Tempat dan Waktu Penelitian Alat Bahan

31 UIN Syarif Hidayatullah Jakarta

BAB 3 METODE PENELITIAN

3.1. Tempat dan Waktu Penelitian

Penelitian dilakukan pada Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan FKIK Universita Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta dan di Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia LIPI Serpong selama bulan Maret hingga Juni 2015.

3.2. Alat

3.2.1. Perangkat Keras Notebook Asus X44C series dengan spesifikasi Intel® celeron® CPU B800 1.50GHz 2 CPUS, ~1.50 GHz, RAM Random Access Memory 2.00 gigabyte, dan Graphic Card Intel® HD Graphics Family 784 MB. Notebook terhubung dengan ACDC adapter dan terkoneksi internet. 3.2.2. Perangkat Lunak Sistem operasi menggunakan Windows 7 Ultimate 64 bit, Autodock Tools, Discovery Studio 3.5 Visualizer Accelrys Enterprise Platform , Open Babel 2.3.2, Autodock Vina, Pymol De Lano Scitientific LLC , Marvin Sketch 5.5.1.0 http:www.chemaxon.com , LigPlot, Hyperchem TM trial for Windows, Protein Data Bank http:www.rcsb.orgpdb , SPSS 16.0 for windows, Microsoft Excel 2007. UIN Syarif Hidayatullah Jakarta

3.3. Bahan

3.3.1. Struktur molekul tiga dimensi enzim Inh A Mycobacterium tuberculosis Struktur tiga dimensi enzim Inh A diunduh dari Bank Data Protein melalui situs http:www.rcsb.orgpdb . Makromolekul protein yang dipilih adalah enzim Inh A pada Mycobacterium tuberculosis yang didapat dari metode X-ray Diffraction dengan resolusi 2,70 Å. Identitas makromolekul tersebut adalah 1ENY dengan format .pdb. 3.3.2. Struktur tiga dimensi ligan senyawa amidasi Etil p-metoksisinamat. Ligan yang digunakan adalah ligan dari senyawa amidasi etil p-metoksisinamat EPMS yang dibuat dengan Marvin Sketch dengan format .mol untuk perhitungan deskriptor dan format .pdb untuk proses docking. 3.3.3 Data anti-tuberculosis beberapa senyawa beserta strukturnya Data anti-tuberkulosis beberapa senyawa di ambil dari referensi dan jurnal penelitian, kemudian digunakan sebagai training sets dan test sets untuk membangun persamaan HKSA. Data aktivitas anti-tuberkulosis yang didapat adalah nilai Minimum Inhibitor Concentration MIC dan strukturnya dalam format .mol.

3.4. Cara Kerja

Dokumen yang terkait

Amidasi Senyawa Etil p-metoksisinamat Melalui Reaksi Langsung dengan Iradiasi Microwave Serta Uji Aktivitas Sebagai Antiinflamasi

4 31 104

Hubungan Kuantitatif Struktur Aktifitas Senyawa Nitrasi Etil P -Metoksisinamat Terhadap Aktivitas Anti Tuberkulosis Melalui Pendekatan Hansch Secara Komputasi

1 34 82

Amidasi senyawa etil p-metoksisinamat melalui reaksi langsung dengan iradiasi microwave serta uji aktivitas sebagai antiinflamasi

2 16 104

Modifikasi Struktur Senyawa Asam p-metoksisinamat Melalui Proses Amidasi Urea Serta Uji Aktivitas Sebagai Antiinflamasi

1 7 92

Amidasi Senyawa Etil p-metoksisinamat yang Diisolasi dari Kencur (Kaempferia galanga L.) dan Uji Aktivitas Antiinflamasi Secara In-Vitro

1 18 82

Hubungan kuantitatif struktur aktifitas senyawa nitrasi etil p -metoksisinamat terhadap aktivitas anti tuberkulosis melalui pendekatan hansch secara komputasi

0 9 82

Studi hubungan kuantitatif strukturaktivitas anti-tuberkulosis senyawa amidasi etil p-metoksisinamat dengan pendekatan hansch dan penambatan molekuler pada enzim inh a

0 6 101

Studi Hubungan Kuantitatif Struktur Aktivitas Dari Amidasi Senyawa Etil-P-Metoksisinamat Sebagai Antiinflamasi Dengan Pendekatan Hansch dan Komputasi

38 208 108

Studi Penambatan Molekul Senyawa-Senyawa Amidasi Etil Para Metoksisinamat Pada Peroxisome Proliferator- Activated Receptor- Gamma (PPARγ)

8 56 121

Optimasi Daya dan Waktu Reaksi Amidasi Etil P-Metoksisinamat dengan Dimetil Formamida Menggunakan Irradiasi Microwave

1 14 78