V. KESIMPULAN DAN SARAN
5.1 Kesimpulan
Perakaran tebu transgenik IPB 1 memiliki keanekaragaman populasi mikrob fungsional mencapai 20,93 x 10
5
CFUgram tanah. Perakaran tebu transgenik IPB 1 memiliki jumlah rata-rata populasi Azotobacter, Pseudomonas,
mikrob pelarut fosfat, mikrob pendegradasi selulosa, mikrob pendegradasi protein dan Nitrobacter yang lebih tinggi dibandingkan dengan perakaran tebu isogenik
PS 851. Sedangkan pada perbandingan rata-rata populasi Azospirillum dan Nitrosomonas
pada perakaran tebu transgenik IPB 1 lebih rendah dibandingkan dengan perakaran tebu isogenik PS 851, meskipun perbedaannya tidak terlalu
besar. Tingginya rata-rata populasi mikrob fungsional pada perakaran tebu
tansgenik dapat dimungkinkan akibat dari aktivitas fitase pada tebu transgenik yang dapat mempengaruhi pertumbuhan tebu transgenik sehingga dapat
menghasilkan eksudat yang lebih banyak dibandingkan tebu isogenik sehingga mikrob yang tumbuh dan berkembang di daerah perakaran tebu transgenik IPB 1
lebih banyak dibandingkan tebu isogenik PS 851 yang tidak menghasilkan enzim fitase. Dampak dari penanaman tebu transgenik IPB 1 terhadap keragaman dan
jumlah mikrob fungsional belum terlihat, karena tidak adanya perbedaan yang besar antara mikrob fungsional pada perakaran yang ditanami tebu transgenik IPB
1 dengan perakaran yang ditanami tebu isogenik PS 851.
5.2 Saran
Perlu adanya penelitian lanjutan tentang ada atau tidaknya penyebaran gen dari tebu transgenik kepada organisme yang lain, terutama pada mikrob di daerah
perakaran tebu transgenik.
DAFTAR PUSTAKA
Allen, O.N. dan E.K. Allen. 1981. The Leguminosae, a Source Book of Characteristics, Uses, and Nodulation. Wisconsin: University of Wisconsin
Press. Alexanderr, M. 1961. Soil Microbiology. New York: John Wiley Sons, Inc.
Allison, F.E. 1973. Soil Organic Matter and It’s Role in Crop Production. New York: Elsevier Scientific Publishing Company.
Anas, I. 1989. Biologi Tanah dalam Praktek. Bogor: PAU Institut Pertanian
Bogor. Bachhawat, A.K. and S. Ghosh. 1989. Temperature inhibition of siderophore
production in Azospirillum brasilense. J. Bacteriol 171: 4092-4094. Bashan Y. and L.E. Bashan. 2002. Protection of tomato seedlings against
infection by Pseudomonas syringae Pv tomato growt-promoting bacterium Azospirillum brasilense.
Appl. Environ. Microbiol. 6: 2637-2643. Bhaskar, K.V. and P.B.B.N. Charyulu. 2005. Effect of environmental factors on
nitrifying bacteria isolated from the rhizosphere of Setaria italica L. Beauv. African Journal of Biotechnology 4 10: 1145-1146.
Dupler, M. and Baker. 1984. Survival of Pseudomonas putida, a biological control agent in soil. J. Phytopathology 742: 195-200.
Fikrida dan I. Anas. 2000. Isolasi dan seleksi bakteri penghasil selulase ekstermofilik dari ekosistem air hitam. J. Mikrobiol. 52: 48-53.
Glick, B.R. 1995. The enhancement of plant growth by free-living bacteria. Canadian Journal of Microbiology 41: 109-117
Grundmann, G.L., M. Neyra, P. Normand. 2000. High-resolution phylogenetic analysis of NO
2
--oxidizing Nitrobacter species using the rrs-rrl IGS
sequence and rrl genes. Int. J. Syst. Evo. Microbiol. 50 5: 1893–1901
Ilmen, M., A. Soloheimo, M. Leina dan M.E. Pentilla. 1997. Regulation of cellulases gene expression in the filamentous fungus Trichoderma reesei.
