UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
sebagai model untuk mempresiksi molekul lain. Molekuler deskriptor diumpamakan sebagai naga dalam mitologi Babylon Istar yang sebenarnya
merupakan pencampuran beberapa hewan, masing-masing memiliki peran sebagai bagian dari tubuh naga. Demikian halnya dengan molekuler
deskriptor memiliki beberapa arti yang berbeda tergantung pada titik pandangnya Todeschini, 2009.
2.6.Marvin Sketch
Marvin Sketch adalah sebuah aplikasi kimia untuk menggambar struktur kimia, dan reaksi kimia serta menyimpannya dalam berbagai
format MRV, CDX, SKC, SDF, RDF V2000V3000, RXN, MOL, MOL2, SMILES, SMARTS, InChi, CML, FASTA, dll.. Marvin Sketch
mampu mengoreksi struktur kimia yang digambar baik secara 3D maupun 2D. Marvin Sketch merupakan aplikasi buatan ChemAxon dan
dikembangkan dengan java sehingga memerlukan Java Runtime Environment JRE untuk berjalan. ChemAxon 2015
2.7. SPSS Statistikal Package and Service Solution
SPSS merupakan software statistik yang pertama kali dibuat pada tahun 1968 oleh tiga mahasiswa Stanford University, yakni Norman H.
Nie, C. Hadlai Hull, dan Dale H. Bent. Saat itu software dioperasikan pada computer mainframe. Setelah penerbit terkenal menerbitkan user manual
SPSS, program tersebut menjadi popular. Pada tahun 1984 SPSS pertama kali muncul dengan versi PC bisa dipakai untuk komputer desktop
Gambar 2.2 Naga dalam mitologi Babylon Istar diambil dari Molecular Deskriptors for Chemoinformatics
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
dengan nama SPSSPC+, dan sejalan dengan mulai populernya sistem operasi Windows, pada tahun 1992 SPSS mengeluarkan versi Windows.
Pada mulanya SPSS ditujukan untuk penggunaan pengolahan data statistik untuk ilmu social SPSS adalah singkatan dari Statistikal Package for the
Social Science namun seiring berkembangnya kerjasama dengan berbagai software house maka kini SPSS memperluas pelayanannya untuk berbagai
jenis pengguna, seperti untuk proses produksi di pabrik, riset ilmu-ilmu sains dan lainnya. Kini kepanjangan dari SPSS adalah Statistikal Product
and Service Solutions Santoso, 2008
2.8. Ligand Scout
Ligand Scout adalah perangkat lunak yang memungkinkan penggunanya untuk melakukan pemodelan farmakofor secara 3D dari
kompleks ligand dan protein, atau dari training set dan test set dari senyawa organic. Ligand Scout mampu menjelaskan fitur-fitur pada
struktur kimia 3D seperti pendonor dan aseptor ikatan hidrogen, daerah yang bersifat lipofil, serta grup yang memiliki sifat positif dan negative
yang menggambarkan interaksi ligand dan situs tambat disekelilingnya makromolekul Wolber 2005. Ligand Scout juga mampu mensejajarkan
farmakofor dari ligan tersebut pada senyawa yang memiliki gugus kromofor yang mirip Wolber 2005. Pada tiap senyawa yang disejajarkan
dapat disisipkan gugus kromofor tambahan yang mampu memberi andil pada interaksi antara ligand dan protein makromolekul. Software ini
telah sukses digunakan dalam memprediksi senyawa penuntun dalam desain obat contohnya ialah prediksi aktivitas biologi senyawa baru
terhadap inhibitor HIV reverse transcriptase. Barecca 2007.
2.9.Open Babel
Open Babel adalah perangkat lunak untuk mengubah beberapa format berkas kimia. Selain itu, perangkat ini menyediakan berbagai
fungsi berguna yaitu pencarian konformer dan penggambaran 2D, penapisan, konversi batch, dan pencarian substruktur dan kemiripan. Open
Babel mendukung 111 format berkas kimia, yang dapat membaca 82
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
format dan menulis 85 format. Perangkat ini tersedia secara gratis dari http:openbabel.org O’Boyle, dkk., 2011.
2.10. CDK Deskriptor
