Tersedia online di: http:ejournal-balitbang.kkp.go.idindex.phpjra KARAKTERISASI DAN EVALUASI POPULASI ABALON Haliotis squamata SECARA MOLEKULER, MORFOMETRIK, DAN BIOLOGI

  Jurnal Riset Akuakult ur, 12 (2), 2017, 111-119

Tersedia online di: ht t p://ej ournal-balit bang.kkp.go.id/index.php/j ra

  KARAKTERISASI DAN EVALUASI POPULASI ABALON Haliotis squamata

  

SECARA M OLEKULER, M ORFOM ETRIK, DAN BIOLOGI

_{)# ) ) )}

Gusti Ngurah Permana* , Rudhy Gustiano* , Ibnu Rusdi* , Fitriyah Husnul Khotimah* ,

_{) ) )}

Bam bang Susant o* , dan Dedi Duryadi Solihin**

  

Balai Besar Riset Budid aya Laut dan Penyuluhan Pe rikanan

₎ *

• **

  Fakultas Mat emat ika dan Ilmu Pen getahuan Alam, Departeme n Bio logi, In stit ut Pertanian Bogor

  

(Naskah dit erima: 25 Juli 2017; Revisi final: 3 Okt ober 2017; Diset ujui publikasi: 3 Okt ober 2017)

ABSTRAK

Abalo n m eru p akan salah satu kom o dit as p en t ing gastro p od a lau t. Tin ggin ya p erm in t aan ab alo n in i

me ngakibat kan m enipisnya stok di alam . Oleh kare na it u, upaya ke berhasilan bud idaya ab alo n perlu

didukung oleh jenis unggul. Indikasi awal suatu jenis unggul dapat dilakukan dengan menganalisis potensi

genetik yang dimiliki. Penelitian ini dilakukan dengan analisis gen 16S rRNA, karakter morfolologi, dan

bio logi dianalisis secara d eskriptif de ngan met ode kajian pu staka. Hasil yan g dipero leh menu njukkan

keragaman inter populasi Haliot is squamat a mendeteksi adanya tujuh haplotipe yang terbagi dalam dua

kelompok. Penyertaan

  H. diversicolor sebagai out group dalam pengujian memperlihatkan bahwa populasi H. dari Pulau Bali dan beberapa lokasi di Pulau Jawa berada dalam satu kelompok yang terpisah squamat a

dengan out group . Hasil ini kongruen dengan analisis morfometrik terdapat perkembangan pertumbuhan

cangkang yang asimetri pada populasi Banten. Pertumbuhan asimetri merupakan indikasi spesifik untuk

populasi Banten atau merupakan gejala abnormalitas yang dapat diakibatkan oleh faktor penurunan kualitas

ge net ik atau lingkun gan . Karakt er bio logi t erlihat p rop orsi d aging dan go nad b erb eda pada pop ulasi

Bante n d engan in dikasi ad anya p ert umb uhan asim et ri. Rasio go nad dan d aging pop ulasi Banyu wan gi

berbeda nyata (P< 0,05) dengan populasi lainnya.

  Haliotis squamata

KATA KUNCI: abalon; biologi; ; morfometrik; mitokondria; dan sgenetik; 16Sr RNA

ABSTRACT: M orphometrical, biological, and molecular evaluation and characterization of abalone Haliot is

squamat a. By: Gusti Ngurah Permana, Rudhy Gustiano, Ibnu Rusdi, Fitriyah Husnul Khotimah, Bambang Susanto, and Dedi Duryadi Solihin

  

Abalone is arguably one of t he highly valued and sought -aft er marine gast ropods. However, t he over-exploit at ion of

t his species has exhaust ed it s wild st ock. To overcome t his challenge, t he cult ure t echnique and management of t his

species must be est ablished and continually improved. One of t he ways is t hrough producing superior broodstocks. An

init ial assessment of a genet ically superior broodst ock can be done using t he pot ent ial genet ic analysis. This recent

research employed t he analysis t o st udy t he species’ 16S rRNA gene. To complement t he st udy, t he morphomet ric and

biological charact erist ics of t he species were analyzed descript ively wit h t he aid of scient ific lit erat ure. The result s

showed t hat t he int erpopulat ion diversit y of Haliotis squamata was det ect ed by t he presence of seven haplot ypes

divided int o t wo groups. The inclusion of H. diversicolor as an out group wit hin t he t est showed t hat t he populat ions

of abalone in Bali and several ot her sit es in Java were genet ically separat ed from t he out group. This finding can be

backed up wit h t he result of t he morphomet ric analysis where t here was asymmet ric shell growt h in Bant en abalone

populat ion. This asymmet ric growt h is considered as a sympt om of abnormalit y caused by genet ic or environment al

degradat ion fact ors. The biological charact erist ics showed t he different rat ios of meat and gonad in t he Bant en

  (P< 0.05)

populat ion due t o t he asymmet ric growt h. Banyuwangi populat ion was significant ly different from ot her

populat ions in t erms of meat and gonad rat ios.

