UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
4.3. Penghilangan Outlier
Gambar 4.5 Pensejajaran alignment beberapa data set terhadap asam Sinamat, dan Pensejajaran alignment senyawa dengan kode S32, S33, dan S34
outlier terhadap asam sinamat
Gambar 4.6 Senyawa dengan kode S33, S32, dan S34 berturut-turut dari kiri kekanan
Dari gambar 4.4 Dapat dilihat bahwa senyawa dengan kode S32, S33, dan S34 memiliki konformasi yang berbeda jauh dari asam sinamat
sebagai senyawa penuntun. Selain itu juga terlihat bahwa senyawa dengan kode S32, S33, dan S34 memiliki gugus kromofor yang berbeda dengan
asam sinamat hal ini menunjukan bahwa ketiga senyawa tersebut dapat dikatakan bukan merupakan turunan dari asam sinamat atau outlier.
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
Karena ketiga senyawa tersebut merupakan outlier maka dalam pembentukan model persamaan HKSA ketiga senyawa tersebut tidak
digunakan.
4.4. Pembagian Data Set
Dari seluruh data set yang didapatkan sebanyak 31 senyawa dengan aktivitas berupa IC50 data set dibagi menjadi 2 bagian yaitu:
training set, dan test set. training set yang digunakan sebanyak 75 23 senyawa dan test set yang digunakan sebanyak 25 8 senyawa.
Tabel 4.5 data set berdasarkan aktivitas yang tinggi hingga rendah
Kode IC 50 µM
Log 1IC
50
S1 0.0231
1.637
S2 0.0432
1.364
S3 0.1071
0.9699
S4 0.2609
0.5834
S5 0.8639
0.0634
S6 2.2296
-0.3482
S7 2.4900
-0.3962
S8 2.82
-0.4502
S9 3.1068
-0.4923
S10 3.1700
-0.5010
S11 3.6701
-0.5646
S12 5.5142
-0.7414
S13 6.8502
-0.8357
S14 7.8901
-0.8970
S15 8.5301
-0.9309
S16 8.5501
-0.9319
S17 8.7
-0.9395
S18 8.8300
-0.9459
UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
S19 9.6302
-0.9836
S20 11.7001
-1.0681
S21 12.9
-1.110
S22 13.1401
-1.1185
S23 14.300
-1.1553
S24 16.649
-1.2214
S25 38.517
-1.5856
S26 44.779
-1.6510
S27 72.995
-1.8632
S28 96.494
-1.9845
S29 125.477
-2.0985
S30 134.086
-2.1273
S31 329.733
-2.5181
Catatan: warna merah=aktivitas tinggi, warna kuning=aktivitas sedang, dan hijau=aktivitas rendah
Pembagian data set dilakukan dengan cara mengurutkan seluruh senyawa berdasarkan aktivitasnya dari yang terbesar hingga yang terkecil.
Setelah diurutkan berdasarkan aktivitasnya data set kemudian dibagi menjadi tiga yaitu: senyawa dengan aktvitas tinggi, sedang, dan rendah.
Senyawa yang digunakan sebagai test set diambil 2 senyawa dari yang memiliki aktivitas tinggi, dan masing-masing 3 senyawa dari yang
memiliki aktivitas sedang dan rendah. Pembagian data set dilakukan secara random karena menurut
Martin dkk 2012 model persamaan HKSA dengan pembagian data set secara random memiliki kemampuan memrediksi yang sama dengan
pembagian data set yang dilakukan secara sistematis.
4.5. Model Persamaan Hubungan Kuantitatif Struktur Aktifitas HKSA
Kategori