2.4 Virus Hepatitis C
Virus Hepatitis C HCV merupakan anggota dari famili Flaviviridae dengan genus Hepacivirus. Virus ini merupakan virus RNA positif. Virus
berbentuk bulat dengan diameter partikelnya 55-65 nm, dan memiliki selubung glikoprotein. Selain itu, terdapat inti core dan di dalamnya terdapat viral RNA.
Virus hepatitis C dibagi menjadi enam genotipe yang disandikan dengan angka, yaitu genotipe satu sampai enam Worman Lin 2000. Bentuk dari virus
hepatitis C dapat dilihat pada Gambar 3.
Gambar 3 Struktur virus hepatitis C HCV Moradpour et al. 2007. Genom HCV berukuran 9,6 kilobasa yang mengkodekan sekitar 3011 asam
amino. Poliproteinnya dipotong setelah proses translasi dan dibagi menjadi protein struktural dan nonstruktural. Protein struktural terdiri dari sebuah
nukleokapsid inti, protein p7, dan dua glikoprotein selubung virusnya E1 dan E2. Dua daerah pada E2 merupakan daerah hipervariabel 1 dan 2. Daerah
tersebut menunjukkan hipermutasi dari selubung sehingga sangat spesifik terhadap antibodi. Daerah E2 juga terdapat sisi pengikatan terhadap cluster of
differentiation 81 CD81, reseptor virus pada hepatosit dan sel limfosit B Tellinghuisen et al. 2007.
Protein nonstruktural pada HCV terbagi menjadi empat macam, yaitu NS1, NS2, NS3, NS4 NS4A dan NS4B, dan NS5 NS5A dan NS5B. Protein
nonstruktural tersebut berfungsi dalam reaksi enzimatis yang berperan dalam replikasi virus. NS1 berinteraksi dengan NS4A dibutuhkan untuk replikasi RNA.
NS2A bersifat hidrofobik yang berfungsi dalam perakitan virion virus baru dan
pelepasan partikel virus. NS2B membentuk kompleks dengan NS3 berperan sebagai kofaktor bagi serin protease dari NS3. Protein NS3 mengkodekan RNA
helikase yang berperan dalam replikasi virus. NS5A merupakan daerah yang sensitif terhadap interferon, sedangkan NS5B berperan di dalam RNA-dependent
RNA polimerase RdRp Tellinghuisen et al. 2007. Peta genomik dari HCV dapat dilihat pada Gambar 4.
Gambar 4 Peta genomik HCV Anzola dan Burgos 2003.
2.5 Ribonucleid Acid RNA Helikase
Kategori