Pemodelan Molekul Optimasi Geometri

4. Black-diagonal newton-rephson hanya untuk MM + , yang memindahkan satu atom pada suatu waktu dengan menggunakan informasi turunan keduanya Pranowo, 2000.

2.10. Aktivitas Penghambatan 50 IC

50 Half maximal inhibitory concentration IC 50 adalah ukuran efektivitas penghambatan suatu senyawa dalam fungsi biologis atau biokimia. Ukuran kuantitatif ini menunjukkan berapa banyak obat tertentu atau bahan lainnya inhibitor yang dibutuhkan untuk menghambat proses biologis tertentu ataukomponen proses, yaitu suatu enzim, sel, reseptor sel atau mikroorganisme hingga setengahnya. Dengan kata lain, itu adalah setengah maksimal 50 konsentrasi penghambatan IC dari suatu zat 50 IC, atau IC 50 . Hal ini umumnya digunakan sebagai ukuran potensi antagonis obat dalam penelitian farmakologi Burger, 1998 dalam Rifai, 2014. BAB 3 METODE PENELITIAN

3.1. Lokasi Penelitian

Penelitian dilakukan di Laboratorium Kimia FMIPA UNNES Gedung D8 Ruang 355b.

3.2. Variabel Penelitian

3.2.1. Variabel Bebas

Variabel bebas adalah variabel yang harganya divariasi. Variabel bebas yang dipelajari dalam penelitian ini adalah jenis deskriptor dan senyawa model turunan dihidropiridin.

3.2.2. Variabel Terikat

Variabel terikat adalah variabel yang nilainya tergantung dari variable bebas. Variabel terikat yang dipelajari dalam penelitian ini adalah hasil eksperimen aktivitas calcium channel blocker dari senyawa turunan dihidropiridin.

3.3. Alat dan Bahan

3.3.1. Perangkat Keras

Perangkat keras yang digunakan dalam penelitian ini adalah seperangkat komputer dengan spesifikasi sebagai berikut 1 Prosesor tipe Intel Quad Core, 2 Harddisk 250 GB, 3 Random Acces Memory RAM 4 GB, dan 4 Monitor Hp LE1851w. 19

3.3.2. Perangkat Lunak

Perangkat lunak yang digunakan dalam penelitian ini adalah sebagai berikut 1 Hyperchem 8.0.8 sebagai software untuk pemodelan molekul. 2 GaussView 3.07 sebagai software pemodelan molekul, pengonversi format .pdb ke .gjf serta membuat file input untuk Gaussian-09W. 3 Gaussian 09W sebagai software untuk untuk optimasi geometri struktur molekul serta perhitungan nilai deskriptor elektronik. 4 MarvinBeans 15.2.0 yang dikeluarkan oleh ChemAxon digunakan menghitung nilai deskriptor sterik dan hidrofobik. 5 Sistem operasi yang digunakan adalah Windows Vista® Business OA EM-SEA untuk pemodelan dan untuk perhitungannya. 6 IBM SPSS Statistics 21 for Windows sebagai software untuk menganalisis korelasi dan menghitung regresi linear.

3.3.3. Bahan Penelitian

Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah aktivitas calcium channel blocker dalam pIC 50 senyawa turunan dihidropiridin disajikan pada Tabel 2.1. halaman 11. Adapun senyawa prediksi dari turunan dihidropiridin yang akan dieksplorasi, dipertimbahkan gugus pada atom mana yang berpengaruh dengan nilai IC 50 -nya. Yaitu dengan menggunakan muatan bersih pada atom-atomnya. Pada Tabel 2.1 diketahui gugus yang memiliki pIC 50 yang bagus adalah gugus R 1 dengan gugus fenil dan sikloheksil. Gugus C l pada atom C 10 dan C 11 divariasi dengan diganti dengan halogen lainnya F dan Br. Untuk mengetahui pengaruh keelektronegatifan terhadap aktivitas calcium channel blocker. Dan pada gugus R 2