fisik, kimia, dan biologi tanah saling berinteraksi satu dengan lainnya sehingga keberadaan suatu faktor akan berpengaruh terhadap faktor lainnya Brock, 1966
dalam Sudadi, 2005.
2 4
6 8
10
RS RU
TM USU ICM
PS
J um
lah Is
ol at
Lokasi Pengambilan Sampel
Akar Daun
Gambar 4.1.1 Kehadiran isolat bakteri endofit pada setiap lokasi perkebunan kelapa sawit di Sumatera Utara
Pengamatan morfologi koloni isolat bakteri endofit berupa bentuk, tepi, elevasi, dan warna koloni. Karakteristik morfologi bakteri endofit bervariasi dengan
bentuk bulat, tidak beraturan, dan berfilamen. Tepi koloni bervariasi dari rata, berbelah, berombak, dan berfilamen, dengan elevasi koloni umumnya rata, namun ada
juga beberapa isolat yang berelevasi cembung. Warna koloni umumnya krem, tapi ada dua koloni dengan warna yang mencolok yaitu biru tua dan merah Tabel 4.1.1.
4.2 Karakterisasi Isolat Bakteri Endofit
Karakterisasi isolat berupa pewarnaan Gram dan beberapa uji biokimia. Hasil pewarnaan Gram yang dilakukan diperoleh sebanyak 9 isolat 22,5 merupakan
bakteri Gram positif dan sebanyak 31 isolat 75,5 merupakan bakteri Gram negatif. Bakteri endofit akar sebagian besar merupakan bakteri Gram negatif dan ditemukan
sebesar 72,4, sedangkan bakteri Gram positif sebesar 27,6. Bakteri endofit daun
Universitas Sumatera Utara
sebagian besar merupakan bakteri Gram negatif dan ditemukan sebesar 90,9, sedangkan bakteri Gram positif sebesar 9,1. Menurut Lay 1994, pewarnaan Gram
merupakan tahap penting dalam pencirian dan identifikasi bakteri. Pewarnaan Gram berperan memilahkan bakteri menjadi kelompok Gram positif dan Gram negatif.
Isolat bakteri endofit umumnya memiliki bentuk basil dan kokus. Hampir semua isolat memiliki penataan monokokus, diplokokus, monobasil, dan diplobasil Tabel 4.2.1.
Namun ada juga beberapa isolat dengan penataan streptokokus PS32A, streptobasil USU21A, stapilokokus USU19A, dan tetrabasil TM13A.
Tabel 4.1.1 Karakteristik morfologi koloni isolat bakteri endofit akar dan daun kelapa sawit
No. Isolat
Karakteristik Morfologi Koloni Bentuk
Tepi Elevasi
Warna
1. 2.
3. 4.
5. 6.
7. 8.
9.
10. 11.
12. 13.
14. 15.
16. 17.
18. 19.
20. 21.
22. 23.
24. 25.
26. 27.
28. 29.
30. 31.
32. 33.
34. 35.
36. 37.
38. 39.
40. RS01A
RS02A RS03A
RS04A RS05D
RU06A RU07A
RU08D RU09D
TM10A TM11A
TM12A TM13A
TM14A TM15D
USU16A USU17A
USU18A USU19A
USU20A USU21A
USU22A USU23A
USU24A USU25D
ICM26A ICM27A
ICM28D ICM29D
PS30A PS31A
PS32A PS33A
PS34A PS35A
PS36D PS37D
PS38D PS39D
PS40D bulat
bulat bulat
tidak beraturan bulat
bulat tidak beraturan
bulat tidak beraturan
tidak beraturan bulat
tidak beraturan tidak beraturan
tidak beraturan tidak beraturan
bulat bulat
bulat tidak beraturan
tidak beraturan berfilamen
tidak beraturan tidak beraturan
tidak beraturan bulat
berfilamen bulat
bulat tidak beraturan
tidak beraturan tidak beraturan
berfilamen tidak beraturan
tidak beraturan tidak beraturan
berfilamen tidak beraturan
tidak beraturan berfilamen
tidak beraturan rata
rata rata
berbelah rata
rata berbelah
rata berombak
berbelah rata
berombak berbelah
berombak berombak
rata rata
rata berbelah
berbelah berbelah
berbelah berbelah
berbelah
rata berfilamen
rata rata
berbelah berombak
berbelah berfilamen
berbelah berbelah
berbelah berfilamen
berbelah berbelah
berfilamen berbelah
rata rata
rata rata
rata rata
rata
cembung rata
rata rata
rata rata
rata rata
rata rata
rata rata
rata rata
rata rata
rata rata
rata rata
rata rata
rata rata
rata
cembung rata
cembung rata
cembung cembung
rata cembung
putih krem
krem putih
krem krem
krem putih
krem krem
merah krem
krem putih pupus
krem krem
kuning biru tua
krem krem pupus
krem krem
krem krem
krem krem
krem putih
krem krem
krem krem
krem krem
krem krem
krem krem
krem krem
Universitas Sumatera Utara
Hasil positif untuk uji sitrat menunjukkan sebanyak 23 isolat mampu menggunakan sitrat sebagai satu-satunya sumber karbon, dan uji positif ditunjukkan
dengan terjadinya perubahan warna pada media dari hijau menjadi biru akibat adanya perubahan pH Lay, 1994. Hasil yang diperoleh pada uji motilitas menunjukkan
bahwa hampir semua isolat bersifat motil, dan sebanyak 13 isolat tidak menunjukkan adanya pergerakan. Namun pada uji katalase, semua isolat menunjukkan hasil negatif
Tabel 4.2.2.
