II TINJAUAN PUSTAKA
2.1 Struktur Protein
Protein merupakan bagian yang sangat penting pada setiap makhluk hidup. Proses untuk mendapatkan protein dinamakan dengan translasi. Setiap makhluk
hidup memiliki kode genetik yaitu DNA deoxyribonucleic acid yang tersusun dari basa nitrogen adenin A, guanin G, thymine T dan cytosine C. Melalui
proses transkripsi, DNA tersebut ditranskripsikan menjadi RNA ribonucleic acid. RNA mengalami proses translasi untuk kemudian menghasilkan protein
Jones dan Pevzner 2004. Secara ringkas proses terbentuknya protein dapat dilihat pada Gambar 1.
Gambar 1. Proses pembentukan protein Protein merupakan elemen dasar dari suatu organisme yang dibentuk dari
asam amino. Terdapat 20 asam amino dengan struktur kimia yang berbeda Polanski dan Kimmel 2007. Susunan asam amino pembentuk protein dapat
dilihat pada Tabel 1. Asam amino tersebut terbentuk dari tiga huruf triplet dari kombinasi Asam
Deoksirobosa DNA yang disebut dengan codon. Codon triplet pembentuk protein dapat dilihat pada Tabel 2. Satu protein protein terdiri atas sejumlah
sekuens asam amino. Ilustrasi dari pembentukan satu protein berdasarkan sekuensnya dapat dilihat pada Gambar 2.
translasi transkripsi
DNA RNA
PROTEIN
DNA : TAC CGC GGC TAT TAC TGC CAG GAA GGA ACT
RNA : AUG GCG CCG AUA AUG ACG GUC CUU CCU UGA
Protein : Met Ala Pro Ile Met Thr Val Leu Pro Stop
Gambar 2. Contoh urutan asam amino pembentuk suatu protein Gambar 2 merupakan ilustrasi proses pembentukan protein mulai dari urutan
sekuens DNA sampai dengan proses translasi yang dapat menghasilkan suatu protein.
Tabel 1. Asam amino, singkatan, simbol dan karakteristik
Asam Amino Singkatan
Simbol Karakteristik
Alanine Ala
A Nonpolar, hydrophobic
Arginine Arg
R Polar, hydrophilic
Asparagine Asn
N Polar, hydrophilic
Aspartic acid Asp
D Polar, hydrophilic
Cystein Cys
C Polar, hydrophilic
Glutamine Gln
Q Polar, hydrophilic
Glutamic acid Glu
E Polar, hydrophilic
Glycine Gly
G Polar, hydrophilic
Histidine His
H Polar, hydrophilic
Isoleucine Ile
I Nonpolar, hydrophobic
Leucine Leu
L Nonpolar, hydrophobic
Lysine Lys
K Polar, hydrophilic
Methionine Met
M Nonpolar, hydrophobic
Phenylalanine Phe
F Nonpolar, hydrophobic
Proline Pro
P Nonpolar, hydrophobic
Serine Ser
S Polar, hydrophilic
Threonine Thr
T Polar, hydrophilic
Tryptophan Trp
W Nonpolar, hydrophobic
Tyrosine Tyr
Y Polar, hydrophilic
Valine Val
V Nonpolar, hydrophobic