Appl. Environ. Microbiol. 63 4: 1208-1306. Irianto, A. 2002. Mikrobiologi Lingkungan. Jakarta: Universitas Tebuka Press.
Kennedy, A.C. dan V.L. Gewin. 1997. Soil microbial diversity: present and future considerations. Soil Sci. 162: 607-617.
Killham, Ken. 1994. Soil Ecology. New york: Cambridge Univercity Press.
Kucey, R.M.N. 1987. Increased phosphorus uptake by wheat and field beans inoculated with a phosphorus-solubilizing Penicillium biliji strain and with
vesicular-arbuscular mycorhizal fungi. Appl. Environ. Microbiol. 53: 2699- 2703.
Lay, B.W. 1994. Analisis Mikroba di Laboratorium. Jakarta: Raja Grafindo Persada.
Lewis, S.M., L. Montgomery, K.A. Garlab, L.L. Beger dan G.C. Fahey. 1988. Effect of alkalin hydrogen peroxide treatment on invitro degradation
cellulosic substrates by mix ruminal microorganism and Bacteroides succinogenes
S85. Appl. Environ. Microbiol. 54: 1163-1169. Macfarlane, I. 2007. Pengelolaan Keanekaragaman Hayati. Jakarta: Global
Village Ltd. Marliani, V.P. 2011. Analisis Kandungan Hara N dan P serta Klorofil Tebu
Transgenik IPB 1 yang Ditanam Di Kebun Percobaan PG Djatiroto, Jawa Timur. Bogor : Skipsi Departemen Ilmu Tanah dan Sumberdaya Lahan IPB.
Marsh, K.L., G.K. Sims dan R.L. Mulvaney. 2005. Availability of urea to autotrophic ammonia-oxidizing bacteria as related to the fate of 14C- and
15N-labeled urea added to soil. Biol. Fert. Soil. 42:137-145 Murashima, K., A. Kosogi dan R.H. Doi. 2003. Synergitic effect of cellulosome
xylanase and cellulases from Clostridium cellulovorans on plant cell wall degradation. J. Bacteriol 185: 1518-1524.
Paul, E.A dan F.E. Clark. 1996. Soil Microbiology and Biochemicstry. New York: Academic Press.
Pelczar, M.J. dan E.C.S. Chandan Merna F. P. 1986. Elements of Microbiology. New York: McGraw-Hill Company.
Purwaningsih, S., R. Hardiningsih, Wardah, dan A. Sujadi. 2004. Populasi bakteri dari tanah di desa Tudu-Aog, Kecamatan Passi, Kabupaten Bolaang
Mongondow, Sulawesi Utara. Biodiversitas. Vol. 5 No. 1 :13-16. Rao, N.S.S. 1994. Mikroorganisme Tanah dan Pertumbuhan Tanaman. Jakarta:
Universitas Indonesia Press. Rodriguez H., T. Gonzales, I. Goire dan Y. Bashan. 2004. Gluconic acid
production and phosphatase solubilization by the plant growth-promoting bacterium Azospirillum spp. Naturwissenschaften 91: 552-555.
Sanchez, P. 1976. Properties and Management of Soil in the Tropic. New York: John Willey an Sons Inc.
Santosa, D.A. 2010. Laporan Akhir Tebu Transgenik IPB 1 yang Mengekspresikan Gen Fitase untuk Menghemat Pemakaian Pupuk P. Bogor:
Indonesian Center for Biodiversity and Biotechnology. Schaad, N.W, J.B. Jones dan W. Chun. 2001. Plant Pathologenic Bacteria. Third
Edition. New York: the American Phytopatological Society. Schlegel, H.G. dan K. Schmidt. 1994. Mikrobiologi Umum.Penerjemah R.M
Tedjo Baskoro. Yogyakarta: Gajah Mada University Press Seshadri, S., R. Muthukumarasamy, C. Lakshminarasimhan, S. Ignacimuthu.
2000. Solubilization of inorganic phosphates by Azospirillum halopraeferans
. Curr. Soil 5: 565-567 Smith, O.L. 1982. Soil Microbiology : A Model of Decomposition and Nutrient
Cycling. Florida: CRC Press, Inc. Soepardi, G. 1983. Sifat dan Ciri Tanah. Bogor: Institut Pertanian Bogor Press.
