Diversitas Bakteri Asal Mikoriza

20 BAB II TINJAUAN PUSTAKA

2.1 Diversitas Bakteri Asal Mikoriza

Keberadaan mikroorganisme tanah di alam sangat melimpah dalam keragaman dan jumlah jenisnya. Setiap mikroorganisme memiliki peran spesifik terhadap pertumbuhan dan perkembangan tumbuhan. Beberapa mikroorganisme memiliki sifat parasit namun ada pula yang bersifat menguntungkan dan tidak sedikit pula yang keberadaannya bersifat netral. Aktivitas mikroorganisme tanah di sekitar rizosfer sangat membantu perbaikan kesuburan tanah dan berdampak positif terhadap peningkatan kualitas dan kuantitas produksi tanaman. Penggunaan mikroorganisme untuk meningkatkan pertumbuhan tanaman merupakan hal menarik yang dalam beberapa tahun terakhir ini mendapat perhatian para peneliti. Sejalan dengan perkembangan ilmu bioteknologi, mikroorganisme tanah merupakan objek yang mempunyai prospek untuk dikembangkan Barriuso et al. 2008. Mikroba yang memiliki sifat asosiasi dengan tanaman inang, umumnya memiliki sifat kompatibilitas antara inang dan mikroba tersebut. Mikroba yang dapat berasosiasi dengan tanaman inang tertentu, belum tentu dapat berasosiasi dengan tanaman inang yang lain. Dengan demikian, perlu dilakukan suatu penelitian untuk mendapatkan jenis-jenis mikroba yang kompatibel dengan jenis tanaman yang diinginkan. Ada beberapa rangkaian kegiatan pengujian yang harus dilakukan hingga didapatkan isolat mikroorganisme yang efektif membantu pertumbuhan tanaman. Keberadaan bakteri yang terlibat secara langsung dalam pembentukan mikoriza pertama kali dibuktikan oleh penelitian yang dilakukan oleh Bowen dan Theodorou 1979. Beberapa penelitian telah dilakukan dan ditemukan adanya bakteri yang berasosiasi dengan mikoriza. Dahm et al. 2005 mengisolasi bakteri dari beberapa jenis fungi ektomikoriza dan mendapatkan sejumlah bakteri dengan jumlah jenis dan penampakan morfologi yang berbeda Tabel 1. Budi et al. 1999 mengisolasi bakteri asal sporokarp FMA Glomus mosseae dan mendapatkan delapan jenis bakteri Tabel 2. Varese et al. 1996 mengisolasi bakteri dari sporokarp Suillus grevillei dan mendapatkan 16 bakteri Tabel 3. Bakhtiar et al. 2010 yang 21 mengisolasi bakteri spora FMA tanpa disterilkan dari daerah mikorizosfer kelapa sawit dan menemukan 20 isolat bakteri. Tabel 1 Jumlah dan morfologi jenis bakteri yang diisolasi dari sporokarp fungi ektomikoriza Fungi Jumlah isolat yang dijumpai Jumlah gram negatif batang Jumlah gram positif basil Jumlah gram positif kokus Jumlah bakteri variabel pelomorfik Amanita muscaria Hebeloma crustuliniforme 1 Hebeloma crustuliniforme 2 Hebeloma crustuliniforme 3 Laccaria amethistina Laccaria laccata 1 Laccaria laccata 2 Laccaria laccata 3 Laccaria proxima1 Lycoperdon sp. Scleroderma sp. Suillus grevillei Suillus luteus Thelephora terrestris Xerocomus sp. 3 30 30 30 29 30 29 30 30 30 30 30 30 30 29 3 21 18 28 5 30 29 27 27 30 30 20 28 30 27 – 6 – – – – – 1 – – – 1 2 – 2 – 2 12 – 24 – – – – – – 9 – – – – 1 – 2 – – – – 3 – – – – – – Sumber : Dahm et al. 2005 Tabel 2 Jenis bakteri yang ditemukan dari sporokarp Glomus mosseae Nomor isolat Jenis-jenis bakteri yang ditemukan B1 Methylobacterium sp. B2 Paenibacillus azotofixans B3 Bacillus megatorium B4 Bacillus firmus B5 Bacillus circulans B6 Bacillus polymixa B7 Bacillus sp. B8 Paenibacillus aspiarius Sumber : Budi et al. 1999 22 Tabel 3 Jenis–jenis bakteri yang ditemukan dari sporokarp Suillus grevillei dan ektomikoriza Bakteri asal Sporokarp Bakteri asal Ektomikoriza Bacillus bravis Bacillus cereus Bacillua megaterium Bacillus mycoides Bacillus polymixa Bacillus purnilus Bacillus subtilis Enterobacter aglomerans Flavobacterium oryzihabitans Micrococcus luteus Pseudomonas aureofaciens Pseudomonas cepacia Pseudomonas chloraphis Pseudomonas fluorocens Serratia fonticola Streptomyces spp. Acinobacter calcoaceticus Aeromonas hydrophyla Agrobacterium radiabacter Bacillus cereus Bacillus mycoides Enterobacter aglomerans 3 Enterobacter aglomerans 4 Enterobacter sakazakii Klebseiella pneumoniae Klebseiella ozaenae Micrococcus luteus Pseudomonas cepacia Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas putida Pseudomonas choraphis Serratia liquefaciens Serratia marcescens Serratia rubidae Streptomyces sp. Sumber : Varese et al. 1996 23

2.2 Fungi Mikoriza Arbuskula FMA