Mendekati 1 : indeks besar atau cenderung dominansi oleh beberapa spesies individu.
2.3 Karakterisasi Fisiologis dari Isolat
Hasil dari pola ARDRA yang berbeda yaitu didapatkan 31 pola ARDRA dari 45 sampel dengan 2 sampel referens. Perwakilan dari sampel dengan pola
ARDRA yang berbeda dilakukan uji biokimia yang meliputi 1 uji motilitas
dengan menggunakan media Sulfide Indol Motile SIM, 2 uji katalase dengan menggunakan Hidrogen Peroksida H
2
O
2
3, 3 uji sitokrom oksidase dengan menggunakan p-aminodimethylaniline-oxalat 1, 4 uji oksidatiffermentatif
menggunakan media oksidatif fermentatif, glukosa dan parafin cair Lampiran 4 untuk mengkarakterisasi fisiologis bakteri tersebut
.
I. HASIL DAN PEMBAHASAN
3.1. Hasil
Pada saat pemeliharaan di tambak udang diberi probiotik bakteri Bacillus sp dengan dosis yang sama banyaknya di setiap umur. Kondisi suhu, DO,
salinitas, dan pH juga relatif sama, sedangkan pembeda antara udang umur 1 bulan, 2 bulan, dan 3 bulan adalah tempat keberadaannya atau berbeda petak
tambaknya. Bakteri yang tumbuh dominan dan unik dibandingkan dengan koloni
bakteri yang lain pada pengenceran tertinggi yaitu 10
4
diisolasi dari media Sea Water Complete SWC. Total jumlah koloni bakteri yang berada pada usus udang
yaitu 45 isolat dan 2 isolat bakteri Vibrio harveyi sebagai bakteri referens untuk data biner pohon filogenetika. Pada usus udang umur 1 bulan didapatkan koloni
bakteri sebanyak 15 isolat, yaitu 4 koloni pada usus udang pertama, 5 koloni pada usus udang kedua, dan 6 koloni pada usus udang ketiga. Pada usus udang umur 2
bulan didapatkan koloni bakteri sebanyak 13 isolat, yaitu 5 koloni pada usus udang pertama, 4 koloni pada usus udang kedua, dan 4 koloni pada usus udang
ketiga. Pada usus udang umur 3 bulan didapatkan koloni bakteri sebanyak 17 isolat, yaitu 8 koloni pada usus udang pertama, 4 koloni pada usus udang kedua,
dan 5 koloni pada usus udang yang ketiga. Ditambahkan 2 isolat bakteri Vibrio harveyi sebagai referens ke-45 isolat tersebut, jadi total semua bakteri berjumlah
47 isolat. Untuk lebih jelasnya dapat dilihat pada Tabel 1 berikut. Tabel 1. Pemilihan Koloni Bakteri Unik dari Usus Udang
Ulangan Umur Udang Bulan
1 2
3 1
4 5
8
2 5
4 4
3 6
4 5
∑
15 13
17 Jumlah keragaman koloni bakteri pada umur 2 bulan paling rendah
dibandingkan dengan jumlah keragaman koloni bakteri 1 bulan dan 3 bulan. Jumlah keragaman koloni bakteri pada umur 1 bulan diantara umur 2 bulan dan 3
Kategori