terdiri atas coding region ekson dan non-coding region intron. Pre-mRNA disintesis dalam inti menjadi mRNA matang yang ditranslasi ke protein dalam sitoplasma.
Sintesis pre-mRNA menyebabkan eliminasi semua intron dan splicing ekson. Situs pengikatan RNA polimerase II pada umumnya berupa urutan TATA yang disebut boks
TATA. RNA polimerase III Pol III mengenali promotor yang mengontrol sintesis RNA pendek seperti 5S rRNA, transfer RNA tRNA, small nuclear RNA snRNA
dan signal recognition particle RNA srpRNA. 5S rRNA merupakan bagian dari subunit ribosom 60S.
4.2.4. Faktor transkripsi pada eukariot.
Protein yang diperlukan untuk proses inisiasi pada transkripsi tetapi tidak merupakan bagian RNA polimerase didefinisikan sebagai faktor transkripsi. Faktor
transkripsi ini mirip dengan faktor sigma pada prokariot. Faktor transkripsi adalah aktivator yang berfungsi dalam sebuah promotor dan selalu berinteraksi secara langsung
dengan RNA polimerase. Faktor transkripsi TFs mengenali situs pengikatan aktifator dalam daerah promotor dan menstimulasi RNA polimerase yang berikatan dengan
promotor. Faktor transkripsi diproduksi secara konstitutif karena sejumlah gen
bergantung kepada faktor ini untuk ekspresinya.
Pengikatan RNA polimerase pada promotor bergantung pada protein yang disebut faktor transkripsi TFs seperti TFIID yang mengenali boks TATA. TFIID adalah faktor
transkripsi pertama yang berikatan sangat dekat dengan promotor pada daerah inisiasi, sekitar -20 sampai -10 pasangan basa sebelum sisi awal transkripsi. Promotor dan faktor
transkripsi bekerja bersama-sama dalam menentukan RNA polimerase mana yang diikat dan gen yang ditranskripsi. TFIID berikatan dengan boks TATA, oleh karena itu disebut
juga TATA-box binding protein TBP. Boks TATA adalah urutan nukleotida yang khas terdapat dalam daerah promotor sel eukariot. Boks TATA berlokasi di sekitar -30
pasangan basa dari sisi pengikatan RNA polimerase dengan ketentuan urutan 5’TCGTATATA AAATCA3’.
TFIID berfungsi mengorganisasikan faktor transkripsi yang lain yang dibutuhkan untuk inisiasi sintesis RNA. Salah satu bagian TFIID adalah TFIIA sementara bagian
lain merupakan faktor jaringan tertentu tissue-specificity factor. Faktor ini merupakan suatu protein yang hanya diproduksi dalam sel eukariot yang memiliki tipe jaringan
tertentu. Pada transkripsi tingkat dasar terbentuk kompleks antara TFIIA dengan TFIIB, TFIID, TFIIE dan RNA polimerase II Gambar 4.11.
37
Gambar 4.11. Faktor transkripsi pada eukariot. Elongasi rantai RNA oleh RNA polimerase pada bakteri maupun eukariot dapat
dihambat oleh antibiotik actinomycin D. Antibiotik ini masuk diantara pasangan basa
G-C pada DNA sehingga menghambat pergerakan RNA polimerase sepanjang templat.
Antibiotik acridin bekerja dengan mekanisme yang sama. Rifampisin menghambat
sintesis RNA bakteri dengan mengikat subunit β RNA polimerase bakteri.
4.3. TRANSKRIPSI BALIK
