Petunjuk Teknis Surveilan Megalocytivirus pada Ikan Hias Air Tawar dan Laut
34
3.5. Interpretasi hasil
Analisis data sesuai dengan software real-time PCR yang digunakan. a Pengamatan setelah analisis data amplifikasi
Interpretasi kurva amplifikasi adalah sebagai berikut: -
contoh uji dinyatakan positif apabila terlihat naiknya kurva di atas garis thresholdcut off dan nilai Ct lebih kecil atau sama dengan
LoD. -
semakin cepat naikmunculnya kurva dan memotong garis thresholdcut off menunjukkan jumlah copy DNA virus yang
semakin banyak konsentrasinya tinggi -
contoh uji dinyatakan negatif apabila berada dibawah garis thresholdcut off dan nilai Ct lebih besar dari LoD dengan tingkat
kepercayaan confident level 95.
b Kuantifikasi copy virus -
Jumlah copy virus dapat dilihat pada tabel laporan kuantifikasi di perangkat lunak komputer yang terhubung dengan mesin real-
time PCR yang digunakan. -
Kurva Standar disajikan pada gambar 1 dan tabel 3 -
Berdasarkan Tabel 4 hasil pengujian dapat dianalisis sebagai berikut :
1 contoh uji dinyatakan positif apabila konsentrasi sama atau lebih dari nilai LoD 10 copies B1 dan B2, C1 dan C2
2 contoh uji dinyatakan negatif apabila nilai konsentrasi kurang dari nilai LoD 10 copies A1 dan A2 .
Petunjuk Teknis Surveilan Megalocytivirus pada Ikan Hias Air Tawar dan Laut
35
Kurva Standar
Gambar 6 – Kurva standar
Petunjuk Teknis Surveilan Megalocytivirus pada Ikan Hias Air Tawar dan Laut
36
Tabel 3 - Keterangan Gambar Kurva Standar Hasil Amplifikasi Real Time
No. Colour Name
Type Ct
Given Conc copiesul
Calc Conc copiesul
Var 1
Standar Megalocytivirus 104 1 Standard 26.34 10,000.0 13,206.3
32.1 2
Standar Megalocytivirus 104 2 Standard 26.37 10,000.0 12,970.7
29.7 3
Standar Megalocytivirus 103 1 Standard 30.48 1,000.0 655.8
34.4 4
Standar Megalocytivirus 103 2 Standard 30.30 1,000.0 748.9
25.1 5
Standar Megalocytivirus 102 1 Standard 33.61 100.0 68.1
31.9 6
Standar Megalocytivirus 102 1 Standard 32.82 100.0 121.0
21.0 7
Standar Megalocytivirus 101 1 Standard 36.01 10.0 12.0
20.0 8
Standar Megalocytivirus 10 12 Standard 36.00 10.0 12.0
20.1 9
Sampel negatif amplifikasi 1 NTC
10 Sampel negatif amplifikasi 2
NTC
Kategori