PENGESAHAN SKRIPSI Skripsi dengan judul: Deteksi Gen TIMP-2 Pada Karsinoma Sel Skuamosa Lidah dari Spesimen Blok Parafin

  DETEKSI GEN TIMP-2 PADA KARSINOMA SEL SKUAMOSA LIDAH DARI SPESIMEN BLOK PARAFIN SKRIPSI Untuk Memenuhi Persyaratan Memperoleh Gelar Sarjana Kedokteran MUHAMMAD RAMA ANSHORIE G0010117 FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET Surakarta 2013 commit to user

  PENGESAHAN SKRIPSI Skripsi dengan judul: Deteksi Gen TIMP-2 Pada Karsinoma Sel Skuamosa Lidah dari Spesimen Blok Parafin

  Muhammad Rama Anshorie, NIM: G.0010117, Tahun: 2013 Telah diuji dan sudah disahkan di hadapan Dewan Penguji Skripsi

  Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret Surakarta Pada Hari...., Tanggal ....... 2013

  Pembimbing Utama

  Nama : Dr. Pradipto Subiyantoro,drg.,SpBM NIP : 19570629 198403 1 003 (...................................)

  Pembimbing Pendamping

  Nama : Vita Nirmala A.,drg.,SpPros.,SpKG NIP : 19660827 199403 2 003 (...................................)

  Penguji Utama

  Nama : Dr. Risya Cilmiaty AR,drg.,M.Si.,SpKG NIP : 19580710 198610 2 001 (...................................)

  Penguji Pendamping

  Nama : Widia Susanti,drg.,M.Kes NIP : 19690216 200401 2 002 (...................................) Surakarta, ………………..

  Ketua Tim Skripsi Dekan FK UNS

  Ari Natalia Probandari, dr., MPH, PhD Prof. Dr. Zainal Arifin Adnan, dr., SpPD-KR-FINASIM

  NIP 197512212005012001 NIP 19510601 197903 1 002 ii

  commit to user

  

PERNYATAAN

  Dengan ini menyatakan bahwa dalam skripsi ini tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar kesarjanaan di suatu perguruan tinggi dan sepanjang pengetahuan penulis juga tidak terdapat karya atau pendapat yang pernah ditulis atau diterbitkan oleh orang lain, kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah dan disebutkan dalam daftar pustaka.

  Surakarta, 7 Oktober 2013 Muhammad Rama Anshorie

  iii

  commit to user

  

ABSTRAK

Muhammad Rama Anshorie, G0010117, 2013, Deteksi Gen Timp-2 pada

  Karsinoma Sel Skuamosa Lidah dari Spesimen Blok Parafin. Skripsi, Fakultas Kedokteran, Universitas Sebelas Maret, Surakarta.

  

Latar belakang: Kanker lidah merupakan kanker yang banyak dijumpai di

  seluruh dunia. Pengobatan dan prognosis dari kanker ini sangat bagus tetapi tingkat metastasisnya cukup tinggi. Banyak kasus di jumpai telah mengalami metastasis. Penelitian ini bertujuan untuk melihat apakah adanya gen TIMP-2 yang berfungsi sebagai inhibitor factor metastasis sel kanker pada sampel Blok Parafin

  

Metode : Produk DNA yang digunakan adalah hasil isolasi DNA dari 14 sampel

  Blok Parafin. Kemudian produk diamplifikasi mengunakan PCR dengan primer sebagai cetakan. Analisis sampel dengan elektroforesis untuk mengetahui Gen TIMP-2 pada ke-14 sampel tersebut.

  

Hasil : Visualisasi gen TIMP-2 pada agarose menunjukkan hasil yang negatif

pada saat elektroforesis pada masing-masing sampel.

Kesimpulan : Gen TIMP-2 tidak tervisualisasi pada gel agarose, menunjukkan

bahwa tidak terdeteksinya gen TIMP-2 pada sampel.

  Kata kunci : Gen TIMP-2, Karsinoma Sel Skuamosa Lidah, PCR.

commit to user

  

ABSTRACT

Muhammad Rama Anshorie, G0010117, 2013, TIMP-2 Gen Detection on

  Squamous Cell Carcinoma of Parafin Block Specimen. Mini Thesis, Faculty of Medicine, Sebelas Maret University, Surakarta.

