3.2.2.2 Pengambilan Contoh Daun
Alat dan bahan yang digunakan dalam pengambilan contoh daun Sengon Solomon adalah silika gel, klip plastik, gunting, kertas label, alat tulis dan kamera
digital.
3.2.2.3 Analisis Genetik dengan Penanda RAPD
Alat dan bahan yang digunakan untuk teknik analisis genetik dengan penanda RAPD terbagi dalam berbagai tahap pekerjaan, yaitu tahapan ekstraksi
DNA, uji kualitas dan kuantitas DNA. Untuk pengujian kuantitas DNA dilakukan proses PCR-RAPD. Alat dan bahan untuk teknik analisis genetik disajikan pada
Tabel 3 dan Gambar 5.
Tabel 3 Alat dan bahan untuk teknik analisis genetik
Analisis Tahapan Pekerjaan
Ekstraksi DNA Uji Kualitas DNA
PCR-RAPD Analisis
Data
RAPD Alat:
Sarung tangan, mortar,
pestel, sudip, mikro pipet, tips,
tube 2 ml, rak tube, mesin
vortex, mesin water bath
fisherbrand, mesin
sentrifugasi, freezer, desikator.
Alat: Sarung
tangan, timbangan analitik, gelas ukur,
tabung elenmeyer, microwave, bak
agar, mikro pipet, mesin
elektroforesis fisher scientific, bak EtBr,
kamera, DNA, mesin UV
transiluminator Alat:
Sarung tangan, mikro tube
0,2 ml, rak mikrotube, mesin
PCR PTC-100 Programmable
Thermal Cycler, timbangan analitik,
gelas ukur, tabung elenmeyer,
microwave, bak agar, mikro pipet,
mesin elektroforesis
fisher scientific, bak EtBr, kamera,
DNA, mesin UV transiluminator,
laptop.
Alat: Komputer,
softwere POPGENE
32 dan NTSYS
versi 2.0.
Bahan: Bufer
ekstrak, PVP 100,
chloroform, isopropanol
dingin, NaCl, etanol 90,
buffer TE. Bahan:
Agarose, buffer TAE 1x,
DNA hasil ekstraksi, blue juice
10x, EtBr. Bahan:
Aquabidest, primer, DNA target,
Green Go Taq Polymerase, nukleas
free-water.
a b c
d e f
g h i
Gambar 5 Foto alat-alat penelitian. Ket: a Pipet mikro effendrof, b Mesin Vortex, c Mesin water bath fisherbrand, d Mesin sentrifugasi, e
Freezer, f Desikator, g Timbangan analitik, h Mesin elektroforesis
Fisher scientific,
i Mesin
PCR PTC-100
Programmable Thermal Cycler foto pribadi.
3.3 Metode Penelitian