaringan tanaman, Sylvia,
bang Nando, Nicko, Aminah, Yeni, serta teman-teman AET-4 2013, teman-teman
Pemuliaan Tanaman 2013 serta seluruh teman-teman yang tidak dapat penulis
iv
Universitas Sumatera Utara
tuliskan satu persatu yang telah banyak membantu penulis dalam menyelesaikan
skripsi ini.
Penulis menyadari dalam penulisan skripsi ini masih banyak kekurangan
sehingga penulis mengharapkan kritik dan saran yang bersifat membagun demi
perbaikan skripsi ini. Akhir kata semoga skripsi ini bermanfaat bagi seluruh pihak
yang memerlukan.
Medan, September 2017
Penulis
v
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR ISI
ABSTRACT .......................................................................................................... i
ABSTRAK ............................................................................................................ ii
RIWAYAT HIDUP............................................................................................... iii
KATA PENGANTAR ......................................................................................... iv
DAFTAR ISI ........................................................................................................ v
DAFTAR TABEL ................................................................................................. vi
DAFTAR GAMBAR ............................................................................................ vii
PENDAHULUAN
Latar Belakang ......................................................................................... 1
Tujuan Penelitian ..................................................................................... 3
Kegunaan Penulisan ................................................................................. 3
TINJAUAN PUSTAKA
Botani Tanaman ........................................................................................
Syarat Tumbuh ..........................................................................................
Klon Kelapa Sawit ....................................................................................
Marka Molekuler.......................................................................................
RAPD ........................................................................................................
4
6
6
8
9
METODE PENELITIAN
Tempat dan Waktu Penelitian ................................................................... 12
Bahan dan Alat Penelitian ......................................................................... 12
Metode Penelitian ..................................................................................... 12
PELAKSANAAN PENELITIAN
Pengambilan Sampel Daun ....................................................................... 13
Isolasi dan Pemurnian DNA ..................................................................... 13
Uji Kualitas ............................................................................................... 14
Amplifikasi................................................................................................ 15
Elektoforesis.............................................................................................. 16
Analisis Data ............................................................................................. 18
Penentuan Skoring Marka RAPD ................................................. 18
Penentuan Ukuran Pasangan Basa ................................................ 18
HASIL DAN PEMBAHASAN
Hasil .......................................................................................................... 19
Visualisasi Hasil Amplifikasi........................................................ 20
Analisis Hubungan Genetik .......................................................... 23
Pembahasan ............................................................................................... 26
vi
Universitas Sumatera Utara
KESIMPULAN DAN SARAN
Kesimpulan ............................................................................................... 30
Saran .......................................................................................................... 30
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN
vii
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR TABEL
No.
Hal.
1. Identitas sampel dan hasil uji kuantitas klon BTC 60 ....................................... 19
2. Hasil amplifikasi 3 primer RAPD ..................................................................... 20
3. Persentase polimorfisme ................................................................................... 21
viii
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR GAMBAR
No.
Hal
1. Elektroforesis hasil amplifikasi sampel DNA kelapa sawit klon BTC 60
dengan Primer OPD-13 .................................................................................... 21
2. Elektroforesis hasil amplifikasi sampel DNA kelapa sawit klon BTC 60
dengan Primer OPD-13 .................................................................................... 21
3. Elektroforesis hasil amplifikasi sampel DNA kelapa sawit klon BTC 60
dengan Primer OPD-20 .................................................................................... 22
4. Elektroforesis hasil amplifikasi sampel DNA kelapa sawit klon BTC 60
dengan Primer OPD-20 .................................................................................... 22
5. Elektroforesis hasil amplifikasi sampel DNA kelapa sawit klon BTC 60
dengan Primer OPD-20 .................................................................................... 23
6. Analisis Faktorial PCoA (Principal Coordinates Analysis) aksis 1
(horinzontal) dan aksis 2 (vertical) berdasarkan matrix dissimilarity
simple matching dengan menggunakan 3 marka RAPD .................................. 24
7. Profil Radial Neighbour-Joining Tree (NJtree) dari 30 klon kelapa sawit
BTC 60 berdasarkan matrix dissimilarity simple matching dengan
menggunakan 3 marka RAPD .......................................................................... 25
8. Diagram filogenetik 30 klon kelapa sawit BTC-60 berdasarkan matrix
dissimilarity simple matching dengan menggunakan 3 marka RAPD ............. 26.
ix
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR LAMPIRAN
No.
