2. Suhu
Pengaruh suhu dalam lingkungan perairan saling berinteraksi dengan faktor lingkungan lainnya, demikian pula pengaruhnya dalam membatasi
penyebaran suatu organisme Krebs, 1972. Temperatur juga merupakan faktor sekunder bagi kehidupan rumput laut dan fluktuasi yang tinggi akan dapat
terhindar dengan adanya water mixing Mubarak, 1981. Rumput laut akan tumbuh subur pada daerah yang suhunya sesuai dengan
suhu di laut. Pada daerah tropis, rumput laut dapat tumbuh pada kisaran suhu 20– 30 ºC, dan untuk jenis Gracillaria sp. tumbuh optimal pada suhu 20–28 º C
Luning, 1990.
3. Kekeruhan
Kekeruhan menggambarkan sifat optik air yang ditentukan berdasarkan banyaknya cahaya yang diserap dan dipancarkan oleh bahan-bahan yang terdapat
dalam air. Kekeruhan disebabkan bahan organik dan bahan anorganik baik tersuspensi maupun terlarut seperti lumpur, pasir halus, bahan anorganik dan
organik seperti plankton dan mikroorganisme lainnya APHA, 1976; Davis dan Cornwell, 1991. Kekeruhan merupakan faktor pembatas bagi proses fotosintesis
dan produksi primer perairan karena mempengaruhi penetrasi cahaya matahari Boyd, 1988.
4. Substrat
Menurut Dawson 1956, pantai berkarang merupakan tempat hidup yang baik bagi sejumlah besar spesies rumput laut dan hanya sedikit yang hidup di
pantai berpasir. Hal ini juga didukung oleh pernyataan Nontji 1987 yang mengatakan bahwa sedikitnya alga di perairan yang dasarnya berlumpur atau
berpasir karena sangat terbatasnya benda-benda keras yang cukup kokoh untuk tempatnya melekat.
Mubarak 1981 mengatakan bahwa susunan kimia dari substrat tidak mempengaruhi kehidupan tumbuhan air, hanya sebagai tempat menempel
melekat, sedangkan makanan diambil dari diambil dari medium sekitarnya.
5. Gerakan Air
Arus dan pergerakan air mempunyai pengaruh yang besar terhadap aerasi, transportasi nutrien, dan pengadukan air yang besar pengaruhnya terhadap
keberadaan oksigen terlarut Trono dan Fortes, 1988. Peranan yang lain yaitu untuk menghindarkan akumulasi silt dan epifit yang melekat pada thallus yang
dapat menghalangi pertumbuhan rumput laut. Semakin kuat arusnya, pertumbuhan rumput laut akan semakin cepat besar karena difusi nutrien ke dalam
sel tanaman semakin banyak sehingga metabolisme dipercepat Soegiarto et al. 1979.
6. Padatan Tersuspensi Total