Penggunaan Software Kimia dalam Penggamb
Paraf Asisten
LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK
Judul
: Penggunaan Software Kimia dalam Penggambaran Struktur
Molekul
Tujuan Percobaan
: Mempelajari dan mengaplikasikan pengetahuan dan ketrampilan
menggambar struktur molekul senyawa kimia menggunakan software Chemsketch.
Pendahuluan
Ilmu pengetahuan dan teknologi semakin berkembang, utamanya dalam bidang pendidikan.
Media pembelajaran banyak diciptakan untuk mempermudah pelajar dalam memahamai
suatu bidang ilmu tertentu. Kimia adalah salah satu dari sekian banyak bidang ilmu yang
memanfaatkan perkembangan teknologi.
Kimia merupakan bidang ilmu yang mempelajari materi dan perubahannya. Perubahan materi
ini meliputi perubahan fisik maupun kimia. Perubahan kimia adalah perubahan zat yang
menghasilkan zat baru dengan sifat-sifat baru, atau disebut juga dengan reaksi kimia
(Anonim, 2014). Perubahan kimia meliputi perubahan struktur molekul. Bentuk molekul zat
kimia yang beraneka ragam dan berbentuk 3D menjadikan suatu hal yang sulit untuk
dibayangkan atau dijelaskan. Namun, dengan berkembangnya ilmu pengetahuan dan
teknologi hal tersebut bukan menjadi alasan untuk tidak bisa memvisualisasikan struktur
molekul yang sebenarnya. Media yang digunakan dapat berupa alat peraga yang terbuat dari
plastik atau kayu. Selain itu, juga dapat menggunakan perangkat lunak komputer. Salah satu
software yang digunakan adalah Chemsketch.
Chemsketch adalah program untuk menggambarkan struktur kimia yang dikembangkan oleh
ACD(Anonim,2014). Aplikasi ACD ChemSketch (ACD = advanced Chemistry development)
merupakan salah satu aplikasi kimia yang tersedia free sebagai open source software. ACD
Chemsketch berfungsi untuk menggambar dan melihat struktur dalam 2D, membuat 3D
untuk melihat dari sudut manapun, menggambar reaksi dan skema reaksi. Chemskecth dapat
digunakan untuk menghitung jumlah reaktan, menghasilkan struktur dari InChI dan SMILES
string. Selain itu, dapat menghasilkan nama sistematis IUPAC untuk molekul hingga 50 atom
dan 3 struktur cincin, memprediksi log P untuk struktur individu(Anonim, 2014).
Chemskecth juga dapat digunakan untuk mendesain presentasi dan laporan secara
profesional.
Aplikasi ini diharapkan dapat membantu mahasiswa kimia untuk menggambarkan bentuk
atau struktur molekul bahan kimia. Selain itu , dapat digunakan untuk mempermudah
mahasiswa dalam memahami bentuk – bentuk molekul, reaksi, maupun nama zat-zat kimia.
Dasar itulah yang digunakan untuk mempelajari chemskecth pada praktikum ini.
Prinsip Kerja
Praktikum ini menggunakan software ChemSketch untuk menggambarkan molekul 2D dan
3D.
Alat
Laptop atau PC, dan aplikasi ACD ChemSketch.
Hasil
a. Target Praktikum
1. Menggambar struktur sederhana
a.
H3C
CH3
3
CH3
F
F
F
F
b.
F
CH3
menjadi
CH2
H3C
H2C
c.
CH3
N
N
N
CH3
N
(CH 2)3Ph
2. Menggambar struktur yang lebih kompleks
HO
O
OH
HO
O
O
O
OH
OH
O
O
OH
3. Memberi muatan
H3C
+
NH2
CH3
4. Stereodescriptor
Z
S
CH3
Cl
CH3
5. Membuat ikatan terkoordinasi
O
O
CH3
Li
O
CH3
6. Ikatan dan Muatan Terdelokalisasi
Br CH3
H3C
CH3
+
CH3
7. Markus Bond
H3C
Br
8. Menggambar peptide siklik : Tyr-Ala-Trp
HO
O
NH
NH
O
H3C
N
H
O
N
H
b. Gambar Senyawa
No.
1.
Nama Senyawa
Atsiri
Gambar
OH
OH
HO
O
OH
O
2.
Eugenol
CH2
O
OH
CH3
3.
Trimiristin
CH3
O
O
O
CH3
O
O
O
CH3
4.
Piperin
N
O
O
O
5.
Kafein
CH3
N
N
H3C
6.
7.
8.
9.
Alkana
H3C
CH3
H3C
CH2
H3C
CH
Alkena
Alkuna
Alkohol
OH
Eter
H3C
11.
CH3
O
H3C
10.
O
N
N
Aldehida
O
CH3
H3C
H
O
12.
Alkanon
O
H3C
13.
CH3
Asam
O
Karboksilat
H3C
14.
O
Ester
H3C
15.
OH
CH3
O
Alkil Halida
H3C
Cl
c. Gambar Alat
No.
1.
2.
Nama Alat
Set Alat Distilasi
Labu Ukur
Gambar
3.
Pemanas Listrik
4
3
21
4.
Termometer
5. Beaker Glass
6.
Erlenmeyer
5 6 7
11
8
9
4
3
2
1
5 6 7
1
0
8
9
7.
Mortar dan Pastle
8.
Corong Buchner
9.
Corong Pisah
10.
Labu Alas Bulat
11.
Rotary Evaporator
12.
Kondensor Reflux
13.
Corong Penyaring
Referensi
Anonim. 2014. Perubahan Kimia Zat.[Serial Online]. http://sukasains.com/materi/perubahankimia-zat/[diakses pada tanggal 20 Februari 2014].
