Pengumpulan Data Set HASIL DAN PEMBAHASAN

26 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta

BAB 4 HASIL DAN PEMBAHASAN

4.1. Pengumpulan Data Set

Data set senyawa turunan asam sinamat dikumpulkan dari 2 sumber yang berbeda yaitu: dari pubchem bioassay sebanyak 22 senyawa dan dari kumpulan beberapa jurnal serta hasil penelitian Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia LIPI sebanyak 12 senyawa. Seluruh senyawa kemudian disimpan dalam bentuk tiga dimensi yaitu .mol. Data set yang didapat dari jurnal dan dari penelitian LIPI terdahulu di gambar dengan menggunakan MarvinSketch kemudian disimpan. Sedangkan data set yang didapat dari pubchem bioassay didownload dalam format .sdf kemudian di ubah menjadi format .mol menggunakan Open Babel GUI. Gambar 4.1 pembuatan struktur asam sinamat menggunakan Marvin Sketch dan download data set dari pubchem bioassay UIN Syarif Hidayatullah Jakarta Dasar dari pemilihan data set ialah senyawa-senyawa turunan asam sinamat yang digunakan harus memiliki kesamaan baik metode pada pengujian in vitronya yaitu terhadap sel p388, begitu juga dengan kontrol positifnya. Selain itu data set yang digunakan harus memiliki nilai aktivitas berupa IC 50 baik dalam satuan µM maupun dalam satuan µgmL. untuk data set yang memiliki aktivitas berupa µgmL harus dirubah menjadi µM agar seluruh satuan dari data set sama. Tabel 4.1 struktur dan aktivitas data set Struktur Kode IC 50 µM Log 1IC 50 Referen si Piperidil para kumaramida S1 0.0231 1.637 Firdaus, dkk 2012 metil 2- cinnamido-3- hidroksi propanoat S2 0.0432 1.364 Teni, dkk 2014 N,N dietil para kumaramida S3 0.107 0.9699 Firdaus, dkk 2012 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta N propil para kumaramida S4 0.2609 0.5834 Firdaus, dkk 2012 E-3-2,5-difluorophenyl-1-4 hydroxyphenylprop-2-en-1-one S5 0.8639 0.0634 Dimmo ck, dkk 1998 phenyl 2E ‐3‐phenylprop‐2‐enoate S6 2.2296 -0.3482 LIPI UIN Syarif Hidayatullah Jakarta 2E ‐1‐4‐hydroxyphenyl‐3‐[4‐ trifluoromethylphenyl]prop ‐2‐en‐1‐one S7 2.490 -0.3962 Dimmo ck, dkk 1998 E-3-3-chlorophenyl-1-4- hydroxyphenylprop-2-en-1-one S8 2.82 -0.4502 Dimmo ck, dkk 1998 E-1-4-hydroxyphenyl-3-phenylprop 2 en-1-one S9 3.107 -0.4923 Dimmo ck, dkk 1998 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta E-3-2,6-dichlorophenyl-1-4 hydroxyphenylprop-2-en-1-one S10 3.170 -0.5010 Dimmo ck, dkk 1998 E-3-4-chlorophenyl-1-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one S11 3.6701 -0.5646 Dimmo ck, dkk 1998 E-3-4-bromophenyl-1-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one S12 5.514 -0.7414 Dimmo ck, dkk 1998 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta E-3-2-chlorophenyl-1-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one S13 6.8502 -0.8357 Dimmo ck, dkk 1998 E-3-2,4-dichlorophenyl-1-4- hydroxyphenylprop-2-en-1-one S14 7.8901 -0.8970 Dimmo ck, dkk 1998 E-1-3,4-dichlorophenyl-3-4- hydroxyphenylprop-2-en-1-one S15 8.5301 -0.9309 Dimmo ck, dkk 1998 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta E-3-4-fluorophenyl-1-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one S16 8.55 -0.9319 Dimmo ck, dkk 1998 E-1-4-hydroxyphenyl-3-4- methoxyphenylprop-2-en-1-one S17 8.7 -0.9395 Dimmo ck, dkk 1998 2E,4E-1-4-hydroxyphenyl-5-phenylpenta-2,4- dien-1-one S18 8.830 -0.9459 Dimmo ck, dkk 1998 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta E-1,3-diphenylprop-2-en-1-one S19 9.6302 -0.9836 Dimmo ck, dkk 1998 E-3-3,4-dichlorophenyl-1-4- hydroxyphenylprop-2-en-1-one S20 11.700 -1.0681 Dimmo ck, dkk 1998 E-1-4-bromophenyl-3-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one S21 12.9 -1.110 Dimmo ck, dkk 1998 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta E-1-4-hydroxyphenyl-3-4-nitrophenylprop-2- en-1-one S22 13.140 1 -1.1185 Dimmo ck, dkk 1998 E-3-4-hydroxyphenyl-1-phenylprop-2-en-1-one S23 14.300 2 -1.1553 Dimmo ck, dkk 1998 E-3-4-bromophenyl-1-4-hydroxyphenylprop- 2-en-1-one S24 16.649 -1.2214 Dimmo ck, dkk 1998 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta methyl 2E ‐3‐4‐nitrophenylprop‐2‐enoate S25 38.517 -1.5856 LIPI Cinnamaldehid S26 44.779 -1.6510 LIPI 2 ‐methylpropyl 2E ‐3‐phenylprop‐2‐enoate S27 72.995 -1.8632 LIPI UIN Syarif Hidayatullah Jakarta Butil sinamat S28 96.494 -1.9845 LIPI Metil sinamat S29 125.47 7 -2.0985 LIPI methyl 2E ‐3‐2‐nitrophenylprop‐2‐enoate S30 134.08 6 -2.1273 LIPI Asam sinamat S31 329.73 3 -2.5181 LIPI UIN Syarif Hidayatullah Jakarta 4 ‐[2E‐3‐4‐methoxyphenylprop‐2‐enoy l]phenyl 2E ‐3‐phenylprop‐2‐enoate S32 10.207 -1.0088 Dimmo ck, dkk 1998 4 ‐[2E‐3‐4‐chlorophenylprop‐2‐enoyl] phenyl 2E ‐3‐ phenylprop‐2‐enoate S33 3.827 -0.5828 Dimmo ck, dkk 1998 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta Catatan: Untuk mempermudah input data, nama senyawa selanjutnya akan digantikan oleh kode senyawa

4.2. Pemilihan Deskriptor