2. Organisasi Koleksi Buku
Koleksi buku terbagai dalam dua kategori, yaitu buku koleksi referensi dan buku koleksi umum. Koleksi referens bahan rujukan adalah berbagai
bahan yang hanya bisa digunakan atau dibaca di perpustakaan, tidak untuk dipinjamkan dibawa pulang. Hingga saat ini Perpustakaan Utama memiliki
kurang lebih 1500 judul buku rujukan referens yang meliputi rujukan tentang kajian Islam, tafsir, hadis, rujukan dalam ilmu-ilmu sosial seperti
pendidikan, hukum, politik, ekonomi, dan berbagai biografi para tokoh. Sedangkan kolkeksi umum adalah buku-buku yang dapat dipinjam untuk
dibawa pulang. Saat ini Pusat Perpustakaan menyediakan tidak kurang dari 30.000 judul 40.000 eksemplar koleksi umum yang siap dipinjamkan
kepada para anggota.
3. Terbitan Berkala
Koleksi serial atau terbitan berkala tercetak ini terdiri dari Jurnal Ilmiah, Majalah Populer dan Surat Kabar. Jurnal ilmiah yang tersedia terdiri dari
jurnal-jurnal dalam bidang kajian ke-Islaman dan juga dalam bidang umum non-ke-Islaman. Sebagian besar jurnal tersebut merupakan terbitan dalam
negeri dan ada beberapa yang merupakan terbitan asing. Beberapa judul terbitan berkala yang tersedia adalah:
a. Jurnal Ilmiah bidang kajian Islam, antara lain: Journal of Islamic
Studies, Al-Huda, Jauhar, Studia Islamika, Kultur, Al- Jami’ah, Ahkam
Refleki, Al-Turats, dll.
b. Jurnal Ilmiah bidang kajian umum, diantaranya: Jurnal
Pendidikan dan Kebudayaan, Jurnal Adabiya, Archipel, International Journal of Middle East Studies, Modern Asian Studies, dll.
c. Majalah popular, terdiri atas: Forum Keadilan, Gatra, Tempo,
Amanah, Alo Indonesia berbahasa Arab, Trubus majalah hobi, Times. dll.
d. Surat kabar dilanggan, yaitu: Republika, Media Indonesia, Tempo,
Kompas, Seputar Indonesia, The Jakarta Post.
4. Muatan Lokal
Muatan atau koleksi lokal adalah koleksi yang berupa karya-karya yang dihasilkan oleh para sivitas akademika UIN Jakarta sendiri, yang termasuk
jenis koleksi ini adalah: Skripsi, Tesis, Disertasi, dan Laporan penelitian. Sampai saat ini, jumlah koleksi skripsi telah mencapai tidak kurang dari
18.127 Delapan Belas Ribu Seratus Dua Puluh Tujuh judul, tesis sekitar 1000 seribu judul, dan disertasi sekitar 300 tiga ratus judul. Sementara
koleksi laporan penelitian yang tersedia saat ini kurang lebih lima ratus judul, dan sebagian besar adalah laporan penelitian dalam bidang keagamaan, sosial
dan budaya. Saat ini perpustakaan sedang mengupayakan digitalisasi untuk koleksi lokal ini, dengan harapan agar dapat diakses secara online dari
berbagai tempat. Koleksi ini hanya boleh dibaca di ruang perpustakaan, tidak dipinjamkan untuk dibawa pulang. Bagi pemustaka yang sangat membutuhkan
diperbolehkan memfotokopi dengan jumlah terbatas dan ketentuan yang sangat ketat.