Nama Praktikan
Marena Thalita Rahma (121810301031)
LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK
Judul
: Penggunaan Software Kimia dalam Penggambaran Struktur
Molekul
Tujuan Percobaan
: Mempelajari dan mengaplikasikan pengetahuan dan ketrampilan
menggambar struktur molekul senyawa kimia menggunakan software Chemsketch.
Pendahuluan
Ilmu pengetahuan dan teknologi semakin berkembang, utamanya dalam bidang pendidikan.
Media pembelajaran banyak diciptakan untuk mempermudah pelajar dalam memahamai
suatu bidang ilmu tertentu. Kimia adalah salah satu dari sekian banyak bidang ilmu yang
memanfaatkan perkembangan teknologi.
Kimia merupakan bidang ilmu yang mempelajari materi dan perubahannya. Perubahan materi
ini meliputi perubahan fisik maupun kimia. Perubahan kimia adalah perubahan zat yang
menghasilkan zat baru dengan sifat-sifat baru, atau disebut juga dengan reaksi kimia
(Anonim, 2014). Perubahan kimia meliputi perubahan struktur molekul. Bentuk molekul zat
kimia yang beraneka ragam dan berbentuk 3D menjadikan suatu hal yang sulit untuk
dibayangkan atau dijelaskan. Namun, dengan berkembangnya ilmu pengetahuan dan
teknologi hal tersebut bukan menjadi alasan untuk tidak bisa memvisualisasikan struktur
molekul yang sebenarnya. Media yang digunakan dapat berupa alat peraga yang terbuat dari
plastik atau kayu. Selain itu, juga dapat menggunakan perangkat lunak komputer. Salah satu
software yang digunakan adalah Chemsketch.
Chemsketch adalah program untuk menggambarkan struktur kimia yang dikembangkan oleh
ACD(Anonim,2014). Aplikasi ACD ChemSketch (ACD = advanced Chemistry development)
merupakan salah satu aplikasi kimia yang tersedia free sebagai open source software. ACD
Chemsketch berfungsi untuk menggambar dan melihat struktur dalam 2D, membuat 3D
untuk melihat dari sudut manapun, menggambar reaksi dan skema reaksi. Chemskecth dapat
digunakan untuk menghitung jumlah reaktan, menghasilkan struktur dari InChI dan SMILES
string. Selain itu, dapat menghasilkan nama sistematis IUPAC untuk molekul hingga 50 atom
dan 3 struktur cincin, memprediksi log P untuk struktur individu(Anonim, 2014).
Chemskecth juga dapat digunakan untuk mendesain presentasi dan laporan secara
profesional.
Aplikasi ini diharapkan dapat membantu mahasiswa kimia untuk menggambarkan bentuk
atau struktur molekul bahan kimia. Selain itu , dapat digunakan untuk mempermudah
mahasiswa dalam memahami bentuk – bentuk molekul, reaksi, maupun nama zat-zat kimia.
Dasar itulah yang digunakan untuk mempelajari chemskecth pada praktikum ini.
Prinsip Kerja
Praktikum ini menggunakan software ChemSketch untuk menggambarkan molekul 2D dan
3D.
Alat
Laptop atau PC, dan aplikasi ACD ChemSketch.
Hasil
a. Target Praktikum
1. Menggambar struktur sederhana
a.
H3C
CH3
3
CH3
F
F
F
F
b.
F
CH3
menjadi
CH2
H3C
H2C
c.
CH3
N
N
N
CH3
N
(CH 2)3Ph
2. Menggambar struktur yang lebih kompleks
HO
O
OH
HO
O
O
O
OH
OH
O
O
OH
3. Memberi muatan
H3C
+
NH2
CH3
4. Stereodescriptor
Z
S
CH3
Cl
CH3
5. Membuat ikatan terkoordinasi
O
O
CH3
Li
O
CH3
6. Ikatan dan Muatan Terdelokalisasi
Br CH3
H3C
CH3
+
CH3
7. Markus Bond
H3C
Br
8. Menggambar peptide siklik : Tyr-Ala-Trp
HO
O
NH
NH
O
H3C
N
H
O
N
H
b. Gambar Senyawa
No.
1.
Nama Senyawa
Atsiri
Gambar
OH
OH
HO
O
OH
O
2.
Eugenol
CH2
O
OH
CH3
3.
Trimiristin
CH3
O
O
O
CH3
O
O
O
CH3
4.
Piperin
N
O
O
O
5.
Kafein
CH3
N
N
H3C
6.
7.
8.
9.
Alkana
H3C
CH3
H3C
CH2
H3C
CH
Alkena
Alkuna
Alkohol
OH
Eter
H3C
11.
CH3
O
H3C
10.
O
N
N
Aldehida
O
CH3
H3C
H
O
12.
Alkanon
O
H3C
13.
CH3
Asam
O
Karboksilat
H3C
14.
O
Ester
H3C
15.
OH
CH3
O
Alkil Halida
H3C
Cl
c. Gambar Alat
No.
1.
2.
Nama Alat
Set Alat Distilasi
Labu Ukur
Gambar
3.
Pemanas Listrik
4
3
21
4.
Termometer
5. Beaker Glass
6.
Erlenmeyer
5 6 7
11
8
9
4
3
2
1
5 6 7
1
0
8
9
7.
Mortar dan Pastle
8.
Corong Buchner
9.
Corong Pisah
10.
Labu Alas Bulat
11.
Rotary Evaporator
12.
Kondensor Reflux
13.
Corong Penyaring
Referensi
Anonim. 2014. Perubahan Kimia Zat.[Serial Online]. http://sukasains.com/materi/perubahankimia-zat/[diakses pada tanggal 20 Februari 2014].
Nama Praktikan
Marena Thalita Rahma (121810301031)