  KEYW ORDS: abalon; biology; _# Haliot is squamat a; morphometric; mitochondria and genetic; 16Sr RNA Ko r esp o n d e n si: Balai Be sar Riset Bu d id aya Lau t d an Pe n yu lu h an Pe r ikan an . Jl. Br. Go n d o l Ke c. Ge ro kg ak Kab . Bu le le n g , Po . Bo x 1 4 0 , Sin g ar aja 8 1 1 5 5 , Bali, In d o n e sia. Te l. + (0 3 6 2 ) 9 2 2 7 8 gust iper mana@ gmai l .com

  E-m ail:

  Keragaan pertumbuhan dan reproduksi abalon ..... (Gust i Ngurah Permana) PENDAHULUAN

  forward (AB-16S-F); dan 1 

  plat e unt uk pro ses amplifikasi gen 16S rRNA.

  Amplifikasi Gen 16S rRNA

  Am p lifika s i ge n 1 6 S rRNA d ila k u k an d e n g a n menggunakan mesin PCR dengan primer forward AB-

  16 S-F: 5 ’-CGCCTGTTTATCAAAAACAT-3’ dan

  reverse

  AB-16S-R: 5’-CTCCGGTTTGAACTCAGATC-3’. Ko mpo - nen reaksi t erdiri at as: 5  L

  t emplat e

  DNA; 1  L primer

  L primer reverse (AB-16S-R) dengan ko nsent rasi 20  mo l/  L; 5  L buffer react ion Q5, 5  L

  Prosedur Analisis Ekstraksi dan Purifikasi DNA

  enhancer

  Q5; 1  L dNTP mix; 0,2  L

  Taq Hotstar high fidalit y ; dan 6,8 

  L nuclease free wat er ; sehingga t ot al reaksi adalah 25  L. Pro ses PCR dilakukan dengan t ahapan reaksi sebagai berikut : sampel didenat urasi pada suhu 94°C selama 4,5 det ik; dilanjut kan anneal-

  ing

  pada suhu 46°C selama 60 det ik, dan

  ext ension

  pada suhu 72°C selama 60 det ik sebanyak 35 siklus. Set elah it u, pro ses PCR dilanjut kan dengan

  post ext ension

  DNA geno mik diekst rak dari epip o dium sam pel ab alo n (5 0 0 m g) m e n gg u n a ka n DNe a sy Blo o d & Tissue™ (QIAGEN, Hilden, Germany) sesuai dengan p et un juk pe ru sah aan . Purifikasi dilakukan d en gan me nggu nakan sp in ko lo m yang t e rsedia dalam kit e kst raksi t e rse b ut . DNA ge n o mik yan g d ih asilkan d im ig ra s ik an d a la m g e l a g a ro s e d e n g a n t e k n ik elekt ro fo resis. DNA yang dihasilkan menjadi DNA t em-

  Se b a n ya k 2 0 e k o r s a m p e l d a ri s e t ia p lo k a s i d ig u n a k a n u n t u k a n a lis is DNA. Sa m p e l ya n g d ipe rgun akan adalah d ari b agian e p ip o d iu m yan g diawet kan dalam alko ho l abso lut .

  Abalo n m erupakan jenis mo luska yang hidup di perairan In do ne sia. Secara u mum, abalo n m emiliki habit at p ant ai yan g b erkaran g, di Ind o nesia Tim ur (Ambo n dan Sulawesi), Indo nesia Tengah (Lo mbo k dan Bali), dan Pesisir Selat an Pulau Jawa. Abalo n dengan ukuran cangkang di at as 9 cm dit emukan di perairan Su m b a d a n Tim o r, s e d a n gka n u n t u k s p e s ie s H.

  et al ., 2003).

  squamat a

  dilapo rkan ban yak dit emu kan di perairan Selatan Bali dan Jawa (Priyambo do et al ., 2005; Dharma, 2008).

  Selam a in i seb aran sp asial Haliot is squamat a d i perairan Indonesia belum banyak diungkapkan, secara ko mprehen sif dan ho list ik dari berbagai aspek dan pendekat an keilmuan. Kajian genet ika po pulasi akan m e n ye d iakan d at a d asar p o p u lasi t e rkait d e n gan pot ensi genet ik dan bio logi. Oleh karena itu, info rmasi yang dipero leh yang ada di Indo nesia sangat pent ing dilakukan unt uk menent ukan arah st rat egi kebijakan yang dapat diambil bagi pengembangan budidaya abalon yan g ko mpet it if dan berdaya saing. Sem ent ara it u, penent uan karakt er jenis secara bio met rik meskipun t erkadang dianggap klasik t et ap merupakan cara yang cu kup aku rat unt uk memb edakan karakt er banyak sp e sie s.