Tabel 4.2.1 Hasil pewarnaan Gram bakteri endofit akar dan daun kelapa sawit
No. Isolat
Bentuk Penataan
Sifat
1. 2.
3. 4.
5. 6.
7. 8.
9.
10. 11.
12. 13.
14. 15.
16. 17.
18. 19.
20. 21.
22. 23.
24. 25.
26. 27.
28. 29.
30. 31.
32. 33.
34. 35.
36. 37.
38. 39.
40. RS01A
RS02A RS03A
RS04A RS05D
RU06A RU07A
RU08D RU09D
TM10A TM11A
TM12A TM13A
TM14A TM15D
USU16A USU17A
USU18A USU19A
USU20A USU21A
USU22A USU23A
USU24A USU25D
ICM26A ICM27A
ICM28D ICM29D
PS30A PS31A
PS32A PS33A
PS34A PS35A
PS36D PS37D
PS38D PS39D
PS40D basil
kokus kokus
kokus basil
basil kokus
basil kokus
kokus kokus
basil basil
basil basil
basil basil
basil
kokus basil
basil basil
basil
kokus basil
basil kokus
kokus basil
kokus basil
kokus kokus
kokus kokus
basil basil
basil basil
kokus monobasil, diplobasil
monokokus, diplokokus monokokus, diplokokus
monokokus, diplokokus monobasil, diplobasil
monobasil, diplobasil monokokus, diplokokus
monobasil, diplobasil monokokus, diplokokus
monokokus, diplokokus monokokus, diplokokus
monobasil, streptobasil monobasil, diplobasil, tetrabasil
monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil
monobasil, diplobasil monobasil, streptobasil
monobasil, diplobasil monokokus, stapilokokus
monobasil, diplobasil monobasil, diplo, streptobasil
monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil
monokokus, tetrakokus monobasil, diplobasil
monobasil, diplobasil monokokus, diplokokus
monokokus, diplokokus monobasil, diplobasil
monokokus,diplokokus monobasil, diplobasil
monokokus, streptokokus monokokus, diplokokus
monokokus, diplokokus monokokus,diplokokus
monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil
monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil
monokokus, diplokokus Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram positif Gram positif
Gram positif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram positif Gram positif
Gram negatif Gram positif
Gram positif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram positif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram negatif Gram negatif
Gram positif Gram negatif
Gram negatif
Sebanyak 21 isolat tidak mampu menghidrolisis pati, dan sebanyak 9 isolat menunjukkan hasil positif terhadap uji gelatin. Sedangkan pada uji TSIA hampir
Universitas Sumatera Utara
semua isolat menunjukkan hasil positif yang diamati melalui perubahan warna pada media daerah butt dan slant, adanya endapan hitam pada bagian butt yang merupakan
senyawa FeS akibat pembentukan H
2
S Lay, 1994.
Tabel 4.2.2 Hasil uji biokimia metabolisme bakteri endofit akar dan daun kelapa sawit
Isolat Uji Biokimia
S itr
at M
o tilit
a s
H id
ro lis
is Pa
ti
G el
a ti
n K
at al
as e
TSIA No.
G luko
sa Sukr
o sa
La k
to sa
E nda
p a
n K
eret a
k a
n K
et era
n g
a n
1. 2.
3. 4.
5. 6.
7. 8.
9.
10. 11.
12. 13.
14. 15.
16. 17.
18. 19.
20. 21.
22. 23.
24. 25.
26. 27.
28. 29.
30. 31.
32. 33.
34. 35.
36. 37.
38. 39.
40. RS01A
RS02A RS03A
RS04A RS05D
RU06A RU07A
RU08D RU09D
TM10A TM11A
TM12A TM13A
TM14A TM15D
USU16A USU17A
USU18A USU19A
USU20A USU21A
USU22A USU23A
USU24A USU25D
ICM26A ICM27A
ICM28D ICM29D
PS30A PS31A
PS32A PS33A
PS34A PS35A
PS36D PS37D
PS38D PS39D
PS40D +
+ +
+ +
+ +
+
- +
+ +
- -
- +
- +
- -
- -
- -
-
+ +
- -
- -
-
+ +
+ +
+ +
+ +
- +
- +
+ +
- +
- +
+ +
+ +
+ +
+ +
- +
- -
+ -
+ +
- +
+ +
- +
+ +
+
- -
+ +
- -
- -
-
+ -
- +
- -
- +
+ +
- +
+ -
- -
-
+ +
- +
+ -
+ +
- -
+ +
+ +
+ +
+ +
- -
- +
- -
- -
+ -
- +
- -
- -
+ -
- -
-
+ -
- +
- -
+ -
- -
+ -
- -
- -
-
+ -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
- +
+ +
+ +
+
- +
+ +
+ +
- +
+ -
- +
- +
- +
- -
- -
- -
-
+ -
- -
-
+ -
- -
+ -
- +
+ -
- -
- -
+ -
+ -
- -
- -
- +
- +
- +
- -
- -
- -
-
+ -
- -
-
+ -
- -
+ -
- +
+ -
- -
- -
+ -
+ -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
+ +
+ +
+ +
+ +
+
- -
+ -
- -
- -
- -
- -
- -
- -
+ +
- -
- -
-
+ -
- -
- -
- -
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+ +
+
- +
+ +
+ +
+
- +
+ +
+ +
- +
+ -
Universitas Sumatera Utara
4.3 Kemampuan Antagonis Bakteri Endofit Akar dan Daun Kelapa Sawit Terhadap