  Background : Tongue cancer is the most cancer type often found across the

  globe. The treatment and the progonosis of this cancer have a very good chance to be succeed but otherwise the spread of the cancer cell (metastasis) has a very high extent on them. There are numerous cases to be found in metastasis process. This research aims to observe whether there is a TIMP-2 cell that function as factor inhibitor of cancer cell metastasis on Parafin Block sample.

  

Method : this research employed a DNA product which is resulted from DNA

  isolation from 14 Parafin Block samples. First, the product is amplified using PCR and primer act as a mold of PCR. Furthermore, the result of PCR product will undergo a electrophoresis process to find out TIMP-2 on each 13 samples

  

Result : TIMP-2 gen visualization on agarose shows negative result on

  electrophoresis process on each sample

  

Summary : This research indicated that TIMP-2 gen was not found on agarose

  gel. Which means that all samples taken for this research did not detect any TIMP-2 gens Keyword : TIMP-2 gen, Squamous Cell Carcinoma, PCR.

  

commit to user

  

PRAKATA

  Alhamdulillahirobbil’aalamiin, segala puji penulis panjatkan kepada Allah SWT. yang senantiasa memberikan rahmat-Nya penulis dapat menyelesaikan skripsi dengan judul

  “Deteksi Gen TIMP-2 pada Karsinoma Sel Skuamosa Lidah dari Spesimen Blok Parafin.

  ”. Penelitian dan penulisan skripsi ini dapat terlaksana dengan baik berkat bantuan, bimbingan, dan petunjuk dari berbagai pihak. Untuk itu, penulis ingin mengucapkan terima kasih kepada: 1.

  Prof. Dr. Zainal Arifin A, dr., Sp.PD (KR), FINASIM selaku Dekan Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret, Surakarta.

  2. Ari Natalia Probandari, dr.,MPH,PhD selaku Ketua Tim Skripsi FK UNS.

  3. Dr. Pradipto Subiyantoro, drg.,SpBM selaku Pembimbing Utama atas bimbingan dalam penyusunan skripsi ini.

  4. Vita Nirmala A., drg.,SpPros.,SpKG selaku Pembimbing Pendamping atas bimbingan dalam penyusunan skripsi ini.

  5. Dr. Risya Cilmiaty AR, drg,M.Si.,SpKG selaku Penguji Utama yang telah memberikan bimbingan, kritik dan saran demi kesempurnaan penulisan skripsi ini.

  6. Widia Susanti, drg.,M.Kes selaku Anggota Penguji yang telah memberikan bimbingan, kririk dan saran demi kesempurnaan penulisan skripsi ini.

  7. Seluruh Dosen dan Staf Laboratorium Biomedik FK UNS.

  8. Bagian Skripsi FK UNS yang turut memberi kelancaran pembuatan skripsi ini.

  9. Ayahanda Halma Anhar, Ibunda Beni Ratna Murwani, adik Salsabil Ayu Anhari yang selalu mendoakan tanpa tiada henti dan memberikan semangat dari jauh bagi penulis

  10. Nurul Wahda Aulia yang dengan setia selalu memberikan semangat dan dukungan kepada penulis

  11. Teman-teman seperjuangan Giluters (Ega, Fai, Nabiel), sahabat-sahabat tercinta faiz, wahyu, mifta, agil, shofri, abbas, iqbal, dan keluarga besar Achiles yang senantiasa bersama penulis dalam menyelesaikan skripsi ini.

  12. Teman-teman dan pihak yang tidak dapat saya sebutkan satu-persatu yang turut mendukung skripsi ini.

  Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih banyak kekurangan dan jauh dari kata sempurna. Penulis mengharapkan saran dan kritik yang membangun demi kebaikan skripsi ini. Akhir kata penulis berharap semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi dunia kedokteran umumnya dan pembaca khususnya.

