TINJAUAN PUSTAKA BAHAN DAN METODE HASIL DAN PEMBAHASAN KESIMPULAN DAN SARAN

vii DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU DAFTAR ISI Halaman PERSETUJUAN i PERNYATAAN ii ABSTRAK iii ABSTRACT iv PENGHARGAAN v DAFTAR ISI vi DAFTAR TABEL ix DAFTAR GAMBAR x DAFTAR LAMPIRAN xi BAB 1. PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang 1 1.2 Perumusan Masalah 2 1.3 Tujuan Penelitian 3 1.4 Manfaat Penelitian 3

BAB 2. TINJAUAN PUSTAKA

2.1 Perkembangan Ekspor Udang 4 2.2 Bakteri Patogen Oportunis pada Udang 5 2.2.1 Escherichia coli 5 2.2.2 Salmonella 6 2.2.3Staphylococcus aureus 7 2.3 Biofilm 8 2.4 Bacillus Sebagai Penghasil Bakteriosin 8

BAB 3. BAHAN DAN METODE

3.1Waktu dan Tempat 10 3.2Alat dan Bahan 10 3.3Peremajaan Isolat Bakteri Patogen dan Bacillus 10 3.4 Optimasi pH dan Penambahan NaCl dalam Pengendalian Sel Bakteri Patogen dengan Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 11 3.4.1 Optimasi pH dan PenambahNaCl 11 3.5 Pembentukan Sel Biofilm 11 3.6 Pengendalian Sel Biofilm Patogen Dengan Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 12 3.6.1 Produksi Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 12 3.6.2 Uji Aktivitas Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 Terhadap Biofilm Bakteri Patogen 12 Universitas Sumatera Utara viii DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU

BAB 4. HASIL DAN PEMBAHASAN

4.1 Optimasi pH dan Penambahan NaCl Pada Media Produksi Terhadap Aktivitas Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 13 4.1.1 Daya Hambat Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 Tehadap Bakteri Patogen Salmonella sp. 13 4.1.2 Daya Hambat Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 Tehadap Bakteri Patogen E. coli 14 4.1.3 Daya Hambat Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 Tehadap Bakteri Patogen Staphylococcus aureus 14 4.2 Pengendalian Sel Biofilm Bakteri Patogen Dengan Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 17

BAB 5. KESIMPULAN DAN SARAN

5.1 Kesimpulan 19 5.2 Saran 19 DAFTAR PUSTAKA 20 Universitas Sumatera Utara ix DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU DAFTAR TABEL Halaman Tabel 1. Rata-rata besar zona hambat senyawa antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 terhadapSalmonellasp. pada media MHA pada suhu 28 C danwaktu inkubasi 24 dan 48 jam 13 Tabel 2. Rata-rata besar zona hambat senyawa antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 terhadapE. coli pada media MHA pada suhu 28 C danwaktu inkubasi 24 dan 48 jam 14 Tabel 3. Rata-rata besar zona hambat senyawa antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 terhadapStaphylococcus aureus. pada media MHA pada suhu 28 Cdan waktu inkubasi 24 dan 48 jam 15 Tabel 4. Jumlah Sel Biofilm Bakteri Uji sebelum dan setelah kontak dengan senyawa antimikroba bakteri Bacillus cereus DA 5.2.3 17 Universitas Sumatera Utara x DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU DAFTAR GAMBAR Halaman Gambar 1. Zona hambat senyawa antimikrobaBacillus cereus DA 5.2.3pada pH 5 dan NaCl 2 terhadap aStaphylococcusaureus; b Salmonella sp.; c E.coli 16 Universitas Sumatera Utara xi DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU DAFTAR LAMPIRAN Halaman Lampiran 1. Bagan Kerja 24 Universitas Sumatera Utara iii DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU ABSTRAK Produktivitas tambak udang dalam beberapa tahun terakhir mengalami penurunan yang antara lain disebabkan oleh adanya bakteri patogen oportunis pada tambak udang sepertiE. coli,Salmonellasp. dan Staphylococcusaureus. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui daya hambat senyawa antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 yang diproduksi pada pH optimum dan penambahan konsentrasi NaCl terhadap pertumbuhan biofilm bakteri patogen oportunistik tambak udang.Penelitian ini menggunakan bakteri Bacillus cereus DA 5.2.3 sebagai penghasil senyawa antimikroba dan bakteri patogen yang digunakan adalah bakteri patogen oportunistik pada tambak udang yaitu E. coli, Salmonella sp. , dan Staphylococcus aureus.Bacillus cereus DA 5.2.3 dikultur dalam media SWC cair pada pH 5, 6, 7, 8, dan 9 dengan penambahan NaCl 0, 1, 2, dan 3 untuk menghasilkan senyawa antimikroba. Kultur disentrifugasi dengan kecepatan 10000 rpm selama 15 menit. Senyawa antimikroba diujikan terhadap bakteri patogen dengan metode kertas cakram. Senyawa antimikroba tersebut juga diujikan terhadap sel biofilm bakteri patogen. Senyawa antimikroba yang diproduksi pada pH 5 dan penambahan NaCl 2 dapat menghambat pertumbuhan ketiga bakteri patogen. Penghambatan senyawa antimikroba terhadap petumbuhan sel biofilm umur 1 hari sebesar hampir 100 terhadap ketiga bakteri patogen oportunistik yang diujikan.Pada sel biofilm yang berumur 3 hari terjadi penghambatan sebesar 96 terhadap Salmonella sp., 95 terhadap E.coli , dan sebesar hampir100 terhadap Staphylococcus aureus. Kata Kunci: biofilm, Bacillus cereus DA 5.2.3, senyawa antimikroba Universitas Sumatera Utara iv DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU ABSTRACT Shrimp farm productivity in recent years has decreased partly due to the presence of opportunistic pathogenic bacteria in shrimp ponds such as E. coli, Salmonella sp. and Staphylococcus aureus. This study wants to know the ability of Bacillus cereus DA 5.2.3 antimicrobial compounds which is produced in optimum pH and adding of NaCl concentration to inhibit growth of the cell biofilm of opportunistic pathogen bacteria in shrimp ponds. This study uses the bacteria Bacillus cereus DA 5.2.3 as a producer of antimicrobial compounds and pathogenic bacteria used are opportunistic pathogens bacteria in shrimp ponds are E. coli, Salmonella sp., and Staphylococcus aureus. Bacillus cereus DA 5.2.3 was cultured in liquid medium SWC at pH 5, 6, 7, 8, and 9 with the addition of NaCl 0, 1, 2, and 3 to produce antimicrobial compounds. Culture was centrifuged at 10,000 rpm for 15 minutes. Antimicrobial compounds were tested against pathogens by disc diffusion method. The antimicrobial compound was also tested against biofilm cells of pathogenic bacteria. Antimicrobial compounds were produced at pH 5 and the addition of 2 NaCl can inhibit the growth of third opportunistic pathogenic bacteria.Inhibition of antimicrobial compounds on the growth of one day old biofilm cell was almost 100 of the third opportunistic pathogen bacteria which are tested. The three days old biofilm cell was reduced as much as 96 of Salmonella sp ., 95 of E.coli, and almost 100 of Staphylococcus aureus. Keywords :biofilms , Bacillus cereus DA 5.2.3 , antimicrobial compounds Universitas Sumatera Utara DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU

BAB 1 PENDAHULUAN