20
BAB II TINJAUAN PUSTAKA
2.1 Diversitas Bakteri Asal Mikoriza
Keberadaan mikroorganisme tanah di alam sangat melimpah dalam keragaman dan jumlah jenisnya. Setiap mikroorganisme memiliki peran spesifik
terhadap pertumbuhan dan perkembangan tumbuhan. Beberapa mikroorganisme memiliki sifat parasit namun ada pula yang bersifat menguntungkan dan tidak
sedikit pula yang keberadaannya bersifat netral. Aktivitas mikroorganisme tanah di sekitar rizosfer sangat membantu
perbaikan kesuburan tanah dan berdampak positif terhadap peningkatan kualitas dan
kuantitas produksi
tanaman. Penggunaan
mikroorganisme untuk
meningkatkan pertumbuhan tanaman merupakan hal menarik yang dalam beberapa tahun terakhir ini mendapat perhatian para peneliti. Sejalan dengan
perkembangan ilmu bioteknologi, mikroorganisme tanah merupakan objek yang mempunyai prospek untuk dikembangkan Barriuso et al. 2008.
Mikroba yang memiliki sifat asosiasi dengan tanaman inang, umumnya memiliki sifat kompatibilitas antara inang dan mikroba tersebut. Mikroba yang
dapat berasosiasi dengan tanaman inang tertentu, belum tentu dapat berasosiasi dengan tanaman inang yang lain. Dengan demikian, perlu dilakukan suatu
penelitian untuk mendapatkan jenis-jenis mikroba yang kompatibel dengan jenis tanaman yang diinginkan. Ada beberapa rangkaian kegiatan pengujian yang harus
dilakukan hingga didapatkan isolat mikroorganisme yang efektif membantu pertumbuhan tanaman.
Keberadaan bakteri yang terlibat secara langsung dalam pembentukan mikoriza pertama kali dibuktikan
oleh penelitian yang dilakukan oleh Bowen dan Theodorou 1979. Beberapa penelitian telah dilakukan dan ditemukan adanya
bakteri yang berasosiasi dengan mikoriza.
Dahm et al. 2005 mengisolasi bakteri dari beberapa jenis fungi ektomikoriza dan mendapatkan sejumlah bakteri dengan jumlah
jenis dan penampakan morfologi yang berbeda Tabel 1. Budi et al. 1999 mengisolasi bakteri asal
sporokarp
FMA
Glomus mosseae dan mendapatkan delapan jenis bakteri Tabel 2. Varese et al. 1996 mengisolasi bakteri dari sporokarp Suillus
grevillei dan mendapatkan 16 bakteri Tabel 3. Bakhtiar et al. 2010 yang
21
mengisolasi bakteri spora FMA tanpa disterilkan dari daerah mikorizosfer kelapa sawit dan menemukan 20 isolat bakteri.
Tabel 1 Jumlah dan morfologi jenis bakteri yang diisolasi dari sporokarp fungi ektomikoriza
Fungi Jumlah
isolat yang
dijumpai Jumlah
gram negatif
batang Jumlah
gram positif
basil Jumlah
gram positif
kokus Jumlah
bakteri variabel
pelomorfik
Amanita muscaria Hebeloma
crustuliniforme 1 Hebeloma
crustuliniforme 2 Hebeloma
crustuliniforme 3 Laccaria amethistina
Laccaria laccata 1 Laccaria laccata 2
Laccaria laccata 3 Laccaria proxima1
Lycoperdon sp. Scleroderma sp.
Suillus grevillei Suillus luteus
Thelephora terrestris Xerocomus sp.
3 30
30 30
29 30
29 30
30 30
30 30
30 30
29
3 21
18 28
5 30
29 27
27 30
30 20
28 30
27 –
6 –
– –
– –
1 –
– –
1 2
– 2
– 2
12 –
24 –
– –
– –
– 9
– –
– –
1 –
2 –
– –
– 3
– –
– –
– –
Sumber : Dahm et al. 2005
Tabel 2 Jenis bakteri yang ditemukan dari sporokarp Glomus mosseae
Nomor isolat Jenis-jenis bakteri yang ditemukan
B1 Methylobacterium sp.
B2 Paenibacillus azotofixans
B3 Bacillus megatorium
B4 Bacillus firmus
B5 Bacillus circulans
B6 Bacillus polymixa
B7 Bacillus sp.
B8 Paenibacillus aspiarius
Sumber : Budi et al. 1999
22
Tabel 3 Jenis–jenis bakteri yang ditemukan dari sporokarp Suillus grevillei dan ektomikoriza
Bakteri asal Sporokarp Bakteri asal Ektomikoriza
Bacillus bravis Bacillus cereus
Bacillua megaterium Bacillus mycoides
Bacillus polymixa Bacillus purnilus
Bacillus subtilis Enterobacter aglomerans
Flavobacterium oryzihabitans Micrococcus luteus
Pseudomonas aureofaciens Pseudomonas cepacia
Pseudomonas chloraphis Pseudomonas fluorocens
Serratia fonticola Streptomyces spp.
Acinobacter calcoaceticus Aeromonas hydrophyla
Agrobacterium radiabacter Bacillus cereus
Bacillus mycoides Enterobacter aglomerans 3
Enterobacter aglomerans 4 Enterobacter sakazakii
Klebseiella pneumoniae Klebseiella ozaenae
Micrococcus luteus Pseudomonas cepacia
Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas putida
Pseudomonas choraphis Serratia liquefaciens
Serratia marcescens Serratia rubidae
Streptomyces sp.
Sumber : Varese et al. 1996
23
2.2 Fungi Mikoriza Arbuskula FMA