26
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
BAB 4 HASIL DAN PEMBAHASAN
4.1. Pengumpulan Data Set
Data set senyawa turunan asam sinamat dikumpulkan dari 2 sumber yang berbeda yaitu: dari pubchem bioassay sebanyak 22 senyawa
dan dari kumpulan beberapa jurnal serta hasil penelitian Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia LIPI sebanyak 12 senyawa. Seluruh senyawa
kemudian disimpan dalam bentuk tiga dimensi yaitu .mol. Data set yang didapat dari jurnal dan dari penelitian LIPI terdahulu di gambar dengan
menggunakan MarvinSketch kemudian disimpan. Sedangkan data set yang didapat dari pubchem bioassay didownload dalam format .sdf
kemudian di ubah menjadi format .mol menggunakan Open Babel GUI.
Gambar 4.1 pembuatan struktur asam sinamat menggunakan Marvin Sketch dan download data set dari pubchem bioassay
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Dasar dari pemilihan data set ialah senyawa-senyawa turunan asam sinamat yang digunakan harus memiliki kesamaan baik metode pada
pengujian in vitronya yaitu terhadap sel p388, begitu juga dengan kontrol positifnya. Selain itu data set yang digunakan harus memiliki nilai
aktivitas berupa IC
50
baik dalam satuan µM maupun dalam satuan µgmL. untuk data set yang memiliki aktivitas berupa µgmL harus dirubah
menjadi µM agar seluruh satuan dari data set sama. Tabel 4.1 struktur dan aktivitas data set
Struktur Kode
IC
50
µM Log
1IC
50
Referen si
Piperidil para kumaramida S1
0.0231 1.637
Firdaus, dkk
2012
metil 2- cinnamido-3- hidroksi propanoat S2
0.0432 1.364
Teni, dkk
2014
N,N dietil para kumaramida S3
0.107 0.9699
Firdaus, dkk
2012
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
N propil para kumaramida S4
0.2609 0.5834
Firdaus, dkk
2012
E-3-2,5-difluorophenyl-1-4 hydroxyphenylprop-2-en-1-one
S5 0.8639
0.0634 Dimmo
ck, dkk 1998
phenyl 2E ‐3‐phenylprop‐2‐enoate
S6 2.2296
-0.3482 LIPI
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
2E ‐1‐4‐hydroxyphenyl‐3‐[4‐
trifluoromethylphenyl]prop ‐2‐en‐1‐one
S7 2.490
-0.3962 Dimmo
ck, dkk 1998
E-3-3-chlorophenyl-1-4- hydroxyphenylprop-2-en-1-one
S8 2.82
-0.4502 Dimmo
ck, dkk 1998
E-1-4-hydroxyphenyl-3-phenylprop 2 en-1-one
S9 3.107
-0.4923 Dimmo
ck, dkk 1998
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
E-3-2,6-dichlorophenyl-1-4 hydroxyphenylprop-2-en-1-one
S10 3.170
-0.5010 Dimmo
ck, dkk 1998
E-3-4-chlorophenyl-1-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one
S11 3.6701
-0.5646 Dimmo
ck, dkk 1998
E-3-4-bromophenyl-1-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one
S12 5.514
-0.7414 Dimmo
ck, dkk 1998
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
E-3-2-chlorophenyl-1-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one
S13 6.8502
-0.8357 Dimmo
ck, dkk 1998
E-3-2,4-dichlorophenyl-1-4- hydroxyphenylprop-2-en-1-one
S14 7.8901
-0.8970 Dimmo
ck, dkk 1998
E-1-3,4-dichlorophenyl-3-4- hydroxyphenylprop-2-en-1-one
S15 8.5301
-0.9309 Dimmo
ck, dkk 1998
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
E-3-4-fluorophenyl-1-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one
S16 8.55
-0.9319 Dimmo
ck, dkk 1998
E-1-4-hydroxyphenyl-3-4- methoxyphenylprop-2-en-1-one
S17 8.7
-0.9395 Dimmo
ck, dkk 1998
2E,4E-1-4-hydroxyphenyl-5-phenylpenta-2,4- dien-1-one
S18 8.830
-0.9459 Dimmo
ck, dkk 1998
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
E-1,3-diphenylprop-2-en-1-one
S19 9.6302
-0.9836 Dimmo
ck, dkk 1998
E-3-3,4-dichlorophenyl-1-4- hydroxyphenylprop-2-en-1-one
S20 11.700
-1.0681 Dimmo
ck, dkk 1998
E-1-4-bromophenyl-3-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one
S21 12.9
-1.110 Dimmo
ck, dkk 1998
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
E-1-4-hydroxyphenyl-3-4-nitrophenylprop-2- en-1-one
S22 13.140
1 -1.1185
Dimmo ck, dkk
1998
E-3-4-hydroxyphenyl-1-phenylprop-2-en-1-one
S23 14.300
2 -1.1553
Dimmo ck, dkk
1998
E-3-4-bromophenyl-1-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one
S24 16.649
-1.2214 Dimmo
ck, dkk 1998
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
methyl 2E
‐3‐4‐nitrophenylprop‐2‐enoate S25
38.517 -1.5856
LIPI
Cinnamaldehid S26
44.779 -1.6510
LIPI
2 ‐methylpropyl
2E ‐3‐phenylprop‐2‐enoate
S27 72.995
-1.8632 LIPI
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Butil sinamat S28
96.494 -1.9845
LIPI
Metil sinamat S29
125.47 7
-2.0985 LIPI
methyl 2E
‐3‐2‐nitrophenylprop‐2‐enoate S30
134.08 6
-2.1273 LIPI
Asam sinamat S31
329.73 3
-2.5181 LIPI
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
4 ‐[2E‐3‐4‐methoxyphenylprop‐2‐enoy
l]phenyl 2E ‐3‐phenylprop‐2‐enoate
S32 10.207
-1.0088 Dimmo
ck, dkk 1998
4 ‐[2E‐3‐4‐chlorophenylprop‐2‐enoyl]
phenyl 2E ‐3‐ phenylprop‐2‐enoate
S33 3.827
-0.5828 Dimmo
ck, dkk 1998
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Catatan: Untuk mempermudah input data, nama senyawa selanjutnya akan digantikan oleh kode senyawa
4.2. Pemilihan Deskriptor