Analisis Hasil Amplifikasi Alel Mikrosatelit

43 mCnCIR0038 LG 13 yaitu sebesar 0.774. Sedangkan nilai PIC terendah pada seluruh populasi terdapat pada lokus mEgCIR0353 LG 16 dan mEgCIR0173 LG 3 yaitu sebesar 0.049 dan 0.149 secara berurutan. Pada populasi Dura, nilai PIC tertinggi terdapat pada lokus mEgCIR0886 LG yaitu sebesar 0.71. Sedangkan nilai PIC terendah terdapat pada mEgCIR0353 LG16 yaitu sebesar 0.107. Pada populasi B57, nilai PIC tertinggi hanya 0.57 dan terendah 0.25. Dan pada populasi C22, nilai PIC tertinggi sebesar 0.696 dan nilai terendah 0.116. Berdasarkan Okoye et al.2016, nilai PIC lebih dari 0.7 menunjukkan bila marka yang digunakan sangat informatif. Sedangkan PIC 0.4 menunjukkan kalau marka informatif moderat. Hal tersebut juga sejalan dengan yang dinyatakan oleh Sajib et al. 2012, yang menyatakan bahwa semakin tinggi nilai PIC yang diperoleh akan semakin informatif primer tersebut didalam membedakan individu didalam populasi maupun antar populasi. Berdasarkan nilai PIC yang diperoleh pada setiap populasi yang dianalisis, terlihat bahwa nilai rataan PIC yang diperoleh terhadap masing-masing populasi masih sangat rendah. Namun nilai PIC pada seluruh populasi masih cukup informatif terlihat dari nilai rataan PIC untuk seluruh populasi yang masih cukup tinggi yaitu 0.62. Hanya marka mEgCIR0173dan mEgCIR0353 yang memiliki nilai PIC dibawah 0.5 yaitu secara berurutan 0.149 dan 0.049. Nilai PIC pada 14 marka SSR lainnya diatas 0.5 yaitu pada kisaran 0.546 - 0.774 Tabel 14. Berdasarkan hal tersebut, 14 marka SSR yang digunakan dalam penelitian ini cukup informatif di dalam membedakan individu dalam populasi yang diuji.

4.3.4 Frekuensi Alel antar populasi

Berdasarkan tabel 15, pada seluruh populasi hanya 1 sampai alel 3 1.45 sampai 4.62 yang digrupkan dalam frekuensi alel tinggi dan 0 sampai 1 alel 0 sampai 1.54 masuk dalam grup langka. Mayoritas alel berada pada grup frekuensi alel rendah 39.58 sampai 62.16 maupun grup frekuensi alel menengah 33.85 sampai 56.25. Populasi C22 merupakan populasi dengan frekuensi alel menengah yang tertinggi 56.25, sedangkan populasi A127 merupakan populasi pada grup frekuensi alel rendah dengan persentase tertinggi 62.16. Alel langka banyak terjadi di populasi B01, yaitu 16 alel 24.62 pada P0.05. Sedangkan populasi C22 memiliki alel langka paling sedikit , yaitu 5 alel 10.42. Alel langka dilaporkan memiliki hubungan dengan kemampuan tanaman dalam beradaptasi terhadap kondisi stress akibat abiotik maupun biotik Rajora et al. 2000. Alel langka ini diduga lebih dipengaruhi oleh seleksi alam dibandingkan terjadinya hanyutan genetik genetic drift Arias et al. 2012.