Disamping xylosa, xylan juga mengandung arabinosa, asam glucoronik atau 4-0- methyl ether, asetat, ferulik dan asam p-coumarin. Sedangkan xylan dari sumber
yang lain, seperti rumput-rumputan, biji-bijian, kayu lunak maupun kayu keras mempunyai komposisi yang berbeda Saha, 2003. Xylan dari dedak mengandung
46 xylosa, 44,9 arabinosa, 1,4 glukosa, dan 8,3 asam anhidrouronik Shibuya dan Iwasaki, 1985. Arabinoxylan dari gandum mengandung 65.8
xylosa, 33.5 arabinose, 0,1 mannose, 0,1 galaktose, dan 0,3 glucose Gruppen et al., 1992. Xylan serat jagung mengandung 48-54xylosa, 33-35
arabinosa, 5-11 galaktosa, dan 3-6 asam glucuronic Doner dan Hicks, 1997.
2.2.3 Komponen Lignin
Lignin merupakan polimer dengan struktur aromatik yang terbentuk melalui unit-unit penilpropan Sjorberg, 2003 yang berhubungan secara bersama
oleh beberapa jenis ikatan yang berbeda Perez et al., 2002. Lignin sulit didegradasi karena strukturnya yang kompleks dan heterogen yang berikatan
dengan selulosa dan hemiselulosa dalam jaringan tanaman. Lebih dari 30 tanaman tersusun atas lignin yang memberikan bentuk yang kokoh dan
memberikan proteksi terhadap serangga dan patogen Orth et al., 1993. Howard et al., 2003 maupun Perez et al., 2002 mengungkapkan bahwa lignin
merupakan faktor pembatas utama degradasi lignoselulosa suatu bahan organik. Lebih lanjut dijelaskan bahwa lignin juga membentuk ikatan yang kuat dengan
polisakarida yang melindungi polisakarida dari degradasi mikroba dan membentuk struktur lignoselulosa.
Lignin terutama terkonsentrasi pada lamela tengah dan lapisan S2 dinding sel yang terbentuk selama proses lignifikasi jaringan tanaman Chahal dan Chahal
1998; Steffen 2003. Lignin tidak hanya mengeraskan mikrofibril selulosa, tetapi juga berikatan secara fisik dan kimia dengan hemiselulosa. Lignin terbentuk
melalui polimerasi tiga dimensi derivat dari sinamil alkohol terutama ρ-kumaril, coniferil dan sinafil alkohol dengan bobot molekul mencapai 11.000 Gambar 2.6
Perez et al. 2002; Rahikainen et al., 2013. Lignin bersifat tahan terhadap hidrolisis karena adanya ikatan arilalkil dan ikatan eter Gambar 2.7 Rahikainen
et al., 2013.
Para Kumaril Alkohol Koniferil Alkohol Sinapil Alkohol Model Kerangka C Gambar 2.6. Senyawa Penyusun Lignin Sumber: Perez et al., 2002
Gambar 2.7. Bangun Struktur Lignin Sumber: Perez et al., 2002
Pembentukan lignin terjadi secara intensif setelah proses penebalan dinding sel terhenti. Pembentukan dimulai dari dinding primer dan dilanjutkan ke
dinding sekunder. Pembatasan fermeabilitas dinding sel tanaman terjadi akibat adanya efek kimia dan fisik yang dihasilkan oleh lignin. Efek kimia, yaitu adanya
hubungan lignin-karbohidrat serta asetilisasi hemiselulosa. Efek fisik terjadi akibat Lignin membungkus mikrofibril dalam suatu matriks hidrofobik dan terikat
secara kovalen dengan hemiselulosa. Hubungan antara lignin-karbohidrat tersebut berperan dalam mencegah hidrolisis polimer selulosa Rahikainen et al., 2013.
2.3. Bakteri Perombak Senyawa Lignoselulosa 2.3.1. Karakteristik bakteri