Definisi dan Perkembangan Mikroba Endofit Isolasi jamur Endofit

macam senyawa alkaloid tersier yaitu hidroksi-berberin, limasin, dan homoarmulin. Verpoote et al. 1982. Dan terdapat pula tujuh senyawa furanoditerpen juga telah diisolasi dari batang kayu kuning yang meliputi 6-hydroxyarcangelisin, 2-dehidroarcangelisinol, tinophylol, 6-hydroxyfibleucin, 6-hydroxyfibraurin, dan fibleucin. Kunii. , et al .1995

2.2 Mikroba Endofit

2.2.1 Definisi dan Perkembangan Mikroba Endofit

Endofit berasal dari bahasa Yunani, ‘endo’berarti di dalam dan ‘fit’ phyte berarti tumbuhan. Petrini 1991 mendefinisikan endofit sebagai koloni organisme hidup tanpa menimbulkan symptom pada jaringan internal inangnya, walaupun pada periode tertentu akan berakibat timbulnya penyakit. Definisi tersebut lebih memperlihatkan bahwa endofit hanyalah sebagai salah satu tahapan dalam proses infeksi makhluk hidup terhadap inang tanpa pembatasan tipe interaksi yang mungkin terjadi pada endofit dan inangnya. Pada tahun 1992, Hirsch dan Braun mengemukakan pendapatnya mengenai definisi jamur endofit, yaitu koloni jamur pada jaringan hidup tumbuhan tanpa menimbulkan efek negatif dalam waktu dekat. Definisi tersebut ternyata tidak cukup untuk menunjukan seluruh organisme hidup selain jamur yang juga berperan sebagai endofit. Namun, untuk konteks jamur endofit, definisi yang diberikan oleh Hirsch dan Braun sudah cukup mewakili. Jamur endofit sejati true endophytic fungi kemungkinan besar tidak akan menimbulkan efek negatif terhadap inangnya, sebaliknya malah akan memberikan manfaat. Agusta .2009 Menurut Tan RX dan WX. Zou , mikroba endofit adalah mikroba yang hidup di dalam jaringan tanaman pada periode tertentu dan mampu hidup dengan membentuk koloni dalam jaringan tanaman tanpa membahayakan inangnya. Setiap tanaman tingkat tinggi dapat mengandung beberapa mikroba endofit yang mampu menghasilkan senyawa biologi atau metabolit sekunder yang diduga sebagai akibat koevolusi atau transfer genetik genetic recombination dari tanaman inangnya ke dalam mikroba endofit Tan, et.al. 2001.

2.2.2 Isolasi jamur Endofit

Pada umumnya jamur endofit diisolasi dari organ tumbuhan yang masih segar dan telah disterilkan permukaannya. Untuk sterilisasi permukaan organ tumbuhan yang umum digunakan adalah dengan cara merendamnya dalam alkohol 70-95. Namun, kemampuan alkohol untuk mensterilkan permukaan organ tumbuhan tersebut memiliki spektrum yang sempit dan sangat terbatas, sehingga perlu dikombinasikan dengan bahan kimia lainnya. Bahan kimia yang sering dikombinasikan biasanya adalah natrium hipoklorit NaOCl. Zang ,et al. 2006 ; Agusta. 2009. Medium tumbuh untuk proses isolasi jamur akan berpengaruh terhadap jumlah dan jenis jamur yang akan diisolasi. Agusta et al 2006, telah mengisolasi jamur endofit dari tanaman teh dengan menggunakan medium corn meal malt agar CMMA dengan antibiotik kloramfenikol dan telah dilaporkan terdapat 6 jenis jamur endofit yang diperoleh. Sedangkan pada proses isolasi dengan menggunakan medium agar dan tanpa penambahan antibiotik diperoleh 2 jenis jamur yang berbeda. Pada medium agar, khamir atau yeast juga memperlihatkan pertumbuhan yang sangat lambat sehingga dapat digunakan untuk purifikasi isolat jamur yang tercampur dengan khamir. Agusta , 2009. Berikut ini merupakan contoh tahapan isolasi jamur endofit yang dilakukan oleh Agusta et al, 2006 dari ranting muda tanaman teh : 1. Organ tumbuhan tertentu ranting dicuci bersih dengan air dan kemudian dipotong-potong dengan ukuran panjang tertentu. 2. Dilakukan sterilisasi terhadap ranting yang telah dipotong dengan merendamnya dalam etanol 75 selama 1 menit, dalam larutan natrium hipoklorit selama 0.5 menit dan direndam kembali dengan etanol 75 selama 0.5 menit. 3. Ranting yang telah disterilisasikan selanjutnya dibelah dengan menggunakan pemotong steril. 4. Potongan ranting kemudian diletakan diatas medium CMMA yang mengandung kloramfenikol 0.5 mg ml 5. Koloni-koloni yang telah tumbuh selanjutnya dipisahkan dengan menginokulasikannya ke dalam medium PDA Potato Dextro Agar.

2.2.3 Metabolit – Metabolit yang Dihasilkan Jamur Endofit.