  De w a s a in i, a n a lis is k e r a g a m a n g e n e t ik menggunakan mat erial genet ik berasal dari DNA int i m a u p u n d a r i DNA m it o k o n d r ia . Ma r k a DNA mit o ko ndria t eru t am a 16 S rRNA dan

  Cyt ochr ome C Oxidase subunit -I (COI) digunakan unt uk menganalisis

  keragaman genet ik jenis abalo n di pant ai Ko rea dapat membedakan spesies yang menjadi dasar penent uan st rat egi budidaya abalo n di negara t ersebut (An et al ., 2005). Karakt er unik dari po limo rfisme sekuen DNA mit o ko nd ria dapat me mb erikan re so lu si info rmasi yang tinggi mengenai evolusi hubungan ant ara anggo ta t axo n yang sama maupun dengan t axo n berbeda di t ingkat spesies, famili maupun t ingkat an yang lebih t inggi sepert i o rdo dan seterusnya. Hal it u disebabkan o le h la ju e vo lu s i d a r i m a t e ria l g e n e t ik DNA mit o ko ndria 10 kali lebih cepat dibandingkan yang t erjadi pada DNA int i (Bro wn

  et al

  ., 1979; Klinbunga

  Gen 16S rRNA merupakan salah sat u gen ribo so - mal berukuran besar pada geno m mit o ko ndria yang bersifat ko nservat if sehingga sangat co co k memilah spesies dan hubungan kekerabatan lainnya. Ukuran gen ini sekit ar 1.500 hingga 1.600 pasang basa (Klinbunga

  Analisis 16S rRNA

  et al ., 2003). Gen 16S rRNA t idak seluruh sekuennya

  digunakan sebagai marka genet ik, akan t et api hanya bagian t ert ent u (

  part ial

  ) saja yait u sekit ar 5 00-7 00 pasang basa (Klinbu nga et al ., 2 003). Penelit ian ini b ert u ju an u nt uk me ngevaluasi ke ragaman ge ne t ik berdasarkan po limo rfisme nukleo t ida gen 16S rRNA, dan karakt er morfo metrik, serta analisis biologi abalon dari po pulasi alami abalo n jenis

  H. squamat a di Pulau Jawa dan Bali dengan sebaran spasial berbeda.

  BAHAN DAN M ETODE

  Abalo n

  H. squamat a diko leksi sebanyak 150 eko r dalam keadaan hidup dari set iap lo kasi yang diamat i.

  Abalo n dipero leh dari perairan Negara (Pro vinsi Bali), Ban yu wa n g i (Pro vin s i Ja w a Tim u r), Pa n g an d a ra n (Pro vinsi Jawa Barat), dan Binuangen (Pro vinsi Bant en) (Ga m b a r 1 ). Pe n g a m a t a n m o le k u le r d ila k u k a n m e n g g u n a k an jarin ga n lu n ak , se d a n g k a n u n t u k m o r fo m e t r ik d a n b io lo g is d ila k u k a n t e r h a d a p cangkang, daging, dan go nad.

  pada suhu 72°C selama t ujuh menit , dan diakhiri pada suhu

  Jurnal Riset Akuakult ur, 12 (2), 2017, 111-119

  Abalo n pada masing-masing p o pulasi dipilih 30 eko r dan dilakukan pengukuran mo rfo met rik dengan cara menghubungkan jarak ant ar diago nal dari abalo n t ersebut (Gambar 2).

  et al

  ., 2 0 1 1). Jarak genet ik dianalisis berdasarkan p-dist ance, sedangkan reko nst ruksi po ho n filo genet ik dengan Neibour j oin-

  ing memakai boot st raps sebanyak 1.000 pengulangan

  (To mura et al ., 2011). Sebagai pembanding dipakai dat a se ku ens 1 6S rRNA ab alo n jen is

  Haliot is diversicolor diversicolor dengan code access gene bank : AY146397 (An et al ., 2005).

  Analisis M or fometrik

  Analisis Biologi

  net ic Analysis

  Pengamat an bio lo gi abalo n dilakukan mengukur panjang cangkang dan bobo t abalon. Tahap selanjutnya yait u m e m isah kan can gka n g, d agin g, d an go n ad . Ma s in g -m a s in g s a m p e l ya n g s u d a h d ip is a h k a n kemudian diukur bo bo tnya. Jumlah abalon yang diukur s e b a n ya k 3 0 e k o r d a ri m a s in g -m a s in g d a e ra h p e n g am at an . An alisis d a t a m e lip u t i ras io g o n ad t erhadap t ubuh dan rasio daging t erhadap berat t o t al.

  HASIL DAN BAHASAN Komposisi Genetik dan Frekuensi Haplotipe Hasil amplifikasi gen 16S rRNA secara partial

  Berdasarkan hasil amplifikasi DNA abalo n dengan p rim e r sp e sifik u nt u k 1 6 S rRNA d id ap at kan h asil amplifikasi sebesar 573 pasang basa (Gambar 3).

  Keragaman Sekuens Nukleotida

  Hasil pensejajaran sekuensi nukleo t ida parsial 16S rRNA int erp o p ulasi sesama je nis

  H. squamat a dari

  ) ve rsi 5 (To m u ra

  d ilaku kan d e n gan memakai pro gram MEGA ( M olecular Evolut ionary Ge-

  Gambar 1. Lo kasi pengambilan sampel abalo n ( H. squamat a ).

  Pro d u k PCR dip u rifikasi, ke m ud ian d ilanju t kan d e n g a n p ro s e s s e k u e n si. Se k u e n s i p ro d u k PCR menggunakan met o de Big Dye Terminat io an dengan Ge n e t ic An a lyz e r 3 7 3 0 XL (Ap p lie d Bio s ys t e m s ) dilakukan di perusahaan

  Figure 1. Sampling locat ions of abalone (H. squamata).

