Klasifikasi enzim selulase Enzim Selulase

dengan memecah ikatan β-1,4-D-glikosidik untuk menghasilkan oligosakarida maupun glukosa.

2.2.1 Klasifikasi enzim selulase

Enzim selulase dapat diklasifikasikan berdasarkan spesifisitas terhadap substrat, mekanisme reaksi atau kemiripan strukturnya. Berdasarkan struktur proteinnya, enzim selulase termasuk ke dalam famili glikosida hidrolase GH. GH merupakan kelompok enzim yang mempunyai aktivitas memotong ikatan glikosisik antara dua atau lebih karbohidrat. GH diklasifikasikan berdasarkan similaritas urutan dan struktur asam aminonya Henrissat 1991; Henrissat Bairoch 1993; Henrissat Bairoch 1996. Saat ini terdapat 113 famili GH yang dilaporkan secara online di website http:www.cazy.org . Cantarel et al. 2009. Untuk selulase, saat ini tersebar sedikitnya ke dalam 11 famili GH, yaitu famili 5- 9, 12, 26, 44, 45, 48 dan 61. Tabel 2 Substrat selulosa dan turunannya Substrat Enzim Larut dalam air Rantai pendek DP rendah Silodekstrin Radio-labelled silodekstrin Turunan silodekstrin β-methyllumberlliferil oligosakarida p-nitrofenol oligosakarida Turunan selulosa dengan rantai panjang Carboxymethylecellulose CMC Dyed CMC Tidak larut dalam air Selulosa kristalin – katun, selulosa mikrokristalin Avicel, selulosa bakteri Selulosa amorf-PASC Dyed cellulose Kromogenik dan turunan fluoreforik Trinitrofenil-karboksimetilselulosa TNP-CMC Fluram selulosa α-selulosa Endo, ekso, BG Endo, ekso, BG Endo, ekso, BG Endo, ekso, BG Endo Endo Total, endo, ekso Total, endo, ekso Total, endo Endo Endo, total Total Ket: Endo = endoglukanase; Ekso = eksoglukanase; BG = glukosidase; Total = ketiga tipe enzim selulase. Aktivitas masing-masing enzim selulase dapat diuji menggunakan berbagai substrat selulosa maupun turunannya. Pada umumnya substrat ini dibagi menjadi dua kategori berdasarkan kelarutannya dalam air, yaitu substrat yang larut dalam air dan substrat yang tidak larut dalam air Tabel 2. Substrat larut dalam air meliputi selodekstrin dengan DP degree of polymerization rendah dari 2 sampai 6 unit gula dan turunannya. Sementara itu substrat tidak larut meliputi selulosa yang hampir murni seperti katun, kertas saring Whatman no.1 dan selulosa bakteri, serta selulosa yang tidak murni seperti α-selulosa. Aktivitas enzim endoglukanase pada umumnya dapat diuji dengan substrat CMC carboxymethyl cellulose sehingga enzim endoglukanase juga dikenal dengan istilah CMCase. Sementara itu aktivitas enzim selobiohidrolase atau eksoglukanase seringkali diuji dengan substrat avicel sehingga enzim eksoglukanase disebut juga avicelase Zhang et al. 2006.

2.2.2 Struktur organisasi enzim selulase