Hal.
1. Deskripsi pembuatan larutan stok ..................................................................... 35
2. Alur penelitian................................................................................................... 35
3. Data skoring ...................................................................................................... 36
4. Data dissimilarity index..................................................................................... 37
5. Data factorial coordinates................................................................................. 39
6. Data output DARwin .Arb ................................................................................ 40
x
Universitas Sumatera Utara
PLASMA NUTFAH PT. SOCFINDO MENGGUNAKAN MARKA RAPD
(Random Amplified Polymorphic DNA)
SKRIPSI
OLEH :
HERMANYANTO LAIA / 130301234
PEMULIAAN TANAMAN
PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2017
Universitas Sumatera Utara
ANALISIS KERAGAMAN GENETIK KLON KELAPA SAWIT (Elaeis guineensis Jacq.)
PLASMA NUTFAH PT. SOCFINDO MENGGUNAKAN MARKA RAPD
(Random Amplified Polymorphic DNA)
SKRIPSI
OLEH :
HERMANYANTO LAIA / 130301234
PEMULIAAN TANAMAN
Skripsi sebagai salah satu syarat untuk dapat memperoleh gelar sarjana di
Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara Medan
PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
2017
Universitas Sumatera Utara
: Analisis Keragaman Genetik Klon Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.)
Plasma Nutfah PT. Socfindo Menggunakan Marka RAPD (Random Amplified
Polymorphic DNA)
Nama
: Hermanyanto Laia
NIM
: 130301234
Program Studi : Agroteknologi
Judul Skripsi
Disetujui Oleh :
Komisi Pembimbing
Dr. Ir. Lollie Agustina P. Putri, M.Si
Ketua Komisi Pembimbing
Dr. Khairunnisa Lubis, S.P., M.P.
Anggota Komisi Pembimbing
Diketahui Oleh :
Dr. Ir. Sarifuddin, M.P.
Ketua Program Studi Agroteknologi
Universitas Sumatera Utara
ABSTRACT
HERMANYANTO LAIA, 2017 : Genetic Diversity of Oil Palm
(Elaeis guinnensis Jacq.) Clones Germaplasm of PT. Socfindo Based on RAPD
(Random Amplified Polymorphic DNA). Supervised by LOLLIE AGUSTINA P.
PUTRI andKHAIRUNISA LUBIS.
The objective of this research was to analyze genetic diversity of Oil Palm Clones
based on RAPD used marker OPD-13, OPD-20 and OPM-01. This research was
conduted at Plant Tissue Culture Laboratory, Faculty of Agriculture, University
of Sumatera Utara, Medan, from March 2017 until June 2017. Genetic materials
were 30 DNA stock of oil palm BTC-60 clone from PT. Socfindo. A total 13 bands
were scored, with the range of band size was 405 bp – 2268 bp and average of
polymorphism was 39,29%. Genetic distance measurement and dendrogram
formation were analyzed using DARwin 6.0 software. Based on the analysis, 30
clones of oil palm grouped into 3 clusters with a total of molecular diversity was
65,89%. The range of dissimilarity coefficient was 0-0,24.
Keywords
: clone, genetic diversity, oil palm, RAPD
i
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
HERMANYANTO LAIA, 2017 : Analisis Keragaman Genetik Klon Kelapa
Sawit (Elaeis guinnensis Jacq.) Plasma Nutfah PT. Socfindo Menggunakan Marka
RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Dibimbing oleh LOLLIE
AGUSTINA P. PUTRI dan KHAIRUNISA LUBIS.
Penelitian ini bertujuan mengetahui keragaman genetik klon kelapa sawit
plasma nutfah PT. Socfindo berdasarkan marka Random Amplified Polymorphic
DNA (RAPD) menggunakan primer OPD-13, OPD-20 dan OPM-01. Penelitian ini
dilaksanakan di Laboratorium Kultur Jaringan Tanaman, Fakultas Pertanian
Universitas Sumatera Utara, Medan, dimulai dari bulan Maret 2017 hingga Juni
2017. Materi genetik yang dianalisis merupakan 30 stok DNA kelapa sawit klon
BTC-60 dari PT. Socfindo. Didapatkan 13 pita dengan ukuran berkisar antara
369 bp – 2586 bp dan rataan persentase polimorfisme 39,29%. Perhitungan jarak
dan pembentukan dendrogram dilakukan menggunakan software DARwin 6.0.