  Ke terangan ( Remarks

  ): Lo kasi pe ngambilan sam pel ( Sampl ing sit e

  )

  2 0°C se lam a 15 me nit . Un t u k me n ge t ahu i apakah p ro s e s PCR b e rja lan b aik , m aka p ro d u k PCR-n ya dimigrasikan dalam pirant i elekt ro fo resis submarine menggunakan gel agaro se 1,2%.

  Sekuensi Produk PCR

  First Base Singapura

  r ever se

  melalui p e ru s a h a an ja sa se ku e n s i d i In d o n e s ia ya it u PT Genet ika Science, Jakart a.

  Analisis Genetik

  Data sekuens dio lah dengan menggunakan

  Sequence Scaner version 1.0 d ari Applied Biosyst em (AB) 2005 .

  Pensejajaran hasil sequens baik berdasarkan primer

  for war d

  m au p u n p rim e r

  delapan sampel didapat kan t ujuh haplo t ipe dengan jarak genet ik intra-individu po pulasi BL (Bali)= 0,002- 0 ,0 0 3 a t a u 0 , 2 %-0 ,3 % d e n g a n r a t a -r a t a 0 ,2 3 %. Pe rb e d aan in t ra-in d ivid u po p u lasi BTN (Ban t en )= 0,002-0,003 at au 0,2%-0,3% dengan rat a-rat a 0,21%. Perbedaan intra-individu po pulasi BW (Banyuwangi)= 0,007-0,010 at au 0,7%-1,0% dengan rat a-rat a 0,85%. Perbedaan int ra-individu po pulasi PN (Pangandaran)= 0,002-0,009 atau 0,2%-0,9% dengan rata-rata 0,25%. Nilai p o lim o rfis m e enzym es d e n g an a n a lisis allo zym e menurut Fakhruddin et al . (2010), abalo n asal Bant en dan Bali lebih t inggi jika dibandingkan dengan analisis allo zyme abalo n bant en (0,13) dan Bali (0,06). Po pulasi

  Keragaan pertumbuhan dan reproduksi abalon ..... (Gust i Ngurah Permana) Ke terangan: SL : jarak ant ara tit ik tengah ujung cangkang d an lubang resp irasi pertama (jarak terp anjang cangkang); SW: jarak antara bagian atas cangkang dan bagian bawah cangkang (jarak terlebar cangkang); dan titik lebar cangkang bagian atas; D2: jarak diagonal antara titik le bar cangkang bagian atas dan titik tengah ujung cangkang; D3: jarak diagonal antara titik t engah ujung cangkang dan titik lebar cangkang bagian bawah; D4: jarak d iagonal antara t it ik le bar can gkan g ba gian b aw a h d a n t it ik p a ng kal lub an g re sp ir as i

et al

  (Soelistyo wati ., 2013) Remar ks: SL: t he dist ance bet ween t he t ip of t he shell and t he fi rst respir at i on hole (t he longest dist ance of t he shell ), SW : t he dist ance bet ween t he t op of t he shell and t he bot t om of t he shel l (t he widest dist ance of t he shell ), D1 : t he di agonal di st ance bet ween t he st ar t i ng point of t he fi rst respirat ory hol e and t he upper shell ’s w idt h point , D2: t he di agonal dist ance bet w een t he w idt h of t he upper shell and t he mi dpoint of t he t i p, D3: t he di agonal dist ance bet ween t he cent er widt h of t he t ip of shel l and t he point of l ow er shel l’s w idt h, D4 : diagonal dist ance bet ween t he widt h of t he bot t om shel l and t he base of t he respi rat ory

hole (Soelist yowat i et al., 201 3)

  Haliotis squamata.

  Gambar 2. Karakt er morfo met rik Figure 2. Truss morfomet ric of Haliotis squamata .

  M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

  M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 0 11 12

  bp 1 0 . 0 0 0 8 .0 0 0

  6 .0 0 0 5 .0 0 0 4 .0 0 0 3 .0 0 0 2 .5 0 0 2 .0 0 0

  1 .5 0 0 1 .0 0 0 7 0 0

  573 bp

  5 0 0 3 0 0

  Gambar 3. Hasil amplifikasi gen 16S rRNA parsial pada abalo n. Tanda panah m e n u n ju kkan fragm e n DNA; M= m arke r DNA 1 kb ; 1 -1 2 = fragmen DNA hasil PCR.

  Figure 3. DNA amplificat ion of 16S r RNA par t ial gene of abalone. Arr ow indicat ed t he fragment of DNA; M = marker DNA 1 kb; 1-12= DNA fragment of PCR product .

  Jurnal Riset Akuakult ur, 12 (2), 2017, 111-119

  H. diver sicolor d i ver si col or

  I ndi vi dual BL-2 BL-6 BL-7 BTN-1 BTN-2 BTN-7 BW-7 PN-1

  16S rRNA gene squences Ke terangan: BL= Bali, BTN= Bant en, BW= Banyuwangi, dan PN= Pangandaran Remar ks: BL= Bali , BTN= Bant en, BW= Banyuwangi, and PN= Pangandar an

