Gambar 23. Akurasi prediksi struktur sekunder protein tiap segmen kelas alpha- helix, betha-sheet dan coil model HSMM skenario 3
4.4.4 Matriks Konfusi Skenario 4
Matriks konfusi skenario 4 menunjukkan hasil identifikasi struktur protein dengan model HSMM yang menggunakan panjang durasi state 50 dari panjang
total tiap struktur kelasnya. Apabila dibandingkan dengan hasil identifikasi pada Matriks konfusi sebelumnya ternyata penggunaan 50 panjang durasi state tidak
memberikan kenaikan akurasi yang siginifikan. Matriks konfusi hasil prediksi pengujian skenario 4 dapat dilihat pada Tabel 8.
Tabel 8. Matriks konfusi pengujian skenario 4
kelas hasil prediksi akurasi
prediksi H B C
kela s a
sal H 4391 254 1408
72,5 B 1003 966 865
34, 1
C 1525 360 3268 63,
4
Berdasar Tabel 8 terlihat bahwa nilai akurasi prediksi struktur alpa-helix H dan betha-sheet B masing-masing adalah 72,5 dan 34,1. Sementara pada prediksi
coil C menghasilkan akurasi pada angka 63,4. Akurasi prediksi struktur sekunder protein tiap segmen pada skenario 4 dapat dilihat pada grafik Gambar
24.
Gambar 24. Akurasi prediksi struktur sekunder protein tiap segmen kelas alpha- helix, betha-sheet dan coil model HSMM skenario 4
4.4.5 Matrik Konfusi Skenario 5
Matriks konfusi skenario 5 menunjukkan hasil identifikasi struktur protein dengan model HSMM yang menggunakan panjang durasi tertentu. Dalam hal ini
panjang durasi state yang ditentukan adalah 21. Matriks konfusi pada skenario 5 dapat dilihat pada Tabel 9.
Tabel 9. Matriks Konfusi Skenario 5
kelas hasil prediksi akurasi
prediksi H B C
kela s asal
H 4274 317 1462 70,6
B 950 1062 822 37,4
C 1421 429 3303 64,1
Penentuan panjang durasi state sebesar 21 memberikan hasil prediksi yang dapat dilihat pada Tabel 9. Sebanyak 4274 residu yang diprediksi sebagai alpha-helix
H, sedangkan sisanya diprediksi sebagai betha-sheet B sebanyak 317 residu dan coil C sebanyak 1462 residu. Adapun betha-sheet B diprediksi dengan
benar sebanyak 1062 residu dan coil C diprediksi dengan benar sebanyak 3303 residu. Akurasi prediksi pengujian skenario 5 dapat dilihat pada Gambar 25.