Hasil analisis tersebut menunjukan bahwa 30 klon tersebut terbagi atas 3
kelompok utama dengan total keragaman molekuler 65,89%. Koefisien jarak
genetik berkisar antara 0-0,24.
Kata Kunci
: kelapa sawit, keragaman genetik, klon, RAPD
ii
Universitas Sumatera Utara
RIWAYAT HIDUP
Hermanyanto Laia lahir pada tanggal 22 Februari 1995 di Lawa-Lawa
Luo, putra dari bapak Fatizanolo Laia dan ibu Nasiba Laia.
Pernah mengikuti pendidikan di SD Negeri 071190 Hililaza lulus pada
tahun 2007, SMP Swasta Bintang Laut Teluk Dalam lulus tahun 2010 dan pada
tahun 2013 menyelesaikan pendidikan dari SMA Swasta Pembda 1 Gunungsitoli.
Pada tahun 2013 diterima sebagai mahasiwa di program studi Agroteknologi
Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara melalui jalur tertulis Seleksi
Bersama Masuk Perguruan Tinggi Negeri (SBMPTN), dengan konsentrasi
peminatan Pemuliaan Tanaman.
Selama mengikuti perkuliahan, penulis berkesempatan untuk menjadi
asisten praktikum di Laboratorium Teknologi Benih pada tahun 2015,
Laboratorium Produksi Benih pada tahun 2017 dan Genetika Molekuler pada
tahun 2017.
Pada tahun 2016 tepatnya pada bulan Juli hingga bulan Agustus, penulis
mengikuti Praktek Kerja Lapangan (PKL) di PT. Perkebunan Nusantara III,
Kebun Sisumut, Kabupaten Labuhan Batu Selatan.
iii
Universitas Sumatera Utara
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis ucapkan kepada Tuhan Yang Maha Esa karena
atas berkat dan rahmat-Nya penulis dapat menyelesaikan skripsi berjudul
“Analisis Keragaman Genetik Klon Kelapa Sawit (Elaeis guinnensis Jacq.)
Plasma Nutfah PT. Socfindo Menggunakan Marka RAPD (Random Amplified
Polymorphic DNA)” yang merupakan salah satu syarat untuk mendapatkan gelar
sarjana di Program Studi Agroteknologi Fakultas Pertanian Universitas Sumatera
Utara, Medan.
Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terima kasih kepada kedua
orang tua penulis yang telah berjuang membesarkan, membimbing dan menjadi
panutan bagi penulis. Kepada Ibu Dr. Ir. Lollie Agustina P. Putri, M.Si selaku
ketua komisi pembimbing yang telah mendukung penuh penyusunan skripsi ini
mulai dari awal hingga akhir, mulai dari materi serta bahan penelitian hingga
waktu, ilmu, dan bimbingannya penulis mengucapkan terima kasih. Penulis juga
mengucapkan terima kasih kepada Ibu Dr. Khairunisa Lubis, S.P.,M.P. selaku
anggota komisi pembimbing yang selalu meluangkan waktu untuk konsultasi,
telah memberi saran, bimbingan, dan kepercayaan dalam menyelesaikan skripsi
ini.
Selain itu penulis juga mengucapkan terimakasih kepada kakak, abang dan
adik penulis atas dukungannya, terutama kak Feb. Serta kepada kak Ana, kak
Dian, kak Rika, bang Alex, Kak Asni laboran kultur jaringan tanaman, Sylvia,
bang Nando, Nicko, Aminah, Yeni, serta teman-teman AET-4 2013, teman-teman
Pemuliaan Tanaman 2013 serta seluruh teman-teman yang tidak dapat penulis
iv
Universitas Sumatera Utara
tuliskan satu persatu yang telah banyak membantu penulis dalam menyelesaikan
skripsi ini.
Penulis menyadari dalam penulisan skripsi ini masih banyak kekurangan
sehingga penulis mengharapkan kritik dan saran yang bersifat membagun demi
perbaikan skripsi ini. Akhir kata semoga skripsi ini bermanfaat bagi seluruh pihak
yang memerlukan.
