4.2.3 Kecepatan Arus
Padang  lamun  umumnya  ditemukan  pada  perairan  dangkal  sepanjang pesisir  pantai  dan  estuary  yang  memiliki  dinamika  secara  fisik  dan  terkena  arus
pasang surut dan gelombang Koch  Gust 1999. Hasil penelitian menunjukkan bahwa  arus  pada  semua  stasiun  penelitian  relatif  sama  dan  termasuk  dalam
kategori  sangat  lambat  sampai  sedang  0,10-0,50  ms.  Macon  1974  Tabel  5. Kondisi  arus  yang  demikian  mengindikasikan  bahwa  padang  lamun  ini  berada
pada  lokasi  yang  relatif  terlindung.  Beberapa  penelitian  menunjukkan  bahwa kebanyakan  jenis  lamun  memerlukan  kondisi  yang  relatif  terlindung  untuk
tumbuh  dengan  subur,  misalnya  di  bagian  antara  pantai  dan  terumbu  karang Fonseca 1996; Fonseca  Bell 1998.
Koch  2001  mengemukakan  bahwa  untuk  mendukung  pertumbuhan  dan distribusi  padang  lamun  yang  sehat  diperlukan  kecepatan  arus  yang  sedang  di
antara 0,05 dan 1,00 ms.. Walau demikian, pergerakan air akan diperlukan untuk kelangsungan pertumbuhan  lamun, diantaranya  berkaitan dalam peningkatan  laju
pengambilan  ammonium  dan  nitrat  Thomas    Cornilisen  2003  dan  transport karbon  serta  nutrient  dari  kolom  air  ke  permukaan  daun  Koch  1994  in  Koch
Gust  1999.  Pada  kondisi  arus  dan  gelombang  yang  terlalu  lemah  bisa mengganggu keberadaan  lamun, karena akan  mengakibatkan penumpukan  bahan
organik Roblee et al. 1991 dan peningkatan konsentrasi sulfida dalam sedimen Koch  2001.  Konsentrasi  bahan  organik  dan  sulfida  yang  terlalu  berlebihan
dalam  sedimen  akan  meningkatkan  kebutuhan  oksigen  oleh  akar  kerena  kondisi sedimen  yang  anoksik  dan  apabila  tidak  tercukupi  karena  ketersediaan  cahaya
yang rendah,  maka akan  menyebabkan kematian  tumbuhan Roblee et al. 1991. Sebaliknya,  pada  daerah  dengan  arus  dan  gelombang  kuat,  akan  mengakibatkan
kerusakan  yang  disebabkan  transport  sedimen  sedimen  yang  belebihan  sehingga tidak memungkinkan anakan untuk tumbuh atau menutupi tegakan padang lamun
Koch  2001.  Sebagai  akibatnya,  daerah  yang  terkena  arus  atau  gelombang  kuat dan  cenderung  memiliki  bidang  lamun  yang  kecil  atau  tanpa  vegetasi  Fonseca
Bell 1998; Hovel et al. 2002; Krause-Jensen et al. 2003 Bagi ikan, kecepatan arus berpengaruh besar dalam transportasi telur, larva
dan ikan-ikan kecil, juga berperan dalam menentukan orientasi selama melakukan
perjalananmigasi yang panjang, terutama di daerah temperate Laevastu  Hayes 1981.
4.2.4 Suhu