Karakterisasi Isolat Bakteri Endofit

fisik, kimia, dan biologi tanah saling berinteraksi satu dengan lainnya sehingga keberadaan suatu faktor akan berpengaruh terhadap faktor lainnya Brock, 1966 dalam Sudadi, 2005. 2 4 6 8 10 RS RU TM USU ICM PS J um lah Is ol at Lokasi Pengambilan Sampel Akar Daun Gambar 4.1.1 Kehadiran isolat bakteri endofit pada setiap lokasi perkebunan kelapa sawit di Sumatera Utara Pengamatan morfologi koloni isolat bakteri endofit berupa bentuk, tepi, elevasi, dan warna koloni. Karakteristik morfologi bakteri endofit bervariasi dengan bentuk bulat, tidak beraturan, dan berfilamen. Tepi koloni bervariasi dari rata, berbelah, berombak, dan berfilamen, dengan elevasi koloni umumnya rata, namun ada juga beberapa isolat yang berelevasi cembung. Warna koloni umumnya krem, tapi ada dua koloni dengan warna yang mencolok yaitu biru tua dan merah Tabel 4.1.1.

4.2 Karakterisasi Isolat Bakteri Endofit

Karakterisasi isolat berupa pewarnaan Gram dan beberapa uji biokimia. Hasil pewarnaan Gram yang dilakukan diperoleh sebanyak 9 isolat 22,5 merupakan bakteri Gram positif dan sebanyak 31 isolat 75,5 merupakan bakteri Gram negatif. Bakteri endofit akar sebagian besar merupakan bakteri Gram negatif dan ditemukan sebesar 72,4, sedangkan bakteri Gram positif sebesar 27,6. Bakteri endofit daun Universitas Sumatera Utara sebagian besar merupakan bakteri Gram negatif dan ditemukan sebesar 90,9, sedangkan bakteri Gram positif sebesar 9,1. Menurut Lay 1994, pewarnaan Gram merupakan tahap penting dalam pencirian dan identifikasi bakteri. Pewarnaan Gram berperan memilahkan bakteri menjadi kelompok Gram positif dan Gram negatif. Isolat bakteri endofit umumnya memiliki bentuk basil dan kokus. Hampir semua isolat memiliki penataan monokokus, diplokokus, monobasil, dan diplobasil Tabel 4.2.1. Namun ada juga beberapa isolat dengan penataan streptokokus PS32A, streptobasil USU21A, stapilokokus USU19A, dan tetrabasil TM13A. Tabel 4.1.1 Karakteristik morfologi koloni isolat bakteri endofit akar dan daun kelapa sawit No. Isolat Karakteristik Morfologi Koloni Bentuk Tepi Elevasi Warna 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 25. 26. 27. 28. 29. 30. 31. 32. 33. 34. 35. 36. 37. 38. 39. 40. RS01A RS02A RS03A RS04A RS05D RU06A RU07A RU08D RU09D TM10A TM11A TM12A TM13A TM14A TM15D USU16A USU17A USU18A USU19A USU20A USU21A USU22A USU23A USU24A USU25D ICM26A ICM27A ICM28D ICM29D PS30A PS31A PS32A PS33A PS34A PS35A PS36D PS37D PS38D PS39D PS40D bulat bulat bulat tidak beraturan bulat bulat tidak beraturan bulat tidak beraturan tidak beraturan bulat tidak beraturan tidak beraturan tidak beraturan tidak beraturan bulat bulat bulat tidak beraturan tidak beraturan berfilamen tidak beraturan tidak beraturan tidak beraturan bulat berfilamen bulat bulat tidak beraturan tidak beraturan tidak beraturan berfilamen tidak beraturan tidak beraturan tidak beraturan berfilamen tidak beraturan tidak beraturan berfilamen tidak beraturan rata rata rata berbelah rata rata berbelah rata berombak berbelah rata berombak berbelah berombak berombak rata rata rata berbelah berbelah berbelah berbelah berbelah berbelah rata berfilamen rata rata berbelah berombak berbelah berfilamen berbelah berbelah berbelah berfilamen berbelah berbelah berfilamen berbelah rata rata rata rata rata rata rata cembung rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata rata cembung rata cembung rata cembung cembung rata cembung putih krem krem putih krem krem krem putih krem krem merah krem krem putih pupus krem krem kuning biru tua krem krem pupus krem krem krem krem krem krem krem putih krem krem krem krem krem krem krem krem krem krem krem krem Universitas Sumatera Utara Hasil positif untuk uji sitrat menunjukkan sebanyak 23 isolat mampu menggunakan sitrat sebagai satu-satunya sumber karbon, dan uji positif ditunjukkan dengan terjadinya perubahan warna pada media dari hijau menjadi biru akibat adanya perubahan pH Lay, 1994. Hasil yang diperoleh pada uji motilitas menunjukkan bahwa hampir semua isolat bersifat motil, dan sebanyak 13 isolat tidak menunjukkan adanya pergerakan. Namun pada uji katalase, semua isolat menunjukkan hasil negatif Tabel 4.2.2. Tabel 4.2.1 Hasil pewarnaan Gram bakteri endofit akar dan daun kelapa sawit No. Isolat Bentuk Penataan Sifat 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 25. 