  Surakarta, 7 Oktober 2013 Muhammad Rama Anshorie

  

commit to user

  

commit to user

DAFTAR ISI

  Halaman PRAKATA ..................................................................................................... vi DAFTAR ISI .................................................................................................. vii DAFTAR TABEL .......................................................................................... ix DAFTAR GAMBAR ..................................................................................... x DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................. xi

  BAB I PENDAHULUAN A. Latar Belakang ............................................................................ 1 B. Perumusan Masalah..................................................................... 3 C. Tujuan Penelitian......................................................................... 4 D. Manfaat Penelitian....................................................................... 4 BAB II LANDASAN TEORI A. Tinjauan Pustaka ......................................................................... 5 1. Rongga Mulut......................................................................... 5 2. Karsinogenesis ....................................................................... 7 3. Karsinoma Sel Skuamosa Lidah ............................................ 10 4. Gen Matrix Metalloproteinases dan Tissue Inhibitor Metalloproteinases .................................................................

  12 5. Hubungan Metastasis Karsinoma Sel Skuamosa Lidah dengan Gen Tissue Inhibitor Metalloproteinases ...............................

  15 B. Kerangka Pemikiran .................................................................... 18

  BAB III METODE PENELITIAN A. Jenis Penelitian ............................................................................ 20 B. Lokasi Penelitian ......................................................................... 20 C. Subjek Penelitian ......................................................................... 20 D. Objek Penelitian .......................................................................... 20 E. Rancangan Penelitian .................................................................. 21 F. Alat dan Bahan Penelitian ........................................................... 21 G. Cara Kerja ................................................................................... 22

  

commit to user

H.

  Teknik Analisis Data ................................................................... 27

  BAB IV HASIL PENELITIAN A. Hasil Penelitian ........................................................................... 28 B. Analisis Hasil Visualisasi Gen TIMP-2 ...................................... 33 BAB V PEMBAHASAN ...............................................................................

  36 BAB VI PENUTUP A. SIMPULAN ................................................................................ 41 B. SARAN ....................................................................................... 41 DAFTAR PUSTAKA ....................................................................................

  42 LAMPIRAN

  

commit to user

  ix

  

DAFTAR TABEL

  Halaman

Tabel 2.1 Informasi tentang Lokasi dan Ekspresi Gen TIMP pada Manusia

  15 Tabel 3.1 Primer Sequence Gen Timp-2........................................................

  24 Tabel 3.1 Kondisi PCR ....................................................................................

  26

  DAFTAR GAMBAR

  Halaman

Gambar 2.1 Gambar Anatomi Lidah ................................................... 6Gambar 2.2 Perbandingan antara Sel Normal dan Sel Kanker ........... 8Gambar 2.3 (a) Histologi Normal Lidah;

  (b) KSSL yang Sudah Bermetastasis ............................... 12

Gambar 2.4 Proses Metastasis Neoplasma .......................................... 16Gambar 2.5 Skema Kerangka Pemikiran ............................................ 19Gambar 3.1 Skema Rancangan Penelitian .......................................... 20Gambar 4.1 Skematik Hasil Elektroforesis ......................................... 30Gambar 4.2 Hasil Elektroforesis Gen TIMP-2 Laboratorium Biomedik

  FK UNS ........................................................................... 31

Gambar 4.3 Hasil Elektroforesis Gen TIMP-2 Sampel nomer 1-12 di

  Laboratorium PK RSUD Dr. Moewardi .......................... 32

  Gamabar 4.4 Hasil Elektroforesis Gen TIMP-2 Sampel no 13 dan 14

  Bersama dengan Gen P-16, P14ARF, dan Ecaderin 12 di Laboratorium PK RSUD Dr. Moewardi .......................... 32

Gambar 4.5 Analisis Gen TIMP-2 yang Dikerjakan di Laboratorium

  Biomedik FK UNS .......................................................... 33

Gambar 4.6 Analisis Hasil Gen TIMP-2 pada Agarose Sesi Pertama

  yang dikerjakan di Laboratorium PK RSUD Dr.Moewardi ................................................................... 34

Gambar 4.7 Analisis Hasil Gen TIMP-2 pada Agarose Kedua yang

  Dikerjakan di Laboratorium PK RSUD Dr. Moewardi ... 35

  

commit to user