vii
DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU
DAFTAR ISI
Halaman
PERSETUJUAN
i PERNYATAAN
ii ABSTRAK
iii ABSTRACT
iv PENGHARGAAN
v DAFTAR ISI
vi DAFTAR TABEL
ix DAFTAR GAMBAR
x DAFTAR LAMPIRAN
xi BAB 1. PENDAHULUAN
1.1 Latar Belakang 1
1.2 Perumusan Masalah 2
1.3 Tujuan Penelitian 3
1.4 Manfaat Penelitian 3
BAB 2. TINJAUAN PUSTAKA
2.1 Perkembangan Ekspor Udang 4
2.2 Bakteri Patogen Oportunis pada Udang 5
2.2.1 Escherichia coli 5
2.2.2 Salmonella 6
2.2.3Staphylococcus aureus 7
2.3 Biofilm 8
2.4 Bacillus Sebagai Penghasil Bakteriosin 8
BAB 3. BAHAN DAN METODE
3.1Waktu dan Tempat 10
3.2Alat dan Bahan 10
3.3Peremajaan Isolat Bakteri Patogen dan Bacillus 10
3.4 Optimasi pH dan Penambahan NaCl dalam Pengendalian Sel Bakteri Patogen dengan Senyawa
Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3 11
3.4.1 Optimasi pH dan PenambahNaCl 11
3.5 Pembentukan Sel Biofilm 11
3.6 Pengendalian Sel Biofilm Patogen Dengan Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3
12 3.6.1 Produksi Senyawa Antimikroba Bacillus cereus
DA 5.2.3 12
3.6.2 Uji Aktivitas Senyawa Antimikroba Bacillus cereus
DA 5.2.3 Terhadap Biofilm Bakteri Patogen
12
Universitas Sumatera Utara
viii
DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU
BAB 4. HASIL DAN PEMBAHASAN
4.1 Optimasi pH dan Penambahan NaCl Pada Media Produksi Terhadap Aktivitas Senyawa Antimikroba
Bacillus cereus DA 5.2.3
13 4.1.1 Daya Hambat Senyawa Antimikroba Bacillus
cereus DA 5.2.3 Tehadap Bakteri Patogen
Salmonella sp. 13
4.1.2 Daya Hambat Senyawa Antimikroba Bacillus cereus
DA 5.2.3 Tehadap Bakteri Patogen E. coli
14 4.1.3 Daya Hambat Senyawa Antimikroba Bacillus
cereus DA 5.2.3 Tehadap Bakteri Patogen
Staphylococcus aureus 14
4.2 Pengendalian Sel Biofilm Bakteri Patogen Dengan Senyawa Antimikroba Bacillus cereus DA 5.2.3
17
BAB 5. KESIMPULAN DAN SARAN
5.1 Kesimpulan 19
5.2 Saran 19
DAFTAR PUSTAKA
20
Universitas Sumatera Utara
ix
DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU
DAFTAR TABEL
Halaman
Tabel 1. Rata-rata besar zona hambat senyawa antimikroba Bacillus cereus
DA 5.2.3 terhadapSalmonellasp. pada media MHA pada suhu 28
C danwaktu inkubasi 24 dan 48 jam
13 Tabel 2. Rata-rata besar zona hambat senyawa antimikroba
Bacillus cereus DA 5.2.3 terhadapE. coli pada media
MHA pada suhu 28 C danwaktu inkubasi 24 dan 48 jam
14 Tabel 3. Rata-rata besar zona hambat senyawa antimikroba
Bacillus cereus DA 5.2.3 terhadapStaphylococcus
aureus. pada media MHA pada suhu 28
Cdan waktu inkubasi 24 dan 48 jam
15 Tabel 4. Jumlah Sel Biofilm Bakteri Uji sebelum dan setelah
kontak dengan senyawa antimikroba bakteri Bacillus cereus
DA 5.2.3 17
Universitas Sumatera Utara
x
DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 1. Zona hambat senyawa antimikrobaBacillus cereus DA 5.2.3pada
pH 5
dan NaCl
2 terhadap
aStaphylococcusaureus; b Salmonella sp.; c E.coli 16
Universitas Sumatera Utara
xi
DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU
DAFTAR LAMPIRAN
Halaman
Lampiran 1. Bagan Kerja 24
Universitas Sumatera Utara
iii
DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU
ABSTRAK
Produktivitas tambak udang dalam beberapa tahun terakhir mengalami penurunan yang antara lain disebabkan oleh adanya bakteri patogen oportunis pada tambak
udang sepertiE. coli,Salmonellasp. dan Staphylococcusaureus. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui daya hambat senyawa antimikroba
Bacillus cereus
DA 5.2.3 yang diproduksi pada pH optimum dan penambahan konsentrasi NaCl terhadap pertumbuhan biofilm bakteri patogen oportunistik
tambak udang.Penelitian ini menggunakan bakteri Bacillus cereus DA 5.2.3 sebagai penghasil senyawa antimikroba dan bakteri patogen yang digunakan
adalah bakteri patogen oportunistik pada tambak udang yaitu E. coli, Salmonella sp.
