Menggambar Struktur Kimia Senyawa Analog Kalkon dan Input File Optimasi Geometri Struktur

3. Random Access Memory RAM 4 GB. 4. Monitor HP 17 inchi.

3.3.2 Perangkat Lunak

Penelitian ini menggunakan sejumlah perangkat lunakdengan kegunaan sebagai berikut: 1. Sistem operasi Windows Vista ™ Business 32-bit. 2. Gaussian-09 digunakan untuk optimasi geometri struktur molekul serta perhitungan nilai deskriptor elektronik. 3. MarvinBeans-6.0.0 yang dikeluarkan oleh ChemAxon digunakan Menghitung nilai deskriptor sterik dan hidrofobik. 4. GaussView-3.07digunakan untuk pemodelan struktur molekul. 5. IBM SPSS 21 digunakan untuk analisis statistika dan menentukan persamaan HKSA. 6. Microsoft Excel 2013 digunakan untuk rekapitulasi hasil perhitungan.

3.3.3 Bahan

Bahan kajian dalam penelitian ini adalah senyawa analog kalkon beserta data IC 50 yang telah diuji secara eksperimental oleh Shenvi et al. 2011 yang dapat dilihat pada Tabel 2.1.

3.4 Prosedur Penelitian

3.4.1 Menggambar Struktur Kimia Senyawa Analog Kalkon dan Input File

Struktur kimia senyawa analog kalkon yang digunakan dalam penelitian ini digambar menggunakan software Gauss View-3.07. Diawali dengan menggambar struktur dasar yang tersaji dalam gambar pada Tabel 2.1, kemudian disubstitusi pada R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , dan R 5 seperti pada Tabel 2.1. Langkah selanjutnya yaitu memilih metode perhitungan dan basis sets. Klik menu Calculate, kemudian pilih menu Gaussian maka akan muncul kotak dialog. Tetapkan Job Type pada Optimization, lanjutkan dengan memilih metode pada kotak dialog Method. Tetapkan metode pada Ground State, DFT, Unrestricted, dan B3LYP. Atur pula basis sets pada 6-311G, carge pada 0 dan spin pada singlet, kemudian klik tombol Retain. Simpan dengan cara klik menu File, kemudian pilih menu Save. Ketik nama file pada kotak File name, tetapkan Files of type pada Gaussian input file .gjf, .com dan Save as pada Gaussian input file, kemudian klik tombol Save.

3.4.2 Optimasi Geometri Struktur

Struktur sampel dioptimasi menggunakan software Gaussian-09 dengan metode Density Functional Theory DFT B3LYP pada basis sets 6-311G. Kemudian deskriptor dihitung pada struktur geometri yang telah optimal menggunakan metode yang sama pada basis sets 6-311G Markovic et al., 2013. Struktur senyawa induk kalkon C 18 H 18 O 4 juga dioptimasi menggunakan metode MP2 6-311G sebagai pembanding hasil optimasi. Setelah dibuat Gaussian input file .gjf, maka dapat dilakukan perhitungan menggunakan software Gaussian-09. Langkah awal yaitu membuka file dalam format Gaussian input file .gjf dengan cara klik menu File, kemudian pilih menu Open. Seleksi file Gaussian input file .gjf yang akan dilakukan perhitungan, kemudian klik tombol Open. Setelah informasi dari Gaussian input file .gjf terbaca pada software Gaussian-09, jalankan perhitungan dengan cara klik menu File, kemudian pilih menu Load. Sebelum perhitungan dimulai, muncul peringatan untuk menyimpan file Gaussian output file .out. Tempatkan Gaussian output file .out pada direktori yang diinginkan, kemudian klik tombol Save.

3.4.3 Perhitungan Nilai Deskriptor