  H. diversicolor diversicolor berdasarkan sekuens gen 16S rRNA

Table 1. The mat rix show ing t he difference bet ween individual and spat ial populat ions is

different from H. squamata wit h t he out group H. diversicolor diversicolor based on

  dengan out -grup

  H. squamat a

  Tabel 1. Mat riks perbedaan ant ar individu dan po pulasi spasial berbeda dari

  d iam b il d ari ke e m p a t lo kasi d iid e n t ifikasi se cara mo rfo lo gi sepert i t erlihat pada Tabel 2. dan D4 t idak t erdapat perbedaan pada empat populasi (P> 0,05), namun pada D1 (jarak diago nal ant ara t it ik p an g kal lu b a n g re sp irasi p e rt am a d an t it ik le b ar cangkang bagian at as) dan D2 (jarak diago nal ant ara t it ik lebar cangkang bagian at as dan t it ik t engah ujung cangkang) pada populasi Banyuwangi, Pangandaran, dan Ba li b e rb e d a d e n g a n p o p u la s i Ba n t e n . Ha l in i m e n gin d ik asikan b a h wa t e rd ap at p e rke m b an g an pert umbuhan cangkang yang asimet ri pada po pulasi Bant e n. Pe rt u mb uhan asim et ri merup akan ind ikasi spesifik unt uk po pulasi Bant en at au merupakan gejala ab n o rm alit as yan g d ap at d iakib at kan o le h fakt o r penurunan kualitas genetik atau lingkungan yang pat ut dikaji lebih lanjut . Menurut Mø ller & Swaddle (2002) , asimet ri berhubungan erat dengan evo lusi, bio lo gi, dan lingkungan. Fakt or lingkungan, yang memengaruhi ketersediaan pangan terhadap perbedaan pertumbuhan d an m o rfo lo gi (Sa u n d e rs et al ., 2 0 0 9 ). As im e t ri merupakan signal awal t ent ang kualit as repro duksi, se rt a h al yang p e rlu d ikaji ad alah fakt o r e ko lo gi,

  H. squamat a ya n g

  Ke ragaa n m o rfo lo gi a b alo n

  Karakter M orfologi Abalon H. squamata

  kekerabatan antara kelompok-1 dan kelompok-2 adalah 0,052 at au 5,2%.

  H. diver sicolor diver sicolor (Ga m b ar 5 ). Hu b u n g an

  H. squamat a , sedangkan kelo mpo k kedua hanya berisi

  t e r lih a t p o h o n filo g e n i h u b u n g a n k e k e r a b a t a n n ya t e r b a g i d u a k e lo m p o k , ya it u k e lo m p o k p e rt a m a t e rd iri s e m u a in d ivid u d a ri

  Pe n a m b ah a n out -g r oup d e n g an

  dengan po lio rfisme yang tinggi disinyalir akan memiliki peluang hidup yang semakin t inggi unt uk beradapt asi dengan perubahan lingkungan.

  dengan jarak perbedaan int ra- in divid u p o pu lasi BL= 0,002 -0,00 4 at au 0,2%-0,4% dengan rat a-rat a 0,0027 at au 0,27%. Perbedaan int ra- individu po pulasi BTN= 0,002-0,004 at au 0,2%-0,4% dengan rat a-rat a 0,0027 at au 0,27%. Perbedaan int ra- individu populasi BW (Banyuwangi)= 0,007-0,011 at au 0,7 %-1,1% dengan rat a-rat a 0,8 6%. Pe rbedaan int ra- individu po pulasi PN (Pangandaran)= 0,002-0,009 at au 0,2%-0,9% dengan rat a-rat a 0,27%. Perbedaan ant ara p o p u la s i

  Hasil pensejajaran sekuens nukleo t ida parsial 16S rRNA int erpo pulasi sesama jenis

  H. squamat a set elah

  d it a m b a h k a n p e m b a n d in g o u t -g r o u p , ya it u

  H. diversicolor diversicolor , maka dari delapan sampel

  yang telah dianalisis didapatkan delapan haplo tipe dari po pulasi

  H. squamat a

  H . squ a m at a

  m e n g h a silk an d u a ke lo m p o k , ya it u kelo mpo k pert ama t erdiri at as individu BL-6, BTN-7, BTN-1, PN-1, BTN-2, BL-2, dan BL-7; Kelo mpo k kedua t e rd iri at as individu BW-7 . Hub ungan ke ke rab at an antara kelompo k-1 dan kelo mpo k-2 adalah 0,0086 at au 0,86%. Pada kelo mpo k pert ama t erbagi lagi menjadi dua sub-kelo mpo k (I-a) yait u yang t erdiri at as BL-6, BTN-7, BTN-1, PN-1, BTN-2; sub kelo mpo k (I-b) t erdiri a t a s BL-2 d a n BL-7 , d e n ga n p e rb e d a a n d u a su b kelo mpo k t ersebut sebesar 0,0027 at au sebesar 0,27% (Gambar 4).

  d e n g a n

  H . d i ver si col or diversicolor

  = 0,050-0,0,57 atau 5,0%-5,7% dengan rata- rat a 0,052 at au 5,2% (Tabel 1).