, dan Staphylococcus aureus.Bacillus cereus DA 5.2.3 dikultur dalam media SWC cair pada pH 5, 6, 7, 8, dan 9 dengan penambahan NaCl 0, 1, 2, dan 3
untuk menghasilkan senyawa antimikroba. Kultur disentrifugasi dengan kecepatan 10000 rpm selama 15 menit. Senyawa antimikroba diujikan terhadap bakteri
patogen dengan metode kertas cakram. Senyawa antimikroba tersebut juga diujikan terhadap sel biofilm bakteri patogen. Senyawa antimikroba yang
diproduksi pada pH 5 dan penambahan NaCl 2 dapat menghambat pertumbuhan ketiga bakteri patogen. Penghambatan senyawa antimikroba
terhadap petumbuhan sel biofilm umur 1 hari sebesar hampir 100 terhadap ketiga bakteri patogen oportunistik yang diujikan.Pada sel biofilm yang berumur 3
hari terjadi penghambatan sebesar 96 terhadap Salmonella sp., 95 terhadap E.coli
, dan sebesar hampir100 terhadap Staphylococcus aureus. Kata Kunci: biofilm, Bacillus cereus DA 5.2.3, senyawa antimikroba
Universitas Sumatera Utara
iv
DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU
ABSTRACT
Shrimp farm productivity in recent years has decreased partly due to the presence of opportunistic pathogenic bacteria in shrimp ponds such as E. coli, Salmonella
sp.
and Staphylococcus aureus. This study wants to know the ability of Bacillus cereus DA 5.2.3 antimicrobial compounds which is produced in optimum pH and
adding of NaCl concentration to inhibit growth of the cell biofilm of opportunistic pathogen bacteria in shrimp ponds. This study uses the bacteria Bacillus cereus
DA 5.2.3 as a producer of antimicrobial compounds and pathogenic bacteria used are opportunistic pathogens bacteria in shrimp ponds are E. coli, Salmonella sp.,
and Staphylococcus aureus. Bacillus cereus DA 5.2.3 was cultured in liquid medium SWC at pH 5, 6, 7, 8, and 9 with the addition of NaCl 0, 1, 2, and 3 to
produce antimicrobial compounds. Culture was centrifuged at 10,000 rpm for 15 minutes. Antimicrobial compounds were tested against pathogens by disc
diffusion method. The antimicrobial compound was also tested against biofilm cells of pathogenic bacteria. Antimicrobial compounds were produced at pH 5 and
the addition of 2 NaCl can inhibit the growth of third opportunistic pathogenic bacteria.Inhibition of antimicrobial compounds on the growth of one day old
biofilm cell was almost 100 of the third opportunistic pathogen bacteria which are tested. The three days old biofilm cell was reduced as much as 96 of
Salmonella sp
., 95 of E.coli, and almost 100 of Staphylococcus aureus. Keywords :biofilms , Bacillus cereus DA 5.2.3 , antimicrobial compounds
Universitas Sumatera Utara
DEPARTEMEN BIOLOGI FMIPA USU
BAB 1 PENDAHULUAN