26. 27. 28. 29. 30. 31. 32. 33. 34. 35. 36. 37. 38. 39. 40. RS01A RS02A RS03A RS04A RS05D RU06A RU07A RU08D RU09D TM10A TM11A TM12A TM13A TM14A TM15D USU16A USU17A USU18A USU19A USU20A USU21A USU22A USU23A USU24A USU25D ICM26A ICM27A ICM28D ICM29D PS30A PS31A PS32A PS33A PS34A PS35A PS36D PS37D PS38D PS39D PS40D basil kokus kokus kokus basil basil kokus basil kokus kokus kokus basil basil basil basil basil basil basil kokus basil basil basil basil kokus basil basil kokus kokus basil kokus basil kokus kokus kokus kokus basil basil basil basil kokus monobasil, diplobasil monokokus, diplokokus monokokus, diplokokus monokokus, diplokokus monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil monokokus, diplokokus monobasil, diplobasil monokokus, diplokokus monokokus, diplokokus monokokus, diplokokus monobasil, streptobasil monobasil, diplobasil, tetrabasil monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil monobasil, streptobasil monobasil, diplobasil monokokus, stapilokokus monobasil, diplobasil monobasil, diplo, streptobasil monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil monokokus, tetrakokus monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil monokokus, diplokokus monokokus, diplokokus monobasil, diplobasil monokokus,diplokokus monobasil, diplobasil monokokus, streptokokus monokokus, diplokokus monokokus, diplokokus monokokus,diplokokus monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil monobasil, diplobasil monokokus, diplokokus Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram positif Gram positif Gram positif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram positif Gram positif Gram negatif Gram positif Gram positif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram positif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram negatif Gram positif Gram negatif Gram negatif Sebanyak 21 isolat tidak mampu menghidrolisis pati, dan sebanyak 9 isolat menunjukkan hasil positif terhadap uji gelatin. Sedangkan pada uji TSIA hampir Universitas Sumatera Utara semua isolat menunjukkan hasil positif yang diamati melalui perubahan warna pada media daerah butt dan slant, adanya endapan hitam pada bagian butt yang merupakan senyawa FeS akibat pembentukan H 2 S Lay, 1994. Tabel 4.2.2 Hasil uji biokimia metabolisme bakteri endofit akar dan daun kelapa sawit Isolat Uji Biokimia S itr at M o tilit a s H id ro lis is Pa ti G el a ti n K at al as e TSIA No. G luko sa Sukr o sa La k to sa E nda p a n K eret a k a n K et era n g a n 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24. 25. 26. 27. 28. 29. 30. 31. 32. 33. 34. 35. 36. 37. 38. 39. 40. RS01A RS02A RS03A RS04A RS05D RU06A RU07A RU08D RU09D TM10A TM11A TM12A TM13A TM14A TM15D USU16A USU17A USU18A USU19A USU20A USU21A USU22A USU23A USU24A USU25D ICM26A ICM27A ICM28D ICM29D PS30A PS31A PS32A PS33A PS34A PS35A PS36D PS37D PS38D PS39D PS40D + + + + + + + + - + + + - - - + - + - - - - - - - + + - - - - - + + + + + + + + - + - + + + - + - + + + + + + + + + - + - - + - + + - + + + - + + + + - - + + - - - - - + - - + - - - + + + - + + - - - - + + - + + - + + - - + + + + + + + + - - - + - - - - + - - + - - - - + - - - - + - - + - - + - - - + - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + - + + - - + - + - + - - - - - - - + - - - - + - - - + - - + + - - - - - + - + - - - - - - + - + - + - - - - - - - + - - - - + - - - + - - + + - - - - - + - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + - - + - - - - - - - - - - - - - + + - - - - - + - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + - + + - Universitas Sumatera Utara

4.3 Kemampuan Antagonis Bakteri Endofit Akar dan Daun Kelapa Sawit Terhadap