Medan, September 2017
Penulis
v
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR ISI
ABSTRACT .......................................................................................................... i
ABSTRAK ............................................................................................................ ii
RIWAYAT HIDUP............................................................................................... iii
KATA PENGANTAR ......................................................................................... iv
DAFTAR ISI ........................................................................................................ v
DAFTAR TABEL ................................................................................................. vi
DAFTAR GAMBAR ............................................................................................ vii
PENDAHULUAN
Latar Belakang ......................................................................................... 1
Tujuan Penelitian ..................................................................................... 3
Kegunaan Penulisan ................................................................................. 3
TINJAUAN PUSTAKA
Botani Tanaman ........................................................................................
Syarat Tumbuh ..........................................................................................
Klon Kelapa Sawit ....................................................................................
Marka Molekuler.......................................................................................
RAPD ........................................................................................................
4
6
6
8
9
METODE PENELITIAN
Tempat dan Waktu Penelitian ................................................................... 12
Bahan dan Alat Penelitian ......................................................................... 12
Metode Penelitian ..................................................................................... 12
PELAKSANAAN PENELITIAN
Pengambilan Sampel Daun ....................................................................... 13
Isolasi dan Pemurnian DNA ..................................................................... 13
Uji Kualitas ............................................................................................... 14
Amplifikasi................................................................................................ 15
Elektoforesis.............................................................................................. 16
Analisis Data ............................................................................................. 18
Penentuan Skoring Marka RAPD ................................................. 18
Penentuan Ukuran Pasangan Basa ................................................ 18
HASIL DAN PEMBAHASAN
Hasil .......................................................................................................... 19
Visualisasi Hasil Amplifikasi........................................................ 20
Analisis Hubungan Genetik .......................................................... 23
Pembahasan ............................................................................................... 26
vi
Universitas Sumatera Utara
KESIMPULAN DAN SARAN
Kesimpulan ............................................................................................... 30
Saran .......................................................................................................... 30
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN
vii
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR TABEL
No.
Hal.
1. Identitas sampel dan hasil uji kuantitas klon BTC 60 ....................................... 19
2. Hasil amplifikasi 3 primer RAPD ..................................................................... 20
3. Persentase polimorfisme ................................................................................... 21
viii
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR GAMBAR
No.
Hal
1. Elektroforesis hasil amplifikasi sampel DNA kelapa sawit klon BTC 60
dengan Primer OPD-13 .................................................................................... 21
2. Elektroforesis hasil amplifikasi sampel DNA kelapa sawit klon BTC 60
dengan Primer OPD-13 .................................................................................... 21
3. Elektroforesis hasil amplifikasi sampel DNA kelapa sawit klon BTC 60
dengan Primer OPD-20 .................................................................................... 22
4. Elektroforesis hasil amplifikasi sampel DNA kelapa sawit klon BTC 60
dengan Primer OPD-20 .................................................................................... 22
5. Elektroforesis hasil amplifikasi sampel DNA kelapa sawit klon BTC 60
dengan Primer OPD-20 .................................................................................... 23
6. Analisis Faktorial PCoA (Principal Coordinates Analysis) aksis 1
(horinzontal) dan aksis 2 (vertical) berdasarkan matrix dissimilarity
simple matching dengan menggunakan 3 marka RAPD .................................. 24
7. Profil Radial Neighbour-Joining Tree (NJtree) dari 30 klon kelapa sawit
BTC 60 berdasarkan matrix dissimilarity simple matching dengan
menggunakan 3 marka RAPD .......................................................................... 25
8. Diagram filogenetik 30 klon kelapa sawit BTC-60 berdasarkan matrix
dissimilarity simple matching dengan menggunakan 3 marka RAPD ............. 26.
ix
Universitas Sumatera Utara
DAFTAR LAMPIRAN
No.
Hal.
1. Deskripsi pembuatan larutan stok ..................................................................... 35
2. Alur penelitian................................................................................................... 35
3. Data skoring ...................................................................................................... 36
4. Data dissimilarity index..................................................................................... 37
5. Data factorial coordinates................................................................................. 39
6. Data output DARwin .Arb ................................................................................ 40
x
Universitas Sumatera Utara