Pengelompokkan hasil elektroforesis berdasarkan kesamaam pola pita

3. Pengelompokkan hasil elektroforesis berdasarkan kesamaam pola pita

Gambar 11. Profil pola pita hasil amplifikasi no. 1 dan no. 6 mempunyai kesamaan pola pita dengan jumlah pita sama yaitu 2 pita. Terdapat pada var.kelapa bali dan manggala. Terletak pada pasangan basa antara 300pb-400pb.

Kesamaan pola pita pada hasil elekroforesis ditunjukkan pada pita no. 1 dan no. 6 yaitu pada salak kelapa bali (1) dan manggala (6) menunjukkan pola pita dan jumlah yang sama satu pita yang jelas dan tajam dan satu pita kurang jelas dan tajam. Keduanya terletak antara 300 pb - 400 pb. Pola pita yang sama menunjukkan kedekatan atau kekerabatan. Dalam hal ini antara salak kelapa bali dan manggala mempunyai hubungan kekerabatan yang dekat secara genetik.

commit to user

Gambar 12. Profil hasil amplifikasi kultivar no.3 dan no.4 mempunyai kesamaan pola pita yang terletak antara 100 pb-400 pb, yaitu Kediri (3) dan p.hitam (4).

Pada gambar diatas menunjukkan dua kultivar yang mempunyai hubungan kekerabatan yang dekat antara no. 3 dan no. 4 yaitu pada kultivar salak Kediri (3) dan salak pondoh hitam (4). Hal ini ditunjukkan pada jumlah pita dan susunan yang sama dan terletak pada pasang basa yang sama. Pada kultivar salak Kediri terletak antara 100 pb - 400 pb menghasilkan pola pita tunggal sebanyak 3 pita dengan kualitas pita yang tajam atau lemah. Sedangkan pada kultivar salak pondoh hitam juga menghasilkan 3 pola pita dan terletak pada pasangan basa yang sama yaitu antara 100 pb - 400 pb. Namun yang membedakan antara kedua kultivar tersebut yaitu pada pita kedua yang terletak antara 200 - 300 pb, pada kultivar salak Kediri menghasilkan pola pita tunggal monomorfik sedangkan pada kultivar salak pondoh hitam menghasilkan pola pita ganda polimorfik. Diketahui bahwa antara kultivar salak kediri yang bukan varietas non pondoh dengan kultivar pondoh hitam mempunyai hubungan kekerabatan yang dekat, dalam hal ini juga dapat diketahui dari ciri-ciri morfologis keduanya. Salah satunya adalah rasa buah dari salak kediri yang manis dengan warna kulit buah gelap seperti pada salak pondoh hitam.

commit to user

Gambar 13. Profil hasil amplifikasi kultivar no. 5, 8, 10, dan 12 mempunyai pola pita sama yang terletak antara 300 pb-500 pb dengan pola pita tunggal, terdapat pada salak pondoh madu, Thailand, bejalen, dan pondoh lawu.

Hasil amplifikasi diatas menunjukkan terdapat empat kultivar salak yang mempunyai hubungan kedekatan secara genetik. Ditunjukkan pada pola pita dan susunan pita polimorfis yang sama dari keempat kultivar. Keempat pita polimorfis terdapat diantara 300 pb - 500 pb dengan kualitas pita tebal atau samar-samar. Pada pola pita no. 1 yaitu kultivar salak pondoh madu, menunjukkan pola pita yang tebal dan jelas, hal ini sama dengan pola pita no.

