Validasi Keturunan Kelapa Sawit Material Genetik PT. Socfindo Berdasarkan Marka SSR (Simple Sequence Repeats)
ABSTRAK
Indra Syahputra, Validasi Keturunan Kelapa Sawit Material Genetik PT. Socfindo
Berdasarkan Marka SSR (Simple Sequence Repeats). Dibimbing oleh Dr. Ir. Lollie
Agustina P.Putri, M.Si. dan Mohammad Basyuni, S.Hut., M.Si., Ph.D.
Tanaman kelapa sawit merupakan tanaman penghasil devisa terbesar bagi
Indonesia, oleh sebab itu perakitan varietas unggul terus dilakukan. Validasi dengan
teknik molekuler dapat membantu proses identifikasi keurunan kelapa sawit dengan
hasil yang lebih cepat dan akurat dibandingkan dengan cara konvensional. Tujuan
penelitian ini adalah untuk menganalisis kandidat primer yang dapat memvalidasi
turunan kelapa sawit, kemurnian genetik dan tingkat keragaman molekuler tanaman
kelapa sawit material genetik PT. Socfindo berdasarkan marka SSR. Bahan yang
digunakan pada penelitian adalah 5 turunan kelapa sawit material generik PT.
Socfindo. Primer yang digunakan pada penelitian ini antara lain mCnCIR0038,
mEgCIR0894, mEgCIR3292 dan mEgCIR3663. Analisis data dilakukan dengan
menggunakan Softwere Gen Alex 3.0, Power Marker 3.25 dan DARwin 6.0.
Kesimpulan penelitian ini menunjukkan bahwa primer mCnCIR0038, primer
mEgCIR3785, primer mEgCIR3663 dan primer mEgCIR0257 telah berhasil
memvalidasi turunan kelapa sawit material genetik PT. Socfindo, kemurnian genetik
berdasarkan empat marka SSR mencapai 95 % sampai dengan 100% dan tingkat
keragaman molekuler berdasarkan empat marka SSR sebesar 41.68%.
Kata kunci : Kelapa sawit, SSR, validasi, kemurnian genetik, keragaman molekuler
Universitas Sumatera Utara
ABSTRACT
Indra Syahputra, Validation of Oil Palm Progeny from Genetic Material of PT.
Socfindo Based on SSR Marker (Simple Sequence Repeats) supervised by Dr. Ir.
Lollie Agustina P.Putri, M.Si. dan Mohammad Basyuni, S.Hut., M.Si., Ph.D.
Oil palm is the plant's largest foreign exchange earner for Indonesia,
therefore the assembly of high-yielding progeny has been continuously done.
Validation results with molecular techniques to assist in the identification of oil palm
progeny more quickly and accurately than the conventional way. The purpose of this
study was to analyze the primer candidate to validate oil palm progeny, genetic
purity and genetic diversity at the molecular level from the genetic material of PT.
Socfindo based on SSR marker. There were 5 palm genetic materials and 4 primers
(mCnCIR0038, mEgCIR0894, mEgCIR3292 dan mEgCIR3663) were used in this
research. Gen Alex 3.0, Power Marker 3.25 and DARwin 6.0 were used to analyze
data in this research has successfully validated the genetic material of oil palm
progeny from the fgenetic material of PT. Socfindo,where genetic purity of SSR
markers was achieved 95% to 100% and molecular variance based on four SSR
markers of was 41.68%.
Keywords : Oil palm, SSR, validation, genetic purity, molecular variance
Universitas Sumatera Utara
Indra Syahputra, Validasi Keturunan Kelapa Sawit Material Genetik PT. Socfindo
Berdasarkan Marka SSR (Simple Sequence Repeats). Dibimbing oleh Dr. Ir. Lollie
Agustina P.Putri, M.Si. dan Mohammad Basyuni, S.Hut., M.Si., Ph.D.
Tanaman kelapa sawit merupakan tanaman penghasil devisa terbesar bagi
Indonesia, oleh sebab itu perakitan varietas unggul terus dilakukan. Validasi dengan
teknik molekuler dapat membantu proses identifikasi keurunan kelapa sawit dengan
hasil yang lebih cepat dan akurat dibandingkan dengan cara konvensional. Tujuan
penelitian ini adalah untuk menganalisis kandidat primer yang dapat memvalidasi
turunan kelapa sawit, kemurnian genetik dan tingkat keragaman molekuler tanaman
kelapa sawit material genetik PT. Socfindo berdasarkan marka SSR. Bahan yang
digunakan pada penelitian adalah 5 turunan kelapa sawit material generik PT.
Socfindo. Primer yang digunakan pada penelitian ini antara lain mCnCIR0038,
mEgCIR0894, mEgCIR3292 dan mEgCIR3663. Analisis data dilakukan dengan
menggunakan Softwere Gen Alex 3.0, Power Marker 3.25 dan DARwin 6.0.
Kesimpulan penelitian ini menunjukkan bahwa primer mCnCIR0038, primer
mEgCIR3785, primer mEgCIR3663 dan primer mEgCIR0257 telah berhasil
memvalidasi turunan kelapa sawit material genetik PT. Socfindo, kemurnian genetik
berdasarkan empat marka SSR mencapai 95 % sampai dengan 100% dan tingkat
keragaman molekuler berdasarkan empat marka SSR sebesar 41.68%.
Kata kunci : Kelapa sawit, SSR, validasi, kemurnian genetik, keragaman molekuler
Universitas Sumatera Utara
ABSTRACT
Indra Syahputra, Validation of Oil Palm Progeny from Genetic Material of PT.
Socfindo Based on SSR Marker (Simple Sequence Repeats) supervised by Dr. Ir.
Lollie Agustina P.Putri, M.Si. dan Mohammad Basyuni, S.Hut., M.Si., Ph.D.
Oil palm is the plant's largest foreign exchange earner for Indonesia,
therefore the assembly of high-yielding progeny has been continuously done.
Validation results with molecular techniques to assist in the identification of oil palm
progeny more quickly and accurately than the conventional way. The purpose of this
study was to analyze the primer candidate to validate oil palm progeny, genetic
purity and genetic diversity at the molecular level from the genetic material of PT.
Socfindo based on SSR marker. There were 5 palm genetic materials and 4 primers
(mCnCIR0038, mEgCIR0894, mEgCIR3292 dan mEgCIR3663) were used in this
research. Gen Alex 3.0, Power Marker 3.25 and DARwin 6.0 were used to analyze
data in this research has successfully validated the genetic material of oil palm
progeny from the fgenetic material of PT. Socfindo,where genetic purity of SSR
markers was achieved 95% to 100% and molecular variance based on four SSR
markers of was 41.68%.
Keywords : Oil palm, SSR, validation, genetic purity, molecular variance
Universitas Sumatera Utara