Sutedjo, M.M., A.G. Kartasapoetra dan S. Sastroatmodjo. 1991. Mikrobiologi Tanah. Jakarta: Rineka Cipta.
Susanti, E. 2003. Isolasi dan karakterisasi protease dari Bacillus subtilis 1012M15. Biodiversitas 4 1: 12-17
Sutanto, R. 2005. Dasar-dasar Ilmu Tanah. Yogyakarta: Kanisius. Syarifudin, A. 2002. Teknik identifikasi mikroorganisme penyedia unsur hara
tanaman pada ultisol pulau Buru. Buletin Teknik Pertanian 7 1: 21-24. Sylvia, D.M., G.H. Peter, J.F. Jeffry, dan A.Z. David. 1999. Principles and
Application of Soil Microbiology. New Jersey: Pearson Education, Inc. Tang, W., J.J. Pasternak dan B.R. Glick. 1994. Stimulation of canola root growth
by Pseudomonas putida GR 12-2 and its genetically engineer derivates. Life Science Advance 13: 89-95.
Tisdale, S.L., L.N. Werner dan P.B. James. 1985. Soil Fertility and Fertilizers. New York: Macmillan Publishing Company.
UU RI No. 5 Tahun 1994. Konvensi Perserikatan Bangsa-bangsa Mengenai Keanekaragaman Hayati.
Waksman, S.A. 1963. Soil Microbiology. New york: John Wiley Sons, Inc. Whitaken, J.R. 1994. Principles of Enzimology for The Food Science. Second
Edition. New york : Marcel Dekker Inc.
LAMPIRAN
Tabel Lampiran 1. Populasi Mikrob Fungsional pada Perakaran Tebu Transgenik IPB 1 dan Tebu Isogenik PS 851
Sampel Tanah
Jumlah Populasi Mikrob gram tanah Azotobacter
10
4
Pseudomonas 10
4
Pelarut P 10
4
P. Selulosa 10
4
P. Protein 10
4
Nitrosomonas 10
3
Nitrobacter 10
3
Azospirillum 10
3
IPB 1-1 10
0.25 39.8
14.8 2
4.9 IPB 1-2
35 36.3
10.8 8
6 2.2
26 IPB 1-3
36 13.3
3.75 15.3
3 2.45
12 IPB 1-4
33.3 0.25
63.3 1.25
17.3 72
12.5 IPB 1-5
40 0.25
26.8 30
3.5 72
13 IPB 1-6
40.5 4
1 4.5
55.8 31.5
IPB 1-7 20
4.75 73.3
2.5 4.25
8.75 65
74.5 IPB 1-12
26.3 3
71.3 2.75
3.25 2.75
14 41
IPB 1-17 18.5
31.8 22.8
6 12.3
62.5 41
IPB 1-21 0.5
15.3 39.8
2.5 3.25
7 70.5
6.15 IPB 1-34
2.5 8.75
89.5 152
2.75 6
57 2
IPB 1-36 0.25
12.5 36
2.75 3.25
4.5 23,8
3.25 IPB
1-37 0.5 3 39.5
2.25 5 3.25 140 3.4 IPB 1-40
4.75 2.5
31 2.75
22.5 8.5
110 2.25
IPB 1-46 14.3
17.3 209.3
3.25 26
6 125
2 IPB 1-51
87.8 40.5
47.3 24
20.8 12.3
72 4.5
IPB 1-52 57.5
46.3 36.5
27.3 13.5
7 140
17.5 IPB 1-53
55.8 97.8
150 19.3
17 1.33
110 19
IPB 1-55 23.2
41.7 24.3
8.4 12.5
1.75 39
IPB 1-56 3.85
24.4 10.4
14.3 7.75
14 33.5
IPB 1-59 8.48
21.3 28.1
0.475 9.83
7.75 6.5
54 IPB 1-62
10.7 22.1
0.475 4.9
9.25 12.5
24 IPB 1-71
57.5 15.3
0.775 1.85
14 12.5
21.5
rata-rata 25.1 19.1
44.6 11.5