  Hubungan Kekerabatan

  Pe n g e lo m p o k a n in d ivid u in t e r p o p u la s i

  H. squam at a

  H. div BL-2 BL-6 0 .0 0 2 BL-7 0 .0 0 2 0.0 04 BTN-1 0 .0 0 2 0 .0 0 4 BTN-2 0.0 02 0 .0 0 2 0 .0 0 2 BTN-7 0 .0 0 4 0.0 02 0 .0 0 5 0 .0 0 2 0 .0 0 4 BW-7 0 .0 0 7 0.0 09 0 .0 0 9 0 .0 0 9 0 .0 0 7 0 .0 1 1 PN-1 0 .0 0 2 0 .0 0 4 0 .0 0 2 0 .0 0 2 0 .00 9 Hd _ d iv 0 .0 5 2 0.0 50 0 .0 5 4 0 .0 5 0 0 .0 5 2 0 .0 5 2 0 .05 7 0 .0 5 0

  Keragaan pertumbuhan dan reproduksi abalon ..... (Gust i Ngurah Permana)

  20

  dengan

  H . squamat a

  Gambar 5. Hubungan kekerabat an ant ar anggo t a populasi

  Ke terangan: BL= Bali, BTN= Bant en, BW= Banyuwangi, dan PN= Pangandaran

Remar ks: BL= Bali , BTN= Bant en, BW= Banyuwangi, and PN= Pangandar an

  45 H. d diver sicolor 0.020 0.025

  45

  0.015 0.010 0.005 0.000

  BL-7 BW-7

  16 BL-6 BTN-7 BTN-1 PN-1 BTN-2 BL-2

  11

  evo lusi bio lo gi, genet ik, dan t ingkah laku (Livshit s & Sm o u s e , 1 9 9 3 ; Sa u n d e r s & Ma yfie ld , 2 0 0 8 ). Be rd a s a r k a n in fo r m a s i ya n g d id a p a t k a n d a r i pengukuran mo rfo met ri, hanya po pulasi Bant en yang dapat dipisahkan dengan po pulasi lainnya. Kurang t itik- t it ik pengamat an spesifik pada cangkang dapat juga merupakan kelemahan dalam analisis mo rfomet ri yang dilakukan.

  66

  0.004 0.003 0.001 0.001 0.000

  BL-2 BL-7 BW-7

  BL-6 BTN-7 BTN-1 PN-1 BTN-2

  

Ke terangan: BL= Ba li, BTN= Ba n t e n , BW= Ba n yu w a n g i, d a n

PN= Pangandaran

Remar ks: BL= Bal i , BTN = Ban t en, BW = Ba nyuw an g i , an d

PN= Pangandar an

  

Figure 4. Genet ic dist ance bet w een geographically different populat ions of Haliotis

squamata based on t he genet ic p-dist ance.

  dengan sebaran spasial berbeda berdasarkan jarak genet ik p-dist ance.

  Haliot is squamat a

  Persent ase rasio bo bot go nad terhadap bobot to tal t ubuh paling t inggi adalah po pulasi Banyuwangi, Jawa Gambar 4. Hubungan kekerabatan ant ar anggot a populasi

  Karakt erisasi Biologi

  out -group Haliot is diversicolor diversicolor berdasarkan jarak genet ik p-dist ance.

Figure 5. Genet ic dist ance bet ween populat ions of H. squamata and t he out group, H. diversicolor,

based on t he genet ic p-dist ance.

• IS S N

  Remar ks: D1 = di agonal dist ance bet w een t he st art ing poi nt of first r espirat ory hole and upper shel l’s widt h point ; D2= diagonal dist ance bet ween t he widt h of upper shel l and t he t ip of t i p of t he shell ; D3= diagonal di st ance bet ween t i p of t ip of t he shel l and point of lower shell’s w idt h; D4= t he diagonal dist ance bet ween bot t om of t he l ower shell and base of t he respi rat ory hol e. The val ues i ncoloumn foll owed by t he same let t eri ndi cat es not signifi cant ly different (P> 0.05 ).

• 6

  9 Tabel 2. Pengamat an mo rfo lo gi abalo n dari empat lo kasi Table 2. M orphological observat ion of abalon from four locat ions Ke terangan: D1= jarak diagonal antara tit ik p angkal lubang respirasi pe rtam a dan t itik lebar cangkang bagian atas; D2= jarak diagonal antara titik lebar cangkang bagian atas dan tit ik tengah ujung cangkang; D3= jarak diagonal antara titik tengah ujung cangkang dan titik lebar cangkang bagian bawah; D4= jarak diagonal antara titik lebar cangkang bagian bawah dan titik pangkal lubang re spirasi.Nilai dalam kolo m d iikuti dengan huruf yang sam a m enunjukkan tid ak berbeda nyata (P> 0,05).

  1

  1

  1

  7 , 1

  1

   2

  2 (2 ),

  1

  rn a l R is et A k u a k u lt u r,

  1

  1

  4

  3

  5

  2

  5

  2

  7 , J u rn a l R is e t A k u a k u lt u r, e

  1

  2

  C o p y ri g h t @

• -1

7 Ju

  Keragaan pertumbuhan dan reproduksi abalon ..... (Gust i Ngurah Permana)

  b

  a

  6 9.5 ± 3.73

  a

  Binuangen, Banten 51 .1 ± 5.5 1 4.6 ± 2.24

  

c

  17.5 ± 4.69

  a

  58 .7 ± 3 .1 3

  ab

  59 .6 ± 5 .6 5

  Pang and aran , Jawa Barat 61 .9 ± 6.9 1 9.6 ± 1.91

  b

  

a

  18.1 ± 3.33

  a

  62 .1 ± 3 .7 4

  ab

  58 .9 ± 2 .2 9

  b Asal

  Origin Panjang cangkang

  Shell length (m m ) Param et er (

  Parameters) Persent ase gonad t erhadap bobot

  

