pH The role of riparian vegetation in maintaining water quality of Cisadane River
menjadi hal yang peka bagi sebagian besar biota akuatik Novotny dan Olem 1994. Perubahan pH yang melebihi batas toleransi organisma akuatik Novotny
dan Olem 1994 atau pH normal bagi organisma akuatik dapat menyebabkan kerusakan fisik terhadap ikan misalnya kerusakan pada kulit, insang dan mata
bahkan dapat menyebabkan kematian Cech 2005. pH mendekati pH netral lebih disukai oleh sebagian besar jenis akuatik Novotny dan Olem 1994.
pH air Sungai Cisadane berfluktuasi yaitu 5 – 6,5. pH air sungai di bagian
hulu yaitu 6,0-6,5. Air sungai di bagian tengah memiliki pH yaitu 6 - 6,3. Nilai pH semakin menurun ke arah hilir yaitu 5,0-5,5. Nilai pH air Sungai Cisadane dari
hulu hingga hilir masih memenuhi baku mutu air sungai untuk semua kelas. Pada musim hujan, nilai pH cenderung lebih tinggi dibandingkan pH pada
musim kemarau. Menurut Novotny dan Olem 1994 dan Sundra 2010, kenaikan pH mungkin disebabkan akumulasi senyawa-senyawa karbonat dan bikarbonat
yang menyebabkan air sungai menjadi lebih basa.