Gambar 21. Akurasi prediksi struktur sekunder protein tiap segmen kelas alpha- helix, betha-sheet dan coil model HSMM skenario 1
4.4.2 Matriks Konfusi Skenario 2
Prediksi tiap segmen struktur alpha-helix H, betha-sheet B dan coil C pada skenario 2 ini menggunakan 90 panjang durasi state. Matriks konfusi pada
pengujian skenario 2 dapat dilihat pada Tabel 6 untuk menggambarkan sebaran hasil identifikasi struktur sekunder protein baik alpha-helix H, betha-sheet B
maupun coil C. Tabel 6. Matriks konfusi pengujian skenario 2
kelas hasil prediksi akurasi
prediksi H B C
kela s asal
H 4396 295 1362 72,6
B 973 1043
818 36,6 C 1491 420 3242
62,9
Pada pengujian dengan 90 durasi state, terlihat bahwa dari sebanyak 4396 residu asam amino yang memiliki struktur alpha-helix H, mampu diprediksi
sesuai dengan strukturnya. Adapun struktur betha-sheet B dan coil masing- masing diprediksi dengan benar sebanyak 1043 residu dan 3242 residu.
Hasil akurasi prediksi Gambar 22 memperlihatkan bahwa akurasi struktur alpha-helix H relatif lebih tinggi dibandingkan dengan akurasi struktur
betha-sheet B dan coil dengan nilai 72, 6. Adapun akurasi betha-sheet B dan coil C masing-masing sebesar 36,8 dan 62,9.
Gambar 22. Akurasi prediksi struktur sekunder protein tiap segmen kelas alpha- helix, betha-sheet dan coil model HSMM skenario 2
4.4.3 Matriks Konfusi Skenario 3
Matriks konfusi skenario 3 menunjukkan hasil identifikasi struktur protein dengan model HSMM yang menggunakan panjang durasi state 75 dari panjang
total tiap struktur kelasnya. Hasil prediksi berupa Matriks konfusi dapat dilihat pada Tabel 7.
Tabel 7. Matriks konfusi pengujian skenario 3
kelas hasil prediksi akurasi
prediksi H B C
kela s asal
H 4394 295 1364 72,6
B 972 1019 843 36
C 1498 412 3243 62,9
Persentase akurasi prediksi pada pengujian skenario 3 masih memperlihatkan hasil masing-masing 72,6, 36 dan 62,9 untuk prediksi struktur alpha-helixH,
betha-sheetB dan coil. Secara grafik, akurasi prediksi pada pengujian skenario 3 ini dapat dilihat pada Gambar 23.