Gonad/weight percentage

(g) Persent ase daging t erhadap bobot

  67.8 ± 2.61

  30.1 ± 3.02

  Timur, yait u

  A C D

  m

  27,9 ± 2,39 g unt uk jant an (P< 0,05) dan bet ina sebesar

  f

  30,1 ± 3,02g (P< 0,05). Begit u juga perhit ungan rasio daging (Tabel 3) dibandingkan dengan bo bo t t ot al t ubuh (P< 0,05). Perhit ungan rasio go nad dan daging menunjukkan keunggulan po pulasi Banyuwangi dibandingkan dengan populasi lainnya yang d iamat i u n t uk re p ro d u ksi d an d aging yan g dap at dikonsumsi. Info rmasi tersebut sangat pent ing karena berhubungan dengan nilai eko no mi ko mo dit as.

  Be rd asa rkan d at a rasio go n a d n am p ak b a h wa p o p u la s i Ne g a ra , Ba li ya n g m e m ilik i k e d e ka t a n g e o g r a fis d e n g a n Ba n yu w a n g i, Ja w a Tim u r m e n u n ju k k a n p e rb e d a a n ya n g n ya t a (P< 0 , 0 5 ) sedan gkan unt uk rasio daging t idak berbeda nyat a (P> 0 ,0 5 ). Da t a ra s io g o n a d d a n d a g in g a n t a ra Binuangen, Bant en dengan Pangandaran, Jawa Barat yang memiliki kedekat an geografis menunjukkan tidak b e rb e d a n ya t a (P> 0 ,0 5 ). Ha l in i d im u n g k in k a n berhubungan dengan ket ersediaan nut risi yang berada d i d a e r a h s e b a ra n p o p u la s i t e rs e b u t . Me n u ru t So ewardi (2007), sebagian besar variasi feno t ipe ant ar po pulasi cenderung disebabkan oleh fakto r lingkungan dan sangat sedikit dipengaruhi fakt o r genet ik. Selain it u, aspek bio lo gi dan fisio lo gi makhluk hidup, efek maternal, po la makan, ko mpensasi pert umbuhan, dan pemeliharaan bersama ( communal st ocking ) juga dapat memengaruhi t ingkat keragaman feno t ipe po pulasi. Tin g k a t k e m irip a n a t a u

  phenet i cana l ysi s

  s e ca ra t ra d is io n a l s e b a g a i s a la h s a t u k r it e r ia u n t u k menent ukan jenis (McShane

  et al

  ., 1988). Selain it u, info rm asi sejarah filo ge ne t ik m eru pakan p en d uga t erbaik unt uk menget ahui hal yang t id ak diket ahui karena mo rfo lo gi, fisio lo gi, dan eko lo gi memberikan ko nt ribusi dari penjalinan genet ik suat u spesies. Gambar 6. Mo rfo lo gi abalo n

  H. squamat a dari empat lo kasi di Indo nesia (A= Pangandaran, B= Bali, C= Bant en, D= Banyuwangi).

Figure 6. M orphology of abalone H. squamata from four populat ions in Indo-

nesia (A= Pangandaran, B= Bali, C= Bant en, D= Banyuwangi).

  A B C D Tabel 3. Pengamat an bio lo gi abalo n dari empat lo kasi

  

b

  Table 3. Biological observation of abalone from four populat ions Ke terangan: Nilai dalam baris d iikuti dengan huruf yang sama m enunjukkan tidak berbed a nyata (P> 0,05) Remar ks: The values i n t he same row follow ed by t he same l et t er i ndi cat es no si gni ficant differ ence

  (P> 0.05)

  ♂ ♀ ♂ ♀ Neg ara, Bali 49 .3 ± 3.0 2 1.6 ± 2.36

  

a

  18.3 ± 2.03

  a

  61 .3 ± 4 .2 7

  ab

  6 8.5 ± 5.99

  a

  Ban yuwan gi, Jawa Timur 56 .1 ± 6.2 2 7.9 ± 2.39

  M eat/weight percentage (g)

  Jurnal Riset Akuakult ur, 12 (2), 2017, 111-119

KESIM PULAN

  H. squamat a

  Differences in abalo ne gro wt h and mo rpho lo gy bet ween lo cat io ns wit h high and lo w fo o d avail- abilit y: morpho logically fixed or plast ic t raits?.

  Gro wt h an d m o rp h o me t r y in ab alo n e ( Haliot is rubr a leach ) fro m Vict o ria. Aust . J. M ar. Freshw.

  Res ., 39, 161-166.

  Priyam bo d o , B., So fyan, Y., & Jaya, I.B.M.S. (2005 ).

  Pro du ksi benih t iram abalo n ( Haliot is asinine ) di Lo ka Bud id aya Laut Lo m bo k.

  Pr osiding Seminar Nasional Tahunan Hasil Penelit ian Per ikanan dan Kelaut an.UGM . Jo gjakart a, 5 hlm.

