Identifikasi Fragmen DNA Genomik Kelapa Sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Hasil PCR (Polymerase Chain Reaction) Menggunakan Primer Spesifik untuk Beta Karoten
ABSTRACT
ALEXANDER M. LUTHFI: Identification of genomic DNA fragments of palm
oil with PCR products using specific primer for beta carotene, supervised by
LOLLIE AGUSTINA P. PUTRI and REVANDY I. M. DAMANIK.
The aim of the research was to identify genomic DNA fragments of palm oil with
PCR products by using spesific primer for beta carotene. This research was
conducted in Plant Tissue Culture Laboratory, Faculty of Agriculture, University
of Sumatera Utara and Bio Molecular Laboratory PT. Socfin Indonesia SSPL
Bangun Bandar, Dolok Masihul, Serdang Bedagai-Sumatera Utara, from
February to August 2016. A total of 38 palm oil samples issued by PT. Socfin
Indonesia was identified using specific Beta primer of molecular marker for beta
carotene
The results showed band patterns a total of 16 amplicons. Polymorphism
percentage was indicated at 100%. There was differences in band patterns on
samples derived from the same individual but different sources of isolated plant
tissues. In this research DNA fragments was obtained ranged from ± 156‒ 3029
bp. Dendogram analysis spread 38 samples into three main groups and molecular
diversity that can be explained using Beta primer was 56.19 %.
Keywords: beta carotene, palm oil, polymerase chain reaction, spesific primer
i
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
ALEXANDER M. LUTHFI: Identifikasi Fragmen DNA Genomik Kelapa Sawit
(Elaeis guineensis Jacq.) Hasil PCR (Polymerase Chain Reaction) Menggunakan
Primer Spesifik untuk Beta Karoten, dibimbing oleh LOLLIE AGUSTINA P.
PUTRI dan REVANDY I. M. DAMANIK.
Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi fragmen DNA genomik kelapa
sawit hasil PCR dengan menggunakan primer spesifik untuk beta karoten.
Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Kultur Jaringan Tanaman, Fakultas
Pertanian, Universitas Sumatera Utara dan Laboratorium Bio Molekuler
PT. Socfin Indonesia SSPL Bangun Bandar, Dolok Masihul, Serdang BedagaiSumatera Utara, dimulai dari bulan Februari hingga Agustus 2016. Sebanyak 38
sampel dari tanaman kelapa sawit yang dikeluarkan oleh PT. Socfin Indonesia
diidentifikasi menggunakan marka molekuler primer spesifik Beta untuk karakter
beta karoten.
Hasil penelitian menunjukkan pola pita sebanyak 16 amplikon. Persentase
polimorfisme yang dihasilkan sebesar 100%. Terdapat perbedaan pola pita pada
sampel yang berasal dari individu yang sama tetapi berbeda sumber bagian
tanaman yang diisolasi. Pada penelitian ini diperoleh fragmen DNA dengan
ukuran berkisar ± 156 bp ‒ 3029 bp. Analisis dendogram membagi 38 sampel
menjadi tiga kelompok utama dan keragaman molekuler yang dapat dijelaskan
dengan primer Beta sebesar 56.19 %.
Kata kunci: beta karoten, kelapa sawit, polymerase chain reaction, primer spesifik
ii
Universitas Sumatera Utara
ALEXANDER M. LUTHFI: Identification of genomic DNA fragments of palm
oil with PCR products using specific primer for beta carotene, supervised by
LOLLIE AGUSTINA P. PUTRI and REVANDY I. M. DAMANIK.
The aim of the research was to identify genomic DNA fragments of palm oil with
PCR products by using spesific primer for beta carotene. This research was
conducted in Plant Tissue Culture Laboratory, Faculty of Agriculture, University
of Sumatera Utara and Bio Molecular Laboratory PT. Socfin Indonesia SSPL
Bangun Bandar, Dolok Masihul, Serdang Bedagai-Sumatera Utara, from
February to August 2016. A total of 38 palm oil samples issued by PT. Socfin
Indonesia was identified using specific Beta primer of molecular marker for beta
carotene
The results showed band patterns a total of 16 amplicons. Polymorphism
percentage was indicated at 100%. There was differences in band patterns on
samples derived from the same individual but different sources of isolated plant
tissues. In this research DNA fragments was obtained ranged from ± 156‒ 3029
bp. Dendogram analysis spread 38 samples into three main groups and molecular
diversity that can be explained using Beta primer was 56.19 %.
Keywords: beta carotene, palm oil, polymerase chain reaction, spesific primer
i
Universitas Sumatera Utara
ABSTRAK
ALEXANDER M. LUTHFI: Identifikasi Fragmen DNA Genomik Kelapa Sawit
(Elaeis guineensis Jacq.) Hasil PCR (Polymerase Chain Reaction) Menggunakan
Primer Spesifik untuk Beta Karoten, dibimbing oleh LOLLIE AGUSTINA P.
PUTRI dan REVANDY I. M. DAMANIK.
Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi fragmen DNA genomik kelapa
sawit hasil PCR dengan menggunakan primer spesifik untuk beta karoten.
Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Kultur Jaringan Tanaman, Fakultas
Pertanian, Universitas Sumatera Utara dan Laboratorium Bio Molekuler
PT. Socfin Indonesia SSPL Bangun Bandar, Dolok Masihul, Serdang BedagaiSumatera Utara, dimulai dari bulan Februari hingga Agustus 2016. Sebanyak 38
sampel dari tanaman kelapa sawit yang dikeluarkan oleh PT. Socfin Indonesia
diidentifikasi menggunakan marka molekuler primer spesifik Beta untuk karakter
beta karoten.
Hasil penelitian menunjukkan pola pita sebanyak 16 amplikon. Persentase
polimorfisme yang dihasilkan sebesar 100%. Terdapat perbedaan pola pita pada
sampel yang berasal dari individu yang sama tetapi berbeda sumber bagian
tanaman yang diisolasi. Pada penelitian ini diperoleh fragmen DNA dengan
ukuran berkisar ± 156 bp ‒ 3029 bp. Analisis dendogram membagi 38 sampel
menjadi tiga kelompok utama dan keragaman molekuler yang dapat dijelaskan
dengan primer Beta sebesar 56.19 %.
Kata kunci: beta karoten, kelapa sawit, polymerase chain reaction, primer spesifik
ii
Universitas Sumatera Utara