4 pada kultivar pondoh lawu. Sedangkan pola pita dengan kualitas yang kurang jelas namun masih dapat terbaca ada pada no. 2 yaitu kultivar Thailand, terletak pada pasang basa yang sama dengan no.1 dan no.4. Kultivar no. 3 yang ditunjukkan pada gambar yaitu salak bejalen, terletak pada 300 pb dan mempunyai hubungan kedekatan dengan ketiga pita lainnya. Antara kultivar salak pondoh madu dan salak pondoh lawu juga mempunyai hubungan kekerabatan yang dekat dalam hal morfologis, keduanya mempunyai rasa manis tidak sepat, namun salak pondoh lawu tidak mempunyai aroma khas seperti pada salak pondoh madu. Salak pondoh madu dan salak lawu mempunyai hubungan kekerabatan dekat dengan salak lokal kultivar thailand dan bejalen. Dilihat dari ciri morfologis dengan rasa buah yang sama-sama manis tidak sepat. Salak thailand merupakan sebutan salak pondoh dari indonesia dipasarkan dan di ekspor ke mancanegara. Salak

500 pb

300 pb

commit to user

pada buah keluar cairan seperti madu. Kekerabatan yang dekat antara kultivar diatas karena lokasi tumbuh yang berdekatan.

Gambar 14. Profil hasil amplifikasi pita DNA no.9 dan no. 11 mempunyai kesamaan pola pita yang sama yang terletak antara 300 pb – 600 pb pada salak banjar dan kecandran.

Hasil amplifikasi diatas menunjukkan dua pita DNA hasil PCR menghasilkan pola pita polimorfis dengan susunan pita yang sama antara kultivar no.9 dan no.11 yaitu pada salak banjar dan salak kecandran. Kedua pita terletak pada pasang basa yang sama antara 300 pb-600 pb. Pada kultivar salak banjar dihasilkan 6 pola pita tunggal dan ganda. Sedangkan pada kultivar kecandran juga dihasilkan 6 pita baik tunggal maupun ganda. Dari hasil diatas diketahui bahwa kedua kultivar tersebut mempunyai hubungan kekerabatan yang dekat dengan ditandai susunan dan jumlah pita yang sama secara genetik. Antara kultivar salak kecandran dan salak banjar mempunyai hubungan kekerabatan yang dekat, dikarenakan keduanya sama-sama merupakan salak lokal yang dibudidayakan oleh masing-masing daerah. Dari segi morfologis keduanya mempunyai rasa kurang manis dan agak sepat. Ukuran buahnya sama- sama besar dan pada kulit buah sedikit duri.

M 9 11 M

commit to user

No. 2 no. 7 no. 13 no. 14 no. 15

Gambar 15. Profil hasil amplifikasi Salak Gula pasir, Madura, Merah, Suaru dan tasik berdiri sendiri tidak ada kesamaan dengan pola pita yang lain. Masing-masing berdiri sendiri.

Dari hasil amplifikasi lima kultivar salak Gula Pasir, Salak madura, salak merah, salak suaru, dan salak tasik masing-masing pita berdiri sendiri tidak ada kesamaan pola pita dengan kulitivar lainnya dalam hasil photo running. Hal ini menunjukkan bahwa diantara kultivar salak diatas mempunyai hubungan kekerabatan yang jauh.

Pada kultivar salak gula pasir (no.2) dihasilkan empat pola pita DNA dengan kualitas pola pita tebal atau lemah dengan pola pita tunggal dan terletak pada susunan basa antara 200 pb-450 pb. Pada kultivar salak madura (no.7) menghasilkan enam pita DNA yang terletak antara 150 pb - 600 pb dengan kualitas pita tajam atau lemah. Pola pita yang terletak antara 300 pb – 600 pb dan menghasilkan tiga susunan pita DNA dihasilkan pada kultivar salak Merah (no.13). Sedangkan untuk kultivar no.14 dan no.15 yaitu salak suaru dan salak tasik menghasilkan masing-masing dua susunan pola pita dengan kualitas pita yang lemah, namun masih dapat terbaca. Diantara kelima kultivar tersebut susunan pola pita yang paling banyak muncul ada pada susunan basa 400 pb untuk kultivar salak Gula Pasir dan salak madura.

commit to user

commit to user