Analisis Marka SSR Pendahuluan
58 yaitu sebesar 0.11. Pada populasi B01 dan B02, nilai PIC tertinggi sebesar 0.71
mEgCIR3543 dan terendah 0.05 mEgCIR0353. Dan pada populasi C72, nilai PIC tertinggi sebesar 0.702 mEgCIR3292 dan nilai terendah 0.116
mEgCIR0173.
Tabel 21. Nilai PIC Polymorphic Information Content pada setiap lokus marka SSR
Locus LG
Polymorphic Information Content PIC for each Locus for Populations : A125
A140 B01
B02 C72
DuraSelf TxT
All mEgCIR0353
16 -
0.19 0.05
0.15 -
0.107 0.115
0.407 mEgCIR3362
11 0.65
0.64 0.54
0.55 0.569
0.69 0.766
0.813 mEgCIR3886
9 0.34
0.47 0.21
0.59 0.408
0.515 0.682
0.731 mEgCIR3543
6 0.58
0.61 0.71
0.37 0.511
0.614 0.65
0.682 mCnCIR0038
13 0.73
0.6 0.5
0.68 0.696
0.794 0.77
0.840 mEgCIR0886
8 0.59
0.48 0.05
0.38 0.55
0.71 0.592
0.729 mEgCIR2414
12 0.51
0.54 0.67
0.58 0.555
0.534 0.798
0.761 mEgCIR3282
2 0.53
0.43 0.47
0.56 0.55
0.483 0.756
0.774 mEgCIR0173
3 0.33
0.11 0.53
0.08 0.116
0.269 0.523
0.458 mEgCIR3292
15 0.69
0.71 0.59
0.56 0.584
0.702 0.773
0.805 mEgCIR3785
10 0.62
0.65 0.62
0.54 0.555
0.644 0.774
0.805 mEgCIR2813
5 0.5
0.3 0.44
0.4 0.375
0.401 0.59
0.556 mEgCIR3533
4 0.64
0.46 0.45
0.61 0.371
0.559 0.735
0.707 mEgCIR0894
7 0.68
0.67 0.54
0.55 0.54
0.678 0.745
0.744 mEgCIR0802
1 0.45
0.69 0.43
0.33 0.56
0.602 0.648
0.711 mEgCIR3546
14 0.59
0.66 0.65
0.61 0.563
0.63 0.797
0.749 Rerata
0.704
Catatan : Marka SSR dan linkage group LG ditentukan berdasarkan Billote et al. 2001.
Berdasarkan Okoye et al.2016, nilai PIC lebih dari 0.7 menunjukkan bila marka yang digunakan sangat informatif. Sedangkan PIC 0.4 menunjukkan kalau
marka informatif moderat. Hal tersebut juga sejalan dengan yang dinyatakan oleh Sajib et al. 2012, yang menyatakan bahwa semakin tinggi nilai PIC yang
diperoleh akan semakin informatif primer tersebut didalam membedakan individu didalam populasi maupun antar populasi. Berdasarkan nilai PIC yang diperoleh
pada setiap populasi yang dianalisis, terlihat bahwa nilai rataan PIC yang diperoleh terhadap masing-masing populasi masih sangat rendah. Namun nilai
PIC pada seluruh populasi masih cukup informatif terlihat dari nilai rataan PIC untuk seluruh populasi yang masih cukup tinggi yaitu 0.70. Hanya marka
mEgCIR0353 dan mEgCIR0173 yang memiliki nilai PIC dibawah 0.5 yaitu secara berurutan 0.407dan 0.458. Nilai PIC pada 14 marka SSR lainnya diatas 0.5
yaitu pada kisaran 0.556 - 0.840Tabel 21. Berdasarkan hal tersebut, disimpulkan 14 marka SSR yang digunakan dalam penelitian ini cukup informatif di dalam