waktu yang lainnya akan dapat ditentukan. Ciri khas dari potensial ini adalah adanya fungsi batas cut off function yang membatasi jumlah atom yang terlibat selama
perhitungan potensial yang bekerja pada suatu atom, sehingga dengan fungsi batas ini, atom-atom yang jauh terpisah dari atom dari suatu jarak tertentu yang lebih jauh dapat
diabaikan sehingga mengurangi jumlah perhitungan. Walaupun hal ini mengurangi ketelitian, tetapi pada kenyataannya kontribusi atom pada suatu potensial berbanding
terbalik secara eksponensial dengan jaraknya sehingga metode ini dapat diterima.
1.2 Tujuan Penelitian
Tujuan dari penelitian ini adalah: 1.
Memahami prinsip dinamika molekul melalui simulasi 2.
Melakukan uji coba simulasi dinamika molekul dengan berbagai parameter yang berbeda
3. Menggunakan program bantu untuk mensimulasi dan memvisualisasikan
gerakan molekul
1.3 Batasan Masalah
Penelitian dengan simulasi dinamika molekul pada penelitian ini dibatasi pada:
1.
Simulasi dilakukan hanya pada ensemble mikrokanonikal yaitu sistem dengan energi dan temperatur konstan.
2. Simulasi dibatasi pada distribusi molekul dan gerak molekul dengan
menggunakan mekanika klasik. 3.
Simulasi untuk potensial dan gaya antarmolekul digunakan model potensial lennard jones.
4. Simulasi dan visualisasi gerak molekul dengan menggunakan program
matlab 6,1
1.4 Metodologi Penelitian
Penelitian dilakukan dengan langkah-langkah sebagai berikut: 1. Studi literature
Merupakan tahap pengumpulan literature mengenai termodinamika statistik, dinamika molekul, potensial lennard jones, dan teknik
pemrograman dengan matlab
Universitas Sumatera Utara
2. Perancangan model
Merupakan tahap menentukan persamaan-persamaan matematis dengan variable-varibel yang telah ditentukan.
3. Pembuatan algoritma
Merupakan metode terstruktur yang berisi tahapan-tahapan penyelesaian masalah dinamika molekul.
4. Pembuatan program komputer
Tahap ini merupakan implementasi dari model dan algoritma yang telah dibuat ke dalam program computer dengan menggunakan bahasa
pemrograman matlab 6,1 5.
Analisa hasil simulasi Memberikan analisa hasil uji coba simulasi dan visualisasi dinamika
molekul yang telah diperoleh. 6.
Penulisan Laporan.
1.5 Sistematika Pembahasan
Laporan tugas akhir ini disusun dalam lima bab yaitu sebagai berikut: Bab I
Pendahuluan Bab ini menjelaskan latar belakang penelitian, tujuan penelitian, batasan
masalah, dan sistematika pembahasan. Bab II
Tinjauan Pustaka Bab ini menjelaskan landasan teori yang digunakan dalam penelitian, yaitu
dasar persamaan gerak, mekanika statistik, dasar-dasar dinamika molekul, model interaksi system dengan lingkungan, model interaksi antarmolekul yang
digunakan untuk mengolah informasi yang akan diimplementasikan dalam simulasi.
Bab III Perancangan Simulasi Dinamika Molekul
Bab ini membahas tentang implementasi fisis yang telah diperoleh ke dalam perangkat lunak. Perancangan perangkat lunak ini menggunakan bahasa
pemrograman matlab versi 6,1. Bab IV
Hasil dan Pembahasan
Universitas Sumatera Utara
Bab ini memberikan hasil uji coba simulasi dinamika molekul yang telah dilakukan pada bab III untuk melihat kesesuaian spesifikasi metode yang
digunakan sehingga dapat dianalisa hasil yang telah diperoleh. Bab V
Kesimpulan dan saran Bab ini memberikan kesimpulan dari hasil perancangan program yang telah
dilakukan dan juga memberikan saran-saran untuk penelitian selanjutnya.
Universitas Sumatera Utara
BAB II
TINJAUAN PUSTAKA
2.1 Atom dan Molekul