  Saun de rs, T. & Mayfield, S. (20 08 ). Pred ict in g bio - lo gical variat io n u sing a sim ple m o rp ho m et ric marker in t he sedent ary marine invert ebrat e pre- dict ing bio lo gical variat io n using a simple mo r- pho met ric marker in t he sedent ary marine inver- t ebrat e Haliot is rubra . M ar. Ecol. Prog. Ser ., 3 66, 75-89. Saunders, T.M., Co nnell, S.D., & Mayfield, S. (2009).

  Ma- rine Biology Int ernat ional Journal on Life in Oceans and Coast al Wat ers , 156(6), 1255-1263.

  Genet ica , 89, 155-166.

  So elist yo wat i, D.T., Kusum awardh ah i, A., & Zairin, J.M. (2013). Karakt erisasi feno t ipe benih hybrida int erspesifik abalo n, Haliot is asinina dan Haliot is

  squamat a . Jurnal Akuakult ur Indonesia , 1 2(1), 26- 32.

  So ewardi, K. (2007). Pengelo laan keragaman genet ik sumberdaya perikanan dan kelaut an. Depart emen Ma n a je m e n Su m b e r d a ya Pe ra ir a n , In s t it u t Pert anian Bo go r. Bo go r, 153 hlm. To mura, K., Duddley, J., Nei, M., & Kumar, S. (2011).

  Mega 5: Mo lecular Evo lut io nary Genet ics Analy- sis (MEGA) so fware versio n 5.0.

  J. M ol. Biol. Evol

  ., 24, 1596-1599.

  MØller, A.P. & Swaddle, J.P. (2002). Asymmet ry, devel- o pment al st abilit y and evo lut io n. Oxfo rd Series in Eco lo gy and Evo lut io n. Oxfo rd Universit y Press, 292 pp. McShane, P.E., Smit h, M.G., & Beinssen, K.H.H. (1988).

  Ao ki, T., & Men asvet a, P. (2003). Genet ic diver- sit y and mo lecular markers o f t he t ro pical aba- lo ne ( Haliot is asinina ) in Thailand. M arine Biot ech- nology , 5(5), 505-517. Livshit s, G. & Smo use, P.E. (1993). Relat io n bet ween fluct uat ing asymmet ry, mo rpho lo gical mao dalit y and het ero zygo sit y in an elderly iraeli po pulat io n.

  t elah menunjukkan adanya t ujuh haplo t ipe namun t erdiri dua kelo mpo k besar di mana Banyuwangi t erpisah dari kelo mpo k lainnya. Di ant ara kelo mpo k po pulasi H .

  Pe ne lit ian ini d ilaksan akan at as dana An ggaran Pendapat an dan Belanja Negara (APBN) 2014. Penulis mengucapkan t erima kasih kepada seluruh st af teknisi bio t ekno lo gi dan t eknisi abalo n at as segala bant uan selama penelit ian ini.

  squamat a dengan sebaran spasial berasal dari Bali dan Banten memiliki ragam haplo t ipe sama-sama beragam.

  Jarak genet ik ant ara

  H. squamat a dan

  H. diversicolor diversicolor

  adalah sebesar 5,2%.

  UCAPAN TERIM A KASIH

  DAFTAR ACUAN An, H.S., Je e , Y.J., Min , K.S., Kim , B.L., & Han , S.J.

  Mo rfo m e t rik can gkan g b e rb e d a p ad a p o p ulasi Bant en dengan indikasi adanya pert umbuhan asimet ri. Rasio gonad nampak bahwa populasi Negara, Bali yang me miliki kede kat an geo grafis de ngan Banyu wangi, Ja wa Tim u r m e n u n ju k kan p e rb e d a an yan g n ya t a (P< 0,05) sedangkan unt uk rasio daging tidak berbeda nyat a (P> 0,05). Dat a rasio go nad dan daging ant ara Binuangen, Bant en dengan Pangandaran, Jawa Barat yang memiliki kedekatan geo grafis tidak berbeda nyata (P> 0,05). Keragaman int er po pulasi

  (20 0 5). Phylo gen e t ic analysis o f six sp ecie s o f p acific ab alo n e (

  Haliot idae

  ) b ase d o n DNA se - quences o f 16s rRNA and cyt o chro me c o xidase subu nit I mit o ch o ndrial gene s. M ar. Biot echnol ., 7(4), 373-380. Bro wn, W.M., Geo rge, M.Jr., & Wilso n, A.C. (19 79).

  Rapid evo lut io n o f animal mit o cho ndrial DNA 76 (pp 1967-1971). USA: Pro c. Nat l. Acad. Sei. Dh a rm a, B. (2 0 0 8 ). Mo lu ska u n gg u lan In d o n e s ia sebagai sumber pangan.

  M akalah dipresent asikan pada Seminar M oluska II , penyelenggara IPB. Bogo r,

  16 hlm. Fahruddin, Permana, G.N., & Haryant i. (2010). Evaluasi k e r a g a m a n g e n e t ik in d u k Ab a lo n (

  H a l i ot i s squam at a ) d a n b e n ih . Pr osiding For um I novasi Teknologi Akuakult ur (FITA) . hlm. 485-481.

  Klinbunga, S., Pripue P., Khamnamt o ng, N., Puanglarp, N., Tassanakajo n, A., Jarayabhand, P., Hiro no , I.,